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Schistosoma mansoni
cluster # 7073 cluster # 7073       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7073#0 length = 927 sequences # 4  

consensusID : consensus_7073#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 927
fasta sequence
                              [TTTTCTTCAAATATACGCGTTTTAACGTCGCCAAAATTTAAACAAACAGTTACTATTCAACGTGTTCAATCTGATCATATATGTAAACCAAATATGGATGTAGTCAGTATTGCAGATAGTATAAATAGTATTAATAATAATGATAAACTTCCTGCTATTCCTTATAATAACCATAGTTCTATCGATTCACAAAATAACGATATCAATGACAATATTCCTACTACTACTACTACTATTACAATTACTAGTAGTGAAGTAACAGCACGTAATGAATCACCGTCTGTGTTATTGTCGTCCACTGAATCATTTCGTAATTTGGATCACTTACATAAGACCAACTTGGAAATACATTATCATGGTAAATGAAATACCAATCTTTTCAGTTGAAAGGAAGCGGCAAGTGTCTACCTCATATAAATGAATTCAAAAGAC-TCATCAGTATCCATATTATCTCAATAGATAATTATAATAATAATCATAATTCAATCAGTATGCATTGTGTATGTCTTCTACTTTTTTTTATTTATCAGCAGTTCGATATGTATAAATCCCTCCCTCAGTGTCCATAATAATAGTAATAATACTAATAATGATAATTTTAACCCTTCTTTCCATT-GGAAGCTTAAACTTGT--GCTATGCGAATTTTCTTTACAC-CAACTGTTATCACTGGATTTATACACATTTTTAATATCACTATTTATATTCCTTATTGCTTAGTATAGATACCATTTTCAGAATAGAACGTATTCTATCCCTTATTATAAGCAATGCACTACAATTATAAACTAGCGTTGATAAATAGGAGGTAGAAATCATTACTGTTTCCGNCATTATATTTTATCTTTTCTCTAAAAAAGAAAATTGATTGTTACATCAGTGTTGTTTTTTGTTGTTTCTTATGGAAAAAAAATGAAATACAATGCAGTA]

[+] EMBL CD078930             [TTTTCTTCAAATATACGCGTTTTAACGTCGCCAAAATTTAAACAAACAGTTACTATTCAACGTGTTCAATCTGATCATATATGTAAACCAAATATGGATGTAGTCAGTATTGCAGATAGTATAAATAGTATTAATAATAATGATAAACTTCCTGCTATTCCTTATAATAACCATAGTTCTATCGATTCACAAAATAACGATATCAATGACAATATTCCTACTACTACTACTACTATTACAATTACTAGTAGTGAAGTAACAGCACGTAATGAATCACCGTCTGTGTTATTGTCGTCCACTGAATCATTTCGTAATTTGGATCACTTACATAAGACCAACTTGGAAATACATTATCATGGTAAATGAAATACCAATCTTTTCAGTTGAAAGGAAGCGGCAAGTGTCTACCTCATATAAATGAATTCAAAAGAC TCATCAGTATCCATATTATCTCAATAGATAATTATAATAATAATCATAATTCAATCAGTATGCATTGGGTATGTCTTCTACTTTTTTTTATTTATCAGCAGTTCGATATGTATAAATCCCTCCCTCAGTGTCCATAATAATAGTAATAATACTAATAATGATAATTTTAACCCTTCTTTNCATT GNAAGCTTAn                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD062225             [                                                                                                                                                                                                                                                                                          GTGTTATTGTCGTCCACTGAATCATTTCGTAATTTGGATCACTTACATAAGACCAACTTGGAAATACATTATCATGGTAAATGAAATACCAATCTTTTCAGTTGAAAGGAAGCGGCAAGTGTCTACCTCATATAAATGAATTCAAAAGAC TCATCAGTATCCATATTATCTCAATAGATAATTATAATAATAATCATAATTCAATCAGTATGCATTGTGTATGTCTTCTACTTTTTTTTATTTATCAGCAGTTCGATATGTATAAATCCCTCCCTCAGTGTCCATAATAATAGTAATAATACTAATAATGATAATTTTAACCCTTCTTTCCATT GGAAGCTTAAACTTGT  GCTATGCGAATTTTCTTTACAC CAACTGTTATCACTGGATTTATACACATTTTTAATATCACTATTTATATTCCTTATTGCTTAGTATAGATACCATTTTCAGAATAGAACGTATTCTATCCCTTATTATAAGCAATGCACTACAATTATAAACTAGCGTTGATAAATAGGAGGTAGAAATCATTACTGTTTCCGNCATTATATTTTATCTTTTCTCTAAAA                                                                         ]
[-] EMBL CD073386             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TCGTAATTTGGATCACTTACATAAGACCAACTTGGAAATACATTATCATGGTAAATGAAATACCAATCTTTTCAGTTGAAAGGAAGCGGCAAGTGTCTACCTCATATAAATGAATTCAAAAGAC TCATCAGTATCCATATTATCTCAATAGATAATTATAATAATAATCATAATTCAATCAGTATGCATTGTGTATGTCTTCTACTTTTTTTTATTTATCAGCAGTTCGATATGTATAAATCCCTCCCTCAGTGTCCATAATAATAGTAATAATACTAATAATGATAATTTTAACCCTTCTTTCCATT GGAAGCTTAAACTTGT  GCTATGCGAATTTTCTTTACAC CAACTGTTATCACTGGATTTATACACATTTTTAATATCACTATTTATATTCCTTATTGCTTAGTATAGATACCATTTTCAGAATAGAACGTATTCTATCCCTTATTATAAGCAATGCACTACAATTATAAACTAGCGTTGATAAATAGGAGGTAGAAATCATTACTGTTTCCGTCATTATATTTTATCTTTTCTCTAAAAAAGAAAATTGATTGTTACATCAGTGTTGTTTTTTGTTGTTTCTTATGGAAAAAAAATGAAATACAATGCAGTA]
[+] EMBL AI618788             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TTCAAAAGACGTCATCAGTATCCATATTATCTCAATAGATAATTATAATAATAATCATAATTCAATCAGTATGCATTGTGTATGTCTTCTACTTTTTTTTATTTATCAGCAGTTCAATATGTATAAATCCCTTCCTCAGTGTCCATAATAATAGTAATAATACTAATAATGATAATTTTAACCCTTCTTTCAATTGGGAAGCTTAAACTTGTGCGCTATACGAATTTTCTTTACACACACGTGTTACCGCGGGTTTTACACACAT                                                                                                                                                                                                                                                     ]


>consensus_7073#0 TTTTCTTCAAATATACGCGTTTTAACGTCGCCAAAATTTAAACAAACAGTTACTATTCAA CGTGTTCAATCTGATCATATATGTAAACCAAATATGGATGTAGTCAGTATTGCAGATAGT ATAAATAGTATTAATAATAATGATAAACTTCCTGCTATTCCTTATAATAACCATAGTTCT ATCGATTCACAAAATAACGATATCAATGACAATATTCCTACTACTACTACTACTATTACA ATTACTAGTAGTGAAGTAACAGCACGTAATGAATCACCGTCTGTGTTATTGTCGTCCACT GAATCATTTCGTAATTTGGATCACTTACATAAGACCAACTTGGAAATACATTATCATGGT AAATGAAATACCAATCTTTTCAGTTGAAAGGAAGCGGCAAGTGTCTACCTCATATAAATG AATTCAAAAGACTCATCAGTATCCATATTATCTCAATAGATAATTATAATAATAATCATA ATTCAATCAGTATGCATTGTGTATGTCTTCTACTTTTTTTTATTTATCAGCAGTTCGATA TGTATAAATCCCTCCCTCAGTGTCCATAATAATAGTAATAATACTAATAATGATAATTTT AACCCTTCTTTCCATTGGAAGCTTAAACTTGTGCTATGCGAATTTTCTTTACACCAACTG TTATCACTGGATTTATACACATTTTTAATATCACTATTTATATTCCTTATTGCTTAGTAT AGATACCATTTTCAGAATAGAACGTATTCTATCCCTTATTATAAGCAATGCACTACAATT ATAAACTAGCGTTGATAAATAGGAGGTAGAAATCATTACTGTTTCCGNCATTATATTTTA TCTTTTCTCTAAAAAAGAAAATTGATTGTTACATCAGTGTTGTTTTTTGTTGTTTCTTAT GGAAAAAAAATGAAATACAATGCAGTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)