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Schistosoma mansoni
cluster # 6794 cluster # 6794       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6794#0 length = 801 sequences # 4  

consensusID : consensus_6794#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 801
fasta sequence
                              [GCTCGAGGCCTATAGAATCACAATCAGATGAATCAAATCACGAACATTCAACATCAGTATTAATCATTTCCGAAACAAGCGATATCGATAATTCACTTTTCAAAGATAATGTAAAATCAGTTTCTGTCGAATCAGGTGACTGTAAAGTTGAATCAACAGACAATATTTCGGTAAACTCATTTGATACATCTAAAAATCGTTTAAATGAAAATAATTACGATAATGACGAAGAAGTGGAAGATGAGGCCGATGAATGTCTACCAGTTCGTAATATACCGCATGTTTCTCCTCAATTTGATAAGCAAATTATTGAAAATCAACCTTGTGTTTCTCCGGATGTTTTTTAAAGTTTACACTTATTTATAATTATGTTCTTTGTTGTATGTGTATGACTAATGTTACTTTTGTATATTTTCCTTTTTGATTGACATTCAGGGAGATTTTTGTAGTGGTCAGTAGTTGTTTTTAAAAATCGCCGATTAATAAATAACTGAAGTCCGATGTAATATTTCTTGGTGTCCTACATTAATCTATACTCGTTATTATCTTATTGTACATAGTTGAATCCTGTCGATTTATTTGTTACAATGTGTTGTCCATTTGTTTATTTTTAATGTTTAGTTCGACAGTATAATAATTNTTCATAATAATGGGAAGCATTTAACTACGTTTAAATACCATCAATGGATACANNAACTAGTNNGTTTTTAATGCGTAAAATGATTNGATTTTCTTNCTTTNTGTGAGGNNTG-TATATAACTGGNCTTTGTTNTCTTTTCG-NAAATTTCACAAAAGATCTNC]

[+] EMBL CD082269             [GCTCGAGGCCTATAGAATCACAATCAGATGAATCAAATCACGAACATTCAACATCAGTATTAATCATTTCCGAAACAAGCGATATCGATAATTCACTTTTCAAAGATAATGTAAAATCAGTTTCTGTCGAATCAGGTGACTGTAAAGTTGAATCAACAGACAATATTTCGGTAAACTCATTTGATACATCTAAAAATCGTTTAAATGAAAATAATTACGATAATGACGAAGAAGTGGAAGATGAGGCCGATGAATGTCTACCAGTTCGTAATATACCGCATGTTTCTCCTCAATTTGATAAGCAAATTATTGAAAATCAACCTTGTGTTTCTCCGGATGTTTTTTAAAGTTTACACTTATTTATAATTATGTTCTTTGTTGTATGTGTATGACTAATGTTACTTTTGTATATTTTCCTTTTTGATTGACATTCAGGGAGATTTTTGTAGTGGTCAGTAGTTGTTTTTAAAAATCGCCGATTAATAAATAACTGAAGTCCGATGTAATATTTCTTGGTGTCCTACATTAATCTATACTCGTTATTATCTTATTGTACATAGTTGAATCCTGTCGATTTATTTGTTACAATGTGTTGTCCATTTGTTTATTTTTAATGTTTAGTTCGACAGTATAATAATTNTTCATAATAATGGGAAGCATTTAACTACGTTTAAATACCATCAATGGATACANNAACTAGTNNGTTTTTAATGCGTAAAATGATTNGATTTTCTTNCTTTNTGTGAGGNNTG TATATAACTGGNCTTTGTTNTCTTTTCG NAAATTTCACAAAAGATCTN ]
[+] EMBL AI975723             [                                                                                GATATCGATAATTCACTTTTCAAAGATAATGTAAAATCAGTTTCTGTCGAATCAGGTGACTGTAAAGTTGAATCAACAGACAATATTTCGGTAAACTCATTTGATACATCTAAAAATCGTTTAAATGAAAATAATTACGATAATGACGAAGAAGTGGAAGATGAGGCCGATGAATGTCTACCAGTTCGTAATATACCGCATGTTTCTCCTCAATTTGATAAGCAAATTATTGAAAATCAACCTTGTGTTTCTCCGGATGTTTTTTAAAGTTTACACTTATTTATAATTATGTTCTTTGTTGTATGTGTATGACTAATGTTACTTTTGTATATNTTCCTTTNTGATTGACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD138284             [                                                                                   ATCGATAATTCACTTTTCAAAGATAATGTAAAATCAGTTTCTGTCGAATCAGGTGACTGTAAAGTTGAATCAACAGACAATATTTCGGTAAACTCATNTGATACATCTAAAAATCGTTTAAATGAAAATAATTACGATAATGACGAAGAAGTGGAAGATGAGGCCGATGAATGTCTACCAGTTCGTAATATACCGCATGTTTCTCCTCAATTTGATAAGCAAATTATTGAAAATCAACCTTGTGTTTCTCTGGATGTTTTTTAAAGTTTACACTTATTTATAATTATGTTCTTTGTTGTATGTGTATGACTAATGTTACTTTTGTATATTTTCCTTTTTGATTGACATTCAGGGAGATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD075876             [                                                                                                                                                                                                                                    AAGAAGTGGAAGATGAGGCCGATGAATGTCTACCAGTTCGTAATATACCGCATGTTTCTCCTCAATTTGATAAGCAAATTATTGAAAATCAACCTTGTGTTTCTCCGGATGTTTTTTAAAGTTTACACTTATTTATAATTATGTTCTTTGTTGTATGTGTATGACTAATGTTACTTTTGTATATTTTCCTTTTTGATTGACATTCAGGGAGATTTTTGTAGTGGTCAGTAGTTGTTTTTAAAAATCGCCGATTAATAAATAACTGAAGTCCGATGTAATATTTCTTGGTGTCCTACATTAATCTATACTCGTTATTATCTTATTGTACATAGTTGAATCCTGTCGATTTATTTGTTACAATGTGTTGTCCATTTGTTTATTTTTAATGTTTAGTTCGACAGTATAATAATTTTTCATAATAATGGAAAGCATTTAACTACGTTTAAATACCATCAATGGATACAAAAACTAGTGTTTTTTTAATGCGT AAATGATTTGATTTTCTTTCTTTTTGTGAGG TTGTTATATAACT GTCTTTGTTTTCGTTTCGTAAAATTTCACAAAAGATCTcc]


>consensus_6794#0 GCTCGAGGCCTATAGAATCACAATCAGATGAATCAAATCACGAACATTCAACATCAGTAT TAATCATTTCCGAAACAAGCGATATCGATAATTCACTTTTCAAAGATAATGTAAAATCAG TTTCTGTCGAATCAGGTGACTGTAAAGTTGAATCAACAGACAATATTTCGGTAAACTCAT TTGATACATCTAAAAATCGTTTAAATGAAAATAATTACGATAATGACGAAGAAGTGGAAG ATGAGGCCGATGAATGTCTACCAGTTCGTAATATACCGCATGTTTCTCCTCAATTTGATA AGCAAATTATTGAAAATCAACCTTGTGTTTCTCCGGATGTTTTTTAAAGTTTACACTTAT TTATAATTATGTTCTTTGTTGTATGTGTATGACTAATGTTACTTTTGTATATTTTCCTTT TTGATTGACATTCAGGGAGATTTTTGTAGTGGTCAGTAGTTGTTTTTAAAAATCGCCGAT TAATAAATAACTGAAGTCCGATGTAATATTTCTTGGTGTCCTACATTAATCTATACTCGT TATTATCTTATTGTACATAGTTGAATCCTGTCGATTTATTTGTTACAATGTGTTGTCCAT TTGTTTATTTTTAATGTTTAGTTCGACAGTATAATAATTNTTCATAATAATGGGAAGCAT TTAACTACGTTTAAATACCATCAATGGATACANNAACTAGTNNGTTTTTAATGCGTAAAA TGATTNGATTTTCTTNCTTTNTGTGAGGNNTGTATATAACTGGNCTTTGTTNTCTTTTCG NAAATTTCACAAAAGATCTNC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)