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Schistosoma mansoni
cluster # 6859 cluster # 6859       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6859#0 length = 875 sequences # 4  

consensusID : consensus_6859#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 875
fasta sequence
                              [CAAGTGCTCAGCAGCCTCCATTAACGAACCATTGCCTTTAACTTGTGCCCATCGTGCTGGTAGACTTACACTCACCAGAGTAGGGTAAAAATAGTCAGCAATGGATGCAGAAAGAAGTGGCCTTGAGTTTGACAAGACTGCCGAAAAGGTGGTTATGGAACCGTATAGTTACATATGTAGTACAAATGGGAAAGGGATTCGCAGTGCATTGGTGGCAGCCTTTAATTACTGGCTAAAAGTTCCTGAAAGTATTTTAAGAGTCATATCAGATGTAATTCAAATGCTGCACAACGCTAGTTTGATTATTGATGACATCGAAGATGGTTCTCACTTACGGCGTGGTAAACCAACTGCTCATTGTATTTTTGGAGTCGCACCATCTATCAATTCCGCAAACTATGCTTATTTTCTTGCTCTTGAAAAATTGTCTTTACTAGAACGTCCTGAAACGGTAAAAATATTTACAGAGCAAATGCTTGTATTGCATCGTGGACAAGGTATGGATATAT-TTTGGCGTTCCTCTTTTAAGTGTCCATCGGAATCAGAATACGAGGCTATGGTATTATGTAGTAAGTGGTGGTCTATTCAGTCTAGGTGTTCGTCTAATGCAATTGTTCTCTGAAATCANACAGATTATAAACCTCTTTTGGATGCGATTGGTCTGTTNTACCAAATTCGTGACGATTATGCAAACTTAGTTGATTCAAGTTATCATAGAAAAAAAACATTCGCAGAAGATTTAACTGAAGGAAAATTCAGTTATCCTATTGTTCGTGCCATTAACGATTATCCTGATGACAATCAAGTGATGAATATTCTCTCACAACATACCACANATTCATCATTAAAACTATATTGTGTTAAACATATGTTNA]

[+] EMBL CD082033             [CAAGTGCTCAGCAGCCTCCATTAACGAACCATTGCCTTTAACTTGTGCCCATCGTGCTGGTAGACTTACACTCACCAGAGTAGGGTAAAAATAGTCAGCAATGGATGCAGAAAGAAGTGGCCTTGAGTTTGACAAGACTGCCGAAAAGGTGGTTATGGAACCGTATAGTTACATATGTAGTACAAATGGGAAAGGGATTCGCAGTGCATTGGTGGCAGCCTTTAATTACTGGCTAAAAGTTCCTGAAAGTATTTTAAGAGTCATATCAGATGTAATTCAAATGCTGCACAACGCTAGTTTGATTATTGATGACATCGAAGATGGTTCTCACTTACGGCGTGGTAAACCAACTGCTCATTGTATTTTTGGAGTCGCACCATCTATCAATTCCGCAAACTATGCTTATTTTCTTGCTCTTGAAAAATTGTCTTTACTAGAACGTCCTGAAACGGTAAAAATATTTACAGAGCAAATGCTTGTATTGCATCGTGGACAAGGTATGGATATATNTTTGGCGTTCCTCTTTTAAGTGTCCATCGGAATCAGAATACGAGGCTATGGTATTATGTA AAACTGGTGGTCTATTCAGTCTAGGTGTTCGTCTAATGCAATTGTTCTCTGAAATCANACAGATTATAAACCTCTTTTGGATGCGATTGGTCTGTTNTACCA                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD120038             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTCTCACTTACGGCGTGGTAAACCAACTGCTCATTGTATTTTTGGAGTCGCACCATCTATCAATTCCGCAAACTATGCTTATTTTCTTGCTCTTGAAAAATTGTCTTTACTAGAACGTCCTGAAACGGTAAAAATATTTACAGAGCAGATGCTTGTATTGCATCGTGGACAAGGTATGGATATAT TTTGGCGTTCCTCTTTTAAGTGTCCATCGGAATCGGAATACGAGGCTATGGTATTATGTAGTAAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD120379             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTCTCACTTACGGCGTGGTAAACCAACTGCTCATTGTATTTTTGGAGTCGCACCATCTATCAATTCCGCAAACTATGCTTATTTTCTTGCTCTTGAAAAATTGTCTTTACTAGAACGTCCTGAAACGGTAAAAATATCTACAGAGCAAATGCTTGTATTGCATCGTGGACAAGGTATGGATATAT TTTGGCGTTCCTCTTTTAAGTGTCCATCGGAATCAGAATACGAGGCTATGGTATTATGTAGTAAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD077636             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gaggGTCTAATGCAATTGTTCTCTGAAAATAAACAGATTATAAACCTCTTTTGGATGCGATTGGTCTGTTTTACCAAATTCGTGACGATTATGCAAACTTAGTTGATTCAAGTTATCATAGAAAAAAAACATTCGCAGAAGATTTAACTGAAGGAAAATTCAGTTATCCTATTGTTCGTGCCATTAACGATTATCCTGATGACAATCAAGTGATGAATATTCTCTCACAACATACCACANATTCATCATTAAAACTATATTGTGTTAAACATATGTTNA]


>consensus_6859#0 CAAGTGCTCAGCAGCCTCCATTAACGAACCATTGCCTTTAACTTGTGCCCATCGTGCTGG TAGACTTACACTCACCAGAGTAGGGTAAAAATAGTCAGCAATGGATGCAGAAAGAAGTGG CCTTGAGTTTGACAAGACTGCCGAAAAGGTGGTTATGGAACCGTATAGTTACATATGTAG TACAAATGGGAAAGGGATTCGCAGTGCATTGGTGGCAGCCTTTAATTACTGGCTAAAAGT TCCTGAAAGTATTTTAAGAGTCATATCAGATGTAATTCAAATGCTGCACAACGCTAGTTT GATTATTGATGACATCGAAGATGGTTCTCACTTACGGCGTGGTAAACCAACTGCTCATTG TATTTTTGGAGTCGCACCATCTATCAATTCCGCAAACTATGCTTATTTTCTTGCTCTTGA AAAATTGTCTTTACTAGAACGTCCTGAAACGGTAAAAATATTTACAGAGCAAATGCTTGT ATTGCATCGTGGACAAGGTATGGATATATTTTGGCGTTCCTCTTTTAAGTGTCCATCGGA ATCAGAATACGAGGCTATGGTATTATGTAGTAAGTGGTGGTCTATTCAGTCTAGGTGTTC GTCTAATGCAATTGTTCTCTGAAATCANACAGATTATAAACCTCTTTTGGATGCGATTGG TCTGTTNTACCAAATTCGTGACGATTATGCAAACTTAGTTGATTCAAGTTATCATAGAAA AAAAACATTCGCAGAAGATTTAACTGAAGGAAAATTCAGTTATCCTATTGTTCGTGCCAT TAACGATTATCCTGATGACAATCAAGTGATGAATATTCTCTCACAACATACCACANATTC ATCATTAAAACTATATTGTGTTAAACATATGTTNA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)