cluster # 6787

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Schistosoma mansoni
cluster # 6787 cluster # 6787 Sequences # 4 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6787#0 length = 872 sequences # 4
consensusID : consensus_6787#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 872
fasta sequence
                              [GACTAATCCTTTGTTTTTCGTATAAACCAGCATCTAATAACACTAATATTAACCATAATAGTATTAGTATATATCAGTAAACCAGATAAGATTAAATAAGTACATTACTCTTTGTACAAATATTGTATTACGCTCTCACTTCTTCTTATTGAACCATGTTTAATTTGCCCAAACTCTCGAGGTACCTCATGGTCCTATTTATTTCTATATTCTGTGTCTGATTAATGTATTTGTGTATCTGCATAGAAACCTCCCATTATTATTATTATTATTATTACTCAATATGTGTATAAACAAATAAGTGTATTGTGCATAAACTTTGTACTGGTGAGTGTTCGCTTCCTCTCTGTGTCTGTCCTTTGGCTTGTGTGTTTCTTTTTGATACTCTTTGCTGTTTCAATGTATCTAACTGCTAATACAGTCAGTGTAATTTTTCATGTCACCACTTTCTCTTGGTCTCTTCTTATAGTTCTGTTTTGTTTCATCATTACCTTTTCTGAATTTTTATCTATCGTATTGTCCTTCTCTGTTTCTCGCGCATATTCATGTTTTATTAAGAAAACCATATTTAATAACAAAAAATAGATGTATTTTTTAAATTTTATTTAGTTGAAAAGATATTCTACAATTTTTGGTACTTTTGACTCAACTGTGACAGTAATATCGGGAAGTTGTTAATCTATTCGAAAATAATCTGAATAACCTACGTTGAACTAATCGATCATCTGACATTCTTATTTCAGTTGTTATTGTGTTTAGAGGTAGCTTTGTTCAACTTATTAATCTCATATTGACTGTATATAGGTTNTAA-TT-TTTTTCTTCACTAGTTC-A-CATTATTTATGTATCACTTGTTACATGGTTAATAGATCATG]

[+] EMBL CD082131             [GACTAATCCTTTGTTTTTCGTATAAACCAGCATCTAATAACACTAATATTAACCATAATAGTATTAGTATATATCAGTAAACCAGATAAGATTAAATAAGTACATTACTCTTTGTACAAATATTGTATTACGCTCTCACTTCTTCTTATTGAACCATGTTTAATTTGCCCAAACTCTCGAGGTACCTCATGGTCCTATTTATTTCTATATTCTGTGTCTGATTAATGTATTTGTGTATCTGCATAGAAACCTCCCATTATTATTATTATTATTATTACTCAATATGTGTATAAACAAATAAGTGTATTGTGCATAAACTTTGTACTGGTGAGTGTTCGCTTCCTCTCTGTGTCTGTCCTTTGGCTTGTGTGTTTCTTTTTGATACTCTTTGCTGTTTCAATGTATCTAACTGCTAATACAGTCAGTGTAATTTTTCATGTCACCACTTTCTCTTGGTCTCTTCTTATAGTTCTGTTTTGTTTCATCATTACCTTTTCTGAATTTTTATCTATCGTATTGTCCTTCTCTGTTTCTCGCGCATATTCATGTTTTATTAAGAAAACCATATTTAATAACAAAAAATAGATGTATTTTTTAAATTTTATTTAGTTGAAAAGATATTCTACAATTTTTGGTACTTTTGACTCAACTGTGACAGTAATATCGGGAAGTTGTTAATCTATTCGAAAAT ATCTGAATAACCTACGTTGAACTAATCGATCATCTGACATTCTTATTTCAGTTGTTATTG GGTTAGAAGTAGCNTTGNTC ACTTA TAATCTCA A TGACTG ATATAGG TNTAA TT TTTNTCT  ACTAG TC A CA TA TTATG ATCAC TGT  CATGG TAAT GAT    ]
[+] EMBL CD082228             [                                                                                                                                                                                                   aaacTATTTCTAT TTCTGTGTCTGATTAATGTTTTTGTGTATCTGCATAAACACCTCCCATTATTATTATTATTATTATTACTCAATATGTGTATAAACAAATAAGTGTATTGTGCATAAACTTTGTACTGGTGAGTGTTCGCTTCCTCTCTGTGTCTGTCCTTTGGCTTGTGTGTTTCTTTTTGATACTCTTTGCTGTTTCAATGTATCTAACTGCTAATACAGTCAGTGTAATTTTTCATGTCACCACTTTCTCTTGGTCTCTTCTTATAGTTCTGTTTTGTTTCATCATTACCTTTTCTGAATTTTTATCTATCGTATTGTCCTTCTCTGTTTCTCGCGCATATTCATGTTTTATTAAGAAAACCATATTTAATAACAAAAAATAGATGTATTTTTTAAATTTTATTTAGTTGAAAAGATATTCTACAATTTTTGGTACTTTTGACTCAACTGTGACAGTAATATCGGGAAGTTGTTAATCTATTCGAAAATAATCTGAATAACCTACGTTGAACTAATCGATCATCTGACATTCTTATTTCAGTTGTTATTGTGTTTAGAGGTAGCTTTGTTCAACTTATTAATCTCATATTGACTGTATATAGGTTNTAA TTNTTTTTCTTCACTAGTTCAA CATTATTTATGTATCACTTGTTACATGGTTAATAGATCAT ]
[-] EMBL CD075746             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TAAACAAATAAGTGTATTGTGCATAAACTTTGTACTGGTGAGTGTTCGCTTCCTCTCTGTGTCTGTCCTTTGGCTTGTGTGTTTCTTTTTGATACTCTTTGCTGTTTCAATGTATCTAACTGCTAATACAGTCAGTGTAATTTTTCATGTCACCACTTTCTCTTGGTCTCTTCTTATAGTTCTGTTTTGTTTCATCATTACCTTTTCTGAATTTTTATCTATCGTATTGTCCTTCTCTGTTTCTCGCGCATATTCATGTTTTATTAAGAAACCCATATTTAATACCAAAAAATAGATGTATTTTTTAAATTTTATTTAGTTGAAAAGATATTCTACAATTTTTGGTACTTTTGACTCAACTGTGACAGTAATATCGGGAAGTTGTTAATCTATTCGAAAATAATCTGAATAACCTACGTTGAACTAATCGATCATCTGACATTCTTATTTCAGTTGTTATTGTGTTTAGAGGTAGCTTTGTTCAACTTATTAATCTCATATTGACTGTATATAGGTTTTAATTT TTTTTCTTCACTAGTTCAA CATTATTTATGTATCACTTGTTACATGGTTAATAGATCATG]
[-] EMBL CD075839             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GTGTTTCTTTTTGATACTCTTTGCTGTTTCAATGTATCTAACTGCTAATACAGTCAGTGTAATTTTTCATGTCACCACTTTCTCTTGGTCTCTTCTTATAGTTCTGTTTTGTTTCATCATTCCCTTTTCTGAATTTTTATCTATCGTATTGTCCTTCTCTGTTTCTCGCGCATATTCATGTTTTATTAAGAAACCCATATTTAATACCAAAAAATAGATGTATTTTTTAAATTTTATTTAGTTGAAAAGATATTCTACAATTTTTGGTACTTTTGACTCAACTGTGCCAGTAATATCGGGAAGTTGTTAATCTATTCGAAAATAATCTGAATAACCTACGTTGAACTAATCGATCATCTGACATTCTTATTTCAGTTGTTATTGTGTTTAGAGGTAGCTTTGTTCAACTTATTAATCTCATATTGACTGTATATAGGTTTTAATTT TTTTTCTTCACTAGTTC ACCATTATTTATGTATCACTTGTTACATGGTTAATAGATCATG]




>consensus_6787#0
GACTAATCCTTTGTTTTTCGTATAAACCAGCATCTAATAACACTAATATTAACCATAATA
GTATTAGTATATATCAGTAAACCAGATAAGATTAAATAAGTACATTACTCTTTGTACAAA
TATTGTATTACGCTCTCACTTCTTCTTATTGAACCATGTTTAATTTGCCCAAACTCTCGA
GGTACCTCATGGTCCTATTTATTTCTATATTCTGTGTCTGATTAATGTATTTGTGTATCT
GCATAGAAACCTCCCATTATTATTATTATTATTATTACTCAATATGTGTATAAACAAATA
AGTGTATTGTGCATAAACTTTGTACTGGTGAGTGTTCGCTTCCTCTCTGTGTCTGTCCTT
TGGCTTGTGTGTTTCTTTTTGATACTCTTTGCTGTTTCAATGTATCTAACTGCTAATACA
GTCAGTGTAATTTTTCATGTCACCACTTTCTCTTGGTCTCTTCTTATAGTTCTGTTTTGT
TTCATCATTACCTTTTCTGAATTTTTATCTATCGTATTGTCCTTCTCTGTTTCTCGCGCA
TATTCATGTTTTATTAAGAAAACCATATTTAATAACAAAAAATAGATGTATTTTTTAAAT
TTTATTTAGTTGAAAAGATATTCTACAATTTTTGGTACTTTTGACTCAACTGTGACAGTA
ATATCGGGAAGTTGTTAATCTATTCGAAAATAATCTGAATAACCTACGTTGAACTAATCG
ATCATCTGACATTCTTATTTCAGTTGTTATTGTGTTTAGAGGTAGCTTTGTTCAACTTAT
TAATCTCATATTGACTGTATATAGGTTNTAATTTTTTTCTTCACTAGTTCACATTATTTA
TGTATCACTTGTTACATGGTTAATAGATCATG
clustalw multiple alignements is not computed in this case