cluster # 6702

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Schistosoma mansoni
cluster # 6702 cluster # 6702 Sequences # 4 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6702#0 length = 882 sequences # 4
consensusID : consensus_6702#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 882
fasta sequence
                              [TTCTAGTTCATGTAAATTAATTCTCACACAATCATAAATAGGTGCATGTTTCACAAATTGTTGACAATGCTATTGATTTTTCAAATATTTAATTGACAGATTTTTTCTTCTTATACTCATATACAAAAATGTATATCTATGTATTTTTTTTTATCACATACCAATAACTTCAGTGTATAAAGATTTTTTTCACTCTTTACTTCTATATCCTAACTTCGATTTCTTTTTAATTTCACTTATATGAATTTCATCCTATTCCTTCTAGTCAGTCGTATGAAAATATATTCTTTGTAAAATTATACTTAAAATAACTAAGAATCTAAACGTTCATTTGTGTAAAATAATTCCAACAATATTGATATTAGTCGTATTATTGATTGCTGATCAAGGTGCATTGAATATTGATTATCTTATTGGTTCATAAGTATATGTTGATAGTGTTTTCCAAGCAATATATCCTACTGATCATTATGAATAATATTTATTTTAATTTTGTTTGTAGACAAGTATTTTGTATTGTAAAGTCTATAATGTCATTCATTTGCTAGACAACATTAAAGTCGGATTGGAAATGTTTGTTTTCATGTTTTTGATAAGCTTCATGAATTCAACGCATTCCCACTTTTGATTGTATTTACTAATTATCCTTAGCCAAATAATTGTTGTGGATAGATTACCAAAATAATACTCTACCATAAGTTAGTTCCTTGGACCTTAGTGGATTAGTGTTTTAGTGAAAGTAATTCCGTTTTAAGTCGTAGATTCGAACGTCACTTCATCTACTGGGGTTCTTATAATCTGTTGGTATCACCAACCCTCACATCAAGTGAAGCTCATAAGAAAGTTTATAAATTTGTAGTTGGTGAATAAGTACCATTTCTT]

[+] EMBL CD084597             [TTCTAGTTCATGTAAATTAATTCTCACACAATCATAAATAGGTGCATGTTTCACAAATTGTTGACAATGCTATTGATTTTTCAAATATTTAATTGACAGATTTTTTCTTCTTATACTCATATACAAAAATGTATATCTATGTATTTTTTTTTATCACATACCAATAACTTCAGTGTATAAAGATTTTTTTCACTCTTTACTTCTATATCCTAACTTCGATTTCTTTTTAATTTCACTTATATGAATTTCATCCTATTCCTTCTAGTCAGTCGTATGAAAATATATTCTTTGTAAAATTATACTTAAAATAACTAAGAATCTAAACGTTCATTTGTGTAAAATAATTCCAACAATATTGATATTAGTCGTATTATTGATTGCTGATCAAGGTGCATTGAATATTGATTATCTTATTGGTTCATAAGTATATGTTGATAGTGTTTTCCAAGCAATATATCCTACTGATCATTATGAATAATATTTATTTTAATTCTGTTTGTAGACAAGTATTTTGTATTGTAAAGTCTATAATGTCATTCATTTGCTAGACAACATTAAAGTCGGATTGGAAATGCTTGTTTTCATGTTTTTGATAAGCTTCATGAATTCAACGCATTCCCACTTTTGATTGTATTTACTAATT                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD074249             [                                                                                                                          ACAAAAATGTATATCTATGGATTTTTTTTTATCACATATCAATAACTTCAGTGTATAAAGATTTTTTTCACTCTTTACTTTTATATCCTAACTTCGATTTTTTTTTAATTTCACTTATATGAATTTCATCCTATTCCTTTTAGTCAGTTGTATGAAAATATATTTTTTGTAAAATTATACTTAAAATAACTAAGAATTTAAACGTTCATTTGTGTAAAATAATTCCCACAATATTGATATTAGTCGTATTATTGATTGCTGATCAAGGGGCATTGAATATTGATTATTTTATTGGTTCATAAGTATATGTTGATAGTGTTTTCCCAGCCATATATCCTACTGATCATTATGAATAATATTTATTTTAATTTTGTTTGTAGACAAGTATTTTGTATTGTAAAGTTTATAATTTCATTGGTTTGGTAGACAACAaaaa                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD084579             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTTGTGTAAAATAATTCCAACAATATTGATATTAGTCGTATTATTGATTGCTGATCAAGGTGCATTGAATATTGATTATCTTATTGGTTCATAAGTATATGTTGATAGTGTTTTCCAAGCAATATATCCTACTGATCATTATGAATAATATTTATTTTAATTTTGTTTGTAGACAAGTATTTTGTATTGTAAAGTCTATAATGTCATTCATTTGCTAGACAACATTAAAGTCGGATTGGAAATGTTTGTTTTCATGTTTTTGATAAGCTTCATGAATTCAACGCATTCCCACTTTTGATTGTATTTACTAATTATCCTTAGCCAAATAATTGTTGTGGATAGATTACCAAAATAATACTCTACCATAAGTTAGTTCCTTGGACCTTAGTGGATTAGTGTTTTAGTGAAAGTAATTCCGTTTTAAGTCGTAGATTCGAACGTCACTTCATCTACTGGGGTTCTTATAATCTGTTGGTATCACCAACCCTCACATCAAGTGAAGCTCATAAGAAAGTTTATAAATTTGTAGTTGGTGAATAAGTACCATTTCTT]
[-] EMBL CD128767             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CATTGAATATTGATTATCTTATTGGTTCATAAGTATATGCTGATAGTGTTTTCCAAGCAATATATCCTACTGATCATTATGAATAATATTTATTTTAATTTTGTTTGTAGACAAGTATTNTGTATTGTAAAGTCTATAATGTCATTCATTTGCTAGACAACATTAAAGTCGGATTGGAAATGTTTGTTTTCATGTTTTTGATAAGCTTCATGAATTCAACACATTCCCACTTTTGATTGTATTTACTAATTATCCTTAGCCAAATAATTGTTGTGGATAGATTACCAAAATAATACTCTACCATAAGTTAGTTCCTTGGACCTTAGTGGATTAGTGTTTTAGTGAAAGTAATTCCGTTTTAAGTCGTAGATTCGAACGTCACTTCATCTACTGGGGTTCTTATATNCTGTTGGTATCACCAAC                                                                   ]




>consensus_6702#0
TTCTAGTTCATGTAAATTAATTCTCACACAATCATAAATAGGTGCATGTTTCACAAATTG
TTGACAATGCTATTGATTTTTCAAATATTTAATTGACAGATTTTTTCTTCTTATACTCAT
ATACAAAAATGTATATCTATGTATTTTTTTTTATCACATACCAATAACTTCAGTGTATAA
AGATTTTTTTCACTCTTTACTTCTATATCCTAACTTCGATTTCTTTTTAATTTCACTTAT
ATGAATTTCATCCTATTCCTTCTAGTCAGTCGTATGAAAATATATTCTTTGTAAAATTAT
ACTTAAAATAACTAAGAATCTAAACGTTCATTTGTGTAAAATAATTCCAACAATATTGAT
ATTAGTCGTATTATTGATTGCTGATCAAGGTGCATTGAATATTGATTATCTTATTGGTTC
ATAAGTATATGTTGATAGTGTTTTCCAAGCAATATATCCTACTGATCATTATGAATAATA
TTTATTTTAATTTTGTTTGTAGACAAGTATTTTGTATTGTAAAGTCTATAATGTCATTCA
TTTGCTAGACAACATTAAAGTCGGATTGGAAATGTTTGTTTTCATGTTTTTGATAAGCTT
CATGAATTCAACGCATTCCCACTTTTGATTGTATTTACTAATTATCCTTAGCCAAATAAT
TGTTGTGGATAGATTACCAAAATAATACTCTACCATAAGTTAGTTCCTTGGACCTTAGTG
GATTAGTGTTTTAGTGAAAGTAATTCCGTTTTAAGTCGTAGATTCGAACGTCACTTCATC
TACTGGGGTTCTTATAATCTGTTGGTATCACCAACCCTCACATCAAGTGAAGCTCATAAG
AAAGTTTATAAATTTGTAGTTGGTGAATAAGTACCATTTCTT
clustalw multiple alignements is not computed in this case