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Schistosoma mansoni
cluster # 6009 cluster # 6009       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6009#0 length = 744 sequences # 4  

consensusID : consensus_6009#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 744
fasta sequence
                              [TGTTGATGTGAATAAACCTGTAGAACCAAAGTCCACAACTAGTAATGGCGATTTGATCGATGATGCACAATCAGATGGTGCTCTTAAACTTGCAACTGTGCTTCTCCAAGCAGCTGTTAATGGAATATACGATATGAATATGGCAATCACACCTCTAGGATTAGAGTCCAGAAATGGGATCAGTAGTAACTCAGTTCGACTACCCGGGCTAAGACAACGTTTAGAAAGAAAAGAAGGTCTCTTCCGTATGCACATGATGGGAAAACGTGTTAATTTCGCATGCCGTTCTGTTATTAGTCCGGATCCAAATCTTAGTGTTACTGAAGTTGGAGTACCGTTATTTTTCGCATTCCGTTTAACATTCCCAACACCAGTAACAAAATTCAATTTAGTTCATTTACGTCAATTAGTAATGAATGGACCAAATAACTATCCAGGCGCTACAAGTATTCAATTTTCAAATGGTGTCATTACTATGCTGCCACAGAATGATACTCCCCAGGCTAAAAAGAAACGTGAAATGTTAGCTTTACGGTTAAAACCACTTATATCGGGTAAAGATAACATACCTATCGTTGTTAATCGTCATCTACTTGATGGTGATATGCTTATTATGAACAGACAACCTACCCTTCATCGGCCTTCAATGCAAGCACATCGTGTTCGAATAATAAAGTGTGTTGGAGCAAAAACCCTTCGATTACATTATTCAAATTGTACAGCTTACAATGCAGATTTCGATGG]

[+] EMBL CD154071             [TGTTGATGTGAATAAACCTGTAGAACCAAAGTCCACAACTAGTAATGGCGATTTGATCGATGATGCACAATCAGATGGTGCTCTTAAACTTGCAACTGTGCTTCTCCAAGCAGCTGTTAATGGAATATACGATATGAATATGGCAATCACACCTCTAGGATTAGAGTCCAGAAATGGGATCAGTAGTAACTCAGTTCGACTACCCGGGCTAAGACAACGTTTAGAAAGAAAAGAAGGTCTCTTCCGTATGCACATGATGGGAAAACGTGTTAATTTCGCATGCCGTTCTGTTATTAGTCCGGATCCAAATCTTAGTGTTACTGAAGTTGGAGTACCGTTATTTTTCGCATTCCGTTTAACATTCCCAACACCAGTAACAAAATTCAATTTAGTTCATTTACGTCAATTAGTAATGAATGGACCAAATAACTATCCAGGCGCTACAAGTATTCAATTTTCAAATGGTGTCATTACTATGCTGCCACAGAATGATACTCCCCAGGCTAAAAGCGACCGTGAAATGTTAGCTTTACGGTTAANACCACTT                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD120501             [                                                                                                                                        AATATGGCAATCACACCTCTAGGATTAGAGTCCAGAAATGGGATCAGTAGTAACTCAGTTCGACTACCCGGGCTAAGACAACGTTTAGAAAGAAAAGAAGGTCTCTTCCGTATGCACATGATGGGAAAACGTGTTAATTTCGCATGCCGTTCTGTTATTGGTCCGGATCCAAATCTTAGTGTTACTGAAGTTGGAGTACCGTTATTTTTCGCATTCCGTTTAACATTCCCAACACCAGTAACAAAATTCAATTTAGTTCATTTACGTCAATTAGTAATGAATGGACCAAATAACTATCCAGGCGCTACAAGTATTCAATTTTCAAATGGTGTCATTACTATGCTGCCACAGAATGATACTCCCCAGGCTANAAAGAAACGTGAAATGTTAGCTTTACGGGTTAAACCACTTATATCGGGTAAAGAT ACATACCT                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD153745             [                                                                                                                                                                                        AGTAACTCAGTTCGACTACCCGGGCTAAGACAACGTTTAGAAAGAAAAGAAGGTCTCTTCCGTATGCACATGATGGGAAAACGTGTTAATTTCGCATGCCGTTCTGTTATTAGTCCGGATCCAAATCTTAGTGTTACTGAAGTTGGAGTACCGTTATTTTTCGCATTCCGTTTAACATTCCCAACACCAGTAACAAAATTCAATTTAGTTCATTTACGTCAATTAGTAATGAATGGACCAAATAACTATCCAGGCGCTACAAGTATTCAATTTTCAAATGGTGTCATTACTATGCTGCCACAGAATGATACTCCCCAGGCTAAAAAGAAACGTGAAATGTTAGCTTTACGGTTAAAACCACTTATATCGGGTAAAGATAACATACCTATCGTTGTTAATCGTCATCTACTTGATGGTGATATGCTTATTATGAACAGACAACCTACCCTTCATCGGCCTTCAATGCAAGCACATCGTGTTCGAATAATAAAGTGTGTTGGAGCAAAAACCCTTCGATTACATTATTCAAATTGTACAGCTTACAATGCAGATTTCGATGG]
[+] EMBL CD154063             [                                                                                                                                                                                        AGTAACTCAGTTCGACTACCCGGGCTAAGACAACGTTTAGAAAGAAAAGAAGGTCTCTTCCGTATGCACATGATGGGAAAACGTGTTAATTTCGCATGCCGTTCTGTTATTAGTCCGGATCCAAATCTTAGTGTTACTGAAGTTGGAGTACCGTTATTTTTCGCATTCCGTTTAACATTCCCAACACCAGTAACAAAATTCAATTTAGTTCATTTACGTCAATTAGTAATGAATGGACCAAATAACTATCCAGGCGCTACAAGTATTCAATTTTCAAATGGTGTCATTACTATGCTGCCACAGAATGATACTCCCCAGGCTAAAAAGAAACGTGAAATGTTAGCTTTACGGTTAAAACCACTTATATCGGGTAAAGATAACATACCTATCGTTGTTAATCGTCATCTACTTGATGGTGATATGCTTATTATGAACAGACAACCTACCCTTCATCGGCCTTCAATGCAAGCACATCGTGTTCGAATAATAAAGTGTGTTGGAGCANAAACCCTCCGATTACATTATTCANATTGTAAAGCTTACAATGCAGATTTCGATGG]


>consensus_6009#0 TGTTGATGTGAATAAACCTGTAGAACCAAAGTCCACAACTAGTAATGGCGATTTGATCGA TGATGCACAATCAGATGGTGCTCTTAAACTTGCAACTGTGCTTCTCCAAGCAGCTGTTAA TGGAATATACGATATGAATATGGCAATCACACCTCTAGGATTAGAGTCCAGAAATGGGAT CAGTAGTAACTCAGTTCGACTACCCGGGCTAAGACAACGTTTAGAAAGAAAAGAAGGTCT CTTCCGTATGCACATGATGGGAAAACGTGTTAATTTCGCATGCCGTTCTGTTATTAGTCC GGATCCAAATCTTAGTGTTACTGAAGTTGGAGTACCGTTATTTTTCGCATTCCGTTTAAC ATTCCCAACACCAGTAACAAAATTCAATTTAGTTCATTTACGTCAATTAGTAATGAATGG ACCAAATAACTATCCAGGCGCTACAAGTATTCAATTTTCAAATGGTGTCATTACTATGCT GCCACAGAATGATACTCCCCAGGCTAAAAAGAAACGTGAAATGTTAGCTTTACGGTTAAA ACCACTTATATCGGGTAAAGATAACATACCTATCGTTGTTAATCGTCATCTACTTGATGG TGATATGCTTATTATGAACAGACAACCTACCCTTCATCGGCCTTCAATGCAAGCACATCG TGTTCGAATAATAAAGTGTGTTGGAGCAAAAACCCTTCGATTACATTATTCAAATTGTAC AGCTTACAATGCAGATTTCGATGG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)