cluster # 6874

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Schistosoma mansoni
cluster # 6874 cluster # 6874 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6874#0 length = 517 sequences # 4

consensusID : consensus_6874#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 517
fasta sequence

                              [GCTGAAGCGGGTCATTTAGTCTGGATTCATGCATGTTACTGTTGCTTGAGTTGGTTTTTCTCCTCATAAATATATCG-AATGGAG-AAAGTGATTATTTACATCTTCGGGTGATAAATCCATCAACACTGCCGTTTACATATCGCTTAAGTCCTGGTCAAATAGGACCTCATTTTAATACAACATTTACATCTACCTCATTAGTGCTAACAGAACCTCCTCACGCATGTGAGCTGATAAATAATGCATATGAAGTTAATCGAAATATTGCTCTCATAATTCGTGGAGGTTGCAGTTTCGTCACGAAAGCTATTAATGCTCACGTTGCCGGTGCAGTTGCTGTGATTGTTTATGATTTTAACCGCAAGGCTATCCACACATTTAGCATGATTCAGGATGATACTTCCAGACGAGTGCAGATACCGTGTGCGTTTATGAATGGAAAAGATGGGCATTCAATAACCACTGCTTTGGATAATTTAAACTTAACAAAAGCATTAGTTGATTTTCCGGTTAATGT]

[+] EMBL CD078117             [GCTGAAGCGGGTCATTTAGTCTGGATTCATGCATGTTACTGTTGCTTGAGTTGGTTTTTCTCCTCATAAATATATCG AATGGAG AAAGTGATTATTTACATCTTCGGGTGATAAATCCATCAACACTGCCGTTTACATATCGCTTAAGTCCTGGTCAAATAGGACCTCATTTTAATACAACATTTACATCTACCTCATTAGTGCTAACAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL SM706                [                                                       TTTNCTCCTCATAAATATATCGNAATGGAGNAAAGTGATTATTTACATCTCCGGGTGATAAATCCATCAACACTGNCGTTTACATATCGCTTANGTCCTGGTCAAATAGGACCTCATTTTANTACAACATTTACATCTACCTCATTAGTGNTAACAGAACCTCCTCACGCATGTGAGCTGATAAATAATGCATATGANGTTAATCGAAATATTGNTCTCATAATTCGTGGAGGTTGCAGTCTCGTCACGAAAGCTATTAATGCTCACGTCGCCGGTGCAGTTG                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD183580             [                                                                                                                                                                     ACCTCATTTTAATACAACATTTACATCTACCTCATTAGTGCTAACAGAACCTCCTCACGCATGTGAGCTGATAAATAATGCATATGAAGTTAATCGAAATATTGCTCTCATAATTCGTGGAGGTTGCAGTTTCGTCACGAAAGCTATTAATGCTCACGTTGCCGGTGCAGTTGCTGTGATTGTTTATGATTTTAACCGCAAGGCTATCCACACATTTAGCATGATTCAGGATGATACTTCCAGACGAGTGCAGATACCGTGTGCGTTTATGAATGGAAAAGATGGGCATTCAATAACCACTGCTTTGGATAATTTAAACTTAACAAAAGCATTAGTTGATTTTCCGGTTAATGT]
[+] EMBL CD189720             [                                                                                                                                                                     ACCTCATTTTAATACAACATTTACATCTACCTCATTAGTGCTAACAGAACCTCCTCACGCATGTGAGCTGATAAATAATGCATATGAAGTTAATCGAAATATTGCTCTCATAATTCGTGGAGGTTGCAGTTTCGTCACGAAAGCTATTAATGCTCACGTTGCCGGTGCAGTTACTGTGATTGTTTATGATTTTAACCGCAAGGCTATCCACACATTTAGCATGATTCAGGATGATACTTCCAGACGAGTGCAGATACCGTGTGCGTTTATGAATGGAAAAGATGGGCATTCAATAACCACTGCTTTGGATAATTTAAACTTAACAAAAGCATTAGTTGATTTTCCGGTTAATGT]




>consensus_6874#0
GCTGAAGCGGGTCATTTAGTCTGGATTCATGCATGTTACTGTTGCTTGAGTTGGTTTTTC
TCCTCATAAATATATCGAATGGAGAAAGTGATTATTTACATCTTCGGGTGATAAATCCAT
CAACACTGCCGTTTACATATCGCTTAAGTCCTGGTCAAATAGGACCTCATTTTAATACAA
CATTTACATCTACCTCATTAGTGCTAACAGAACCTCCTCACGCATGTGAGCTGATAAATA
ATGCATATGAAGTTAATCGAAATATTGCTCTCATAATTCGTGGAGGTTGCAGTTTCGTCA
CGAAAGCTATTAATGCTCACGTTGCCGGTGCAGTTGCTGTGATTGTTTATGATTTTAACC
GCAAGGCTATCCACACATTTAGCATGATTCAGGATGATACTTCCAGACGAGTGCAGATAC
CGTGTGCGTTTATGAATGGAAAAGATGGGCATTCAATAACCACTGCTTTGGATAATTTAA
ACTTAACAAAAGCATTAGTTGATTTTCCGGTTAATGT

clustalw multiple alignements is not computed in this case