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Schistosoma mansoni
cluster # 6927 cluster # 6927       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6927#0 length = 1121 sequences # 4  

consensusID : consensus_6927#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1121
fasta sequence
                              [CCTCGAGGGCCANAATTCGGCACGAGGTTTTTTACCGACCATCGTTCTGGTCGTCTTACTTCACAAGAATATGTTAGCATTATTCGAGAAATTCTCAATATGGAGACCAATGTTGTACTTGCTCGAAATTTCGATAGAGTAATTTTTGATGAAGGTATGTCTGGTTGGGATACAACTCGACGTTATTTCCGAAATATTTTTCATACAACTAATCGTTCTCAACGACTAAATTCAAATTATAATAATGGTTATAATGCAGGTACTGTAATGGATACTACTAATTCAATGCATGAAATTAATCCATATATAGTAGACACTTCAAAAGCTATATTCTTTGATATATGGCCAATTAACCTTCTTGAATTTTATGGTGGGACTTTAAATCCACCATCATCTTCATCATCACATGAAGGAATTTACAAACAAGCAATTGATCGTACTGGTCTTTTCCTCTTACAACTTGCCTGTTTAGTCGCTAGATCACCCTATTGGCGTAAACGTCGTCATCCACCAAAACTACGCGCATTTTTTCCACAGTTACGTACAATGAATCAAATGAATCCACCTATGGGGNGAAGTTGTTACGGTAATTGACAAAGCACGTTCCCAATTATCGACTTTGTTGAAAAATTTACGAATTCCTGCGGAAATACATCTGGTTGATATGGATAGTTCAGTAATGAAAAAAATTCAATGTTGAAAAATATTGATGATAATACTAATGATAACAGAAGAATAATCTATTTGAACCAATTAGTTCTGTCTTATTGTCATCCGAATACAACAGCTTTATTTCTTTATTTGCCTAAACCAAGTTCAGATTTATCATTAGCTGATATTTATTTGAATCAATTGAATATACTAACCGATACGTTACCGCCAACATTGTTAGCTCATGGTTTACATGAAGTTACATCAGCTGAACTGTAACGATTAATTTTGTGTTTTGATATGAGTTTGAAAATGAGTGAGCAACAACATACTTGTATTTTTCGATACGCATTATAACAATAATTTGATCCATTTTTTTACTACTATCTGGTTGTTTTTTCTCTGATTGAATTGATTGTTATCTATTTGTGTGTTTGCGCTTACACATGTATCCCTTTTTGATCAATACA]

[+] EMBL CD081980             [CCTCGAGGGCCANAATTCGGCACGAGGTTTTTTACCGACCATCGTTCTGGTCGTCTTACTTCACAAGAATATGTTAGCATTATTCGAGAAATTCTCAATATGGAGACCAATGTTGTACTTGCTCGAAATTTCGATAGAGTAATTTTTGATGAAGGTATGTCTGGTTGGGATACAACTCGACGTTATTTCCGAAATATTTTTCATACAACTAATCGTTCTCAACGACTAAATTCAAATTATAATAATGGTTATAATGCAGGTACTGTAATGGATACTACTAATTCAATGCATGAAATTAATCCATATATAGTAGACACTTCAAAAGCTATATTCTTTGATATATGGCCAATTAACCTTCTTGAATTTTATGGTGGGACTTTAAATCCACCATCATCTTCATCATCACATGAAGGAATTTACAAACAAGCAATTGATCGTACTGGTCTTTTCCTCTTACAACTTGCCTGTTTAGTCGCTAGATCACCCTATTGGCGTAAACGTCGTCATCCACCAAAACTACGCGCATTTTTTCCACAGTTACGTACAATGAATCAAATGAATCCACCTATGGGGNGAAGTTGTTACGGTAATTGACAAAGCACGTTCCCAATTATCGACTTTGTTGAAAAATTTACGAATTCCTGCGGAAATACATCTGGTTGATATGGATAGTTCAGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD162984             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTACGGTAATTGACAAAGCACGTTCCCAATTATCGACTTTGTTGAAAAATTTACGAATTCCTGCGGAAATACATCTGGTTGATATGGATAGTTCAGTAATGAAAAAAATTCAATGTTGAAAAATATTGATGATAATACTAATGATAACAGAAGAATAATCTATTTGAACCAATTAGTTCTGTCTTATTGTCATCCGAATACAACAGCTTTATTTCTTTATTTGCCTAAACCAAGTTCAGATTTATCATTAGCTGATATTTATTTGAATCAATTGAATATACTAACCGATACGTTACCGCCAACATTGTTAGCTCATGGTTTACATGAAGTTACATCAGCTGAACTGTAACGATTAATTTTGTGTTTTGATATGAGTTTGAAAATGAGTGAGCAACAACATACTTGTATTTTTCGATACGCATTATAACAATAATTTGATCCATTTTTT                                                                                            ]
[+] EMBL CD169605             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGTTACATCAGCTGAACTGTAACGATTAAATCTGTGTTTTGATATGAGTTTGAAAATGAGTGAGCAACAACATACTTGTATTTTTCGATACGCATTATAACAATAATTTGATCCATTTTTTTACTACTATCTGGTTGTTTTTTCTCTGATTGAATTGATTGTTATCTATTTGTGTGTTTGCGCTTACACATGTATCCCTTTTTGATCAATACA]
[+] EMBL CD169604             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGTTACATCAGCTGAACTGTAACGATTAATTTTGTGTTTTGATATGAGTTTGAAAATGAGTGAGCAACAACATACTTGTATTTTTCGATACGCATTATAACAATAATTTGATCCATTTTTTTACTACTATCTGGTTGTTTTTTCTCTGATTGAATTGATTGTTATCTATTTGTGTGTTTGCGCTTACACATGTATCCCTTTTTGATCAATACA]


>consensus_6927#0 CCTCGAGGGCCANAATTCGGCACGAGGTTTTTTACCGACCATCGTTCTGGTCGTCTTACT TCACAAGAATATGTTAGCATTATTCGAGAAATTCTCAATATGGAGACCAATGTTGTACTT GCTCGAAATTTCGATAGAGTAATTTTTGATGAAGGTATGTCTGGTTGGGATACAACTCGA CGTTATTTCCGAAATATTTTTCATACAACTAATCGTTCTCAACGACTAAATTCAAATTAT AATAATGGTTATAATGCAGGTACTGTAATGGATACTACTAATTCAATGCATGAAATTAAT CCATATATAGTAGACACTTCAAAAGCTATATTCTTTGATATATGGCCAATTAACCTTCTT GAATTTTATGGTGGGACTTTAAATCCACCATCATCTTCATCATCACATGAAGGAATTTAC AAACAAGCAATTGATCGTACTGGTCTTTTCCTCTTACAACTTGCCTGTTTAGTCGCTAGA TCACCCTATTGGCGTAAACGTCGTCATCCACCAAAACTACGCGCATTTTTTCCACAGTTA CGTACAATGAATCAAATGAATCCACCTATGGGGNGAAGTTGTTACGGTAATTGACAAAGC ACGTTCCCAATTATCGACTTTGTTGAAAAATTTACGAATTCCTGCGGAAATACATCTGGT TGATATGGATAGTTCAGTAATGAAAAAAATTCAATGTTGAAAAATATTGATGATAATACT AATGATAACAGAAGAATAATCTATTTGAACCAATTAGTTCTGTCTTATTGTCATCCGAAT ACAACAGCTTTATTTCTTTATTTGCCTAAACCAAGTTCAGATTTATCATTAGCTGATATT TATTTGAATCAATTGAATATACTAACCGATACGTTACCGCCAACATTGTTAGCTCATGGT TTACATGAAGTTACATCAGCTGAACTGTAACGATTAATTTTGTGTTTTGATATGAGTTTG AAAATGAGTGAGCAACAACATACTTGTATTTTTCGATACGCATTATAACAATAATTTGAT CCATTTTTTTACTACTATCTGGTTGTTTTTTCTCTGATTGAATTGATTGTTATCTATTTG TGTGTTTGCGCTTACACATGTATCCCTTTTTGATCAATACA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)