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Schistosoma mansoni
cluster # 6523 cluster # 6523       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6523#0 length = 723 sequences # 4  

consensusID : consensus_6523#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 723
fasta sequence
                              [CAGCTATTACAAGTTATTTTGCATTATTAGCTAGTGCTGTATCAATGCATCATTTATCTGAAATTGTTTTAAATTTACGAACTAACAGTGAAATCAACATAGATAATTGGCTTTTAACTAATAACATTGAGTTTATGCATGAGATTATGCAAGAGTTAACAAATAAAGAGGAAGTTTGTGATAATAATAATGCTAACAATGGGATACAATCCTTTCCAAAATATAGTAATCTACCAAGTTTATCTGGCTCCTTGTTATCTTTGATGTTGGCACGTTTAGGTTCATTATTAGATGATGATTTGGAAGGGACTAGACGTTTAGCTTGTCTTTGTTTGACAGTATTCTTTAATGGTCTTCTTATACCTTCACCACCAATATCACTGACATCTTCATCACCGATGGAGTTATCTGACAGTAATCAAAATCATTATGAAGGTAATCGAGTGATAGATTTTCTCAATTCACCTACATGGATTCAACCGCTTACTACTATTACTAATACTGCTAGCAGTACTATTAAAAGTAATCATGAATCGACCAAAGAATATAATGTATTATTGCCTTATTGTCCACTGGCCAATTCATTTGGTGATCAAGTCTATCGTTTCTATGGTAATTTTATTAAGCGTCTAAATGATTCGAAAGATCAGATACGATTACTTATCTGTGAAACAATCAATGCATGGATTCGTCTACTTATTCCAATGTTAACATCATCATCAG]

[+] EMBL CD147425             [CAGCTATTACAAGTTATTTTGCATTATTAGCTAGTGCTGTATCAATGCATCATTTATCTGAAATTGTTTTAAATTTACGAACTAACAGTGAAATCAACATAGATAATTGGCTTTTAACTAATAACATTGAGTTTATGCATGAGATTATGCAAGAGTTAACAAATAAAGAGGAAGTTTGTGATAATAATAATGCTAACAATGGGATACAATCCTTTCCAAAATATAGTAATCTACTAAGTTTATCTGGCTCCTTGTTATCTTTGATGTTGGCACGTTTAGGTTCATTATTAGATGATGATTTGGAAGGGACTAGACGTTTAGCTTGTCTTTGTTTGACAGTATTCTTTAATGGTCTTCTTATACCTTCACCACCAATATCACTGACATCTTCATCACCGATGGAGTTATCTGACAGTAATCAAAATCATTATGAAGGTAATCGAGTGATAGATTTTCTCAATTCACCTACATGGATTCAACgc                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD147560             [CAGCTATTACAAGTTATTTTGCATTATTAGCTAGTGCTGTATCAATGCATCATTTATCTGAAATTGTTTTAAATTTACGAACTAACAGTGAAATCAACATAGATAATTGGCTTTTAACTAATAACATTGAGTCTGTGCATGAGATTATGCAAGAGTTAACAAATGAAGAGGAAGTTTGTGATAATAATAATGCTAACAATGGGATACAATCCTTTCCAAAATATAGTAATCTACCAAGTTTATCTGGCTCCTTGTTATCTTTGATGTTGGCACGTTTAGGTTCATTATTAGATGATGATTTGGAAGGGACTAGACGTTTAGCTTGTCTTTGTTTGACAGTATTCTTTAATGGTCTTCTTATACCTTCACCACCAATATCTCTGACATCTTCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD147823             [                                                                                                                                                                         GGAAGTTTGTGATAATAATAATGCTAACAATGGGATACAATCCTGTCCAAAATATAGTAATCTACCAAGTTTATCTGGCTCCTTGTTATCTTTGATGTTGGCACGTTTAGGTTCATTATTAGATGACGATTTGGAAGGGACTAGACGTTTAGCTTGTCTTTGTTTGACAGTATTCTTTAATGGTCTTCTTATACCTTCACCACCAATATCACTGACATCTTCATCACCGATGGAGTTATCTGACAGTAATCAAAATCATTATGAAGGTAATCGAGTGATAGATTTTCTCAATTCACCTACATGGATTCAACCGCTTACTACTATTACTAATACTGCTAGCAGTACTATTAAAAGTAATCATGAATCGACCAAAGAATATAATGTATTATTGCCTT                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD169749             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TGGAAGGGACTAGACGTTTAGCTTGTCTTTGTTTGACAGTATTCTTTAATGGTCTTCTTATACCTTCACCACCAATATCACTGACATCTTCATCACCGATAGAGTTATCTGACAGTAATCAAAATCATTATGAAGGTAATCGAGTGATAGATTTTCTCAATTCACCTACATGGATTCAACCGCTTACTACTATTACTAATACTGCTAGCAGTACTATTAAAAGTAATCATGAATCGACCAAAGAATATAATGTATTATTGCCTTATTGTCCACTGGCCAATTCATTTGGTGATCAAGTCTATCGTTTCTATGGTAATTTTATTAAGCGTCTAAATGATTCGAAAGATCAGATACGATTACTTATCTGTGAAACAATCAATGCATGGATTCGTCTACTTATTCCAATGTTAACATCATCATCAG]


>consensus_6523#0 CAGCTATTACAAGTTATTTTGCATTATTAGCTAGTGCTGTATCAATGCATCATTTATCTG AAATTGTTTTAAATTTACGAACTAACAGTGAAATCAACATAGATAATTGGCTTTTAACTA ATAACATTGAGTTTATGCATGAGATTATGCAAGAGTTAACAAATAAAGAGGAAGTTTGTG ATAATAATAATGCTAACAATGGGATACAATCCTTTCCAAAATATAGTAATCTACCAAGTT TATCTGGCTCCTTGTTATCTTTGATGTTGGCACGTTTAGGTTCATTATTAGATGATGATT TGGAAGGGACTAGACGTTTAGCTTGTCTTTGTTTGACAGTATTCTTTAATGGTCTTCTTA TACCTTCACCACCAATATCACTGACATCTTCATCACCGATGGAGTTATCTGACAGTAATC AAAATCATTATGAAGGTAATCGAGTGATAGATTTTCTCAATTCACCTACATGGATTCAAC CGCTTACTACTATTACTAATACTGCTAGCAGTACTATTAAAAGTAATCATGAATCGACCA AAGAATATAATGTATTATTGCCTTATTGTCCACTGGCCAATTCATTTGGTGATCAAGTCT ATCGTTTCTATGGTAATTTTATTAAGCGTCTAAATGATTCGAAAGATCAGATACGATTAC TTATCTGTGAAACAATCAATGCATGGATTCGTCTACTTATTCCAATGTTAACATCATCAT CAG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)