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Schistosoma mansoni
cluster # 6142 cluster # 6142       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6142#0 length = 789 sequences # 4  

consensusID : consensus_6142#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 789
fasta sequence
                              [TTAAAGTTTAACTTTAGAGGTTCTAGTTACGAAGTTTATAAAACCTGATAGAACCTCCAGAGAAAAAAAACACTAAAGCACTTATTTTCTTTTCTTATGATGTACCACTTGAACGCTTGTTATTTCTATTATTAAAAGGGTGTATATTCAAAGTTTTTTAGAGTAAAGTGGTTAAATTGGAAAACAATACGGTGAGGTGAGGTAGGTAGTGCAAAGGAATACAGGAATACAATATCGATTTTATCCGGTCAGATATATTTAATTTGATGGGACAAGTTCCAAGTGAAGTGGTTCATTTGACTCAACTAATAATCTCCACTCCTAAGAAAAACTAACAATGATACAGATCTTATTTTAAGATAGAAAAATAATTATACTTTTACGAACTGAAAATTAATAAAGTATGTTTTTGAGCAACTAATTAGACCATCTATTTCGGTAAACTAGTTCAACTGATCAATTCTCAATAGAAATTTATAATAATACTATCTAACTAATACAATATGTTGCCGACCTCGGTTTTATCAGAATGAGAAGTGAGCAAACGATTATCACAGATGGTAAGTTAAATGATTTAGGAATTTATTATGATACTCATTTGTCAAATAAGTGAGTATTTGTTCTTCAATAAATTAAAACCATTTGAAATGGGACATTATCAAATGGTACTTAGTTAACTTAGTTATGATCTCAAAAACAGGAAAGAAAATATGTTCATAATAATTGCACAAATAAGAATTTTATCTCACTTTACATGAAGGAAACAACTAAGATTTATTGAAAAAGGAG]

[+] EMBL CD140367             [TTAAAGTTTAACTTTAGAGGTTCTAGTTACGAAGTTTATAAAACCTGATAGAACCTCCAGAGAAAAAAAACACTAAAGCACTTATTTTCTTTTCTTATGATGTACCACTTGAACGCTTGTTATTTCTATTATTAAAAGGGTGTATATTCAAAGTTTTTTAGAGTAAAGTGGTTAAATTGGAAAACAATACGGTGAGGTGAGGTAGGTAGTGCAAAGGAATACAGGAATACAATATCGATTTTATCCGGTCAGATATATTTAATTTGATGGGACAAGTTCCAAGTGAAGTGGTTCATTTGACTCAACTAATAATCTCCACTCCTAAGAAAAACTAACAATGATACAGATCTTATTTTAAGATAGAAAAATAATTATACTTTTACGAACTGAAAATTAATAAAGTATGTTTTTGAGCAACTAATTAGACCATCTATTTCGGTAAACTAGTTCAACTGATCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD140454             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TATTTTAAGATAGAAAAATAATTATACTTTTACGAACTGAAAATTAATAAAGTATGTTTTTGAGCAACTAATTAGACCATCTATTTCGGTAAACTAGTTCAACTGATCAATTCTCAATAGAAATTTATAATAATACTATCTAACTAATACAATATGTTGCCGACCTCGGCTTTATCAGAATGAGAAGTGAGCAAACGATTATCACAGATGGTAAGTTAAATGATTTAGGAATTTATTATGATACTCATTTGTCAAATAAGTGAGTATTTGTTCTTCAATAAATTAAAACCATTTGAAATGGGACATTATCAAATGGTACTTAGTTAACTTAGTTATGATCTCAAAAACAGGAAAGAAAATATGTTCATAATAATTGCACAAATAAGAATTTTATCTCACTTTACGTGAAGGAAACAACTAAGATTTATTGAAAAAGGAG]
[-] EMBL CD140370             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATTTTAAGATAGAAAAATAATTATACTTTTACGAACTGAAAATTAATAAAGTATGTTTTTGAGCAACTAATTAGACCATCTATTTCGGTAAACTAGTTCAACTGATCAATTCTCAATAGAAATTTATAATAATACTATCTAACTGATACAATATGTTGCCGACCTCGGTTTTATCAGAATGAGAAGTGAGCAAACGATTATCACAGATGGTAAGTTAAATGATTTAGGAATTTATTATGATACTCATTTGTCAAATAAGTGAGTATTTGTTCTTCAATAAATTAAAACCATTTGAAATGGGACATTATCAAATGGTACTTAGTTAACTTAGTTATGATCTCAAAAACAGGAAAGAAAATATGTTCATAATAATTGCACAAATAAGAATTTTATCTCACTTTACATGAAGGAAACAACTAAGATTTATTGAAAAAGGAG]
[-] EMBL CD140341             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CAACTGATCAATTCTCAATAGAAATTTATAATAATACTATCTAACTAATACAATATGTCGCCGACCTCGGTTTAATCAGAATGAGAAGTGAGCAAACGATTATCACAGATGGTAAGTTAAATGATTTAGGAATTTATTATGATACTCATTTGTCAAATAAGTGAGTATTTGTTCTTCAATAAATTAAAACCATTTGAAATGGGACATTATCAAATGGTACTTAGTTAACTTAGTTATGATCTCAAAAACAGGAAAGAAAATATGTTCATAATAATTGCACAAATAAGAATTTTATCTCACTTTACATGAAGGAAACAACTAAGATTTATTGAAAAAGGAG]


>consensus_6142#0 TTAAAGTTTAACTTTAGAGGTTCTAGTTACGAAGTTTATAAAACCTGATAGAACCTCCAG AGAAAAAAAACACTAAAGCACTTATTTTCTTTTCTTATGATGTACCACTTGAACGCTTGT TATTTCTATTATTAAAAGGGTGTATATTCAAAGTTTTTTAGAGTAAAGTGGTTAAATTGG AAAACAATACGGTGAGGTGAGGTAGGTAGTGCAAAGGAATACAGGAATACAATATCGATT TTATCCGGTCAGATATATTTAATTTGATGGGACAAGTTCCAAGTGAAGTGGTTCATTTGA CTCAACTAATAATCTCCACTCCTAAGAAAAACTAACAATGATACAGATCTTATTTTAAGA TAGAAAAATAATTATACTTTTACGAACTGAAAATTAATAAAGTATGTTTTTGAGCAACTA ATTAGACCATCTATTTCGGTAAACTAGTTCAACTGATCAATTCTCAATAGAAATTTATAA TAATACTATCTAACTAATACAATATGTTGCCGACCTCGGTTTTATCAGAATGAGAAGTGA GCAAACGATTATCACAGATGGTAAGTTAAATGATTTAGGAATTTATTATGATACTCATTT GTCAAATAAGTGAGTATTTGTTCTTCAATAAATTAAAACCATTTGAAATGGGACATTATC AAATGGTACTTAGTTAACTTAGTTATGATCTCAAAAACAGGAAAGAAAATATGTTCATAA TAATTGCACAAATAAGAATTTTATCTCACTTTACATGAAGGAAACAACTAAGATTTATTG AAAAAGGAG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)