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Schistosoma mansoni
cluster # 6907 cluster # 6907       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6907#0 length = 1030 sequences # 4  

consensusID : consensus_6907#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1030
fasta sequence
                              [TTGTTAGCGTGGATTTTACTGATTTTAAAGTTGTCATGTACATTGACAGAGAAGTTGCCAGTTATTATCTGGCACGGGATGGGCGATCGAGGGACGGGTATGGGTATACTTAAGCTGGCTACTGCGATACAAAACGAAATACCTAGGACATATGTCAAATGCATTACCACTAGTGACTCAGTAATTGAGGATATTGAAGATACATATTTCATGCCAATCAACGATCAATTGGATTATGTTTGTCGCATGATACATGAAGACAAAAACTTATCTAATGGTTTACATATGATTGGTATATCACAGGGTGGATTATTTGTTAGAGCGTTAGTCCAAAAATGCAATTTCTCGAAAGTTGGCACCGTTGTTTCGATTGGAGGACCTCAACAGGGTATATTTGGGATTCCGAAATGCATTAATGATGGCTTTATTCATCTATGCTTATTAATGAACGAGCTACTTTCATATGGAGCCTATATAAATTTTATTCAGAGCCACCTTGTTCAAGCTCAATACTGGCATGATCCATTGGAGGAAGATGTCTATCGCAAATACTCCCAATTTTTAGCTGATATTAATCAGGAAAATGAAATAAACGAAATTTATCGTGAAAAAATGAAAAATATTCAAAGATTAGTATTGGTAAAGTTTTCGGGTGACACTATTGTAATCCCCAAAGAATCTGAATGGTTTGGATTTTATCAGAATGGATCGTCGACAAATACAACAACGTTACAAGACAGCATTCTGTATACTGAAGATCGTCTAGGTCTTANAGAACTTGATAAAAGGGGTGATTTACATTNTATTGAAAAAGATGGTGATCATTTACATTNTGATGTGAATTGGTTTATTGAAAAGATTGTTATTGCTTTTTTGAAATAACTTTAATTCATAGAATATACACTATTTACTTCGTACATTTCAAAGTAGTATATATGGCATTNGGTAATTTTTGACCCGTTAATATCATACTGCAAGAACACATAATCTTTCTGATTTACATTAAAACTTTTTACATTTCTGAATAATT]

[+] EMBL CD083504             [TTGTTAGCGTGGATTTTACTGATTTTAAAGTTGTCATGTACATTGACAGAGAAGTTGCCAGTTATTATCTGGCACGGGATGGGCGATCGAGGGACGGGTATGGGTATACTTAAGCTGGCTACTGCGATACAAAACGAAATACCTAGGACATATGTCAAATGCATTACCACTAGTGACTCAGTAATTGAGGATATTGAAGATACATATTTCATGCCAATCAACGATCAATTGGATTATGTTTGTCGCATGATACATGAAGACAAAAACTTATCTAATGGTTTACATATGATTGGTATATCACAGGGTGGATTATTTGTTAGAGCGTTAGTCCAAAAATGCAATTTCTCGAAAGTTGGCACCGTTGTTTCGATTGGAGGACCTCAACAGGGTATATTTGGGATTCCGAAATGCATTTATGATGGCTTTATTCATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD083572             [                                                                                            ggCGGGTATGGGTATACTTAAGCTGGCTACTGCGATACAAAACGAAATACCTAGGACATATGTCAAATGCATTACCACTAGTGACTCAGTAATTGAGGATATTGAAGATACATATTTCATGCCAATCAACGATCAATTGGATTATGTTTGTCGCATGATACATGAAGACAAAAACTTATCTAATGGTTTACATATGATTGGTATATCACAGGGTGGATTATTTGTTAGAGCGTTAGTCCAAAAATGCAATTTCTCGAAAGTTGGCACCGTTGTTTCGATTGGAGGACCTCAACAGGGTATATTTGGGATTCCGAAATGCATTAATGATGGCTTTATTCATCTATGCTTATTAATGAACGAGCTACTTTCATATGGAGCCTATATAAATTTTATTCAGAGCCACCTTGTTCAAGCTCAATACTGGCATGATCCATTGGAGGAAGATGTCTATCGCAAATACTCCCAATTTTTAGCTGATATTAATCAGGAAAATGAAATAAACGAAATTTATCGTGAAAAAATGAAAAATATTCAAAGATTAGTATTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD079873             [                                                                                                                                                                                                 gTGAAGATACATATTTCATGCCAATCAACGATCAATTGGATTATGTTTGTCGCATGATACATGAAGACAAAAACTTATCTAATGGTTTACATATGATTGGTATATCACAGGGTGGATTATTTGTTAGAGCGTTAGTCCAAAAATGCAATTTCTCGAAAGTTGGCACCGTTGTTTCGATTGGAGGACCTCAACAGGGTATATTTGGGATTCCGAAATGCATTAATGATGGCTTTATTCATCTATGCTTATTAATGAACGAGCTACTTTCATATGGAGCCTATATAAATTTTATTCAGAGCCACCTTGTTCAAGCTCAATACTGGCATGATCCATTGGAGGAAGATGTCTATCGCAAATACTCCCAATTTTTAGCTGATATTAATCAGGAAAATGAAATAAACGAAATTTATCGTGAAAAAATGAAAAATATTCAAAGATTAGTATTGGTAAAGTTTTCGGGTGACACTATTGTAATCCCCAAAGAATCTGAATGGTTTGGATTTTATCAGAATGGATCGTCGACAAATACAACAACGTTACAAGACAGCATTCTGTATACTGAAGATCGTCTAGGTCTTANAGAACTTGATAAAAGGGGTGATTTACATTNTATTGAAAAAGATGGTGATCATTTACATTNTGATGTGAATTGGTTTATTGAAAAGATTGTTATTGCTTTTTTGAAATAACTTTAATTCATAGAATATACACTATTTACTTCGTACATTTCAAAGTAGTATATATGGCATTNGGTAATTTTTGACCCGTTAATATCATACTGCAAGAACACATAATCTTTCTGATTTACATTAAAACTTTTTACATTTCTGAATAATT]
[+] EMBL CD079874             [                                                                                                                                                                                                         ACATAATTCATGCCAATCAACGATCAATTGGATTATGTTTGTCGCCTGATACATGAAGACAAAAACTTATCTAATGG TTACATATGATTGGTATATCACAGGGTGGATTATTTGTTAGAGCGTTAGTCCAAAAATGCAATTTCTCGAAAGTTGGCACCGTTGTTTCGATTGGAGGACCTCAACAGGGTATATTTGGGATTCCGAAATGCATTAATGATGGCTTTATTCATCTATGCTTATTAATGAACGATCTACTTTCATATGGAGCCTATATAAATTTTATTCAGAGCCACCTTGTTCAAGCTCAATACTGGCATGATCCATTGGAGGAAGATGTCTATCGCAGATACTCCCAATTTTTAGCTGATATTAATCAGGAAAATGAAATAAACGAAATTTATCGTGAAACAATGAAAAATATTCAAAGATTAGTATTGGTAAAGTTTTCGGGTGACACTATTGTAATCCCCAAAGAATCTGAATGGTTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]


>consensus_6907#0 TTGTTAGCGTGGATTTTACTGATTTTAAAGTTGTCATGTACATTGACAGAGAAGTTGCCA GTTATTATCTGGCACGGGATGGGCGATCGAGGGACGGGTATGGGTATACTTAAGCTGGCT ACTGCGATACAAAACGAAATACCTAGGACATATGTCAAATGCATTACCACTAGTGACTCA GTAATTGAGGATATTGAAGATACATATTTCATGCCAATCAACGATCAATTGGATTATGTT TGTCGCATGATACATGAAGACAAAAACTTATCTAATGGTTTACATATGATTGGTATATCA CAGGGTGGATTATTTGTTAGAGCGTTAGTCCAAAAATGCAATTTCTCGAAAGTTGGCACC GTTGTTTCGATTGGAGGACCTCAACAGGGTATATTTGGGATTCCGAAATGCATTAATGAT GGCTTTATTCATCTATGCTTATTAATGAACGAGCTACTTTCATATGGAGCCTATATAAAT TTTATTCAGAGCCACCTTGTTCAAGCTCAATACTGGCATGATCCATTGGAGGAAGATGTC TATCGCAAATACTCCCAATTTTTAGCTGATATTAATCAGGAAAATGAAATAAACGAAATT TATCGTGAAAAAATGAAAAATATTCAAAGATTAGTATTGGTAAAGTTTTCGGGTGACACT ATTGTAATCCCCAAAGAATCTGAATGGTTTGGATTTTATCAGAATGGATCGTCGACAAAT ACAACAACGTTACAAGACAGCATTCTGTATACTGAAGATCGTCTAGGTCTTANAGAACTT GATAAAAGGGGTGATTTACATTNTATTGAAAAAGATGGTGATCATTTACATTNTGATGTG AATTGGTTTATTGAAAAGATTGTTATTGCTTTTTTGAAATAACTTTAATTCATAGAATAT ACACTATTTACTTCGTACATTTCAAAGTAGTATATATGGCATTNGGTAATTTTTGACCCG TTAATATCATACTGCAAGAACACATAATCTTTCTGATTTACATTAAAACTTTTTACATTT CTGAATAATT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)