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Schistosoma mansoni
cluster # 6847 cluster # 6847       Sequences # 4       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6847#0 length = 1031 sequences # 4  
consensusID : consensus_6847#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1031
fasta sequence 
                              [TTATTCATATAAGTAAACAACAACAATAATAATAGTACACTTGTTATTAATTACAATTTAATCAATATTTATAAAGTAATTATATAATGAAAAGTAAATTAATAAATATCATTTGATGTTTTAAAACAATGAAAATGTTTATTAAACCAATCACGTATACGTCTTAATAATCTTATAGGATATAAACTTTGATCTGTAGTTTTTTCATAATTCATTTCATTTTCATGAGATTGATAAGATTTACGATTTTCCCATTTAGCTAATTTAGCTAATGGAAAACAAAGTAGACCTGATATTAAAACAGATAATCCACCAAGAATAAAGATTAAATTAAAATTCTTGAATCGATCATACATAGCACCGAATGCTGGTGGTGCCCCGATATATGCAAAAGCTTGAAATAGTAACATATATCCAAAAGCATTGGTTAATCGATCTAAACCCAAAACTTGAACAATTAAAATTGTTCGAACAGATATAAATGCAGATATTGAGAGACCATATAAACATGAATAGCCAATCAGTCCACCGTAAACTGTAATTAACGGGACCAGAGATGTAAGTAACCCGGATGTGACTAGTGAAATATTATTAATGTAAAGTACATTAGCCCATGGCTGATCAGATAACCAACCTGTGAATATTCTTCCAACTGTATTCGAACCACCAAGATAAGCTAATAAATACGATGCAGATGATTCACTTGCACCAAGCTGTTGAGCATTATCTTTAAGAAATTGATATGGAACGCAATAGCCAATCATACTGAGTACACTAGAAACTGA-AAGT-ATAT-AATGTTGGACTTTTCAATAATTCTATATCTAAAACATTTTTAATCATAGA-CCATATTGGCCGACGTATATGCACTTCTTCAGCGGGCATTGTTACTGATCGAATATATGAGGCTACATCAGTTGTAGATAGGAATTCATTAAGATGTATCAGGCTTCCACTAAGGAATAAATCTTTCTTATAGGCTGGTCTTGACATTTCTTTTTGTAATTCGTTTACAATAGCTTGACAAATTGATG]

[+] EMBL CD077017             [TTATTCATATAAGTAAACAACAACAATAATAATAGTACACTTGTTATTAATTACAATTTAATCAATATTTATAAAGTAATTATATAATGAAAAGTAAATTAATAAATATCATTTGATGTTTTAAAACAATGAAAATGTTTATTAAACCAATCACGTATACGTCTTAATAATCTTATAGGATATAAACTTTGATCTGTAGTTTTTTCATAATTCATTTCATTTTCATGAGATTGATAAGATTTACGATTTTCCCATTTAGCTAATTTAGCTAATGGAAAACAAAGTAGACCTGATATTAAAACAGATAATCCACCAAGAATAAAGATTAAATTAAAATTCTTGAATCGATCATACATAGCACCGAATGCTGGTGGTGCCCCGATATATGCAAAAGCTTGAAATAGTAACATATATCCAAAAGCATTGGTTAATCGATCTAAACCCAAAACTTGAACAATTAAAATTGTTCGAACAGATATAAATGCAGATATTGAGAGACCATATAAACATGAATAGCCAATCAGTCCACCGTAAACTGTAATTAACGGGACCAGAGATGTAAGTAACCCGGATGTGACTAGTGAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD137286             [                                                                                                                                                                                                                          ATTTTCATGAGATTGATAAGATTTACGATTTTCCCATTTAGCTAATTTAGCTAATGGAAAACAAAGTAGACCTGATATTAAAACAGATAATCCACCAAGAATAAAGATTAAATTAAAATTCTTGAATCGATCATACATAGCACCGAATGCTGGTGGTGCCCCGATATATGCAAAAGCTTGAAATAGTAACATATATCCAAAAGCATTGGTTAATCGATCTAAACCCAAAACTTGAACAATTAAAATTGTTCGAACAGATATGAATGCAGATATTGAGAGACCATATAAACATGAATAGCCAATCAGTCCACCGTAAACTGTAATTAACGGGACCAGAGATGTAAGTAACCCGGATGTGACTAGTGAAATATTATTAATGTAAAGTACATTAGCCCATGGCTGATCAGATAACCAACCTGTGAATATTCTTCCAACTGTATTCGAACCACTAAGATAAGCTAATAAATACGATGCAGATGATTCACTTGCACCAAGCTGTTGAGCATTATCTTTAAGAAATNGATATGGNACGCAATAGCCAATCATACTGAGTACACTAGAAACTGANNAGT ATAT AATGTGGNACTTTTTCATAATTCTATATCTAAAACATTCTAAATCATAGACCCATATTGGGCGACGTATATGCACTTCTTCAGCGGGCATTGTTAC                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD197543             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AATAGCCAATCAGTCCACCGTAAACTGTAATTAACGGGACCAGAGATGTAAGTAACCCGGATGTGACTAGTGAAATATTATTAATGTAAAGTACATTAGCCCATGGCTGATCAGATAACCAACCTGTGAATATTCTTCCAACTGTATTCGAACCACCAAGATAAGCTAATAAATACGATGCAGATGATTCACTTGCACCAAGCTGTTGAGCATTATCTTTAAGAAATTGATATGGAACGCAATAGCCAATCATACTGAGTACACTAGAAACTGA AAGTAATATAAATGTTGGACTTTTCAATAATTCTATATCTAAAACATTTTTAATCATAGA CCATATTGGCCGACGTATATGCACTTCTTCAGCGGGCATTGTTACTGATCGAATATATGAGGCTACATCAGTTGTAGAT                                                                                                             ]
[-] EMBL CD197596             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CCGGATGTGACTAGTGAAATATTATTAATGTAAAGTACATTAGCCCATGGCTGATCAGATAACCAACCTGTGAATATTCTTCCAACTGTATTCGAACCACCAAGATAAGCTAATAAATACGATGCAGATGATTCACTTGCACCAAGCTGTTGAGCATTATCTTTAAGAAATTGATATGGAACGCAATAGCCAATCATACTGAGTACACTAGAAACTGA AAGTAATATAAATGTTGGACTTTTCAATAATTCTATATCTAAAACATTTTTAATCATAGA CCATATTGGCCGACGTATATGCACTTCTTCAGCGGGCATTGTTACTGATCGAATATATGAGGCTACATCAGTTGTAGATAGGAATTCATTAAGATGTATCAGGCTTCCACTAAGGAATAAATCTTTCTTATAGGCTGGTCTTGACATTTCTTTTTGTAATTCGTTTACAATAGCTTGACAAATTGATG]




>consensus_6847#0
TTATTCATATAAGTAAACAACAACAATAATAATAGTACACTTGTTATTAATTACAATTTA
ATCAATATTTATAAAGTAATTATATAATGAAAAGTAAATTAATAAATATCATTTGATGTT
TTAAAACAATGAAAATGTTTATTAAACCAATCACGTATACGTCTTAATAATCTTATAGGA
TATAAACTTTGATCTGTAGTTTTTTCATAATTCATTTCATTTTCATGAGATTGATAAGAT
TTACGATTTTCCCATTTAGCTAATTTAGCTAATGGAAAACAAAGTAGACCTGATATTAAA
ACAGATAATCCACCAAGAATAAAGATTAAATTAAAATTCTTGAATCGATCATACATAGCA
CCGAATGCTGGTGGTGCCCCGATATATGCAAAAGCTTGAAATAGTAACATATATCCAAAA
GCATTGGTTAATCGATCTAAACCCAAAACTTGAACAATTAAAATTGTTCGAACAGATATA
AATGCAGATATTGAGAGACCATATAAACATGAATAGCCAATCAGTCCACCGTAAACTGTA
ATTAACGGGACCAGAGATGTAAGTAACCCGGATGTGACTAGTGAAATATTATTAATGTAA
AGTACATTAGCCCATGGCTGATCAGATAACCAACCTGTGAATATTCTTCCAACTGTATTC
GAACCACCAAGATAAGCTAATAAATACGATGCAGATGATTCACTTGCACCAAGCTGTTGA
GCATTATCTTTAAGAAATTGATATGGAACGCAATAGCCAATCATACTGAGTACACTAGAA
ACTGAAAGTATATAATGTTGGACTTTTCAATAATTCTATATCTAAAACATTTTTAATCAT
AGACCATATTGGCCGACGTATATGCACTTCTTCAGCGGGCATTGTTACTGATCGAATATA
TGAGGCTACATCAGTTGTAGATAGGAATTCATTAAGATGTATCAGGCTTCCACTAAGGAA
TAAATCTTTCTTATAGGCTGGTCTTGACATTTCTTTTTGTAATTCGTTTACAATAGCTTG
ACAAATTGATG

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)