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Schistosoma mansoni
cluster # 6390 cluster # 6390       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6390#0 length = 573 sequences # 4  

consensusID : consensus_6390#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 573
fasta sequence
                              [GAGGAAAGCCAAATTTACTATGTATACATTTTATAAAATGGTCACATACATAAAAAGAATCTCAATTACATATTGGTGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGACACAAAATACCTAAATACATTTTCATAAAAACAAACAAATGAGACCTTTTTTGCAAAAAATGGGAAAACAAAAAACCCAGTTAGATATACAATAAATTGGG-TTAAAAAAAAAACAAACAAGAAATGTATGTTATAAAGATTATAAAAGACCTGAAATCCATGTTAAACGTATAACATGATCCACTTTTCGACGAGTTGATTTAATACAACCTAAATATTGTAATTCTGCTAATCCTTGTAAGAAACGACATTGAGTCTCTTGAGATGGAGGATTTTCTGAGTCGACCGCCTCTCCCAGTATACTTGCAAATGCCATAAGCCAATCATATAAATTTACCATTTTATTTGTTTCAATTAATAATTTATATAAAATGCATAAATCAAATAATTTCGATGAAATACTACTTGAATTAGATAGTTTTAAATCAGTAATCTGTAAATATACACCAGGATTCACAAGTGCTTGATGTAA]

[+] EMBL CD145194             [GAGGAAAGCCAAATTTACTATGTATACATTTTATAAAATGGTCACATACATAAAAAGAATCTCAATTACATATTGGTGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGACACAAAATACCTAAATACATTTTCATAAAAACAAACAAATGAGACCTTTTTTGCAAAATATGGGATAACAAAAAACCCAGTTAGATATACAATAAATTGGG TTAAAAAAAAAACAAACAAAAAATGTATGTTATAAAGATTATAAAAGACCTGAAATCCATGTTAAACGTATAACATGATCCACTTTTCGACGAGTTGATTTAATACAACCTAAATATTGTAATTCTGCTAATCCTTGTAAGAAACGACATTGAGTCTCTTGAGATGGAGGATTTTCTGAGTCGACCGCCTCTCCCAGTATACTTGCAAATGCCATAAGCCAATCATATAAATTTACCATTTTATTTGTTTCAATTAATAATTTATATAAAATGCATAAATCAAATAATTTCGATGAAATACTACTTGAATTAGATAGTTTTAAATCAGTAATCTGTAGATATACACCAGGATTCACAAGTGCTTGATGTA ]
[+] EMBL CD145248             [                   ATGTATACATTTTATAAAATGGTCACATACATAAAAAGAATCTCAATTACATATTGGTGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGACACAAAATACCTAAATACATTTTCATAAAAACAAACAAATGAGACCTTTTTTGCAAAAAATGGGAAAACAAAAAACCCAGTTAGATATACAATAAATTGGG TTTAAAAAAAAACAAACAAGAAATGTATGTTATAAAGATTATAAAAGACCTGAAATCCATGTTAAACGTATAACATGATCCACTTTTCGACGAGTTGATTTAATACAACCTAAATATTGTAATTCTGCTAATCCTTGTAAGAAACGACATTGAGTCTCTTGAGATGGAGGATTTTCTGAGTCGACCGCCTCTCCCAGTATACTTGCAAATGCCATAAGCCAATCATATAAATTTACCATTTTATTTGTTTCAATTAATAATTTATATAAAATGCATAAATCAAATAATTTCGATGAAATACTACTTGAATTAGATAGTTNTAAATCAGTAATCTGTAAATATACACCAGGATTCACAAGTGCTTGATGTA ]
[+] EMBL CD145184             [                   ATGTATACATTTTATAAAATGGTCACATACATAAAAAGAATCTCAATTACATATTGGTGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGACACAAAATACCTAAATACATTTTCATAAAAACAAACAAATGAGACCTTTTTTGCAAAAAATGGGAAAACAAAAAACCCAGTTAGATATACAATAAATTGGGTTTAAAAAAAAAACAAACAAGAAATGTTTGTTATAAAGATTATAAAAGACCTGAAATCCATGTTAAACGTATAACATGATCCACTTTTCGACGAGTTGATTTAATACAACCTAAGTATTGTAATTCTGCTAATCCTTGTAAGAAACGACATTGAGTC                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD145158             [                                                                                                                                          AATGAGACCTTTTTTGCAAAAAATGGGAAAACAAAAAACCCAGTTAGATATACAATAAATTGGGTTTAAAAAAAAAACAAACAAGAAATGTATGTTATAAAGATTATAAAAGACCTGAAATCCATGTTAAACGTATAACATGATCCACTTTTCGACGAGTTGATTTAATACAACCTAAATATTGTAATTCTGCTAATCCTTGTAAGAAACGACATTGAGTCTCTTGAGATGGAGTATTTTCTGAGTCGACCGCCTCTCCCAGTATACTTGCAAATGCCATAAGCCAATCATATAAATTTACCATTTTATTTGTTTCAATTAATAATTTATATAAAATGCATAAATCAAATAATTTCGATGAAATACTACTTGAATTAGATAGTTTTAAATCAGTAATCTGTAAATATACACCAGGATTCACAAGTGCTTGATGTAA]


>consensus_6390#0 GAGGAAAGCCAAATTTACTATGTATACATTTTATAAAATGGTCACATACATAAAAAGAAT CTCAATTACATATTGGTGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGACACAAAATACCTAAATACA TTTTCATAAAAACAAACAAATGAGACCTTTTTTGCAAAAAATGGGAAAACAAAAAACCCA GTTAGATATACAATAAATTGGGTTAAAAAAAAAACAAACAAGAAATGTATGTTATAAAGA TTATAAAAGACCTGAAATCCATGTTAAACGTATAACATGATCCACTTTTCGACGAGTTGA TTTAATACAACCTAAATATTGTAATTCTGCTAATCCTTGTAAGAAACGACATTGAGTCTC TTGAGATGGAGGATTTTCTGAGTCGACCGCCTCTCCCAGTATACTTGCAAATGCCATAAG CCAATCATATAAATTTACCATTTTATTTGTTTCAATTAATAATTTATATAAAATGCATAA ATCAAATAATTTCGATGAAATACTACTTGAATTAGATAGTTTTAAATCAGTAATCTGTAA ATATACACCAGGATTCACAAGTGCTTGATGTAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)