These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_5932#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 3 consensus length = 760 fasta sequence [GAGGCCAAAAAAGACATAATGCCCGAAGGGACATCCTGGGTAGATTAATAAATTTTGGCGTCGCTAGGACCAAATATGCAACGGATTGTATTGGAATTTTATTAAGAGAGATGCGTCTCCTATCATCTAATCCTGGTGGCCCTCCTTGTTTATTGGTCATCGATGGTGTAAATTCCTTATGGTGTCGTGGAACTTTATTAAAGGATAAAACTCTTTCCGTTAATGTTACTACCGATCGATTGGCGATTGTACATCATTTGAAACGTGCATTGAGGGGAGACTGGCGTCATGGTGTCATAGTTACCTCTACAAATATTCGGGCGGCTTGGCCTACAGACAGAGAACAATATACTCCTGGTTATCTTTTGGGGAAATCCGGTTTCGAATATATGGATCCATTCATTCCTGTTCTCGCTGAAAATTACACCCCAACAGAAATTAATGCCTTATTAAGATTTTATGCAGAGAATAATTGGCTTACAAATCCCGCTGCTTTTACACCAAATGGACAAGCTGAATTAATATTTTTGTCTGATTATAATCCTCTGGAACTTAGCCGTTTAGCTGCTGAATGGTAGACTAATCGAACTATTAAAATATTAACTGAGTTGAAAATTATTAACCTATTGTCTGTATATTTAAAAGACTAAATAACAGTAATCTCTGTCCTCTTTT-AATTGGATATTGTAAATATCAGTGAAAT-ATCCTTTNAAATC-TTTGTACAGTTNTAACTTTNNTGATA-TTAGTAAAACATAAGTTA] [+] EMBL CD081859 [GAGGCCAAAAAAGACATAATGCCCGAAGGGACATCCTGGGTAGATTAATAAATTTTGGCGTCGCTAGGACCAAATATGCAACGGATTGTATTGGAATTTTATTAAGAGAGATGCGTCTCCTATCATCTAATCCTGGTGGCCCTCCTTGTTTATTGGTCATCGATGGTGTAAATTCCTTATGGTGTCGTGGAACTTTATTAAAGGATAAAACTCTTTCCGTTAATGTTACTACCGATCGATTGGCGATTGTACATCATTTGAAACGTGCATTGAGGGGAGACTGGCGTCATGGTGTCATAGTTACCTCTACAAATATTCGGGCGGCTTGGCCTACAGACAGAGAACAATATACTCCTGGTTATCTTTTGGGGAAATCCGGTTTCGAATATATGGATCCATTCATTCCTGTTCTCGCTGAAAATTACACCCCAACAGAAATTAATGCCTTATTAAGATTTTATGCAGAGAATAATTGGCTTACAAATCCCGCTGCTTTTACACCAAATGGACAAGCTGAATTAATATTTTTGTCTGATTATAATCCTCTGGAACTTAGCCGTTTAGCTGCTGAATGGTAGACTAATCGAACTATTAAAATATTAACTGAGTTGAAAATTATTAACCTATTGTCTGTATATTTAAAAGACTAAATAACAGTAATCTCTGTCCTCTTTT AATTGGATATTGTAAATATCAGTGAAAT ATCCTTTNAAATC TTTGTACAGTTNTAACTTTNNTGATA TTAGTAAAACATAAGT ] [-] EMBL CD075573 [ TTTATTAAAGGATAAAACTCTTTCCGTTAATGTTACTACCGATCGATTGGCGATTGTACATCATTTGAAACGTGCATTGAGGGGAGACTGGCGTCATGGTGTCATAGTTACCTCTACAAATATTCGGGCGGCTTGGCCTACAGACAGAGAACAATATACTCCTGGTTATCTTTTGGGGAAATCCGGTTTCGAATATATGGATCCATTCATTCCTGTTCTCGCTGAAAATTACACCCCACCAGAAATTAATGCCTTATTAAGATTTTATGCAGAGAATAATTGGCTTACAAATCCCGCTGCTTTTACACCAAATGGACAAGCTGAATTAATATTTTTGTCTGATTATAATCCTCTGGAACTTACCCGTTTAGCTGCTGAATGGTAGACTAATCGAACTATTAAAATATTAACTGAGTTGAAAATTATTAACCTATTGTCTGTATATTTAAAAGACTAAATACCAGTAATCTCTGTCCTCTTTTAAATTGGATATTGTAAATATCAGTGAAATAATCCTTT AAATCTTTTGTACAGTTTTAACTTT TTGATATTTAGTAACCAATAAagta] [-] EMBL CD112241 [ CGTCATGGTGTCATAGTTACCTCTACAAATATTCGGGCGGCTTGGCCTACAGACAGAGAACAATATACTCCTGGTTATCTTTTGGGGAAATCCGGTTTCGAATATATGGATCCATTCATTCCTGTTCTCGCTGAAAATTACACCCCAACAGAAATTAATGCCTTATTAAGATTTTATGCAGAGAATAATTGGCTTACAAATCCCG ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||