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Schistosoma mansoni
cluster # 6574 cluster # 6574       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6574#0 length = 740 sequences # 4  

consensusID : consensus_6574#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 740
fasta sequence
                              [TACATATTTCTCCTGGTAACAAAAAAGAAATTTGTCTACATGAAACTGTTGAATATAAGACAATTAATATTAGTTATTTTTTTAAATATTTGGTCACAATGTTTAGGATATGTTACATTAATGTCAGAAGAAAATAACAGACAACAGCAACGACTACAAACCCCTTTATATTACTATTATCATGAAGGAGATATCACTTCTAATGAACAACCATATTATGAAGGAACTGGTGAAATGTATGATACTTATCAAGTGACACCGTATGATTATTATGTTGACGAAGGTGACAATAATAATAATAATAATATCGAGTATGAATACTCTGGAACTTATTCAAACTATTATCCAAATTCAGATTATGAAGTTAACTATGGTGAAAGTGATCAATACTATGGACCAGTTGAATACAGTGGTACATATAATGATTATGAAGACAATGATTATAACACTCAATATGATGAATATTATCCAAGACGAGATGTATTCAATAATTATCAAACAAAAACAACTAGAAGACATCCATCAAGTGGTGAATATAATGATTATCAAAAAAATGATTATGGAAATGAGAACAATTATGAAGGTGACATCTACAATGACTATAATTCATATAATACTAAGAATACAGTAGATGATCGTGATTATTCTAATTTACCTACAACATCATATAAACATCAAAAGTATGTACCTCATAGAATAATCTATTTAAATGGTTATTACCCAATTGATAATAAATTATA]

[+] EMBL CD067869             [TACATATTTCTCCTGGTAACAAAAAAGAAATTTGTCTACATGAAACTGTTGAATATAAGACAATTAATATTAGTTATTTTTTTAAATATTTGGTCACAATGTTTAGGATATGTTACATTAATGTCAGAAGAAAATAACAGACAACAGCAACGACTACAAACCCCTTTATATTACTATTATCATGAAGGAGATATCACTTCTAATGAACAACCATATTATGAAGGAACTGGTGAAATGTATGATACTTATCAAGTGACACCGTATGATTATTATGTTGACGAAGGTGACAATAATAATAATAATAATATCGAGTATGAATACTCTGGAACTTATTCAAACTATTATCCAAATTCAGATTATGAAGTTAACTATGGTGAAAGTGATCAATACTATGGACCAGTTGAATACAGTGGTACATATAATGATTATGAAGACAATGATTATAACACTCAATATGATGAATAT                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD129633             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATTATGAAGTTAACTATGGTGAAAGTGATCAATACTATGGACCAGTTGAATACAGTGGTACATATAATGATTATGAAGACAATGATTATAACACTCAATATGATGAATATTATCCAAGACGAGATGTATTCAATAATTATCAAACAAAAACAACTAGAAGACATCCATCAAGTGGTGAATATAATGATTATCAAAAAAATGATTATGGAAATGAGAACAATTATGAAGGTGACATCTACAATGACTATAATTCATATAATACTAAGAATACAGTAGATGATCGTGATTATTCTAATTTACCTACAACATCATATAAACATCAAAAGTATGTACCTCATAGAATAATCTATTTAAATGGTTATTACCCAATTGATAATAAATTATA]
[+] EMBL CD168327             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TATGGTGAAAGTGATCAATACTATGGACCAGTTGAATACAGTGGTACATATAATGATTATGAAGACAATGATTATAACACTCAATATGATGAATATTATCCAAGACGAGATGTATTCAATAATTATCAAACAAAAACAACTAGAAGACATCCATCAAGTGGTGAATATAATGATTATCAAAAAAATGATTATGGAAATGAGAACAATTATGAAGGTGACATCTACAATGACTATAATTCATATAATACTAAGAATACAGTAGATGATCGTGATTATTCTAATTTACCTACAACATCATATAAACATCAAAAGTATGTACCTCATAGAATAATCTATTTAAATGGTTATTACCCAATTGGTAATAAAT    ]
[+] EMBL CD129629             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATGGTGAAAGTGATCAATACTATGGACCAGTTGAATACAGTGGTACATATAATGATTATGAAGACAATGATTATAACACTCAATATGATGAATATTATCCAAGACGAGATGTATTCAATAATTATCAAACAAAAACAACTAGAAGACATCCATCAAGTGGTGAATATAATGATTATCAAAAAAATGATTATGGAAATGAGAACAATTATGAAGGTGACATCTACAATGACTATAATTCATATAATACTAAGAATACAGTAGATGATCGTGATTATTCTAATTTACCTACAACATCATATAAACATCAAAAGTATGTACCTCATAAAATAATCTATTTAAATGG                           ]


>consensus_6574#0 TACATATTTCTCCTGGTAACAAAAAAGAAATTTGTCTACATGAAACTGTTGAATATAAGA CAATTAATATTAGTTATTTTTTTAAATATTTGGTCACAATGTTTAGGATATGTTACATTA ATGTCAGAAGAAAATAACAGACAACAGCAACGACTACAAACCCCTTTATATTACTATTAT CATGAAGGAGATATCACTTCTAATGAACAACCATATTATGAAGGAACTGGTGAAATGTAT GATACTTATCAAGTGACACCGTATGATTATTATGTTGACGAAGGTGACAATAATAATAAT AATAATATCGAGTATGAATACTCTGGAACTTATTCAAACTATTATCCAAATTCAGATTAT GAAGTTAACTATGGTGAAAGTGATCAATACTATGGACCAGTTGAATACAGTGGTACATAT AATGATTATGAAGACAATGATTATAACACTCAATATGATGAATATTATCCAAGACGAGAT GTATTCAATAATTATCAAACAAAAACAACTAGAAGACATCCATCAAGTGGTGAATATAAT GATTATCAAAAAAATGATTATGGAAATGAGAACAATTATGAAGGTGACATCTACAATGAC TATAATTCATATAATACTAAGAATACAGTAGATGATCGTGATTATTCTAATTTACCTACA ACATCATATAAACATCAAAAGTATGTACCTCATAGAATAATCTATTTAAATGGTTATTAC CCAATTGATAATAAATTATA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)