These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6961#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 728 fasta sequence [TACACTGTCAAGGTGAGAGCCATCCAACTTGGACAAGATCACCTCGAGTAAGCCACGTTGGTTCCATATTAGTGACACTCATTGATAAACGGGCATGGTGCGCCACAATAATCTTATGAAGTCTGCGTAAACTGTCTACAGACGGTAAAGCATTACCGGATTTAGAAATGTTGTTATTTATATTATTTAACTGAGAAGAGTCGGAGTGATTTCTCATGCTTGAACTTATAAGTGCATTAAAAATGTGGGATTCAGGTAAACTAGGAACATTGAGTCCACTACGTGGGGAAGGTGAAGGTACGGGAGGAAATTGACTACCCATACTGCGTAGTTTATCTTGGAGTTCTGCAAGAGCAAGATATGACTTGTTTATTTGACGATGGTT-AATTTTGGGATTTTGTTGTGCAGA-CAAATGGGCATTTAATAACTTCATGATCAGATTAAGGGCAGTTGTCCCGGGTTCTACCTCATAAAAGTTCGCACCGGATAAAATAAGCATGTTAGCCATATCAAAATCTCCTGCTGCTATCGCTAAACCAAGAGCTGATCGTTGTCGGCGGTTGGGTTCGACACAGTTAGGCTTAGCACCTGCATCAAGTAGTGCTTGAGCAGCATGTAAACGGCCCAAACAAACCGCTAAAGCTAATAATGGCCATTTAGAATTAGGTTCAGTAACCTTATTAGGATCCAATCCAGAAGCAAGCAGTCGATCTAAAACTAACGGTCTC] [+] EMBL CD164578 [TACACTGTCAAGGTGAGAGCCATCCAACTTGGACAAGATCACCTCGAGTAAGCCACGTTGGTTCCATATTAGTGACACTCATTGATAAACGGGCATGGTGCGCCACAATAATCTTATGAAGTCTGCGTAAACTGTCTACAGACGGTAAAGCATTACCGGATTTAGAAATGTTGTTATTTATATTATTTAACTGAGAAGAGTCGGAGTGATTTCTCATGCTTGAACTTATAAGTGCATTAAAAATGTGGGATTCAGGTAAACTACGAACATTGAGTCCACTACGTGGGGAAGGTGAATGTACGGGAGGAAATTGACTACCCATACTGCGTAGTTTATCTTGGAGTTCTGCAAGAGCACGATATGACTTGTTTATTTGACGATGGTT AATTTTGGGATTTTGTTGTGCAGA CAAATGGGCATTTAATAACTTCATGATCAGATT ] [+] EMBL CD164556 [ CACAATAAGCTCATGAAGTCTGCGTAAACTGCCTACAGACGGTAAAGCATTACCGGATTTAGAAATGTTGTTATTTATATTATTTAACTGAGAAGAGTCGGAGTGATTTCTCATGCTTGAACTTATAAGTGCATTAAAAATGTGGGATTCACGTAAACTAGGAACATTGAGTCCACTATGTGGGGAAGGTGAACGTACCGGAGGAAATTGACTACCCATACTGCGTAGTTTATCTTGGAGTTCTGCAAGAGCAAGATATGACTTGTTTATTTGACGATGGTTAAATTTTGGGATTTTGTTGTGCACACCAAATGGGCATTTAATAACCTCATGATCACATT ] [-] EMBL CD094796 [ AAATG TGTTATTTATATTATTTAACTGAGAAGAGTCGGAGTGATTTCTCATGCTTGAACTTATAAGTGCATTAAAAATGTGGGATTCAGGTAAACTAGGAACATTGAGTCCACTAGGTGGGGAAGGTGAAGGTACGGGAGGAAATTGACTACCCATACTGCGTAGTTTATCTTGGAGTTCTGCAAGAGCAAGATATGACTTGTTTATTTGACGATGGTT AATTTTGGGATTTTGTTGTGCAGA CAAATGGGCATTTAATAACTTCATGATCAGATTAAGGGCAGTTGTCCCGGGTTCTACCTCATAAAAGTTCGCACCGGATAAAATAAGCATGTTAGCCATATCAAAATCTCC ] [-] EMBL BG932605 [ AGGTGAAGGTACGGGAGGAAATTGACTACCCATACTGCGTAGTTTATCTTGGAGTTCTGCAAGAGCAAGATATGACTTGTTTATTTGACGATGGTT AATTTTGGGATTTTGTTGTGCAGA CAAATGGGCATTTAATAACTTCATGATCAGATTAAGGGCAGTTGTCCCGGGTTCTACCTCATAAAAGTTCGCACCGGATAAAATAAGCATGTTAGCCATATCAAAATCTCCTGCTGCTATCGCTAAACCAAGAGCTGATCGTTGTCGGCGGTTGGGTTCGACACAGTTAGGCTTAGCACCTGCATCAAGTAGTGCTTGAGCAGCATGTAAACGGCCCAAACAAACCGCTAAAGCTAATAATGGCCATTTAGAATTAGGTTCAGTAACCTTATTAGGATCCAATCCAGAAGCAAGCAGTCGATCTAAAACTAACGGTCTC] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||