These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6434#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 535 fasta sequence [GGGGGATAATGTAAAACGTTTGATGGATGATTAAATGTTTTATCATTTACATCAAGTATATCAGTTGGTAAATGTAATTCATTTGGTTGTGATTGGTGATAAGTAAATGTTGGTGGTTCGTTACAACGATGATGACGACCACAACCGGTATCTAATTCACCCAAACTTTTTAAATAACTTCCAATCCTATCATGAGGTGGTATTGTAGAGAATTGTTCCATTAGTGGATTAACATTAAATTGAGTAGATGAGGCAGAAGAAATATGAGTAGTTGTGGTATTGATAGTAGTAGTTGTTATTCTTGTTGTAGAAGTATTAGTAGTTTGAAATAAGTATGGATAGGAATGTGGATGGTGAATAACAGAATTTGAAGTAGGAGTTATTATTTGTGCATGGTGGAAATGTTGAGAATGATCATCAATTGGCATGGACACTTCAAACGGCACATTAAAATGCCAATCAACTTGACTAGGTGCACTTGATAATATCGAATTCATAGTAGCAATTACACCAACACCGGCAGCATTACTCATTA] [+] EMBL CD117568 [GGGGGATAATGTAAAACGTTTGATGGATGATTAAATGTTTTATCATTTACATCAAGTATATCAGTTGGTAAATGTAATTCATTTGGTTGTGATTGGTGATAAGTAAATGTTGGTGGTTCGTTACAACGATGATGACGACCACAACCGGTATCTAATTCACCCAAACTTTTTAAATAACTTCCAATCCTATCATGAGGTGGTATTGTAGAGAATTGTTCCATTAGTGGATTAACATTAAATTGAGTAGATGAGGCAGAAGAAATATGAGTAGTTGTGGTATTGATAGTAGTAGTTGTTATTCTTGTTGTAGAAGTATTAGTAGTTTGAAATAAGTATGGATAGGAATGTGGATGGTGAATAACAGAATTTGAAGTAGGAGTTATTATTTGTGCATGGTGGAAATGTTGAGAATGATCATCAATTGGCATGGACACTTCAAACGGCACATTAAAATGCCAATCAACTTGACTAGGTGCACTTGATAATATCGAATTCATAGTAGCAATTACACCAACACCGGCAGCATTACTCATTA] [+] EMBL CD117509 [GGGGGATAATGTAAAACGTTTGATGGATGATTAAATGTTTTATCATTTACATCAAGTATATCAGTTGGTAAATGTAATTCATTTGGTTGTGATTGGTGATAAGTAAATGTTGGTGGTTCGTTACAACGATGATGACGACCACAACCGGTATCTAATTCACCCAAACTTTTTAAATAACTTCCAATCCTATCATGAGGTGGTATTGTAGAGAATTGTTCCATTAGTGGATTAACATTAAATTGAGTAGATGAGGCAGAAGAAATATGAGTAGTTGTGGTATTGATAGTAGTAGTTGTTATTCTTGTTGTAGAAGTATTAGTAGTTTGAAATAAGTATGGATAGGAATGTGGATGGTGAATAACAGAATTTGAAGTAGGAGTTATTATTTGTGCATGGTGGAAATGTTGAGAATGATCATCAATTGGCATGGACACTTCAAACGGCACATTAAAATGCCCATCAACTTGACTAGGTGCACTTGATAA ] [+] EMBL CD117562 [GGGGGATAATGTAAAACGTTTGATGGATGATATAATGTTTTATCATTTACATCAAGTATATCAGTTGGTAAATGTAATTCATTTGGTTGTGATTGGTGATAAGTAAATGTTGGTGGTTCGTTACAACGATGATGACGACCACAACCGGTATCTAATTCACCCAAACTTTTTAAATAACTTCCAATCCTATCATGAGGTGGTATTGTAGAGAATTGTTCCATTAGTGGATTAACATTAAATTGAGTACATGAGGCACAAGAAATATGAGTAGTTGTGGTATTGATAGTAGTAGTTGTTATTCTTGTTGTACAAGTATTAGTAGTTTGAAATAAGTATGGATAGGAATGTGGATGGTGAATAACAGAATTTGAAGTATGAGTTATTATTTGTGCATGGTGGAAATGTTGAGAATGATCATCAATTGGCATGGACACTTCAAACGGCACATTAAAATG ] [+] EMBL CD117557 [GGGGGATAATGTAAAACGTTTGATGGATGATTAAATGTTTTATCATTTACATCAAGTATATCAGTTGGTAAATGTAATTCATTTGGTTGTGATTGGTGATAAGTAAATGTTGGTGGTTCGTTACAACGATGATGACGACCACAACCGGTATCTAATTCACCCAAACTTTTTAAATAACTTCCAATCCTATCATGAGGTGGTATTGTAGAGAATTGTTCCATTAGTGGATTAACATTAAATTGAGTAGATGAGGCAGAAGAAATATGAGTAGTTGTGGTATTGATAGTAGTAGTTGTTATTCTTGTTGTAGAAGTATTAGTAGTTTGAAATAAGTATGGATAGGAATGTGGATGGTGAATAACAGAATTTGAAGTAGGAGTTATTATTTGTGCATGGTGGAAATGTTGAGAATGATCATCAATTGGCATGGACA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||