cluster # 6971

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Schistosoma mansoni
cluster # 6971 cluster # 6971 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6971#0 length = 641 sequences # 4

consensusID : consensus_6971#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 641
fasta sequence

                              [TGATCGTGAAGGTGATGGCTTTAAAGGATATGGTGAGTAAGCTTTAGTTAAACGTGCTACTGACATATTGGAGCTTCCAGACACTGTAGAATCATCAACAGTATCAAGTGTTGTTGGCGTTGCTGTTGCATCGAATGATTCATTTGCACTTGATGAATTATACAATGATTTGGTATCTGGAATGTGAAAAGTTAAAGTAGGATGATAAGTGAGCAAATTATCAATATAAAAACTGAACAATGTTTATATCTTTATTGGTAAAATTTTCAGAGTGATTTTGGAAAGATTTTTGAATTTCATTAAAAGTGATGAACCTGATTAAGTTAGACCATTATTGTAAACATGTAAGCACCGGACTTTTATTCCGTCCTAATATACAATTCGTAAGTAGTGCAGATTCACAGTCCCTCTGTAAGAGGTAGAACTCAAGACTTTCGATATCGCGCGCGAATGTTTAACCTGCAGACCACTGACCCGACAGCCAGTGGTGTCAATATCCAATCTAAGTGAATCCACGACAATGCCTGCCCAGTG-GTTAAACGTCCGCGCGCTAGACCGATGGTCTTGAGTTCCATTCCCGTCCGCAGGATCGTGGATGCATACTGTTGTATAAATCCCAAATAAGGACCAAATGGGCTGTG]

[+] EMBL CD087586             [TGATCGTGAAGGTGATGGCTTTAAAGGATATGGTGAGTAAGCTTTAGTTAAACGTGCTACTGACATATTGGAGCTTCCAGACACTGTAGAATCATCAACAGTATCAAGTGTTGTTGGCGTTGCTGTTGCATCGAATGATTCATTTGCACTTGATGAATTATACAATGATTTGGTATCTGGAATGTGAAAAGTTAAAGTAGGATGATAAGTGAGCAAATTATCAATATAAAAACTGAACAATGTTTATATCTTTATTGGTAAAATTTTCAGAGTGATTTTGGAAAGATTTTTGAATTTCATTAAAAGTGATGAACCTGATTAAGTTAGACCATTATTGTAAACATGTAAGCACCGGACTTTTATTCCGTCCTAATATACAATTCGTAAGTAGTGCAGATTCACAGTCCCTCTGTAAGAGGTAGAACTCAAGACTTTCGATATCGCGCGCGAATGTTTAACCTGCAGACCACTGACCCGACAGCCAGTGGTGTCAATATCCAATCTAAGTGAATCCACGACAATGCCTGCCCAGTG GTTATACGTCCGCGCGCTAGACCGATGGTCTTGAGTTCCATTCCCGTCCGCAGGATCGTGGATGCATACTGTTGTATAAATTCCAAATAAcg               ]
[+] EMBL CD087596             [TGATCGTGAAGGTGATGGCTTTAAAGGATATGGTGAGTAAGCTTTAGTTAAACGTGCTACTGACATATTGGAGCTTCCAGACACTGTAGAATCATCAACAGTATCAAGTGTTGTTGGCGTTGCTGTTGCATCGAATGATTCATTTGCACTTGATGAATTATACAATGATTTGGTATCTGGAATGTGAAAAGTTAAAGTAGGATGATAAGTGAGCAAATTATCAATATAAAAACTGAACAATGTTTATATCTTTATTGGTAAAATTTTCAGAGTGATTTTGGAAAGATTTTTGAATCTCATTAAAAGTGATGAACCTGATTAAGTTAGACCATTATTGTAAACATGTAAGCACCGGACTTTTATTCCGTCCTAATATACAATTCGTAAGTAGTGCAGATTCACAGTCCCTCTGTAAGAGGTAGAACTCAAGACTTTCGATATCGCGCGCGAATGTTTAACCTGCAGACCACTGACCCGACAGCCAGTGGTGTCAATATCCAATCTAAGTGAATCCACGACAATGCCTGCCCAGTG GTTAAACGTCCGCGCGCTAGACCGATGGTCTTGAGTTCCATTCCCGTCCGCAGGATCGTGGATGCATACTGTTGTATAAATCCCAAATAAG                ]
[+] EMBL CD087540             [TGATCGTGAAGGTGATGGCTTTAAAGGATATGGTGAGTAAGCTTTAGCTAAACGTGCTACTGACATATTGGAGCTTCCAGACACTGTAGAATCATCAACAGTATCAAGTGTTGTTGGCGTTGCTGTTGCATCGAATGATTCATTTGCACTTGATGAATTATACAATGATTTGGTATCTGGAATGTGAAAAGTTGAAGTAGGATGATAAGTGAGCAAATTATCAATATAAAAACTGAACAATGTTTATATCTTTATTGGTAAAATTTTCAGAGTGATTTTGGAAAGATTTTTGAATTTCATTAAAAGTGATGAACCTGATTAAGTTAGACCATTATTGTAAACATGTAAGCACCGGACTTTTATTCCGTCCTAATATACAATTCGTAAGTAGTGCAGATTCACAGTCCCTCTGTAAGAGGTAGAACTCAAGACTTTCGATATCGCGCGCGAATGTTTAACCTGCAGACCACTGACCCGACAGCCAGTGGTGTCAATATCCAATCTAAGTGAATCCACGACAATGCCTGCCCAGTG GTTAAACGTCCGCGCGCTAGACCGATGGCCTTGAGTTCCA                                                                   ]
[-] EMBL CD087564             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TGGTGTCAATATCCAATATAAGTGAATCCACAACAATGCCTGCCCAGTGTGTTAAACGTCCGCGCGCTAGACCGATGGTCTTAAGTTCCATTCCCGTCCGCAGGATCGTGGATGCAGACTGTTGTATAAATCCCAAATAAGGACCAAATGGGCTGTG]




>consensus_6971#0
TGATCGTGAAGGTGATGGCTTTAAAGGATATGGTGAGTAAGCTTTAGTTAAACGTGCTAC
TGACATATTGGAGCTTCCAGACACTGTAGAATCATCAACAGTATCAAGTGTTGTTGGCGT
TGCTGTTGCATCGAATGATTCATTTGCACTTGATGAATTATACAATGATTTGGTATCTGG
AATGTGAAAAGTTAAAGTAGGATGATAAGTGAGCAAATTATCAATATAAAAACTGAACAA
TGTTTATATCTTTATTGGTAAAATTTTCAGAGTGATTTTGGAAAGATTTTTGAATTTCAT
TAAAAGTGATGAACCTGATTAAGTTAGACCATTATTGTAAACATGTAAGCACCGGACTTT
TATTCCGTCCTAATATACAATTCGTAAGTAGTGCAGATTCACAGTCCCTCTGTAAGAGGT
AGAACTCAAGACTTTCGATATCGCGCGCGAATGTTTAACCTGCAGACCACTGACCCGACA
GCCAGTGGTGTCAATATCCAATCTAAGTGAATCCACGACAATGCCTGCCCAGTGGTTAAA
CGTCCGCGCGCTAGACCGATGGTCTTGAGTTCCATTCCCGTCCGCAGGATCGTGGATGCA
TACTGTTGTATAAATCCCAAATAAGGACCAAATGGGCTGTG

clustalw multiple alignements is not computed in this case