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Schistosoma mansoni
cluster # 7086 cluster # 7086       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7086#0 length = 671 sequences # 4  

consensusID : consensus_7086#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 671
fasta sequence
                              [CCGCATCATGTTAAAAGTATGGGTTGGTCGATTTTTATGGTAAAATAATAAATAGGTCAAGTTGTCTAGAGTTTCCTCGTTATCAAGAAAGTACAATTGGCTATTGGCAGTATAAATATATCCAAGACTAAAGAAATCAAAGCCATAGAGTTAATATTTTCTTCAGATCCACACTATATAAATGCACATCTTATTTCTCAGACTTTGTAACTGATAACTCAGCCCCCTATTTCTGGTGGTATAACTTGAGCACATTTTAGCAATCTTGTAGATTTTCTCACTTTTGAAGCTAAACCTTCCTGCTGTACAGTATTGTTTTAATTATTATTCATTCATACTGTAGTTAGCCTCTAGGTCGTAAAACTGATTTCCATTTGTAATTTCTTCATTCTGGCGTTTGATAAGAGAATTATGCTTTTCTGTAACCCTCTGATCATGTAATTCTCGAAGTCAACTCAGTTGCATCTGACTAGTCTCTGTACTTTTGAAAAAGTAGTAGTATTTGACTAGATTTTATAGTTCTATTTTTCAATGGAATAGAAGTTAAAAAAGTGTTCGCATCAACATACCAAACCTTAGTTTTGATTAAGATACTGGGATGGTGCTCAGAGTTATGANACAATTAGACTTTATATACATAGTTCCTTTTATTATCATATAAAGAGATCTCT]

[+] EMBL AI067889             [CCGCATCATGTTAAAAGTATGGGTTGGTCGATTTTTATGGTAAAATAATAAATAGGTCAAGTTGTCTAGAGTTTCCTCGTTATCAAGAAAGTACAATTGGCTATTGGCAGTATAAATATATCCAAGACTAAAGAAATCAAAGCCATAGAGTTAATATTTTCTTCAGATCCACACTATATAAATGCACATCTTATTTCTCAGACTTTGTAACTGATAACTCAGCCCCCTATTTCTGGTGGTATAACTTGAGCACATTTTAGCAATCTTGTAGATTTTCTCACTTTTGAAGCTAAACCTTCCTGCTGTACAGTATTGTTTTAATTATTATTCATTCATACTGTAGTTAGCCTCTAGGTCGTAAAACTGATTTCCATTTGTAATTTCTTCATTCTGGCGTTTGATAAGAGAATTATGCTTTTCTGTAACCCTCTGATCATGTAATTCTCGAAGTCAACTCAGTTGCATCTGACTAGTCTCTGTACTTTTGAAAAAGTAGTAGTATTTGACTAGATTTTATAGTTCTATTTTTCAATGGAATAGAAGTTAAAAAAGTGTTCGCATCAACATACCAAACCTTAGTTTTGATTAAGATACTGGGATGGTGCTCAGAGTTATGANACAATTAGACTTTATATACATAGTTCCTTTTATTATCATATAAAGAGATCTCT]
[+] EMBL AI068016             [CCGCATCATGTTAAAAGTATGGGTTGGTCGATTTTTATGGTAAAATAATAAATAGGTCAAGTTGTCTAGAGTTTCCTCGTTATCAAGAAAGTACAATTGGCTATTGGCAGTATAAATATATCCAAGACTAAAGAAATCAAAGCCATAGAGTTAATATTTTCTTCAGATCCACACTATATAAATGCACATCTTATTTCTCAGACTTTGTAACTGATAACTCAGCCCCCTATTTCTGGTGGTATAACTTGAGCACATTTTAGCAATCTTGTAGATTTTCTCACTTTTGAAGCTAAACCTTCCTGCTGTACAGTATTGTTTTAATTATTATTCATTCATACTGTAGTTAGCCTCTAGGTCGTAAAACTGATTTCCATTTGTAATTTCTTCATTCTGGTGTTTGATAATAGAATTATGCTTTTCTGTAACCCTCTGATCATGTAATTCTCGAAGTCAACTCAGTTG                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL AI067642             [CCGCATCATGTTAAAAGTATGGGTTGGTCGATTTTTATGGTAAAATAATAAATAGGTCAAGTTGTCTAGAGTTTCCTCGTTATCAAGAAAGTACAATTGGCTATTGGCAGTATAAATATATCCAAGACTAAAGAAATCAAAGCCATAGAGTTAATATTTTCTTCAGATCCACACTATATAAATGCACATCTTATTTCTCAGACTTTGTAACTGATAACTCAGCCCCCTATTTCTGGTGGTATAACTTGAGCACATTTTAGCAATCTTGTAGATTTTCTCACTTTTGAAGCTAAACCTTCCTGCTGTACAGTATTGTTTTAATTATTATTCATTCATACTGTAGTTAGCCTCTAGGTCGTAAAACTGATTTCCATTTGTAATTTCTTCATTCTGGCGTTTG                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL AI068121             [      CATGTTAAAAGTATGGGTTGGTCGATTTTTATGGTAAAATAATAAATAGGTCAAGTTGTCTAGAGTTTCCTCGTTATCAAGAAAGTACAATTGGCTATTGGCAGTATAAATATATCCAAGACTAAAGAAATCAAAGCCATAGAGTTAATATTTTCTTCAGATCCACACTATATAAATGCACATCTTATTTCTCAGACTTTGTAACTGATAACTCAGCCCCCTATTTCTGGTGGTATAACTTGAGCACATTTTAGCAATCTTGTAGATTTTCTCACTTTTGAAGCTAAACCTTCCTGCTGTACAGTATTGTTTTAATTATTATTCATTCATACTGTAGTTAGCCTCTAGGTCGTAAAACTGATTTCCATTTGTAATTTCTTCATTCTGGCGTTTGATAAGAGAATTATGCTTTTCTGTAACCCTCTGAT                                                                                                                                                                                                                                             ]


>consensus_7086#0 CCGCATCATGTTAAAAGTATGGGTTGGTCGATTTTTATGGTAAAATAATAAATAGGTCAA GTTGTCTAGAGTTTCCTCGTTATCAAGAAAGTACAATTGGCTATTGGCAGTATAAATATA TCCAAGACTAAAGAAATCAAAGCCATAGAGTTAATATTTTCTTCAGATCCACACTATATA AATGCACATCTTATTTCTCAGACTTTGTAACTGATAACTCAGCCCCCTATTTCTGGTGGT ATAACTTGAGCACATTTTAGCAATCTTGTAGATTTTCTCACTTTTGAAGCTAAACCTTCC TGCTGTACAGTATTGTTTTAATTATTATTCATTCATACTGTAGTTAGCCTCTAGGTCGTA AAACTGATTTCCATTTGTAATTTCTTCATTCTGGCGTTTGATAAGAGAATTATGCTTTTC TGTAACCCTCTGATCATGTAATTCTCGAAGTCAACTCAGTTGCATCTGACTAGTCTCTGT ACTTTTGAAAAAGTAGTAGTATTTGACTAGATTTTATAGTTCTATTTTTCAATGGAATAG AAGTTAAAAAAGTGTTCGCATCAACATACCAAACCTTAGTTTTGATTAAGATACTGGGAT GGTGCTCAGAGTTATGANACAATTAGACTTTATATACATAGTTCCTTTTATTATCATATA AAGAGATCTCT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)