cluster # 6804

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Schistosoma mansoni
cluster # 6804 cluster # 6804 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6804#0 length = 681 sequences # 4

consensusID : consensus_6804#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 681
fasta sequence

                              [CCCTCGAGGCCANAATTCGGCACGAGGGCGTTGCGTGACCTGCGTTCATACAGATATAAATGGATATAAACGCAGTCCTTTTGGGCTTGTATAATATCTCCTAGTTTCATACTGTGATTCATGAGCTAGTGAATTGGCCTTGATATCCGATAACACATCCCATCTAATAACTAG-GAAAAAAACGGGTCATGTTGTTGTACCCGAACGACTGACGTTAAACTATGGTGAGCCACAACATCATATATGTCTGGACTGATGACAATCCTGTGATTCAGCTTAAGAGACCGGGTAAGTTTTTATTTGTGATGATTTACACAGACCTGTATTGAATACACTACATGTAACAAAACCTTTCTGAATGTTTTAGCTAAACTAATGTCCCTGACTTTCTACGTTTTCAGATCATATTTGTCTGGACTGACGACAATCCTGTGATTCAGCTTAAGAGACCGGGTAAGTTTTTATTTGTGATGATTTACACAGACCTGTATTGAATACACTACATGTAACAAAACCTTTCTGAATGTTTTAGCTAAACTAATGTCTCTGACTTTCTATGTTTTCAGATATTTGGCTGACCTGGTGACTCCCATGTGGTCACGCCGAGGTCTGTTCG-TTTTTTC-ACATATGCATTTGTTTTAGCGCAACCTGTACATGCCTGCAT-GGCGTTTAAATAAACTT]

[+] EMBL CD082553             [CCCTCGAGGCCANAATTCGGCACGAGGGCGTTGCGTGACCTGCGTTCATACAGATATAAATGGATATAAACGCAGTCCTTTTGGGCTTGTATAATATCTCCTAGTTTCATACTGTGATTCATGAGCTAGTGAATTGGCCTTGATATCCGATAACACATCCCATCTAATAACTAG GAAAAAAACGGGTCATGTTGTTGTACCCGAACGACTGACGTTAAACTATGGTGAGCCACAACATCATATATGTCTGGACTGATGACAATCCTGTGATTCAGCTTAAGAGACCGGGTAAGTTTTTATTTGTGATGATTTACACAGACCTGTATTGAATACACTACATGTAACAAAACCTTTCTGAATGTTTTAGCTAAACTAATGTCCCTGACTTTCTACGTTTTCAGATCATATTTGTCTGGACTGACGACAATCCTGTGATTCAGCTTAAGAGACCGGGTAAGTTTTTATTTGTGATGATTTACACAGACCTGTATTGAATACACTACATGTAACAAAACCTTTCTGAATGTTTTAGCTAAACTAATGTCTCTGACTTTCTATGTTTTCAGATATTTGGCTGACCTGGTGACTCCCATGTGGTCACGCCGAGGTCTGTTCG TTTTTTC ACATATGCATTTGTTTTAGCGCAACCTGTACATGCCTGCAT GGCGTTTAAATAAACTT]
[-] EMBL CD122800             [                             GTTGCGTGACCTGCGTTCATACAGATATAAATGGATATAAACGCAGTCCTTTTGGGCTTGTATAATATCTCCTAGTTTCATACTGTGATTCATGAGCTAGTGAATTGGCCTTGATATCCGATAACACATCCCATCTAATAACTAGAAAAAAAAACGGGTCATGTTGTTGTACCCGAACGACTGACGTTAAACTATGGTGAGCCACAACATCATATATGTCTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD076151             [                                                                                           TAATATCTCCTAGTTTCATACTGTGATTCATGAGCTAGTGAATTGGCCTTGATATCCGATAACACATCCCATCTAATAACTAG GAAAAAAACGGGTCATGTTGTTGTACCCGAACGACTGACGTTAAACTATGGTGAGCCCCAACATCATATATGTCTGGACTGATGACAATCCTGTGATTCAGCTTAAGAGACCGGGTAAGTTTTTATTTGTGATGATTTACACAGACCTGTATTGAATACACTACATGTAACAAAACCTTTCTGAATGTTTTAGCTAAACTAATGTCCCTGACTTTTTACGTTTTCAGATCATATTTGTCTGGACTGACGACAATCCTGTGATTCAGCTTAAGAGACCGGGTAAGTTTTTATTTGTGATGATTTACACAGACCTGTATTGAATACCCTACATGTAACAAAACCTTTTTGAATGTTTTAGCTAAACTAATGTCTCTGACTTTCTATGTTTTCAGATATTTGGCTGACCTGGTGACTCCCATGTGGTCACGCCGAGGTCTGTTCG TTTTTTCAACATATGCATTTGTTTTAGCGCAACCTGTACATGCCTGCAT GGCGTTTAAATAAACTT]
[+] EMBL CD079848             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GGTGACTCCCATGTGGTCACGCCGAGGTCTGTTCGTTTTTTTA ACATATGCATTTGTTTTAACGCAACCTGTACATGCCTGCATGGGCGTTTAAATAAACTT]




>consensus_6804#0
CCCTCGAGGCCANAATTCGGCACGAGGGCGTTGCGTGACCTGCGTTCATACAGATATAAA
TGGATATAAACGCAGTCCTTTTGGGCTTGTATAATATCTCCTAGTTTCATACTGTGATTC
ATGAGCTAGTGAATTGGCCTTGATATCCGATAACACATCCCATCTAATAACTAGGAAAAA
AACGGGTCATGTTGTTGTACCCGAACGACTGACGTTAAACTATGGTGAGCCACAACATCA
TATATGTCTGGACTGATGACAATCCTGTGATTCAGCTTAAGAGACCGGGTAAGTTTTTAT
TTGTGATGATTTACACAGACCTGTATTGAATACACTACATGTAACAAAACCTTTCTGAAT
GTTTTAGCTAAACTAATGTCCCTGACTTTCTACGTTTTCAGATCATATTTGTCTGGACTG
ACGACAATCCTGTGATTCAGCTTAAGAGACCGGGTAAGTTTTTATTTGTGATGATTTACA
CAGACCTGTATTGAATACACTACATGTAACAAAACCTTTCTGAATGTTTTAGCTAAACTA
ATGTCTCTGACTTTCTATGTTTTCAGATATTTGGCTGACCTGGTGACTCCCATGTGGTCA
CGCCGAGGTCTGTTCGTTTTTTCACATATGCATTTGTTTTAGCGCAACCTGTACATGCCT
GCATGGCGTTTAAATAAACTT

clustalw multiple alignements is not computed in this case