These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6531#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 869 fasta sequence [GCCGGTACCGTGTTGTAAACTAG-TACATTACTCTA-TTTA-TTTTTTTAA-TAGGTATTCAC-TTA-TGAA-ACGTTTTAACCTATCAACTTAG-TTAAGTCCAACGGTAGTCATACCGGTTAATTTATCATTTGTCACTTTACTTTAATCTTTACTCTGAGACAACTGACTTCTTTGATAATCCTCAGTAAGAAAATAAGTTATCATTAGATCATTGAAATAATTTGATTTTCTGTAAGTTACGCGAATGAATTTTTAATAATTGGGCTAAAAGATTTTACTGCTTAATTAATCAGAGAAAAACGCTTAGTACTATGAAGTTACTCATAAGAAATGCTACAAACTGTTAGTAAAGATCAATGAAATAGTAAAAGGGTTACATTTCTTAAAAATTCCTCTATTTTGTCTAAAGACTGACAAAACTTTTTAAATATTTTAACGATNAACGTTTTAAAGGACCAGAAATTTAAAGAAACGGAATGTATTTGAAACTAAATAACAAGTTGATTGAAATACTAAAGATAGCTAGTAGTAGGATTCACTCTATTGGCTAAGCTTAAAACTTGATATCTTTCTTTTCAAAACAATATATTAATTGATTTGTTGCTATTATATCAAACATGAAAGTTATTAAATGTACTTCAACATGAATGAAATGTATTCAATTCCATTTAAAATATAAGCTATTTACAAATAAACCTGCTTCTGGATATAATACTAACCTTTTGTAAATATTGTTGCTTGTTGACCTGAACATTACATAAGTGATAAATAAAAGTTTGCTTCTAGAATAATATTTTACAGTTTGGTCAATTGAACATGTTTTGACATATCTAAATGTATAAGAACTACAATTTAATCGTTCTGTCTTCTTC] [+] EMBL CD065852 [GCCGGTACCGTGTTGTAAACTAG TACATTACTCTA TTTA TTTTTTTAA TAGGTATTCAC TTA TGAA ACGTTTTAACCTATCAACTTAG TTAAGTCCAACGGTAGTCATACCGGTTAATTTATCATTTGTCACTTTACTTTAATCTTTACTCTGAGACAACTGACTTCTTTGATAATCCTCAGTAAGAAAATAAGTTATCATTAGATCATTGAAATAATTTGATTTTCTGTAAGTTACGCGAATGAATTTTTAATAATTGGGCTAAA ] [+] EMBL CD065844 [ ACTAGCTACATTACTCTACTTTACTTTTTTTAACTAGGTATTCACTTTAGTGAAGACGTTTTAACCTATCAACTTAGATTAAGTCCAACGGTAGTCATACCGGTTAATTTATCATTTGTCACTTTACTTTAATCTTTACTCTGAGACAACTGACTTCTTTGATAATCCTCAGTAAGAAAATAAGTTATCATTAGATCATTGAAATAATTTGATTTTCTGTAAGTTACGCGAATGAATTTTTAATAATTGGGCTAAAAGATTTTACTGCTTAATTAATCAGAGAAAAACGCTTAGTACTATGAAGTTACTCATAAGAAATGCTACAAACTGTTAGTAAAGATCAATGAAATAGTAAAAGGGTTACATTTCTTAAAAATTCCTCTATTTTGTCTAAAGACTGACAAAACTTTTTAAATATTTTAACGATNAACGTTTTAAAGGACCAGAAATTTAAAGAAACGGAATGTATTTGAAACTAAATAACAAGTTGATTG ] [+] EMBL CD065853 [ AAAGATTTTACTGCTTAATTAATCAGAGAAAAACACTTAGTACTATGAAGTTACTCATAAGAAATGCTACAAACTGATAGTAAAGATCAATGAAATAGTAAAAGGGTTACATTTCTTAAAAATTCCTCTATTTTGTCTAAAGACTGACAAAACTTTTTAAATATTTTAACGATAAACGTTTTAAAGGACCAGAAATTTAAAGAAACGGAATGTATATGAAACTAAATAACAAGTTGATTGAAATACTAAAGATAGCTAGTAGTAGG ] [-] EMBL CD065798 [ TAACAAGTTGATTGAAATACTAAAGATAGCTAGTAGTAGGATTCACTCTATTGGCTAAGCTTAAAACTTGATATCTTTCTTTTCAAAACAATATATTAATTGATTTGTTGCTATTATATCAAACATGAAAGTTATTAAATGTACTTCAACATGAATGAAATGTATTCAATTCCATTTAAAATATAAGCTATTTACAAATAAACCTGCTTCTGGATATAATACTAACCTTTTGTAAATATTGTTGCTTGTTGACCTGAACATTACATAAGTGATAAATAAAAGTTTGCTTCTAGAATAATATTTTACAGTTTGGTCAATTGAACATGTTTTGACATATCTAAATGTATAAGAACTACAATTTAATCGTTCTGTCTTCTTC] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||