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Schistosoma mansoni
cluster # 6531 cluster # 6531       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6531#0 length = 869 sequences # 4  

consensusID : consensus_6531#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 869
fasta sequence
                              [GCCGGTACCGTGTTGTAAACTAG-TACATTACTCTA-TTTA-TTTTTTTAA-TAGGTATTCAC-TTA-TGAA-ACGTTTTAACCTATCAACTTAG-TTAAGTCCAACGGTAGTCATACCGGTTAATTTATCATTTGTCACTTTACTTTAATCTTTACTCTGAGACAACTGACTTCTTTGATAATCCTCAGTAAGAAAATAAGTTATCATTAGATCATTGAAATAATTTGATTTTCTGTAAGTTACGCGAATGAATTTTTAATAATTGGGCTAAAAGATTTTACTGCTTAATTAATCAGAGAAAAACGCTTAGTACTATGAAGTTACTCATAAGAAATGCTACAAACTGTTAGTAAAGATCAATGAAATAGTAAAAGGGTTACATTTCTTAAAAATTCCTCTATTTTGTCTAAAGACTGACAAAACTTTTTAAATATTTTAACGATNAACGTTTTAAAGGACCAGAAATTTAAAGAAACGGAATGTATTTGAAACTAAATAACAAGTTGATTGAAATACTAAAGATAGCTAGTAGTAGGATTCACTCTATTGGCTAAGCTTAAAACTTGATATCTTTCTTTTCAAAACAATATATTAATTGATTTGTTGCTATTATATCAAACATGAAAGTTATTAAATGTACTTCAACATGAATGAAATGTATTCAATTCCATTTAAAATATAAGCTATTTACAAATAAACCTGCTTCTGGATATAATACTAACCTTTTGTAAATATTGTTGCTTGTTGACCTGAACATTACATAAGTGATAAATAAAAGTTTGCTTCTAGAATAATATTTTACAGTTTGGTCAATTGAACATGTTTTGACATATCTAAATGTATAAGAACTACAATTTAATCGTTCTGTCTTCTTC]

[+] EMBL CD065852             [GCCGGTACCGTGTTGTAAACTAG TACATTACTCTA TTTA TTTTTTTAA TAGGTATTCAC TTA TGAA ACGTTTTAACCTATCAACTTAG TTAAGTCCAACGGTAGTCATACCGGTTAATTTATCATTTGTCACTTTACTTTAATCTTTACTCTGAGACAACTGACTTCTTTGATAATCCTCAGTAAGAAAATAAGTTATCATTAGATCATTGAAATAATTTGATTTTCTGTAAGTTACGCGAATGAATTTTTAATAATTGGGCTAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD065844             [                  ACTAGCTACATTACTCTACTTTACTTTTTTTAACTAGGTATTCACTTTAGTGAAGACGTTTTAACCTATCAACTTAGATTAAGTCCAACGGTAGTCATACCGGTTAATTTATCATTTGTCACTTTACTTTAATCTTTACTCTGAGACAACTGACTTCTTTGATAATCCTCAGTAAGAAAATAAGTTATCATTAGATCATTGAAATAATTTGATTTTCTGTAAGTTACGCGAATGAATTTTTAATAATTGGGCTAAAAGATTTTACTGCTTAATTAATCAGAGAAAAACGCTTAGTACTATGAAGTTACTCATAAGAAATGCTACAAACTGTTAGTAAAGATCAATGAAATAGTAAAAGGGTTACATTTCTTAAAAATTCCTCTATTTTGTCTAAAGACTGACAAAACTTTTTAAATATTTTAACGATNAACGTTTTAAAGGACCAGAAATTTAAAGAAACGGAATGTATTTGAAACTAAATAACAAGTTGATTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD065853             [                                                                                                                                                                                                                                                                                AAAGATTTTACTGCTTAATTAATCAGAGAAAAACACTTAGTACTATGAAGTTACTCATAAGAAATGCTACAAACTGATAGTAAAGATCAATGAAATAGTAAAAGGGTTACATTTCTTAAAAATTCCTCTATTTTGTCTAAAGACTGACAAAACTTTTTAAATATTTTAACGATAAACGTTTTAAAGGACCAGAAATTTAAAGAAACGGAATGTATATGAAACTAAATAACAAGTTGATTGAAATACTAAAGATAGCTAGTAGTAGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD065798             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TAACAAGTTGATTGAAATACTAAAGATAGCTAGTAGTAGGATTCACTCTATTGGCTAAGCTTAAAACTTGATATCTTTCTTTTCAAAACAATATATTAATTGATTTGTTGCTATTATATCAAACATGAAAGTTATTAAATGTACTTCAACATGAATGAAATGTATTCAATTCCATTTAAAATATAAGCTATTTACAAATAAACCTGCTTCTGGATATAATACTAACCTTTTGTAAATATTGTTGCTTGTTGACCTGAACATTACATAAGTGATAAATAAAAGTTTGCTTCTAGAATAATATTTTACAGTTTGGTCAATTGAACATGTTTTGACATATCTAAATGTATAAGAACTACAATTTAATCGTTCTGTCTTCTTC]


>consensus_6531#0 GCCGGTACCGTGTTGTAAACTAGTACATTACTCTATTTATTTTTTTAATAGGTATTCACT TATGAAACGTTTTAACCTATCAACTTAGTTAAGTCCAACGGTAGTCATACCGGTTAATTT ATCATTTGTCACTTTACTTTAATCTTTACTCTGAGACAACTGACTTCTTTGATAATCCTC AGTAAGAAAATAAGTTATCATTAGATCATTGAAATAATTTGATTTTCTGTAAGTTACGCG AATGAATTTTTAATAATTGGGCTAAAAGATTTTACTGCTTAATTAATCAGAGAAAAACGC TTAGTACTATGAAGTTACTCATAAGAAATGCTACAAACTGTTAGTAAAGATCAATGAAAT AGTAAAAGGGTTACATTTCTTAAAAATTCCTCTATTTTGTCTAAAGACTGACAAAACTTT TTAAATATTTTAACGATNAACGTTTTAAAGGACCAGAAATTTAAAGAAACGGAATGTATT TGAAACTAAATAACAAGTTGATTGAAATACTAAAGATAGCTAGTAGTAGGATTCACTCTA TTGGCTAAGCTTAAAACTTGATATCTTTCTTTTCAAAACAATATATTAATTGATTTGTTG CTATTATATCAAACATGAAAGTTATTAAATGTACTTCAACATGAATGAAATGTATTCAAT TCCATTTAAAATATAAGCTATTTACAAATAAACCTGCTTCTGGATATAATACTAACCTTT TGTAAATATTGTTGCTTGTTGACCTGAACATTACATAAGTGATAAATAAAAGTTTGCTTC TAGAATAATATTTTACAGTTTGGTCAATTGAACATGTTTTGACATATCTAAATGTATAAG AACTACAATTTAATCGTTCTGTCTTCTTC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)