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Schistosoma mansoni
cluster # 6961 cluster # 6961       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6961#0 length = 728 sequences # 4  

consensusID : consensus_6961#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 728
fasta sequence
                              [TACACTGTCAAGGTGAGAGCCATCCAACTTGGACAAGATCACCTCGAGTAAGCCACGTTGGTTCCATATTAGTGACACTCATTGATAAACGGGCATGGTGCGCCACAATAATCTTATGAAGTCTGCGTAAACTGTCTACAGACGGTAAAGCATTACCGGATTTAGAAATGTTGTTATTTATATTATTTAACTGAGAAGAGTCGGAGTGATTTCTCATGCTTGAACTTATAAGTGCATTAAAAATGTGGGATTCAGGTAAACTAGGAACATTGAGTCCACTACGTGGGGAAGGTGAAGGTACGGGAGGAAATTGACTACCCATACTGCGTAGTTTATCTTGGAGTTCTGCAAGAGCAAGATATGACTTGTTTATTTGACGATGGTT-AATTTTGGGATTTTGTTGTGCAGA-CAAATGGGCATTTAATAACTTCATGATCAGATTAAGGGCAGTTGTCCCGGGTTCTACCTCATAAAAGTTCGCACCGGATAAAATAAGCATGTTAGCCATATCAAAATCTCCTGCTGCTATCGCTAAACCAAGAGCTGATCGTTGTCGGCGGTTGGGTTCGACACAGTTAGGCTTAGCACCTGCATCAAGTAGTGCTTGAGCAGCATGTAAACGGCCCAAACAAACCGCTAAAGCTAATAATGGCCATTTAGAATTAGGTTCAGTAACCTTATTAGGATCCAATCCAGAAGCAAGCAGTCGATCTAAAACTAACGGTCTC]

[+] EMBL CD164578             [TACACTGTCAAGGTGAGAGCCATCCAACTTGGACAAGATCACCTCGAGTAAGCCACGTTGGTTCCATATTAGTGACACTCATTGATAAACGGGCATGGTGCGCCACAATAATCTTATGAAGTCTGCGTAAACTGTCTACAGACGGTAAAGCATTACCGGATTTAGAAATGTTGTTATTTATATTATTTAACTGAGAAGAGTCGGAGTGATTTCTCATGCTTGAACTTATAAGTGCATTAAAAATGTGGGATTCAGGTAAACTACGAACATTGAGTCCACTACGTGGGGAAGGTGAATGTACGGGAGGAAATTGACTACCCATACTGCGTAGTTTATCTTGGAGTTCTGCAAGAGCACGATATGACTTGTTTATTTGACGATGGTT AATTTTGGGATTTTGTTGTGCAGA CAAATGGGCATTTAATAACTTCATGATCAGATT                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD164556             [                                                                                                       CACAATAAGCTCATGAAGTCTGCGTAAACTGCCTACAGACGGTAAAGCATTACCGGATTTAGAAATGTTGTTATTTATATTATTTAACTGAGAAGAGTCGGAGTGATTTCTCATGCTTGAACTTATAAGTGCATTAAAAATGTGGGATTCACGTAAACTAGGAACATTGAGTCCACTATGTGGGGAAGGTGAACGTACCGGAGGAAATTGACTACCCATACTGCGTAGTTTATCTTGGAGTTCTGCAAGAGCAAGATATGACTTGTTTATTTGACGATGGTTAAATTTTGGGATTTTGTTGTGCACACCAAATGGGCATTTAATAACCTCATGATCACATT                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD094796             [                                                                                                                                                                     AAATG TGTTATTTATATTATTTAACTGAGAAGAGTCGGAGTGATTTCTCATGCTTGAACTTATAAGTGCATTAAAAATGTGGGATTCAGGTAAACTAGGAACATTGAGTCCACTAGGTGGGGAAGGTGAAGGTACGGGAGGAAATTGACTACCCATACTGCGTAGTTTATCTTGGAGTTCTGCAAGAGCAAGATATGACTTGTTTATTTGACGATGGTT AATTTTGGGATTTTGTTGTGCAGA CAAATGGGCATTTAATAACTTCATGATCAGATTAAGGGCAGTTGTCCCGGGTTCTACCTCATAAAAGTTCGCACCGGATAAAATAAGCATGTTAGCCATATCAAAATCTCC                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL BG932605             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AGGTGAAGGTACGGGAGGAAATTGACTACCCATACTGCGTAGTTTATCTTGGAGTTCTGCAAGAGCAAGATATGACTTGTTTATTTGACGATGGTT AATTTTGGGATTTTGTTGTGCAGA CAAATGGGCATTTAATAACTTCATGATCAGATTAAGGGCAGTTGTCCCGGGTTCTACCTCATAAAAGTTCGCACCGGATAAAATAAGCATGTTAGCCATATCAAAATCTCCTGCTGCTATCGCTAAACCAAGAGCTGATCGTTGTCGGCGGTTGGGTTCGACACAGTTAGGCTTAGCACCTGCATCAAGTAGTGCTTGAGCAGCATGTAAACGGCCCAAACAAACCGCTAAAGCTAATAATGGCCATTTAGAATTAGGTTCAGTAACCTTATTAGGATCCAATCCAGAAGCAAGCAGTCGATCTAAAACTAACGGTCTC]


>consensus_6961#0 TACACTGTCAAGGTGAGAGCCATCCAACTTGGACAAGATCACCTCGAGTAAGCCACGTTG GTTCCATATTAGTGACACTCATTGATAAACGGGCATGGTGCGCCACAATAATCTTATGAA GTCTGCGTAAACTGTCTACAGACGGTAAAGCATTACCGGATTTAGAAATGTTGTTATTTA TATTATTTAACTGAGAAGAGTCGGAGTGATTTCTCATGCTTGAACTTATAAGTGCATTAA AAATGTGGGATTCAGGTAAACTAGGAACATTGAGTCCACTACGTGGGGAAGGTGAAGGTA CGGGAGGAAATTGACTACCCATACTGCGTAGTTTATCTTGGAGTTCTGCAAGAGCAAGAT ATGACTTGTTTATTTGACGATGGTTAATTTTGGGATTTTGTTGTGCAGACAAATGGGCAT TTAATAACTTCATGATCAGATTAAGGGCAGTTGTCCCGGGTTCTACCTCATAAAAGTTCG CACCGGATAAAATAAGCATGTTAGCCATATCAAAATCTCCTGCTGCTATCGCTAAACCAA GAGCTGATCGTTGTCGGCGGTTGGGTTCGACACAGTTAGGCTTAGCACCTGCATCAAGTA GTGCTTGAGCAGCATGTAAACGGCCCAAACAAACCGCTAAAGCTAATAATGGCCATTTAG AATTAGGTTCAGTAACCTTATTAGGATCCAATCCAGAAGCAAGCAGTCGATCTAAAACTA ACGGTCTC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)