These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6859#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 875 fasta sequence [CAAGTGCTCAGCAGCCTCCATTAACGAACCATTGCCTTTAACTTGTGCCCATCGTGCTGGTAGACTTACACTCACCAGAGTAGGGTAAAAATAGTCAGCAATGGATGCAGAAAGAAGTGGCCTTGAGTTTGACAAGACTGCCGAAAAGGTGGTTATGGAACCGTATAGTTACATATGTAGTACAAATGGGAAAGGGATTCGCAGTGCATTGGTGGCAGCCTTTAATTACTGGCTAAAAGTTCCTGAAAGTATTTTAAGAGTCATATCAGATGTAATTCAAATGCTGCACAACGCTAGTTTGATTATTGATGACATCGAAGATGGTTCTCACTTACGGCGTGGTAAACCAACTGCTCATTGTATTTTTGGAGTCGCACCATCTATCAATTCCGCAAACTATGCTTATTTTCTTGCTCTTGAAAAATTGTCTTTACTAGAACGTCCTGAAACGGTAAAAATATTTACAGAGCAAATGCTTGTATTGCATCGTGGACAAGGTATGGATATAT-TTTGGCGTTCCTCTTTTAAGTGTCCATCGGAATCAGAATACGAGGCTATGGTATTATGTAGTAAGTGGTGGTCTATTCAGTCTAGGTGTTCGTCTAATGCAATTGTTCTCTGAAATCANACAGATTATAAACCTCTTTTGGATGCGATTGGTCTGTTNTACCAAATTCGTGACGATTATGCAAACTTAGTTGATTCAAGTTATCATAGAAAAAAAACATTCGCAGAAGATTTAACTGAAGGAAAATTCAGTTATCCTATTGTTCGTGCCATTAACGATTATCCTGATGACAATCAAGTGATGAATATTCTCTCACAACATACCACANATTCATCATTAAAACTATATTGTGTTAAACATATGTTNA] [+] EMBL CD082033 [CAAGTGCTCAGCAGCCTCCATTAACGAACCATTGCCTTTAACTTGTGCCCATCGTGCTGGTAGACTTACACTCACCAGAGTAGGGTAAAAATAGTCAGCAATGGATGCAGAAAGAAGTGGCCTTGAGTTTGACAAGACTGCCGAAAAGGTGGTTATGGAACCGTATAGTTACATATGTAGTACAAATGGGAAAGGGATTCGCAGTGCATTGGTGGCAGCCTTTAATTACTGGCTAAAAGTTCCTGAAAGTATTTTAAGAGTCATATCAGATGTAATTCAAATGCTGCACAACGCTAGTTTGATTATTGATGACATCGAAGATGGTTCTCACTTACGGCGTGGTAAACCAACTGCTCATTGTATTTTTGGAGTCGCACCATCTATCAATTCCGCAAACTATGCTTATTTTCTTGCTCTTGAAAAATTGTCTTTACTAGAACGTCCTGAAACGGTAAAAATATTTACAGAGCAAATGCTTGTATTGCATCGTGGACAAGGTATGGATATATNTTTGGCGTTCCTCTTTTAAGTGTCCATCGGAATCAGAATACGAGGCTATGGTATTATGTA AAACTGGTGGTCTATTCAGTCTAGGTGTTCGTCTAATGCAATTGTTCTCTGAAATCANACAGATTATAAACCTCTTTTGGATGCGATTGGTCTGTTNTACCA ] [-] EMBL CD120038 [ TTCTCACTTACGGCGTGGTAAACCAACTGCTCATTGTATTTTTGGAGTCGCACCATCTATCAATTCCGCAAACTATGCTTATTTTCTTGCTCTTGAAAAATTGTCTTTACTAGAACGTCCTGAAACGGTAAAAATATTTACAGAGCAGATGCTTGTATTGCATCGTGGACAAGGTATGGATATAT TTTGGCGTTCCTCTTTTAAGTGTCCATCGGAATCGGAATACGAGGCTATGGTATTATGTAGTAAGT ] [-] EMBL CD120379 [ TTCTCACTTACGGCGTGGTAAACCAACTGCTCATTGTATTTTTGGAGTCGCACCATCTATCAATTCCGCAAACTATGCTTATTTTCTTGCTCTTGAAAAATTGTCTTTACTAGAACGTCCTGAAACGGTAAAAATATCTACAGAGCAAATGCTTGTATTGCATCGTGGACAAGGTATGGATATAT TTTGGCGTTCCTCTTTTAAGTGTCCATCGGAATCAGAATACGAGGCTATGGTATTATGTAGTAAGT ] [+] EMBL CD077636 [ gaggGTCTAATGCAATTGTTCTCTGAAAATAAACAGATTATAAACCTCTTTTGGATGCGATTGGTCTGTTTTACCAAATTCGTGACGATTATGCAAACTTAGTTGATTCAAGTTATCATAGAAAAAAAACATTCGCAGAAGATTTAACTGAAGGAAAATTCAGTTATCCTATTGTTCGTGCCATTAACGATTATCCTGATGACAATCAAGTGATGAATATTCTCTCACAACATACCACANATTCATCATTAAAACTATATTGTGTTAAACATATGTTNA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||