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Schistosoma mansoni
cluster # 6028 cluster # 6028       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6028#0 length = 641 sequences # 4  

consensusID : consensus_6028#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 641
fasta sequence
                              [TGACGTGAGTCTCAACGGTGTTTGTTTTTTCCTCTGATATTCTGTAAGTGGCTTGTTGATT-TGCAGATTACAACTGGTATTTAAATGAGTTGTAATCCATTGATGGTCACCTATGTTGTCT-GTCCCCGATGTGTGGGGGTGAAAGCAAACGTGATTGGTCAGTGAGGGTGGCCAAACAGGAACTCAGCTTACGAACTATTTTCCCCCATTTGACAACCGATTCGCTCTATTATGATTGAACTGTTTGCAGTAATCACTCATAGATTGGTTTGGAAGTGGTTTAATTTTTCTCACAGAATTTAATTATGTCACTATAATCTGTATGTATGATGAGT-TTCATTCTTCAAACATCGATTAGTATCAGAATGTGTTCTTTGAGTAAAGCAATTCTGGACATCTGACCTGTTGGTGACAGGGAAATACAGTCAGGCTATTATGAATAACAGAGTTGTATTTACTTGTATGCACCAATGCCGTAGTAGAAGAAACACAATGTTTTCACCCAGCTTTTGTCTTCTATAACTCTGTGTAATTCGGTTGGTTAAATATAGAAGTGTATGTTGATAACTGAATTGGACAGCAACACACGAAAGTCATCACCACTGCTGAACTATTCAAGTAAAGTATCCTGTGCTTTCCAC]

[+] EMBL CD085576             [TGACGTGAGTCTCAACGGTGTTTGTTTTTTCCTCTGATATTCTGTAAGTGGCTTGTTGATT TGCAGATTACAACTGGTATTCAAATGAGTTGTAATCCATTGATGGTCACCTATGTTGTCT GTCCCCGATGTGTGGGGGTGAAAGCAAACGTGATTGGTCAGTGAGGGTGGCCAAACAGGAACTCAGCTTACGAACTATTTTCCCCCATTTGACAACCGATTCGCTCTATTATGATTGAACTGTTTGCAGTAATCACTCATAGATTGGTTTGGAAGTGGTTTAATTTTTCTCACAGAATTTAATTATGTCACTATAATCTGTATGTATGATGAGT TTCATTCTTCAAACATCGATTAGTATCAGAATGTGTTCTTTGAGTAAAGCAATTCTGGACATCTGACCTGTTGGTGACAGGGAAATACAGTCAGGCTATTATGAATAACAGAGTTGTATTTACTTGTATGCACCAATGCCGTAGTAGAAGAAACACAATGTTTGCACCCAGCTTTTGTCTCTTATAACTCTGTGTAATTCGGTTGGTTAAATATAGAAGTGTATGTTGATAACTGAATTGGACAGNCACACACGANAGTCATCACCACTGCTGAACTATTCNAGTA                    ]
[+] EMBL CD085425             [TGACGTGAGTCTCAGCGGTGTTTGTTTTTTCCTCTGATATTCTGTAAGTGGCTTGTTGATT TGCAGATTACAACTGGTATTTAAATGAGTTGTAATCCATTGATGGTCACCTATGTTGTCT GTCCCCGACGTGTGGGGGTGAAAGCAAACGTGATTGGTCAGTGAGGGTGGCCAAACAGGAACTCAGCTTACGAACTATTTTCCCCCATTTGACAACCGATTCGCTCTATTATGATTGAACTGTTTGCAGTAATCACTCATAGATTGGTTTGGAAGTGGTTTAATTTTTCTCACAGAATTTAATTATGTCACTATAATCTGTATGTATGATGAGTCTTCATTCTTCAAACATCGATTAGTATCAGAATGTGTTCTTTGAGTAAAGCAATTCTGGA                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD085573             [                                                     TGTTGATTNTGCAGATTACAACTGGTATTTAAATGAGTTGTAATCCATTGATGGTCACCTATG TGTCTGGTCNCCGATGTGTGNGGGTGAAAGCAAACGTGATTGGTCAGTGAGGGTGGCCAAACAGGAACTCAGCTTACGAACTATTTTCCCCCATTTGACAACCGATTCGCTCTATTATGATTGAACTGTTTGCAGTAATCACTCATAGATTGGTTTGGAAGTGGTTTAATTTTTCTCACAGAATTTAATTATGTCACTATAATCTGTATGTATGATGAGT TTCATTCTTCAAACATCGATTAGTATCAGAATGTGTTCTTTGAGTAAAGCAATTCTGGACATCTGACCTGTTGGTGACAGGGAAATACAGTCAGGCTATTATGAATAACAGAGTTGTATTTACTTGTATGCACCAATGCCGTAGTAGAAGAAACACAATGTTTTCACCCAGCTTTTGTCTTCTATAACTCTGTGTAATTCGGTTGGTTAAATATAGAAGTGTATGTTGATAACTGAATTGGACAGCAACACACGAAAGTCATCACCACTGCTGAACTATTCAAGTAAAGTATCCTGTGCTTTCCAC]
[-] EMBL CD085596             [                                                                                                            CACCTATGNTGTCT GTCNCCGATGTGTGGGGGTGAAAGCAAACGTGATTGGTCAGTGAGGGTGGCCAAACAGGAACTCAGCTTACGAACTATTTTCCCCCATTTGACAACCGATTCGCTCTATTATGATTGAACTGTTTGCAGTAATCACTCATAGATTGGTTTGGAAGTGGTTTAATTTTTCTCACAGAATTTAATTATGTCACTATAATCTGTATGTATGATGAGT TTCATTCTTCAAACATCGATTAGTATCAGAATGTGTTCTTTGAGTAAAGCAATTCTGGACATCTGACCTGTTGGTGACAGGGAAATACAGTCAGGCTATTATGAATAACAGAGTTGTATTTACTTGTATGCACCAATGCCGTAGTAGAAGAAACACAATGTTTTCACCCAGCTTTTGTCTTCTATAACTCCGTGTAATTCGGTTGGTTAAATATAGAAGTGTATGTTGATAACTGAATTGGACAGCAACACACGAAAGTCATCACCACTGCTGAACTATTCAAGTAAAGTATCCTGTGCTTTCCAC]


>consensus_6028#0 TGACGTGAGTCTCAACGGTGTTTGTTTTTTCCTCTGATATTCTGTAAGTGGCTTGTTGAT TTGCAGATTACAACTGGTATTTAAATGAGTTGTAATCCATTGATGGTCACCTATGTTGTC TGTCCCCGATGTGTGGGGGTGAAAGCAAACGTGATTGGTCAGTGAGGGTGGCCAAACAGG AACTCAGCTTACGAACTATTTTCCCCCATTTGACAACCGATTCGCTCTATTATGATTGAA CTGTTTGCAGTAATCACTCATAGATTGGTTTGGAAGTGGTTTAATTTTTCTCACAGAATT TAATTATGTCACTATAATCTGTATGTATGATGAGTTTCATTCTTCAAACATCGATTAGTA TCAGAATGTGTTCTTTGAGTAAAGCAATTCTGGACATCTGACCTGTTGGTGACAGGGAAA TACAGTCAGGCTATTATGAATAACAGAGTTGTATTTACTTGTATGCACCAATGCCGTAGT AGAAGAAACACAATGTTTTCACCCAGCTTTTGTCTTCTATAACTCTGTGTAATTCGGTTG GTTAAATATAGAAGTGTATGTTGATAACTGAATTGGACAGCAACACACGAAAGTCATCAC CACTGCTGAACTATTCAAGTAAAGTATCCTGTGCTTTCCAC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)