Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 6392 cluster # 6392       Sequences # 4       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6392#0 length = 942 sequences # 4  
consensusID : consensus_6392#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 942
fasta sequence 
                              [AGTGGGATAACAGAGAATAAAACTTCGGAAACTACAGAATTGACAAAAGAAAATATTAATGGTTCAGAGAAAGAAATTAAAACTTATAAATGTGTAACACTTGGAGCATTTGGTGGTTCAAAACATATTAGAATAGATATGAATGAAGTGAAACCAATAGGAAAGAATGAAGTTGCAATTGATGTACAAGCATGTGGTATTAACTTTCTTGATATAATGACAAGACAAGGTTTAATTGATCAAGCAATGAAACCTCCATTCACTTTGGGCTCTGAATGTACTGGAATTATTAGTGAAGTCGGTGAAAAAGTGACAACCTATAAGGTTGGTGATCCAGTTATAGTTCTACTTAACAATGGTGCTTGGAGTGAACGTCTTGTA-TTACCAATTATAGAAAAAGTTAATACAGATCAAACAAATTCAACAACACAATCTGAAGATGTTGAATGTACAGAGTCAAATGAATTTGGAATGATTAAGTCAATTATATTACCAAGACCTAAAACATTAGATGTTAATAAAGCTGCAATTATTAGTTTTGCTTATATTCCAGCTTATATATTAACTTATCATATACTTAATATTCATTCTGGTGATATAATTTTGATATTTTCAGCTGGTGGTGGAATTGGAACTGCTTTACGACAGTTAATGAAATTAATACCGAATGTAACCTTAATTGGTATTGCATCTAACGCAAAACATGAAAAAGTGACAAACATCTATGATATATTATTAAAACCTGATCAAAATTGTGTAACAGAAATTAAAAAGTTAGCTTTATCCTAATGGAATCGATGCAATTTTGGATTGTATAAGTGGACCAGATACAAATAAACTATATGGAACATTAAAACCTTTAGGAAAGCATGTAATTTATGGTATGTCAAACTTAGTTACTGGAGACAGGANAAACTTTCTCAACTTAGCANAACATTGGTT]

[+] EMBL CD179949             [AGTGGGATAACAGAGAATAAAACTTCGGAAACTACAGAATTGACAAAAGAAAATATTAATGGTTCAGAGAAAGAAATTAAAACTTATAAATGTGTAACACTTGGAGCATTTGGTGGTTCAAAACATATTAGAATAGATATGAATGAAGTGAAACCAATAGGAAAGAATGAAGTTGCAATTGATGTACAAGCATGTGGTATTAACTTTCTTGATATAATGACAAGACAAGGTTTAATTGATCAAGCAATGAAACCTCCATTCACTTTGGGCTCTGAATGTACTGGAATTATTAGTGAAGTCGGTGAAAAAGTGACAACCTATAAGGTTGGTGATCCAGTTATAGTTCTACTTAACAATGGTGCTTGGAGTGAACGTCTTGTATTTACC ATTATAGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD146873             [                                                                                                                                                                                                                                           TTGATCAAGCAATGAAACCTCCATTCACTTTGGGCTCTGAATGTACTGGAATTATTAGTGAAGTCGGTGAAAAAGTGATAACCTATAAGGTTGGTGATCCAGTTATAGTTCTACTTAACAATGGTGCTTGGAGTGAACGTCTTGTA TTACCAATTATAGAAAAAGTTAATACAGATCAAACAAATTCAACAACACAATCTGAAGATGTTGAATGTACAGAGTCGAATGAATTTGGAATGATTAAGTCAATTATATTACCAAGACCTAAAACATTAGATGTTAATAAAGCTGCAATTATTAGTTTTGCTTATATTCCAGCTTATATATTAACTTATCATATACTTAATATTCATTCTGGTGATATAATTTTGATATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD118233             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ttcactCAATGGTGCTTGGAGTGAACGTCTTGTA TTACCAATTATAGAAAAAGTTAATACAGATCAAACAAATTCAACAACACAATCTGAAGATGTTGAATGTACAGAGTCAAATGAATTTGGAATGATTAAGTCAATTATATTACCAAGACCTAAAACATTAGATGTTAATAAAGCTGCAATTATTAGTTTTGCTTATATTCCAGCTTATATATTAACTTATCATATACTTAATATTCATTCTGGTGATATAATTGTGATATTTTCAGCTGGTGGTGGAATTGGAACTGCTTTACGACAGTTAATGAAATTAATACCGAATGTAACCTTAATTGGTATTGCATCTAACGCAAAACATGAAAAAGTGACAAACATCTATGATATATTATTAAAACCTGATCAAAATTGTGTAACAGAAATTAAAAAGTTAGCTTTATCCTAATGGAATCGATGCAATTT                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD118667             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AATACAGATCAAACAAATTCAACAACACAATCTGAAGATGTTGAATGTACCGAGTCAAATGAATTTGGAATGATTAAGTCAATTATATTACCAAGACCTAAAACATTAGATGTTAATAAAGCTGCAATTATTAGTTTTGCTTATATTCCAGCTTATATATTAACTTATCATATACTTAATATTCATTCTGGTGATATAATTTTGATATTTTCAGCTGGTGGTGGAATTGGAACTGCTTTAGGACAGTTAATGAAATTAATACCGAATGTAACCTTAATCGGTATTGCTTCTAAGGCAAAACATGAAAAGTTGACAAACATCTATGATATATTATTAGAACCTGATCAAGATTGTGTAACAGAAATTAAAA    AGCTTTATCCTAATGGAATTGATGCAATTTTGGATTGTATAAGTGGACCAGATACAAATAAACTATATGGAACATTAAAACCTTTAGGAAAGCATGTAATTTATGGTATGTCAAACTTAGTTACTGGAGACAGGANAAACTTTCTCAACTTAGCANAACATTGGTT]




>consensus_6392#0
AGTGGGATAACAGAGAATAAAACTTCGGAAACTACAGAATTGACAAAAGAAAATATTAAT
GGTTCAGAGAAAGAAATTAAAACTTATAAATGTGTAACACTTGGAGCATTTGGTGGTTCA
AAACATATTAGAATAGATATGAATGAAGTGAAACCAATAGGAAAGAATGAAGTTGCAATT
GATGTACAAGCATGTGGTATTAACTTTCTTGATATAATGACAAGACAAGGTTTAATTGAT
CAAGCAATGAAACCTCCATTCACTTTGGGCTCTGAATGTACTGGAATTATTAGTGAAGTC
GGTGAAAAAGTGACAACCTATAAGGTTGGTGATCCAGTTATAGTTCTACTTAACAATGGT
GCTTGGAGTGAACGTCTTGTATTACCAATTATAGAAAAAGTTAATACAGATCAAACAAAT
TCAACAACACAATCTGAAGATGTTGAATGTACAGAGTCAAATGAATTTGGAATGATTAAG
TCAATTATATTACCAAGACCTAAAACATTAGATGTTAATAAAGCTGCAATTATTAGTTTT
GCTTATATTCCAGCTTATATATTAACTTATCATATACTTAATATTCATTCTGGTGATATA
ATTTTGATATTTTCAGCTGGTGGTGGAATTGGAACTGCTTTACGACAGTTAATGAAATTA
ATACCGAATGTAACCTTAATTGGTATTGCATCTAACGCAAAACATGAAAAAGTGACAAAC
ATCTATGATATATTATTAAAACCTGATCAAAATTGTGTAACAGAAATTAAAAAGTTAGCT
TTATCCTAATGGAATCGATGCAATTTTGGATTGTATAAGTGGACCAGATACAAATAAACT
ATATGGAACATTAAAACCTTTAGGAAAGCATGTAATTTATGGTATGTCAAACTTAGTTAC
TGGAGACAGGANAAACTTTCTCAACTTAGCANAACATTGGTT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)