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Schistosoma mansoni
cluster # 6756 cluster # 6756       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6756#0 length = 791 sequences # 4  

consensusID : consensus_6756#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 791
fasta sequence
                              [NCGGAGGCCATNAATTCGGCACGCAGGCGACCATCAAAAATCAAGAAGCATTGGACAACTGTTTCGTTAAAATCCCCATCAAAGCATATCTAAAACCCTTTCACAGGCTATCGAACCCATAACCTTCAAGTCACGTGGTAACCGCTTTACCTTTACACTACCAAAATTGGCATTGAATTGCTCACAAGCATAAATTTAACAAATTCGCGATACTGTGCAACCATCTTCTATTTTTCTTGGTTGGTATCTATCGAAGACTTGAAAACGTTGCACTCCACTGATCATGTCTTCTCATTATAACTCGTGTAATTTCGTTTCAAATTTAGCTACTTGTGAACAAATAATGATTATCATTATGGGAATCTGTAGGGGTCGTGATCCCAATAACATTCACCAATCTCCATAACCCATCATATTGATAATAATAATAAGACGAAGTATCATTTTCATGTTAACCAAGGGTTTGACCAGAATTGTCATTATTCAGAAAACTCCAGAAAAGACATGCTTCATTGATAATTTACAACAGAAAGTGTAAAGTAGACTTTCCATTCTACATCGAACTAATTTTTTTTCTGCCCAACTTTAACAACATACTTATGACAAGTAATTATAACTATTAGTTGTGATTATATTAGAGAGAAACACTTCAGTTACTAATATCTTTCTTAAAAAAAATTAACTTCGTTTTCTTTTGTGTTTACAGAGAGAAAAAAATTGAAAAAAAAAATCAAAGTTACAAGTGATATTTACTTGAAGGTTGATTAATGTTAGGATAAATAAACAAACCA]

[+] EMBL CD081499             [NCGGAGGCCATNAATTCGGCACGCAGGCGACCATCAAAAATCAAGAAGCATTGGACAACTGTTTCGTTAAAATCCCCATCAAAGCATATCTAAAACCCTTTCACAGGCTATCGAACCCATAACCTTCAAGTCACGTGGTAACCGCTTTACCTTTACACTACCAAAATTGGCATTGAATTGCTCACAAGCATAAATTTAACAAATTCGCGATACTGTGCAACCATCTTCTATTTTTCTTGGTTGGTATCTATCGAAGACTTGAAAACGTTGCACTCCACTGATCATGTCTTCTCATTATAACTCGTGTAATTTCGTTTCAAATTTAGCTACTTGTGAACAAATAATGATTATCATTATGGGAATCTGTAGGGGTCGTGATCCCAATAACATTCACCAATCTCCATAACCCATCATATTGATAATAATAATAAGACGAAGTATCATTTTCATGTTAACCAAGGGTTTGACCAGAATTGTCATTATTCAGAAAACTCCAGAAAAGACATGCTTCATTGATAATTTACAACAGAAAGTGTAAAGTAGACTTTCCATTCTACATCGAACTAATTTTTTTTCTGCCCAACTTTAACAACATACTTATGACAAGTAATTATAACTATTAGTTGTGATTATATTAGAGAGAAACACTTCAGTTACTAATATCTTTCTTAAAAAAAATTAACTTCGTTTTCTTTTGTGTTTACAGAGAGAAAAAAATTGAAAAAAAAAATCAAAGTTACAAGTGATATTTACTTGAAGGTTGATTAATGTTAGGATAAATAAACAAACC ]
[+] EMBL CD081497             [             ATTC GCAC CA GCGACC TCAAAAATC AGAAGCATTGGACAACTGTTTCGTTAAAATCCCCATCAAAGCATATCTAAAACCCTTTCACAGGCTATCGAACCCATAACCTTCAAGTCACGTGGTAACCGCTTTACCTTTACACTACCAAAATTGGCATTGAATTGCTCACAAGCATAAATTTAACAAATTCGCGATACTGTGCAACCATCTTCTATTTTTCTTGGTTGGTATCTATCGAAGACTTGAAAACGTTGCACTCCACTGATCATGTCTTCTCATTATAACTCGTGTAATTTCGTTTCAAATTTAGCTACTTGTGAACAAATAATGATTATCATTATGGGAATCTGTAGGGGTCGTGATCCCAATAACATTCACCAATCTCCATAACCCATCATATTGATAATAATAATAAGACGAAGTATCATTTTCATGTTAACCAAGGGTTTGACCAGAATTGTCATTATTCAGAAAACTCCAGAAAAGACATGCTTCATTGATAATTTACAACAGAAAGTGTAAAGTAGACTTTCCATTCTACATCGAACTAATTTTTTTTCTGCCCAACTTTAACAACATACTTATGACAAGTAATTATAACTATTAGTTGTGATTATATTAGAGAGAAACACTTCAGTTACTAATATCTTTCTTAAAAAAAATTAACTTCGTTTTCTTTTGTGTTTACAGAGAGAAAAAAATTGAAAAAAAAAATCAAAGTTACAAGTGATATTTACTTGAAGGTTGATTAATGTTAGGATAAATAAACAAcc  ]
[-] EMBL CD075321             [                                                                                                                                                                                                                                                                                               CTTCTCATTATAACTCGTGTAATTTCGTTTCAAATTTAGCTACTTGTGAACAAATAATGATTATCATTATGGGAATCTGTAGGGGTCGTGATCCCAATAACATTCACCAATCTCCATAACCCATCATATTGATAATAATAATAAGACGAAGTATCATTTTCATGTTAACCAAGGGTTTGACCAGAATTGTCATTATTCAGAAAACTCCAGAAAAGACATGCTTCATTGATAATTTACAACAGAAAGTGTAAAGTAGACTTTCCATTCTACATCGAACTAATTTTTTTTCTGCCCAACTTTAACAACATACTTATGACAAGTAATTATAACTATTAGTTGTGATTATATTAGAGAGAAACACTTCAGTTACTAATATCTTTCTTAAAAAAAATTAACTTCGTTTTCTTTTGTGTTTACAGAGAGAAAAAAATTGAAAAAAAAAATCAAAGTTACAAGTGATATTTACTTGAAGGTTGATTAATGTTAGGATAAATAAACAAACCA]
[-] EMBL CD075323             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CTCATTATAACTCGTGTAATTTCGTTTCAAATTTAGCTACTTGTGAACAAATAATGATTATCATTATGGGAATCTGTAGGGGTCGTGATCCCAATAACATTCACCAATCTCCATAACCCATCATATTGATAATAATAATAAGACGAAGTATCATTTTCATGTTAACCAAGGGTTTGACCAGAATTGTCATTATTCAGAAAACTCCAGAAAAGACATGCTTCATTGATAATTTACAACAGAAAGTGTAAAGTAGACTTTCCATTTTACATCGAACTAATTTTTTTTCTGCCCAACTTTAACAACATACTTATGACAAGTAATTATAACTATTAGTTGTGATTATATTAGAGAGAAACACTTCAGTTACTAATATCTTTCTTAAAAAAAATTAACTTCGTTTTCTTTTGTGTTTACAGAGAGAAAAAAATTGAAAAAAAAAATCAAAGTTACAAGTGATATTTACTTGAAGGTTGATTAATGTTAGGATAAATAAACAAACCA]


>consensus_6756#0 NCGGAGGCCATNAATTCGGCACGCAGGCGACCATCAAAAATCAAGAAGCATTGGACAACT GTTTCGTTAAAATCCCCATCAAAGCATATCTAAAACCCTTTCACAGGCTATCGAACCCAT AACCTTCAAGTCACGTGGTAACCGCTTTACCTTTACACTACCAAAATTGGCATTGAATTG CTCACAAGCATAAATTTAACAAATTCGCGATACTGTGCAACCATCTTCTATTTTTCTTGG TTGGTATCTATCGAAGACTTGAAAACGTTGCACTCCACTGATCATGTCTTCTCATTATAA CTCGTGTAATTTCGTTTCAAATTTAGCTACTTGTGAACAAATAATGATTATCATTATGGG AATCTGTAGGGGTCGTGATCCCAATAACATTCACCAATCTCCATAACCCATCATATTGAT AATAATAATAAGACGAAGTATCATTTTCATGTTAACCAAGGGTTTGACCAGAATTGTCAT TATTCAGAAAACTCCAGAAAAGACATGCTTCATTGATAATTTACAACAGAAAGTGTAAAG TAGACTTTCCATTCTACATCGAACTAATTTTTTTTCTGCCCAACTTTAACAACATACTTA TGACAAGTAATTATAACTATTAGTTGTGATTATATTAGAGAGAAACACTTCAGTTACTAA TATCTTTCTTAAAAAAAATTAACTTCGTTTTCTTTTGTGTTTACAGAGAGAAAAAAATTG AAAAAAAAAATCAAAGTTACAAGTGATATTTACTTGAAGGTTGATTAATGTTAGGATAAA TAAACAAACCA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)