These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6362#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 715 fasta sequence [AAAGCGAAAGTTGTCTGAAACTGTTAAAAGTAATTCATTGTCTAGTAATATTGACTCTACAATAGACCATTCTACTTCACCAGATGGCGATACAGAACCCTCCGGATCATTACTAATAGACTTAGCTGCCTCTGATTTTTCACCTAAGGTTGTGTCGGAAGCAATGAATTCACATCTTAAGGATGTTCCTCACTTCTTGTCATGCAATACTAGTTCTGATTGTATTCAATCTGTTAAAGAATGTGGACGTGATGATTCTGTAGATCGGTGGTCACATGCATACGGAAATCAGAACAGTATAGATTGTAATCATAGTTCAACAGGATTGCTAGGAAATTGTAATGTCGACTCTTCGGATTCAGCTCCATTAAACTCACTTTAAATGTCTATTTTGTATCTATGAATAAAGAAATATATTAATGTATTTTGAAATGTTTCTATGGTTACATATGTACTGTAAGAAATGTTGGAATTTTAGTTTTTCTTTTTAACTAACTTAGTTCCAAATCTTCTTGTTTTAAACCAACATTTATTTAAAATCAAATCGCCAAACATTGAATTTCAGTATCATTTTTGATGTGTCCTATCGATTCATCGGTTATAGTTTATTTTTCTTTTTTGCACTTGTGTTTTCTTTTTTGTAGTTCACATTTTTTTGTAATTTTTTGAATACATGTATGCTCTTGGCTTACAAACAGTGCAACAAAATTTATTT] [+] EMBL CD196778 [AAAGCGAAAGTTGTCTGAAACTGTTAAAAGTAATTCATTGTCTAGTAATATTGACTCTACAATAGACCATTCTACTTCACCAGATGGCGATACAGAACCCTCCGGATCATTACTAATAGACTTAGCTGCCTCTGATTTTTCACCTAAGGTTGTGTCGGAAGCAATGAATTCACATCTTAAGGATGTTCCTCACTTCTTGTCATGCAATACTAGTTCTGATTGTATTCAATCTGTTAAAGAATGTGGACGTGATGATTCTGTAGATCGGTGGTCACATGCATACGGAAATCAGAACAGTATAGATTGTAATCATAGTTCAACAGGATTGCTAGGAAATTGTAATGTCGACTCTTCGGATTCAGCTCCATTAAACTCACTTTAAATGTCTATTTTGTATCTATGAATAAAGAAATATATTAATGTATTTTGAAATGTTTCTATGGTTACATATGTACT ] [+] EMBL AW017224 [ AATGAATTCACATCTTAAGGATGTTCCTCACTTCTTGTCATGCAATACTAGTTCTGATTGTATTCAATCTGTTAAAGAATGTGGACGTGATGATTCTGTAGATCGGTGGTCACATGCATACGGAAATCAGAACAGTATAGATTGTAATCATAGTTCAACAGGATTGCTAGGAAATTGTAATGTCGACTCTTCGGATTCAGCTCCATTAAACTCACTTTAAATGTCTATTTTGTATCTATGAATAAAGAAATATATTAATGTATTTTGAAATGTTTCTATGGTTACATATGTACTGTAAGAAATGTTGGAATTTTAGTTTTTCTTTTTAACTAACTTAGTTCCAAATCTTCTTGTTTTAAACCAACATTTATTTAAAATCAAATCGCCAAACATTGAATTTCAGTATCATTTTTGATGTGTCCTATCGATTCATCGGTTATAGTTTATTTTTCTTTTTTGCACTTGTGTTTTCTTTTTTGTAGTTCACATTATTTTGTAATTTTTTGAATACATGTATGCTCTTGGCTTACAAACAGTGCAACAAAATTTATTT] [+] EMBL CD083653 [ gTGCAATACTAGTTCTGATTGTATTCAATCTGTTAAAGAATGTGGACGTGATGATTCTGTAGATCGGTGGTCACATGCATACGGAAATCAGAACAGTATAGATTGTAATCATAGTTCAACAGGATTGCTAGGAAATTGTAATGTCGACTCTTCGGATTCAGCTCCATTAAACTCACTTTAAATGTCTATTTTGTATCTATGAATAAAGAAATATATTAATGTATTTTGAAATGTTTCTATGGTTACATATGTACTGTAAGAAATGTTGGAATTTTAGTTTTTCTTTTTAACTAACTTAGTTCCAAATCTTCTTGTTTTAAACCAACATTTATTTAAAATCAAATCGCCAAACATTGAATTTCAGTATCATTTTTGATGTGTCCTATCGATTCATCGGTTATAGTTTATTTTTCTTTTTTGCACTTGTGTTTTCTTTTTTGTAGTTCACATTTTTTTGTAATTTTTTGAATACATGTATGCTCTTGGCTTACAAACA ] [-] EMBL CD196555 [ AACAGTATAGATTGTAATCATAGTTCAACAGGATTGCTAGGAAATTGTAATGTCGACTCTTCGGATTCAGCTCCATTAAACTCACTTTAAATGTCTATTTTGTATCTATGAATAAAGAAATATATTAATGTATTTTGAAATGTTTCTATGGTTACATATGTACTGTAAGAAATGTTGGAATTTTAGTTTTTCTTTTCAACTAACTTAGTTCCAAATCTTCTTGTTTTAAACCAACATTTATTTAAAATCAAATCGCCAAACATTGAATTTCAGTATCATTTTTGATGTGTCCTATCGATTCATCGGTTATAGTTTATTTTTCTTTTTTGCACTTGTGTTTTCTTTTTTGTAGTTCACATTTTTTTGTAATTTTTTGAAT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||