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Schistosoma mansoni
cluster # 5991 cluster # 5991       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5991#0 length = 618 sequences # 3  

consensusID : consensus_5991#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 618
fasta sequence
                              [GCATGATATCTATGGATCTTGGAAATTTGAAGATTTCTACTGTTAGTTGAGCTAATCTGATATCGTCTTTGACATGGATTATTTAAGAAATATCATATTATATCTTAGCTTTTCTGGGGGATTTTTATTATTCTATTGTCTACGTCATACCATGATGGGACGCTTTTTAAAATTTCTACTTTTGAAACCGGCATCCGTAATCTGGGTAATTATGCCGTTTGCTGTCAGAAAAATGATTTCAGAAACAATTCTTTGGTTCTTATTTGAGAGGCATTGTATTTATCAAGTCGTTTATTTAAGCTGTCTTGTTTTTGGACATTATATATTGATAATGGATGTTATAACTGTGCTCTATCGGTATTCCTGGTTAGAGAATAATCTGTTTCTTGGATCTGGATGTTTATTCCTTAATGGTGTGTTGTATATGTTGTTGTGTTTTAGTGATCCAGGTTTTATAACATCACGAAATAAGTCAGTTTATGCAAATATTTATGAATACGATAATTTTATTTATTCACCTAAACAATGCACAATATGCTGTCATATAATTCCAGCTAGATCTAAACATTGTTCTCGATGTGACCATTGCATATTTCGATTTGATCATCACTGTGTTTG]

[+] EMBL CD116933             [GCATGATATCTATGGATCTTGGAAATTTGAAGATTTCTACTGTTAGTTGAGCTAATCTGATATCGTCTTTGACATGGATTATTTAAGAAATATCATATTATATCTTAGCTTTTCTGGGGGATTTTTATTATTCTATTGTCTACGTCATACCATGATGGGACGCTTTTTAAAATTTCTACTTTTGAAACCGGCATCCGTAATCTGGGTAATTATGCCGTTTGCTGTCAGAAAAATGATTTCAGAAACAATTCTTTGGTTCTTATTTGAGAGGCATTGTATTTATCAAGTCGTTTATTTAAGCTGTCTTGTTTTTGGACATTATATATTGATAATGGATGTTATAACTGTGCTCTATCGGTATTCCTGGTTAGAGAATAATCTGTTTCTTGGATCTGGATGTTTATTCCTTAATGGTGTGTTGTATATGTTGTTGTGTTTTAGTGATCCAGGTTTTATAACATCACGAAATAAGTCAGTTTATGCAAATATTTATGAATACGATAATT                                                                                                                ]
[+] EMBL CD117118             [GCATGATATCTATGGATCTTGGAAATTTGAAGATTTCTACTGTTAGTTGAGCTAATCTGATATCGTCTTTGACATGGATTATTTAAGAAATATCATATTATATCTTAGCTTTTCTGGGGGATTTTTATTATTCTATTGTCTACGTCATACCATGATGGGACGCTTTTTAAAATTTCTACTTTTGAAACCGGCATCCGTAATCTGGGTAATTATGCCGTTTGCTGTCAGAAAAATGATTTCAGAAACAATTCTTTGGTTCTTATTTGAGAGGCATTGTATTTATCAAGTCGTTTATTTAAGCTGTCTTGTTTTTGGACATTATATATTGATAATGGATGTTATAACTGTGCTCTATCGGTATTCCTGGTTAGAGAATAATCTGTTTCTTGGATCTGGATGTTTATTCCTTAATGGT                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD083195             [                         ggccAAGATTTCTACTGTTAGTTGAGCTAATCTGTTATCGTCTTTGACATGGCTTATTTAAGAAATATCATATTATATCTTAGCTTTTCTGGGGGATTTTTATTATTCTATTGTCTACGTCATACCATGATGGGACGCTTTTTAAAATTTCTACTTTTGAAACCGGCATCCGTAATCTGGGTAATTATGCCGTTTGCTGTCAGAAAAATGATTTCAGAAACAATTCTTTGGTTCTTATTTGAGAGGCATTGTATTTATCAAGTCGTTTATTTAAGCTGTCTTGTTTTTGGACATTATATATTGATAATGGATGTTATAACTGTGCTCTATCGGTATTCCTGGTTAGAGAATAATCTGTTTCTTGGATCTGGATGTTTATTCCTTAATGGTGTGTTGTATATGTTGTTGTGTTTTAGTGATCCAGGTTTTATAACATCACGAAATAAGTCAGTTTATGCAAATATTTATGAATACGATAATTTTATTTATTCACCTAAACAATGCACAATATGCTGTCATATAATTCCAGCTAGATCTAAACATTGTTCTCGATGTGACCATTGCATATTTCGATTTGATCATCACTGTGTTTG]


>consensus_5991#0 GCATGATATCTATGGATCTTGGAAATTTGAAGATTTCTACTGTTAGTTGAGCTAATCTGA TATCGTCTTTGACATGGATTATTTAAGAAATATCATATTATATCTTAGCTTTTCTGGGGG ATTTTTATTATTCTATTGTCTACGTCATACCATGATGGGACGCTTTTTAAAATTTCTACT TTTGAAACCGGCATCCGTAATCTGGGTAATTATGCCGTTTGCTGTCAGAAAAATGATTTC AGAAACAATTCTTTGGTTCTTATTTGAGAGGCATTGTATTTATCAAGTCGTTTATTTAAG CTGTCTTGTTTTTGGACATTATATATTGATAATGGATGTTATAACTGTGCTCTATCGGTA TTCCTGGTTAGAGAATAATCTGTTTCTTGGATCTGGATGTTTATTCCTTAATGGTGTGTT GTATATGTTGTTGTGTTTTAGTGATCCAGGTTTTATAACATCACGAAATAAGTCAGTTTA TGCAAATATTTATGAATACGATAATTTTATTTATTCACCTAAACAATGCACAATATGCTG TCATATAATTCCAGCTAGATCTAAACATTGTTCTCGATGTGACCATTGCATATTTCGATT TGATCATCACTGTGTTTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)