These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6741#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 1048 fasta sequence [TAATTTCTATATTATAATTATTAATAAAAAAATTACTAAAGT-GCGTTTACAAAATCACTTTTAAAAAAAAAACAATCCGCCATTATTATTCTTTTTACTGGTAATGCCAAAAAAACTAAAACAGTGAAAACTACTGGTATCGGATAGTACCAATTAAAAAACATAAATATTAATATAAACTAGTCGCCGCAAAAAAAAGGAACACGAAACCGAAAACAGAGAGAACAAAGTGTGAGAAAATGACTAAGTTCATGATATTCAATTATAATAAAAAAATAAGAAAATAGTAAAGTAAGAAAAGTTGACAACAGCCGTGTTTGATAATAATAAATACTAAAATAAAATGCTATTGATGTTATGTAATTAAATAAGACAAACAAGG-TGCAGCTTAGTTTACATAGACTTATGTATAAGCAACATTAGAATAAAGATATAAATGATAAAATTAGTGCCTTTTTTGAGAAAGAACATTATGTAGTTTGTTGATATGAATTCTGTGTAAATCGGTTTGATTACACATACTAAAAATATTTTTTCGATGTTAATTACAGCCATTCTATGCTACATCATAATAAGAGATAGTTTTAATGATGAATAAAACTCGACTAGGTATATATTGATACAGTAATAAATAGATACAAATTAAATCAAATAAAAGAGAATATCAAAAAAAAGTAAAATTATTAGATAAAGTAAGCAGAAAAATTATTGGAAGACAACTTTAAGAGTAAATCATAATGAAGTGACTGCAGTTTATGAACGCGGTAACTGTAAATAAGAATTTAGCATGAATCGTAATAAAGAATACACAACAATAGAGGGGATCAATGATATGTATTTCATTTGCGTTGATTTATTTAACACTTGATAAAAATGTCTTGATTATTTTGTACACATTTAAAAATAACTATATATGTATTGTTGATCATCAATCAAATCCCTGGATAATTAGGCATTAGTGAAGGATCTAAAGCTCGATACTGATGATGCATATCACGAGCACCGTTATTTATATCGACCTGTCTAGCGACATCTTCCAAATCATGAC] [+] EMBL CD075138 [TAATTTCTATATTATAATTATTAATAAAAAAATTACTAAAGT GCGTTTACAAAATCACTTTTAAAAAAAAAACAATCCGCCATTATTATTCTTTTTACTGGTAATGCCAAAAAAACTAAAACAGTGAAAACTACTGGTATCGGATAGTACCAATTAAAAAACATAAATATTAATATAAACTAGTCGCCGCAAAAAAAAGGAACACGAAACCGAAAACAGAGAGAACAAAGTGTGAGAAAATGACTAAGTTCATGATATTCAATTATAATAAAAAAATAAGAAAATAGTAAAGTAAGAAAAGTTGACAACAGCCGTGTTTGATAATAATAAATACTAAAATAAAATGCTATTGATGTTATGTAATTAAATAAGACAAACAAGG TGCAGCTTAGTTTACATAGACTTATGTATAAGCAACATTAGAATAAAGATATAAATGATAAAATTAGTGCCTTTTTTGAGAAAGAACATTATGTAGTTTGTTGATATGAATTCTGTGTAAATCGGTTTGATTACACATACTAAAAATATTTTTTCGATGTTAATTACAGCCATTCTATGCTACATCATAATAAGAGATAGTTTTAATGATGAATAAAACTCGACTAGGTATATATTGATACAGTA ] [+] EMBL CD075017 [ aatcctTATATTATAAGAATTAATAAAAAAATTACTAAAGTGGCGTTTTCCAAATCACTTTTAAAAAAAAAACAATCCGCCATTATTATTCTTTTTACTGGTAATGCCAAAAAAACTAAAACAGTGAAAACTACTGGTATCGGATAGTACCAATTAAAAAACATAAATATTAATATAAACTAGTCGCCGCAAAAAAAAGGAACACGAAACCGAAAACAGAGAGAACAAAGTGTGAGAAAATGACTAAGTTCATGATATTCAATTATAATAAAAAAATAAGAAAATAGTAAAGTAAGAAAAGTTGACAACAGCCGTGTTTGATAATAATAAATACTAAAATAAAATGCTATTGATGTTATGTAATTAAATAAGACAAACAAGG TGCAGCTTAGTTTACATAGACTTATGTATAAGCAACATTAGAATAAAGATATAAATGATAAAATTAGTGCCTTTTTTGAGAAAGAACATTATGTAGTTTGTTGATATGAATTCTGTGTAAATCGGTTTGATTACACATACTAAAAATATTTTTTCGATGTTAATTACAGCCATTCTATGCTACATCATAATAAGAGATAGTTTTAATGATGAATAAAACTCGACTAGGTATATATTGATACAGTAATAAATAGATACAAATTAAATCAAATAAAAGAGAATATCAAAAAAAAGTAAAATTATTAGATAAAGTAAGCAGAAAAATTATTGGAAGACAACTTTAAGAGTAAATCATAATGAAGTGACTGCA ] [-] EMBL CD081306 [ TAAATAAGAC AACAAGGNTGCAGCTTAGTTTACATAGACTTATGTATAAGCAACATTAGAATAAAGATATAAATGATANAATTAGTGCCTTTTNTGAGAAAGAACATTATGTAGTTTGTTGATATGAATTCTGTGTAAATCGGTTTGATTACACATACTAAAAATATTTTTTCGATGTTAATTACAGCCATTCTATGCTACATCATAATAAGAGATAGTTTTAATGATGAATAAAACTCGACTAGGTATATATTGATACAGTAATAAATAGATACAAATTAAATCAAATAAAAGAGAATATCAAAAAAAAGTAAAATTATTAGATAAAGTAAGCAGAAAAATTATTGGAAGACAACTTTAAGAGTAAATCATAATGAAGTGACTGCAGTTTATGAACGCGGTAACTGTAAATAAGAATTTAGCATGAATCGTAATAAAGAATACACAACAATAGAGGGGATCAATGATATGTATTTCATTTGCGTTGATTTATTTAACACTTGATAAAAATGTCTTGATTATTTTGTACACATTTAAAAATAACTATATATGTATTGTTGATCATCAATCAAATCCCTGGATAATTAGGCATTAGTGAAGGATCTAAAGCTCGATACTGATGATGCATATCACGAGCACCGTTATTTATATCGACCTGTCTAGCGACATCTTCCAAATCATGAC] [+] EMBL CD141477 [ ATATGTATTTCATTTGCGTTGATTTATTTAACACTTGATAAAAATGTCTTGATTATTTTGTACACATTTAAAAATAACTATATATGTATTGTTGATCATCAATCAAATCCCTGGATAATTAGGCATTAGTGAAGGATCTAAAGCTCGATACTGATGATGCATATCACGAGCACCGTTATTTA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||