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Schistosoma mansoni
cluster # 6739 cluster # 6739       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6739#0 length = 772 sequences # 4  

consensusID : consensus_6739#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 772
fasta sequence
                              [TATATGAT-ATTAATGAATTGAGAAAATTAGTATGAATATGATTATTATTATTTCTATTGTATGTTGGTTTAATGAAGAAATCACTTTTCGATGGTCTAAATGCATCAGACATTGATGTGATCGAATCAAAATTCACTCGTTCTCTTATTTGTACGGATTTAATATTCTCTTCATGATTATTAACTAAGATCAGTTGTTGATCATGATCAGCATCGTCGGTTGTTTCTGACCATTCCAATTGTTTAATGAATTGTTTTAAATCATTCTCTGACATATCCAAAAAACTCATTAGTAATGGTTTGGATATACGTTGATAGGTTTGTGAAATAATTTGTACAATAAATTTACATACGGATTCACGGAATCCAGGGATAGCAGAAAAAATTTTGGGATTTTCTTTAACTTTCGTCCAAAACTCAGAAAACCGACAAGTTTCCAGAAAAAGCCCAAGTTTCACAACCTGCGAAAGTGGCTCTTCATTGAGATGTTCCAGATGAATCAAGTACTTGCACAATGTAAAATCTGAGTGACTCATGCTTATAATTGCCTTTAGCAACACTAACCTCGCACACTCAGCATTGAAACGTTCTGGATAGAACTGATATAATCTAAGTAGAGCTAAATTAGCTTCGAAATCATAATCATTATTTATAATCTGCCACGAAAGATGTTCTTCAAGTGCTGCTATGTGTTCAGGGTTATAGCT--CT-CTATT-CCTTGTAGTTTGCTTTTGATGACTGCCTTACGATCCATAACGTGAAACACTTCAAGAAC]

[+] EMBL CD074991             [TATATGAT ATTAATGAATTGAGAAAATTAGTATGAATATGATTATTATTATTTCTATTGTATGTTGGTTTAATGAAGAAATCACTTTTCGATGGTCTAAATGCATCAGACATTGATGTGATCGAATCAAAATTCACTCGTTCTCTTATTTGTACGGATTTAATATTCTCTTCATGATTATTAACTAAGATCAGTTGTTGATCATGATCAGCATCGTCGGTTGTTTCTGACCATTCCAATTGTTTAATGAATTGTTTTAAATCATTCTCTGACATATCCAAAAAACTCATTAGTAATGGTTTGGATATACGTTGATAGGTTTGTGAAATAATTTGTACAATAAATTTACATACGGATTCACGGAATCCAGGGATAGCAGAAAAAATTTTGGGATTTTCTTTAACTTTCGTCCAAAACTCAGAAAACCGACAAGTTTCCAGAAAAAGCCCAAGTTTCACAACCTGCGAAAGTGGCTCTTCATTGAGATGTTCCAGATGAATCAAGTACTTGCACAATGTAAAATCTGAGTGACTCATGCTTATAATTGCCTTTAGCAACACTAACCTCGCACACTCAGCATTGAAACGTTCTGGATAGAACTGATATAATCTAAGTAGAGCTAAATTAGCTTCGAAATCATAATCATTATTTATAATCTGCCACGAAAGATGTTCTTCAAGTGCTGCTATGTGTTCAGGGTTATAGCT  CT CTATT CCTTGTAGTTTGCTTTTGATGACTGCCTTACGATCCATAAC                  ]
[+] EMBL AW017182             [TATATGATAAATAATGAATTTATTTATTTAGTATGAATATGATTATTATTATGATTATTGTATGTTGTTTTAATGAAGAAATCACTTTTCGATGGTCTAAATGCATCAGACATTGATGTGATCGAATCAAAATTCACTCGTTCTCTTATTTGTACGGATTTAATATTCTCTTCATGATTATTAACTAAGATCAGTTGTTGATCATGATCAGCATCGTCGGTTGTTTCTGACCATTCCAATTGTTTAATGAATTGTTTTAAATCATTCTCTGACATATCCAAAAAACTCATTAGTAATGGTTTGGATATACGTTGATAGGTTTGTGAAATAATTTGTACAATAAATTTACATACGGATTCACGGAATCCAGGGATAGCAGAAAAAATTTTGGGATTTTCTTTAACTTTCGTCCAAAACTCAGAAAACCGACAAGTTTCCAGAAAAAGCCCAAGTTTCACAACCTGCGAAAGTGGCTCTTCATTGAGATGTTCCAGATGAATCAAGTACTTGCACAATGTAAAATCTGAGTGACTCATGCTTATAATTGCCTTTAGCAACACTAACCTTGCACACTCAGCATTGAAACGTTCTG                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD081170             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATGTAAAATCTGAGTGACTCATGCTTATAATTGCCTTTAGCAACACTAACCTCGCACACTCAGCATTGAAACGTTCTGGATAGAACTGATATAATCTAAGTAGAGCTAAATTAGCTTCGAAATCATAATCATTATTTATAATCTGCCACGAAAGATGTTCTTCAAGTGCTGCTATGTGTTCAGGGTTATAGCTNNCTNCTATTCCCTTGTAGTTTGCTTTTGATGACgaa                                 ]
[+] EMBL CD160811             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GTTCTGGATAGAACTGATATAATCTAAGTAGAGCTAAATTAGCTTCGAAATCATAATCATTATTTATAATCTGCCACGAAAGATGTTCTTCAAGTGCTGCTATGTGTTCAGGGTTATAGCT  CT CTATT CCTTGTAGTTTGCTTTTGATGACTGCCTTACGATCCATAACGTGAAACACTTCAAGAAC]


>consensus_6739#0 TATATGATATTAATGAATTGAGAAAATTAGTATGAATATGATTATTATTATTTCTATTGT ATGTTGGTTTAATGAAGAAATCACTTTTCGATGGTCTAAATGCATCAGACATTGATGTGA TCGAATCAAAATTCACTCGTTCTCTTATTTGTACGGATTTAATATTCTCTTCATGATTAT TAACTAAGATCAGTTGTTGATCATGATCAGCATCGTCGGTTGTTTCTGACCATTCCAATT GTTTAATGAATTGTTTTAAATCATTCTCTGACATATCCAAAAAACTCATTAGTAATGGTT TGGATATACGTTGATAGGTTTGTGAAATAATTTGTACAATAAATTTACATACGGATTCAC GGAATCCAGGGATAGCAGAAAAAATTTTGGGATTTTCTTTAACTTTCGTCCAAAACTCAG AAAACCGACAAGTTTCCAGAAAAAGCCCAAGTTTCACAACCTGCGAAAGTGGCTCTTCAT TGAGATGTTCCAGATGAATCAAGTACTTGCACAATGTAAAATCTGAGTGACTCATGCTTA TAATTGCCTTTAGCAACACTAACCTCGCACACTCAGCATTGAAACGTTCTGGATAGAACT GATATAATCTAAGTAGAGCTAAATTAGCTTCGAAATCATAATCATTATTTATAATCTGCC ACGAAAGATGTTCTTCAAGTGCTGCTATGTGTTCAGGGTTATAGCTCTCTATTCCTTGTA GTTTGCTTTTGATGACTGCCTTACGATCCATAACGTGAAACACTTCAAGAAC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)