cluster # 7111

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Schistosoma mansoni
cluster # 7111 cluster # 7111 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_7111#0 length = 623 sequences # 4

consensusID : consensus_7111#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 623
fasta sequence

                              [CAATATACTTTAAACGTACTAACTATGACCTCTCACTAGGATGTCGAATATTTTTAGGAAGCTAGTGGCTGTTAAGCAAACGATTTTCACTAAAGTAATAAATTTTTAACGCGAAGCTATATACTGTTGAAGAGTCCCTTACTAACTTGAAACATCTCCTCATCCCTCTTTTCCCACTACTGTATAACCGAAGTCACTCCTGCGAGGGAATAGTTAAAGTAGACTTTCTTGTCATTAATTTTGTCACTGTCTGCATTTTTATGCAATTTTTACAATTTGTAAAATTACCATTATTGCCCGTAAAATTGTTGTTTGACCGTCCATTCCGGTTTATGGTCGCACATAGCATAACCGAGTGATTATCGCTCACAAATACTCTGCTGCACACATGGGCTATTTCAGTTTCTGGGCAGAAGAATCTATTCATTCTTTTCAACTACATTTTGACCTTATCACTTATTAACCCTGACTGTTTTTATATGATCGTATAAGTGTTGACTGTTTA-TCCTATTCATTCTATGTCTGTAATTTATTTTCGGTCTGACTATAAATATTAAGTACCGCTTAATTAAAAGAAGTTAACTCACTTGCCTTCT-CTGATCCGTTTAACTTCTCTCTCTCCT]

[+] EMBL CD111565             [CAATATACTTTAAACGTACTAACTATGACCTCTCACTAGGATGTCGAATATTTTTAGGAAGCTAGTGGCTGTTAAGCAAACGATTTTCACTAAAGTAATAAATTTTTAACGCGAAGCTATATACTGTTGAAGAGTCCCTTACTAACTTGAAACATCTCCTCATCCCTCTTTTCCCACTACTGTATAACCGAAGTCACTCCTGCGAGGGAATAGTTAAAGTAGACTTTCTTGTCATTAATTTTGTCACTGTCTGCATTTTTATGCAATTTTTACAATATGTAAAATTACCATTATTGCCCGTAAAATTGTTGTTTGACCGTCCATTCCGGTTTATGGTCGCACATAGCATAACCGAGTGATTATCGCTCACAAATACTCTGCTGCACACATGGGCTATTTCAGTTTCTGGGCAGAAGAATCCATTCATTCTTTTCAACTACATTTTGACCTTAT                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD111300             [CAATATACTTTAAACATACTAACTATGACCTCTCACTAGGATGTCGAATATTTTTAGGAAGCTAGTGGCTGTTAAGCAAACGATTTTCACTAAAGTAATAAATTTTTAACGCGAAATTATATACTGTTGAAGAGTCCCTTACTAACTTGAAACATCTCCTCATCCCTCTTTTCCCACTACTGTATAACCGAAGTCACTCCTGCGAGGGAATAGTTAAAGTAGACTTTCTTGTCATTAATTTTGTCACTGTCTGCATTTTTATGCAATTTTTACAATTTGTAAAATTACCATTATTGCCCGTAAAATTGTTGTTTGACCGTCCATTCCGGTTTATGGTCGCACATAGCATAACCGAGTGATTATCGCTCACAAATACT                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD110905             [                                                                                                                                                                                                                        AAGTAGACTTTCTTGTCATTAATTTTGTCACTGTCTGCATTTTTATGCAATTTTTACGATTTGTAAAATTACCATTATTGCCCGTAAAATTGTTGTTTGACCGTCCATTCCGGTTTATGGTCGCACATAGCATAACCGAGTGATTATCGCTCACAAATACTCTGCTGCACACATGGGCTATTTCAGTTTCTGGGCAGAAGAATCTATTCATTCTTTTCAACTACATTTTGACCTTATCACTTATTAACCCTGACTGTTTTTATATGATCGTATAAGTGTTGACTGTTTA TCCTATTCATTCTATGTCTGTAATTTATTTTCGGTCTGACTATAAATATTAAGTACCGCTTAATTAAAAGAAGTTAACTCACTTGCCTTCT CTGATCCGTTTAACTTCTCTCTCTCCT]
[-] EMBL CD098453             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TCCGGTTTATGGTCGCACATAGCATAACCGAGTGATTATCGCTCACAAATACTCTGCTGCACACATGGGCTATTTCAGTTTCTGGGCAGAAGAATCTATTCATTCTTTTCAACTACATTTTGACCTTATCACTTATTAACCCTGACTGTTTTTATATGATCGTATAAGTGTTGACTGTTTAGTCCTATTCATTCTATGTTTGTAATTTATTTTCGGTCTGACTATAAATATTAAGTACCGCTTAATTAACAGAAGTTAACTCACTTGCCTTCTGCTGATCCGTTTAACTTCTCTCTCTCCT]




>consensus_7111#0
CAATATACTTTAAACGTACTAACTATGACCTCTCACTAGGATGTCGAATATTTTTAGGAA
GCTAGTGGCTGTTAAGCAAACGATTTTCACTAAAGTAATAAATTTTTAACGCGAAGCTAT
ATACTGTTGAAGAGTCCCTTACTAACTTGAAACATCTCCTCATCCCTCTTTTCCCACTAC
TGTATAACCGAAGTCACTCCTGCGAGGGAATAGTTAAAGTAGACTTTCTTGTCATTAATT
TTGTCACTGTCTGCATTTTTATGCAATTTTTACAATTTGTAAAATTACCATTATTGCCCG
TAAAATTGTTGTTTGACCGTCCATTCCGGTTTATGGTCGCACATAGCATAACCGAGTGAT
TATCGCTCACAAATACTCTGCTGCACACATGGGCTATTTCAGTTTCTGGGCAGAAGAATC
TATTCATTCTTTTCAACTACATTTTGACCTTATCACTTATTAACCCTGACTGTTTTTATA
TGATCGTATAAGTGTTGACTGTTTATCCTATTCATTCTATGTCTGTAATTTATTTTCGGT
CTGACTATAAATATTAAGTACCGCTTAATTAAAAGAAGTTAACTCACTTGCCTTCTCTGA
TCCGTTTAACTTCTCTCTCTCCT

clustalw multiple alignements is not computed in this case