These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6472#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 1194 fasta sequence [TAACACCAAAAAAAAACACAAGGAAAAACCAAAAAAAATAATCAATAATATACAAGATTTGTTCTTTGTGATTAATTAATATTTATCTTACACATAACAACATGGATTAAGGCCACATACATACACACACAAATATATGCGTGTATCCATGTACACGTACAGATGCATATACAAAAACTTGTACAATATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAGCAAATAAATAATGCGGTATCAATGTAACGAAAAAGAATGAATCAAATGTAAAATGAATGAAAAAAAAAAGAATATTCTGAATCCTTTTTTGTTGTTCACAGTATCATTATTGTTATTGACAAGTGAAGGAGCTTGGTATAGGCACTTTAGTGGTGTGTGTGTGTATGTATGAATGTATGTTATAAAGACACGTGAACACATAGGAAGGGAGGTTTGTCACCAAATACAAATTAAATACGAGTCATAATAGTTAATCTTTCTTTTTTGTAAACATAAATAAGTACGTACATAAATACCGAGAGAGAGATGGAGATGGAAGGGGGGTGTGTGTGAAAAGCATATATTCAAAATAATTGAATATTAAGAAATAGATGGATAAAAATAGAATATTGAACACACACACACAAATTGAACAGAGACTAGCTATGGTTAGCTAATATAAACAGTTAGCTCATTCATTTATTAGGTAGTTGAGTGCACATAAGTTGAAATAAATAACAACAAGGAAATTCAAG-AAAAAAAAACAATGTGACAATAATTGTAGGTAAGATCTAATCTACATCATTAGAAATACAAGAAAAAAAAATTGAATAGTGTAATCTCTATGAGTCTATTTCCTCTTTTCTGAATCAAACCAATACAAGAATACTACTACCAGTAGTAGCAGTAACTGTGGGATCGATCGCACCATGATACACAAATGGATGGATACTTGATTGATCTAACATAAATTAACATATATGAATATCTATCCGTCTAGTATAACAGTTCCGTTGTTTTGAAATATAAAAATAAGTTTTACTAGTCATTGTCAACATCATCATTATCATAAATAATGACACCAATTCTGTGATTTTTCGTTTCTACTTGTATATTACAACAATGGTGTGAACACATTAAAGAAAAGTCTGAAAGATTGGCGCATAGATTAAGACATATGGATAGAGTAATAATATAATGCATAGATATATT] [+] EMBL CD135786 [TAACACCAAAAAAAAACACAAGGAAAAACCAAAAAAAATAATCAATAATATACAAGATTTGTTCTTTGTGATTAATTAATATTTATCTTACACATAACAACATGGATTAAGGCCACATACATACACACACAAATATATGCGTGTATCCATGTACACGTACAGATGCATATACAAAAACTTGTACAATATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAGCAAATAAATAATGCGGTATCAATGTAACGAAAAAGAATGAATCAAATGTAAAATGAATGAAAAAAAAAAGAATATTCTGAATCCTTTTTTGTTGTTCACAGTATCATTATTGTTATTGACAAGTGAAGGAGCTTGGTATAGGCACTTTAGTGGTGTGTGTGTGTATGTATGAATGTATGTTATAAAGACACGTGAACACATAGGAAGGGAGGTTTGTCACCAAATACAAATTAAATACGAGTCATAATAGTTAATCTTTCTTTTTTGTAAACATAAATAAGTACGTACATAA ] [+] EMBL CD087052 [ TTGTCAACAAATACAAATTAAATACGAGTCATAATAGTTAATCTTTCCTTTTTGTAAACATAAATAAGTACGTACATAGATACCGAGAGAGAGATGGAGATGGAAGGGGGGTGTGTGTGAAAAGCATATATTCAAAATAATTGAGTATTAAGAAATAGATGGATAAAAATAGAATATTGAACACACACACACAAATTGAACAGAGACTAGCTATGGTTAGCTAATATAAACAGTTAGCTCATTCATTTATTAGGTAGTTGAGTGCACATAAGTTGAAATAAATAACAACAAGGAAATTCAAG AAAAAAAACAATGTGACAATAATTGTAGGTAAGATCTAATCTACATCGTTAGAAATACAAGAAAAAAAAATTGAATAGT ] [+] EMBL CD200752 [ TGGAAGGGGGGTGTGTGTGAAAAGCATATATTCAAAATAATTGAATATTAAGAAATAGATGGATAAAAATAGAATATTGAACACACACACACAAATTGAACAGAGACTAGCTATGGTTAGCTAATATAAACAGTTAGCTCATTCATTTATTAGGTAGTTGAGTGCACATAAGTTGAAATAAATAACAACAAGGAAATTCAAGAAAAAAAAAACAATGTGACAATAATTGTAGGTAAGATCTAATCTACATCATTAGAAATACAAGAAAAAAAAATTGAATAGTGTAATCTCTATGAGTCTATTTCCTCTTTTCTGAATCAAACCAATACAAGAATACTACTACCAGTAGTAGCAGTAACTGTGGGATCGATCGCACCATGATACACAAATGGATGGATACTTGATTGATCTAACATAAATTAACATATATGAATATCTATCCGTCTAGTATAACAGTTCCGT ] [+] EMBL CD160728 [ GTGAAAAGCATATATTCAAAATAATTGAATATTAAGAAATAGATGGATAAAAATAGAATATTGAACACACACACACAAATTGAACAGAGACTAGCTATGGTTAGCTAATATAAACAGTTAGCTCATTCATTTATTAGGTAGTTGAGTGCACATAAGTTGAAATAAATAACAACAAGGAAATTCAAG AAAAAAAAGCAATGTGACAATAATTGTAGGTAAGATCTAATCTACATCATTAGAAATACAAGAAAAAAAAATTGAATAGTGTAATCTCTATGAGTCTATTTCCTCTTTTCTGAATCAAACCAATACAAGAATACTACTACCAGTAGTAGCAGTAACTGTAGGATCGATCGCACCATGATACACAAATGGATGGATACTTGATTGATCTAACATAAATTAACATATATGAATATCTATCCGCCTAGTATAACAGTTCCGTTGTTTTGAAATATAAAAATAAGTTTTACTAGTCATTGTCAACATCATCATTATCATAAATAATGACACCAATTCTGTGATTTTTCGTTTCTACTTGTATATTACAACAATGGTGTGAACACATTAAAGAAAAGTCTGAAAGATTGGCGCATAGATTAAGACATATGGATAGAGTAATAATATAATGCATAGATATATT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||