These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7018#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 549 fasta sequence [TTCACCTTGTTTCTATGTTTAATATTTCACCAATGGTTATCATTTTCTGTTGCGAATATCCCAATGCCCCACTCTAGGATTGATTCGGAACTTGCATTATTCATTACAAATGAATTATCTCGACTATTAAGTCCAGACATTCCAACAGTGGA-AGATGTCGGTGATACTGTAGTGAGAGCTTGGTTTAAACATGAAAAAGAATTTTGTCTAAAAGGTACGTCTTGTTTTTGGTAATTTAATGCTCTGATCTACAAGATGATCTTCTAGTTGTGTGATTGTCAGAGATTATGTGAAATTGATGATGGACTGAAAACAGTAGGAAAATTTTGAAGTTTTATCTTCAAATTTAACTAGTATCCATAAGTCACCTCACCGAATAATAATCCGATACTCAATAGTGAATAACCTCAAGATAAATTTACCGAATTACTAAAGAGTTTTAATGACAGTTCGAGTTTACCAATGTCAGTCATGAGACAATCACCTAGTATCAATATCGGTCTTTGNACCACACCATATCGGC-ATCGACTAANATTCAGAATGCGAACA] [+] EMBL CD153281 [TTCACCTTGTTTCTATGTTTAATATTTCACCAATGGTTATCATTTTCTGTTGCGAATATCCCAATGCCCCACTCTAGGATTGATTCGGAACTTGCATTATTCATTACAAATGAATTATCTCGACTATTAAGTCCAGACATTCCAACAGTGGA AGATGTCGGTGATACTGTAGTGAGAGCTTGGTTTAAACATGAAAAAGAATTTTGTCTAAAAGGTACGTCTTGTTTTTGGTAATTTAATGCTCTGATCTACAAGATGATCTTCTAGTTGTGTGATTGTCAGAGATTATGTGAAATTGATGATGGACTGAAAACAGTAGGAAAATTTTGAAGTTTTATCTTCAAATTTAACTAGTATCCATAAGTCACCTCACCGAATAATAATCCGATACTCAATAGTGAATAACCTCAAGATAAATTTACCGAATTACTAAAGAGTTTTAATGACAGTTCGAGTTTACCAATGTCAGTCATGAGACAATCACCTAGTATCAATATCGGTCTTTGNACCACACCATATCGGC ATCGACTANNATTCAGAATGCGAACA] [+] EMBL CD153230 [TTCACCTTGTTTCTATGTTTAATATTTCACCAATGGTTATCATTTTCTGTTGCGAATATCCCAATGCCCCACTCTAGGATTGATTCGGAACTTGCATTATTCATTACAAATGAATTATCTCGACTATTAAGTCCAGACATTCCAACAGTGGA AGATGTCGGTGATACTGTAGTGAGAGCTTGGTTTAAACATGAAAAAGAACTTTGTCTAAAAGGTACGTCTTGTTTTTGGTAATTTAATGCTCTGATCTACAAGATGATCTTCTAGTTGTGTGATTGTCAGAGATTATGTGAAATTGATGATGGACTGAAAACAGTAGGAAAATTTTGAAGTTTTATCTTCAAATTTAACTAGTATCCATAAGTCACCTCACCGAATAATAATCCGATACTCAATAGTGAATAACCTCAAGATAAATTTACCGAATTACTAAAGAGTTTTAATGACAGTTCGAGTTTACCAATGTCAGTCATGAGACAATCACCTAGTATCAATATCGGTCTTTGNACCACACCATATCGGC ATCGACTAANATTCAGAATGCGAACA] [+] EMBL CD153374 [TTCACCTTGTTTCTATGTTTAATATTTCACCAATGGTTATCATTTTCTGTTGCGAATATCCCAATGCCCCACTCTAGGATTGATTCGGAACTTGCATTATTCATTACAAATGAATTATCTCGACTATTAAGTCCAGACATTCCAACAGTGGA AGATGTCGGTGATACTGTAGTGAGAGCTTGGTTTAAACATGAAAAAGAATTTTGTCTAAAAGGTACGTCTTGTTTTTGGTAATTTAATGCTCTGATCTACAAGATGATCTTCTAGTTGTGTGATTGTCAGAGATTATGTGAAATTGATGATGGACTGAAAACAGTAGGAAAATTTTGAAGTTTTATCTTCAAATTTAACTAGTATCCATAAGTCACCTCACCGAATAATAATCCGATACTCAATAGTGAATAACCTCAAGATAAATTTACCGAATTACTAAAGAGTTTTAATGACAGTTCGAGTTTACCAATGTCAGTCATGAGACAATCACCTAGTATCAATATCGGTCTTTG ACCACACCATATCGGCAATCGACTAAaa ] [+] EMBL CD153278 [TTCACCTTGGTTCTATGTTTAATATTTCACCAATGGGTATCATTTTCTGTTGCGAATATCCCAATGCCCCACTCTACGATTGATTCGGAACTTGCATTATTCATTACAAATGAATTATCTCGACTATTAAGTCCAGACATTCCAACAGTGGATAGATGTCGACGATACTGCAGTGAGAGCTTGGCTTAAACATGAAAAAGAATTTTGTCTAACAGGTACGTCTTGCTTTTGGTAATTTAATGCTCTGATCTACTAGATGATCTTCTAGTTGTGCGATTGTCAGAGATTATGTGAAATTGATGATGGACTGAAAACAGTAGGAAAATTTTGAAGTTCTATCTTCGAATTTAACTAGTATACATAAGTCACCTCACCGAATACTAATCCGATACTCATTAGAGAATAACCTCAAGATAAATTTACCGAATTACTAAAGAGTTTTAATGACAGTTCGAGTTTA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||