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Schistosoma mansoni
cluster # 6699 cluster # 6699       Sequences # 4       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6699#0 length = 1143 sequences # 4  
consensusID : consensus_6699#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1143
fasta sequence 
                              [CACGAGGGGTGACGTTGCTGCATCAATGGGAAGTGCTGCACTATCATTGAATGAATCTTCAGGGTGGTCGCTTACTGCTCAATGA-GGCCGATATATATGGAGGATATCCAATGAAATTTTTAGTCATGGTGACAAAATTATCTAAAATTCTAGAAGTTAAGAAACGGTGTGTTGATGAACTACAAGATTTAAATGATGAAGCAGAACGAAAAATTTCCAATAAAGCTGAATTATCTTTAGAATTTCAACATACATATCTTACCTTGGTTATGCATTTAGAACGTTTGAATAAGGAATTAAATCAATATTTAGTACATGTATTACAATATGCAAATGAAATCGCTCAAGAACATGGTGTAGCACCGTTAGAACAAGCAGCTGATTTTAAACAGCGTTGTGATGAAGATGCCTATGAAATCGTCACACGAATAAAGAGTATGCAGGCTCAAAAATTCCGAAATTTGAAAACAGTTGATCTAATTACAAAACTTGTCAGTTTACTTGTACAAATTCGTTCATTAAGTGAACATGAAGAATCCACATATGATTGTTCTAGCATACAAGAATCTTTACATGAATTAAAATCGAGTATTCATTCTAGTAATGTTCATGTATTTGAAAACAGTGTAGAGATATCTATACATCATACATTAAGTGGCCTTTGTACATTAAGTAATTTAAATTCATTTTTATATACCCATCCTAATCATTTTCATTATTTATAATCATAATCATATTAATGATAATGATCATTCTTCTTTGTGAATAAATCAATGATATGAAGTATATTGTGTTCATTCCCCCCTGGTAACAAACAAACCGAAGAGTATTAAAAAGATTATTCTATCTGTTTTTTTGGGGGTTATTCATTATACTTTTGTCGTTTTCATTGATTGGGCATTATTTTTTTTG--GTGTGTGTGTGTGAAGTAAAAAAATGTTTATGTTTATATTAAAAATATGAATTTAT----TCTCTCTCTCTCTCGCTCTCATATTTCCTCTTTTTTTATTTTCGGTATAAAAATATATATTGTATTTATATTCCTTTTTTTCTTTGTCTCTTTCATATATACATATTTATTGTGTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGCCATGCAGCTGCATTACCGTACTGCGTA]

[+] EMBL CD084068             [CACGAGGGGTGACGTTGCTGCATCAATGGGAAGTGCTGCACTATCATTGAATGAATCTTCAGGGTGGTCGCTTACTGCTCAATGA GGCCGATATATATGGAGGATATCCAATGAAATTTTTAGTCATGGTGACAAAATTATCTAAAATTCTAGAAGTTAAGAAACGGTGTGTTGATGAACTACAAGATTTAAATGATGAAGCAGAACGAAAAATTTCCAATAAAGCTGAATTATCTTTAGAATTTCAACATACATATCTTACCTTGGTTATGCATTTAGAACGTTTGAATAAGGAATTAAATCAATATTTAGTACATGTATTACAATATGCAAATGAAATCGCTCAAGAACATGGTGTAGCACCGTTAGAACAAGCAGCTGATTTTAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD079952             [                                                               GTGGTCGCTTACTGCTCAATGAGGGCCGATATATATGGAGGATATCCAATGAAATTTTTAGTCATGGTGACAAAATTATCTAAAATTCTAGAAGTTAAGAAACGGTGTGTTGATGAACTACAAGATTTAAATGATGAAGCAGAACGAAAAATTTCCAATAAAGCTGAATTATCTTTAGAATTTCAACATACATATCTTACCTTGGTTATGCATTTAGAACGTTTGAATAAGGAATTAAATCAATATTTAGTACATGTATTACAATATGCAAATGAAATCGCTCAAGAACATGGTGTAGCACCGTTAGAACAAGCAGCTGATTTTAAACAGCGTTGTGATGAAGATGCCTATGAAATCGTCACACGAATAAAGAGTATGCAGGCTCAAAAATTCCGAAATTTGAAAACAGTTGATCTAATTACAAAACTTGTCAGTTTACTTGTACAAATTCGTTCATTAAGTGAACATGAAGAATCCACATATGATTGTTCTAGCATACAAGAATCTTTACATGAATTAAAATCGAGTATTCATTCTAGTAATGTTCATGTATTTGAAAACAGTGTAGAGATATCTATACATCATACATTAAGTGGCCTTTGTACATTAAGTAATTTANATTCATTTTTATATACCCATCCTAATCATTNTCATTATTTATAATCATAATCATATTAATGATAATGATCATTCTTCTTTGTGAAT AATC ATGATAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD074148             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GATGCCTATGAAATCGTCACACGAATAAAGAGTATGCAGGCTCAAAAATTCCGAAATTTGAAAACAGTTGATCTAATTACAAAACTTGTCAGTTTACTTGTACAAATTCGTTCATTAAGTGAACATGAAGAATCCACATATGATTGTTCTAGCATACAAGAATCTTTACATGAATTAAAATCGAGTATTCATTCTAGTAATGTTCATGTATTTGAAAACAGTGTAGAGATATCTATACATCATACATTAAGTGGCCTTTGTACATTAAGTAATTTAAATTCATTTTTATATACCCATCCTAATCATTTTCATTATTTATAATCATAATCATATTAATGATAATGATCATTCTTCTTTGTGAATAAATCAATGATATGAAGTATATTGTGTTCATTCCCCCCTGGTAACAAACAAACCGAAGAGTATTAAAAAGATTATTCTATCTGTTTTTTTGGGGGTTATTCATTATACTTTTGTCGTTTTCATTGATTGGGCATTATTTTTTTTG  GTGTGTGTGTGTGAAGTAAAAAAATGTTTATGTTTATATTAAAAATATGAATTTAT    TCTCTCTCTCTCTCGCTCTCATATTTCCTCTTTTTTTATTTTCGGTATAAAAATATATAT                                                                                                                   ]
[-] EMBL AI977280             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      nAATCGAGTATTCATTCTAGTAATGTTCATGTATTTGAAAACAGTGTAGAGATATCTATACATCATACATTAAGTGGCCTTTGTACATTAAGTAATTTAAATTCATTTTTATATACCCATCCTAATCATTTTCATTATTTATAATCATAATCATATTAATGATAATGATCATTCTTCTTTGTGAATAAATCAATGATATGAAGTATATTGTGTTGATTCCCCCCTGGTAACAAACAAACCGAAGAGTATTAAAAAGATTATTCTATCTGTTTTTTGGGGGGTTATTCATTATACTTTTGTCGTTTTCATTGATTGGGCATTATTTTTTTTGGTGTGTGTGTGTGTGAAGTAAAAAAATGTTTATGTTTATATTAAAAATATGAATTTATTCTCTCTCTCTCTCTCTCGCTATCATATTTCCTCTTTTTTTATTTTCGGTATAAAAATATATATTGTATTTATATTCCTTTTTTTCTTTGTCTCTTTCATATATACATATTTATTGTGTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGCCATGCAGCTGCATTACCGTACTGCGTA]




>consensus_6699#0
CACGAGGGGTGACGTTGCTGCATCAATGGGAAGTGCTGCACTATCATTGAATGAATCTTC
AGGGTGGTCGCTTACTGCTCAATGAGGCCGATATATATGGAGGATATCCAATGAAATTTT
TAGTCATGGTGACAAAATTATCTAAAATTCTAGAAGTTAAGAAACGGTGTGTTGATGAAC
TACAAGATTTAAATGATGAAGCAGAACGAAAAATTTCCAATAAAGCTGAATTATCTTTAG
AATTTCAACATACATATCTTACCTTGGTTATGCATTTAGAACGTTTGAATAAGGAATTAA
ATCAATATTTAGTACATGTATTACAATATGCAAATGAAATCGCTCAAGAACATGGTGTAG
CACCGTTAGAACAAGCAGCTGATTTTAAACAGCGTTGTGATGAAGATGCCTATGAAATCG
TCACACGAATAAAGAGTATGCAGGCTCAAAAATTCCGAAATTTGAAAACAGTTGATCTAA
TTACAAAACTTGTCAGTTTACTTGTACAAATTCGTTCATTAAGTGAACATGAAGAATCCA
CATATGATTGTTCTAGCATACAAGAATCTTTACATGAATTAAAATCGAGTATTCATTCTA
GTAATGTTCATGTATTTGAAAACAGTGTAGAGATATCTATACATCATACATTAAGTGGCC
TTTGTACATTAAGTAATTTAAATTCATTTTTATATACCCATCCTAATCATTTTCATTATT
TATAATCATAATCATATTAATGATAATGATCATTCTTCTTTGTGAATAAATCAATGATAT
GAAGTATATTGTGTTCATTCCCCCCTGGTAACAAACAAACCGAAGAGTATTAAAAAGATT
ATTCTATCTGTTTTTTTGGGGGTTATTCATTATACTTTTGTCGTTTTCATTGATTGGGCA
TTATTTTTTTTGGTGTGTGTGTGTGAAGTAAAAAAATGTTTATGTTTATATTAAAAATAT
GAATTTATTCTCTCTCTCTCTCGCTCTCATATTTCCTCTTTTTTTATTTTCGGTATAAAA
ATATATATTGTATTTATATTCCTTTTTTTCTTTGTCTCTTTCATATATACATATTTATTG
TGTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGCCATGCAGCTGCATTACCGTACTGC
GTA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)