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Schistosoma mansoni
cluster # 6227 cluster # 6227       Sequences # 4       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6227#0 length = 1361 sequences # 4  
consensusID : consensus_6227#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1361
fasta sequence 
                              [AAGAGCTGAAATTTTGGCAGCTCGTGCATGTAAACAGCCTCAAGAATCTGTCTTCGATAACAGTGAACCTGTTGGTGCTAATTATAAACGACCAGATGTTCAGTCGGAAATTCGTTCTATTAAAGCCGCGAATAATTCAAATACTTTATCATCAACAAATGAAAAGTCTGATATTAATAATAATTTAAATAGTCAAGACCAGTTATCATATCAAAATGGTTATCATCATCATCAGTGCTCTTTACAACAATCCCAACAACAAACCACATCACCTCCTTTTTCTTTATCGCCAATAGCAGATATTTCAAATAATCAAAGAAACTCTAACATTGAGCAACAGTTAAACAATGGTAACAATAATATTTATCATCAAAACTCAGTTTCACCACAGAATTCAATGTATAAACTAGCTTCATCATGTATTGATTCATCGCCTAACACGGAAGTGCACAATAAAAGAAATTCAAATCTTAAAGCTGTTTGTCTATATGATTATAACGCTAATGAAGATGATGAATTATCATTTCGTGCCAAAGA-ACATATATTTGACATTGAACAAATTGATGAAGGTTGGTGGCTTGGTCGAAATGCTGATGGACAAGTTGGATTGTTTCCAGCTAATTATGTTAAATTAATGATGTAAAAAGCTGATGAAAAGCAAAAAATATAAATGTAGTTCTTTGATAATTTAGTTTATAAAAACAAACAAACACAT-ACTATATANTGGTTGCANGTTNTGGTGTTCGTTTCTAATTTATTCATACAAGGCAAAATGGATACAGTTGTATTCTCCTCATATCAATTCAGAGTATAAAACATGTTNTTCTTTTATTTTATGGAGTTATCATTTATATTACCATCAATGATGNTACTTTGACTGTTATTATGTAACTGATTTGTTGTTGCTTCCCAGTTCTCTTAATACACATCAATGAAGAATTGTTACAACGAATACTAAAATGAAACACATCATAGACATACATTTTTAACTTCCTTATTGAATTTATTTCATTACTAACTTTCATATGATTTTTCATTGTTTATTCTTATCTTCTATGAGTTATTTAACTTTGTGATCACCATATAGTTTGATGCACAACTTAATTTCTAGGTATATATTTCACTTGTGTAGATTTTTTTTTATTTATATCCACATATATGGCCATACTTATGTTGACGGTTTTTTTCTTTTTTCATACTTCAATAATTTATACTCACTAAATGAAACATAAACGGATCATAAACAAAACCATTAGTGTTTCTATTAAGAAACATTGATAGTTTGGTAGTTTCATTTTTCGCATTGTTTTTCAGCTTGTATTTAATTTTTGTTCCAAATTCACTTGTGTATACGACNTATA]

[+] EMBL AA756899             [AAGAGCTGAAATTTTGGCAGCTCGTGCATGTAAACAGCCTCAAGAATCTGTCTTCGATAACAGTGAACCTGTTGGTGCTAATTATAAACGACCAGATGTTCAGTCGGAAATTCGTTCTATTAAAGCCGCGAATAATTCAAATACTTTATCATCAACAAATGAAAAGTCTGATATTAATAATAATTTAAATAGTCAAGACCAGTTATCATATCAAAATGGTTATCATCATCATCAGTGCTCTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD079397             [                                                                                                                                                                                   gaggTTTAAATAGTCAAGACCAGTTATCATATCAAAATGGTTATCATCATCATCAGTCGTCTTTACAACAATCCCAACAACAAACCACATCACCTCCTTTTTCTTTATCGCCAATAGCAGATATTTCAAATAATCAAAGAAACTCTAACATTGAGCAACAGTTAAACAATGGTAACAATAATATTTATCATCAAAACTCAGTTTCACCACAGAATTCAATGTATAAACTAGCTTCATCATGTATTGATTCATCGCCTAACACGGAAGTGCACAATAAAAGAAATTCAAATCTTAAAGCTGTTTGTCTATATGATTATAACGCTAATGAAGATGATGAATTATCATTTCGTGCCAAAGA ACATATATTTGACATTGAACAAATTGATGAAGGTTGGTGGCTTGGTCGAAATGCTGATGGACAAGTTGGATTGTTTCCAGCTAATTATGTTAAATTAATGATGTAAAAAGCTGATGAAAAGCAAAAAATATAAATGTAGTTCTTTGATAATTTAGTTTATAAAAACAAACAAACACAT ACTATATANTGGTTGCANGTTNTGGTGTTCGTTTCTAATTTATTCATACAAGGCAAAATGGATACAGTTGTATTCTCCTCATATCAATTCAGAGTATAAAACATGTTNTTCTTTTATTTTATGGAGTTATCATTTATATTACCATCAATGATGNTACTTTGACTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD063959             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AATAAAAGAAATTCAAATCTTAAAGCTGTTTGTCTATATGATTATAACGCTAATGAAGATGATGAA TATCATTTCGTGCCAAAGANACATATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD073672             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TAAAAACAAACAAACACATNNCTATATA TGGTTGCA GTT TTGTGTTCGTTTCTAATTTATTCATACAAGGCAAAATGGATACAGTTGTATTCTCCTCATATCAATTCAGAGTATAAAACATGTTTTTCTTTTATTTTATGGAGTTATCATTTATATTACCATCAATGATGTTACTTTGACTGTTATTATGTAACTGATTTGTTGTTGCTTCCCAGTTCTCTTAATACACATCAATGAAGAATTGTTACAACGAATACTAAAATGAAACACATCATAGACATACATTTTTAACTTCCTTATTGAATTTATTTCATTACTAACTTTCATATGATTTTTCATTGTTTATTCTTATCTTCTATGAGTTATTTAACTTTGTGATCACCATATAGTTTGATGCACAACTTAATTTCTAGGTATATATTTCACTTGTGTAGATTTTTTTTTATTTATATCCACATATATGGCCATACTTATGTTGACGGTTTTTTTCTTTTTTCATACTTCAATAATTTATACTCACTAAATGAAACATAAACGGATCATAAACAAAACCATTAGTGTTTCTATTAAGAAACATTGATAGTTTGGTAGTTTCATTTTTCGCATTGTTTTTCAGCTTGTATTTAATTTTTGTTCCAAATTCACTTGTGTATACGACNTATA]




>consensus_6227#0
AAGAGCTGAAATTTTGGCAGCTCGTGCATGTAAACAGCCTCAAGAATCTGTCTTCGATAA
CAGTGAACCTGTTGGTGCTAATTATAAACGACCAGATGTTCAGTCGGAAATTCGTTCTAT
TAAAGCCGCGAATAATTCAAATACTTTATCATCAACAAATGAAAAGTCTGATATTAATAA
TAATTTAAATAGTCAAGACCAGTTATCATATCAAAATGGTTATCATCATCATCAGTGCTC
TTTACAACAATCCCAACAACAAACCACATCACCTCCTTTTTCTTTATCGCCAATAGCAGA
TATTTCAAATAATCAAAGAAACTCTAACATTGAGCAACAGTTAAACAATGGTAACAATAA
TATTTATCATCAAAACTCAGTTTCACCACAGAATTCAATGTATAAACTAGCTTCATCATG
TATTGATTCATCGCCTAACACGGAAGTGCACAATAAAAGAAATTCAAATCTTAAAGCTGT
TTGTCTATATGATTATAACGCTAATGAAGATGATGAATTATCATTTCGTGCCAAAGAACA
TATATTTGACATTGAACAAATTGATGAAGGTTGGTGGCTTGGTCGAAATGCTGATGGACA
AGTTGGATTGTTTCCAGCTAATTATGTTAAATTAATGATGTAAAAAGCTGATGAAAAGCA
AAAAATATAAATGTAGTTCTTTGATAATTTAGTTTATAAAAACAAACAAACACATACTAT
ATANTGGTTGCANGTTNTGGTGTTCGTTTCTAATTTATTCATACAAGGCAAAATGGATAC
AGTTGTATTCTCCTCATATCAATTCAGAGTATAAAACATGTTNTTCTTTTATTTTATGGA
GTTATCATTTATATTACCATCAATGATGNTACTTTGACTGTTATTATGTAACTGATTTGT
TGTTGCTTCCCAGTTCTCTTAATACACATCAATGAAGAATTGTTACAACGAATACTAAAA
TGAAACACATCATAGACATACATTTTTAACTTCCTTATTGAATTTATTTCATTACTAACT
TTCATATGATTTTTCATTGTTTATTCTTATCTTCTATGAGTTATTTAACTTTGTGATCAC
CATATAGTTTGATGCACAACTTAATTTCTAGGTATATATTTCACTTGTGTAGATTTTTTT
TTATTTATATCCACATATATGGCCATACTTATGTTGACGGTTTTTTTCTTTTTTCATACT
TCAATAATTTATACTCACTAAATGAAACATAAACGGATCATAAACAAAACCATTAGTGTT
TCTATTAAGAAACATTGATAGTTTGGTAGTTTCATTTTTCGCATTGTTTTTCAGCTTGTA
TTTAATTTTTGTTCCAAATTCACTTGTGTATACGACNTATA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)