Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 6152 cluster # 6152       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6152#0 length = 619 sequences # 4  

consensusID : consensus_6152#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 619
fasta sequence
                              [TTACATGGAAATAAATTTGATGCTGCAGATCGTCAATTCTATTCTATCCCAAAAGCATGGCGTTTTATATTAGATAATCCAAATGATAATAAGGAGTTAATTCCGGAATTCTTCTTTTTACCCGAATTTCTACGAAACAGTAATAATTTTGACTTAGGCTTTCGTCAATACAATCAAAATCGAATCAATGATGTGGAATTACCGAATTGGGCTTCATCACCAGAAGAATTTATACGTAAACATCGTGCTGCATTGGAATCTGACTATGTTTCAGCACATTTACACTTATGGATAGATTTAATTTTTGGTTGTAAACAACGTGGTCCAGATGCTGTGAATGCATTGAATGTATTCAATTTTGTAACATATGAAGGTGCTGTAGATTTAGATAAGATTACTAATTCCTATGAACGTGAAGCATTCGAAAGTATGATACAAAATTTTGGACAAACTCCAAGTCAATTACTTAAAGAACCACATCCAAAACGTTTAACTTATTCTGAATGGTTATCTCTATTATATCATCAATATAGATTACCTGTTATTAGTTTATTAACTCTAGCTAATTATAAAAATGATAAATCAATAAAAAAACAGAAATCAATTACCCAATTCACAT]

[+] EMBL CD154287             [TTACATGGAAATAAATTTGATGCTGCAGATCGTCAATTCTATTCTATCCCAAAAGCATGGCGTTTTATATTAGATAATCCAAATGATAATAAGGAGTTAATTCCGGAATTCTTCTTTTTACCCGAATTTCTACGAAACAGTAATAATTTTGACTTAGGCTTTTGTCAATACAATCAAAATCGAATCAATGATGTGGAATTACCGAATTGGGCTTCATCACCAGAAGAATTTATACGTAAACATCGTGCTGCATTGGAATCTGACTATGTTTCAGCACATTTACACTTATGGATAGATTTAATTTTTGGTTGTAAACAACGTGGTCCAGATGCTGTGAATGCATTGAATGTATTCAATTTTGTAACATATGAAGGTGCTGTAGATTTAGATAAGATTACTAATTCCTATGAACGTGAAGCATTCGAAAGTATGATACAAAATTTTGGACAAACTCCAAGTCAATTACTTAAAGAACCACATCCAAAACGTTTAACTTATTCTGAATGGTTATCTCTATTATATCATCAATATAGATTACCTGTTATTAGTTTATTAACTCTAGCTAATTATAANAATGANTAATCAATANAAAAACAGAAATCAATTACCCAA       ]
[+] EMBL CD117172             [                                                                                                tacgTTCCGGAATTCTTCTTTTTACCCGAATTTCTACGAAACAGTAATAATTTTGACTTAGGCTTTCGTCAATACAATCAAAATCGAATCAATGATGTGGAATTACCGAATTGGGCTTCATCACCAGAAGAATTTATACGTAAACATCGTGCTGCATTGGAATCTGACTATGTTTCAACACATTTACACTTATGGATAGATTTAATTTTTGGTTGTAAACAACGTGGTCCAGATGCTGTGAATGCATTGAATGTATTCAATTTTGTAACATATGAAGGTGCTGTAGATTTAGATAAGATTACTAATTCCTATGAACGTGAAGCATTCGAAAGTATGATACAAAATTTTGGACAAACTCCAAGTCAATTACTTAAAGAACCACATCCAAAACGTTTAACTTATTCTGAATGGTTATCTCTATTATATCATCAATATAGATTACCTGGTATTAGTTTATTAACTCTAGC                                                        ]
[-] EMBL CD117060             [                                                                                                               TTCTTTTTACCCGAATTTCTACGAAACAGTAATAATTTTGACTTAGGCTTTCGTCAATACAATCAAAATCGAATCAATGATGTGGAATTACCGAATTGGGCTTCATCACCAGAAGAATTTATACGTAAACATCGTGCTGCATTGGAATCTGACTATGTTTCAGCACATTTACACTTATGGATAGATTTAATTTTTGGTTGTAAACAACGTGGTCCAGATGCTGTGAATGCATTGAATGTATTCAATTTTGTAACATATGAAGGTGCTGTAGATTTAGATAAGATTACTAATTCCTATGAACGTGAAGCATTCGAAAGTATGATACAAAATTTTGGACAAACTCCAAGTCAATTACTTAAAGAACCACATCCAAAACGTTTAACTTATTCTGAATGGTTATCTCTATTATATCATCAATATAGATTACCTGTTATTAGTTTATTAACTCTAGCTAATTATAAAAATGATAAATCAATAAAAAAACAGAAATCAATTACCCAATTCACAT]
[-] EMBL CD116729             [                                                                                                               TTCTTTTTACCCGAATTTCTACGAAACAGTAATAATTTTGACTTAGGCTTTCGTCAATACAATCAAAATCGAATCAATGATGTGGAATTACCGAATTGGGCTTCATCACCAGAAGAATTTATACGTAAACATCGTGCTGCATTGGAATCTGACTATGTTTCAGCACATTTACACTTATGGATAGATTTAATTTTTGGTTGTAAACAACGTGGTCCAGATGCTGTGAATGCATTGAATGTATTCAATTTTGTAACATATGAAGGTGCTGTAGATTTAAATAAGATTACTAATTCCTATGAACGTGAAGCATTCGAAGGTATGATACAAAATTTTGGACAAACTCCAAGTCAATTACTTAAAGAACCACATCCAAAACGTTTAACTTATTCTGAATGGTTATCTCTATTATATCATCAATATAGATTACCTGTTATTAGTTTATTAACTCTAGCTAATTATAAAAATGATAAATCAATAAAAAAACAGAAATCAATTACCCAATTCACAT]


>consensus_6152#0 TTACATGGAAATAAATTTGATGCTGCAGATCGTCAATTCTATTCTATCCCAAAAGCATGG CGTTTTATATTAGATAATCCAAATGATAATAAGGAGTTAATTCCGGAATTCTTCTTTTTA CCCGAATTTCTACGAAACAGTAATAATTTTGACTTAGGCTTTCGTCAATACAATCAAAAT CGAATCAATGATGTGGAATTACCGAATTGGGCTTCATCACCAGAAGAATTTATACGTAAA CATCGTGCTGCATTGGAATCTGACTATGTTTCAGCACATTTACACTTATGGATAGATTTA ATTTTTGGTTGTAAACAACGTGGTCCAGATGCTGTGAATGCATTGAATGTATTCAATTTT GTAACATATGAAGGTGCTGTAGATTTAGATAAGATTACTAATTCCTATGAACGTGAAGCA TTCGAAAGTATGATACAAAATTTTGGACAAACTCCAAGTCAATTACTTAAAGAACCACAT CCAAAACGTTTAACTTATTCTGAATGGTTATCTCTATTATATCATCAATATAGATTACCT GTTATTAGTTTATTAACTCTAGCTAATTATAAAAATGATAAATCAATAAAAAAACAGAAA TCAATTACCCAATTCACAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)