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Schistosoma mansoni
cluster # 6956 cluster # 6956       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6956#0 length = 723 sequences # 4  

consensusID : consensus_6956#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 723
fasta sequence
                              [AATTCCTAGATGGTCAGAGACCCCCTGCTCACCGTATGAATTGAGTCTAATGAATACAAAGATACCAGAATGTTTAAATGCAGAAGAACGTTCAAAACTATGTCATGCATTATTGACACATTTTCGTACTTTCAAAAATTTATCATCAGAACAACAATCACATTCAACATTATCCATGTCGGAAAATCAACATTCTGATGATCAGTTGCCTCTACCATCTGACTGTTTAAACGCTATGTTCAGGTTGATGCTTCGTTTATGCTTTACAAGTTATGAAGATGCAGATAAGTTAGCTGAAGCGGATCTCTTGACAACTCTATTCTCGTATCCACATGCGCCGGAGTTTTCTCCGGAATTTTCATCTTTCGTTGGTGCTTTGATTTCCGAAATTTTTGACGATACTTCGACAATTGATCGGATAATGAAGGAAATTTGCATCCGAATGTCCAGATCCGGTATGCCTAATGTGTTTATGGGAATCGATGCTGGCCCTAGAACTTGTCGAGATTTGTTCTATTTATTGAGTTTATGTGCACCTTTGCTTGCTAAAGATCGTGAACGTGCTCTTAGATTAGCAACAGAAACATTCAGTTTATCTTTGCCCGATAGCGATATAGAAGGTAAAGTTTATCCAAAGACGTATATCGTTGAAGAATCTAATCCTCCTGGTGCTGCTGTTTCGGACCGATCTTCAGTAATATCCTTCCCTCTCTCACGCCTTAT]

[+] EMBL CD160488             [AATTCCTAGATGGTCAGAGACCCCCTGCTCACCGTATGAATTGAGTCTAATGAATACAAAGATACCAGAATGTTTAAATGCAGAAGAACGTTCAAAACTATGTCATGCATTATTGACACATTTTCGTACTTTCAAAAATTTATCATCAGAACAACAATCACATTCAACATTATCCATGTCGGAAAATCAACATTCTGATGATCAGTTGCCTCTACCATCTGACTGTTTAAACGCTATGTTCAGGTTGATGCTTCGTTTATGCTTTACAAGTTATGAAGATGCAGATAAGTTAGCTGAAGCGGATCTCTTGACAACTCTATTCTCGTATCCACATGCGCCGGAGTTTTCTCCGGAATTTTCATCTTTCGTTGGTGCTTTGATTTCCGAAATTTTTGACGATACTTCGACAATTGATCGGATAATGAAGGAAATTTGCATCCGAATGTCCAGATCCGGTATGCCTAATGTGTTTATGGGAATCGATGCTGGCCCTAGAACTTGTCGAGATTTGTTCTATTTATTGAGTTTATGTGCACCTTTGCTTGCTAAAGATCGTGAACGTGCTCTTAGATTAGCAACAGAAACATTCAGTTTATCTTTGCCCGATAGCGATATAGAAGGTAAAGTT                                                                                               ]
[-] EMBL CD117670             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATCTTTCGTTGGTGCTTTGATTTCCGAAATTTTTGACGATACTTCGACAATTGATCGGATAATGAAGGAAATTTGCATCCGAATGTCCAGATCCGGTATGCCTAATGTGTTTATGGGAATCGATGCTGGCCCTAGAACTTGTCGAGATTTGTTCTATTTATTGAGTTTATGTGCACCTTTGCTTGCTAAAGATCGTGAACGTGCTCTTAGATTAGCAACAGAAACATTCAGTTTATCTTTGCCCGATAGCGATATAGAAGGTAAAGTTTATCCAAAGACGTATAT                                                                              ]
[+] EMBL CD147378             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TGCCTAATGTGTTTATGGGAATCGATGCTGGCCCTAGAACTTGTCGAGATTTGTTCTATTTATTGAGTTTATGTGCACCTTTGCTTGCTAAAGATCGTGAACGTGCTCTTAGATTAGCAACAGAAACATTCAGTTTATCTTTGCCCGATAGCGATATAGAAGGTAAAGTTTATCCAAAGACGTATATCGTTGAAGAATCTAATCCTCCTGGTGCTGCTGTTTCGGACCGATCTTCAGTAATATCCTTCCCTCTCTCACGCCTTAT]
[+] EMBL CD147441             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TGCCTAATGTGTTTATGGGAATCGATGCTGGCCCTAGAACTTGTCGAGATTTGTTCTATTTATTGAGTTTATGTGCACCTTTGCTTGCTAAAGATCGTGAACGTGCTCTTAGATTAGCAACAGAAACATTCAGTTTATCTTTGCCCGATAGCGATATAGAAGGTAAAGTTTATCCAAAGACGTATATCGTTGAAGAATCTAATCCTCCTGGTGCTGCTGTTTCGGACCGATCTTCAGTAATATCCTTCC                ]


>consensus_6956#0 AATTCCTAGATGGTCAGAGACCCCCTGCTCACCGTATGAATTGAGTCTAATGAATACAAA GATACCAGAATGTTTAAATGCAGAAGAACGTTCAAAACTATGTCATGCATTATTGACACA TTTTCGTACTTTCAAAAATTTATCATCAGAACAACAATCACATTCAACATTATCCATGTC GGAAAATCAACATTCTGATGATCAGTTGCCTCTACCATCTGACTGTTTAAACGCTATGTT CAGGTTGATGCTTCGTTTATGCTTTACAAGTTATGAAGATGCAGATAAGTTAGCTGAAGC GGATCTCTTGACAACTCTATTCTCGTATCCACATGCGCCGGAGTTTTCTCCGGAATTTTC ATCTTTCGTTGGTGCTTTGATTTCCGAAATTTTTGACGATACTTCGACAATTGATCGGAT AATGAAGGAAATTTGCATCCGAATGTCCAGATCCGGTATGCCTAATGTGTTTATGGGAAT CGATGCTGGCCCTAGAACTTGTCGAGATTTGTTCTATTTATTGAGTTTATGTGCACCTTT GCTTGCTAAAGATCGTGAACGTGCTCTTAGATTAGCAACAGAAACATTCAGTTTATCTTT GCCCGATAGCGATATAGAAGGTAAAGTTTATCCAAAGACGTATATCGTTGAAGAATCTAA TCCTCCTGGTGCTGCTGTTTCGGACCGATCTTCAGTAATATCCTTCCCTCTCTCACGCCT TAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)