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Schistosoma mansoni
cluster # 7131 cluster # 7131       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7131#0 length = 698 sequences # 4  

consensusID : consensus_7131#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 698
fasta sequence
                              [TCTTGAAGTATAAGCTCTGATTGAACAATTAATTCAAGTCGACATTTACGAACACGTACTCCATCGTATAAGAGTAATGTATACAGGCCAGGACGTGAATCACAAGGGCGTAATAAATAGCTAAATGGACCAGCTGTCAAAAGAAAATGTAATACATAAAGTTGCAATGTTTAGTCTTGATAAAATGATACTACATAATCAAGAAACAGAGATGTCACCTTCACAAAAGACTCAGAATAAAACTCTAGTGATATTCATCTGCCTGTCCAAACAAAATTAAATGGAATAAAGTTTGAACCAAAGTGAAAAACATTTAGAATTTTCTCCACTAACGAATATACCTATATGATAAATTAAGACTAGCAATTCTTATTTTACATTCCCTGTGCAAATAGTTCTTGTTTGAACAGGTCTAATAACTAAGCGTCGTTCTTAATTCTATCAACCAAATGTACTCATTCCTGGATGGTTAATTAATAACTTTGTATG-CTTGTGTATACCGGAATGTACGTATGGAGTACTGATATTGTGTAAAATCTATGGACATAAATAAACTGAGATTATTTAGCGATTTCGAGGACATATCAGCTTACTAGTTCATCGATTTACGCTCATT-GTCGATCTCCATATACCAATATATGAAATACACGTATCTGAACGACTTTTTCATACTTCGATGTTTACAATTCTGATGTTAT]

[+] EMBL BF936544             [TCTTGAAGTATAAGCTCTGATTGAACAATTAATTCAAGTCGACATTTACGAACACGTACTCCATCGTATAAGAGTAATGTATACAGGCCAGGACGTGAATCACAAGGGCGTAATAAATAGCTAAATGGACCAGCTGTCAAAAGAAAATGTAATACATAAAGTTGCAATGTTTAGTCTTGATAAAATGATACTACATAATCAAGAAACAGAGATGTCACCTTCACAAAAGACTCAGAATAAAACTCTAGTGATATTCATCTGCCTGTCCAAACAAAATTAAATGGAATAAAGTTTGAACCAAAGTGAAAAACATTTAGAATTTTCTCCACTAACGAATATACCTATATGATAAATTAAGACTAGCAATTCTTATTTTACATTCCCTGTGCAAATAGTTCTTGTTTGAACAGGTCTAATAACTAAGCGTCGTTCTTAATTCTATCAACCAAATGTACTCATTCCTGGATGGTTAATTAATAACTTTGTATGCCTTGTGTATACCGGAATGTACGTATGGAGTACTGATATTGTGTAAAATCTATGGACATAAATAAACTGAGATTATTTAGCGATTTCGAGGACATATCAGCTTACTAGTTCATCGATTTACGCTCATTGGTCGATCTCCATATACCAATATATGAAATACACGTATCTGAACGACTTTTTCATACTTCGATGTTTACAATTCTGATGTTAT]
[+] EMBL AI976251             [TCTTGAAGTATAAGCTCTGATTGAACAATTAATTCAAGTCGACATTTACGAACACGTACTCCATCGTATAAGAGTAATGTATACAGGCCAGGACGTGAATCACAAGGGCGTAATAAATAGCTAAATGGACCAGCTGTCAAAAGAAAATGTAATACATAAAGTTGCAATGTTTAGTCTTGATAAAATGATACTACATAATCAAGAAACAGAGATGTCACCTTCACAAAAGACTCAGAATAAAACTCTAGTGATATTCATCTGCCTGTCCAAACAAAATTAAATGGAATAAAGTTTGAACCAAAGTGAAAAACATTTAGAATTTTCTCCACTAACGAATATACCTATATGATAAATTAAGACTAGCAATTCTTATTTTACATTCCCTGTGCAAATAGTTCTTGTTTGAACAGGTCTAATAACTAAGCGTCGTTCTTAATTCTATCAACCAAATGTACTCATTCCTGGATGGTTAATTAATAACTTTGTATG CTTGTGTATACCGGAATGTACGTATGGAGTACTGATATTGTGTAAAATCTATGGACATAAATAAACTGAGATTATTTAGCGATTTCGAGGACATATCAGCTTACTAGTTCATCGATTTACGCTCATT GTCGATCTCCATATACCAATATATGAAATACACGTATCTGAACGACTntn                                ]
[+] EMBL AI975012             [TCTTGAAGTATAAGCTCTGATTGAACAATTAATTCAAGTCGACATTTACGAACACGTACTCCATCGTATAAGAGTAATGTATACAGGCCAGGACGTGAATCACAAGGGCGTAATAAATAGCTAAATGGACCAGCTGTCAAAAGAAAATGTAATACATAAAGTTGCAATGTTTAGTCTTGATAAAATGATACTACATAATCAAGAAACAGAGATGTCACCTTCACAAAAGACTCAGAATAAAACTCTAGTGATATTCATCTGCCTGTCCAAACAAAATTAAATGGAATAAAGTTTGAACCAAAGTGAAAAACATTTAGAATTTTCTCCACTAACGAATATACCTATATGATAAATTAAGACTAGCAATTCTTATTTTACATTCCCTGTGCAAATAGTTCTTGTTTGAACAGGTCTAATAACTAAGCGTCGTTCTTAATTCTATCAACCAAATGTACTCATTCCTGGATGGTTAATTAATAACTTTGTATG CTTGTGTATACCGGAATGTACGTATGGAGTACTGATATTGTGTAAAATCTATGGACATAAATAAACTGAGATTATTTAGCGATTTCGAGGACATATCAGCTTACTAGTTCATCGATTT                                                                                            ]
[-] EMBL CD123331             [                                                                                                                                                                                                                                         AGAATAAAACTCTAGTGATATTCATCTGCCTGTCCAAACAAAATTAAATGGAATAAAGTTTGAACCAAAGTGAAAAACATTTAGAATTTTCTCCACTAACGAATATACCTATATGATAAATTAAGACTAGCAATTCTTATTTTACATTCCCTGTGCAAATAGTTCTTGTTTGAACAGGTCTAATAACTAAGCGTCGTTCTTAATTCTATCAACCAAATGTACTCATTCCTGGATGGTTAATTAATAACTTTGTATG CTTGTGTATACCGGAATGTACGTATGGAGTACTGATATTGTGTAAAATCTATGGACATAAATAAACTGAGATTATTTAGCGATTTCGAGGACATATCAGCTTACTAGTTCATCGATTTACGCTCATT GTCGATCTCCATATACCAATATATGAAATACACGTATCTGAACGACTTTTTCAT                            ]


>consensus_7131#0 TCTTGAAGTATAAGCTCTGATTGAACAATTAATTCAAGTCGACATTTACGAACACGTACT CCATCGTATAAGAGTAATGTATACAGGCCAGGACGTGAATCACAAGGGCGTAATAAATAG CTAAATGGACCAGCTGTCAAAAGAAAATGTAATACATAAAGTTGCAATGTTTAGTCTTGA TAAAATGATACTACATAATCAAGAAACAGAGATGTCACCTTCACAAAAGACTCAGAATAA AACTCTAGTGATATTCATCTGCCTGTCCAAACAAAATTAAATGGAATAAAGTTTGAACCA AAGTGAAAAACATTTAGAATTTTCTCCACTAACGAATATACCTATATGATAAATTAAGAC TAGCAATTCTTATTTTACATTCCCTGTGCAAATAGTTCTTGTTTGAACAGGTCTAATAAC TAAGCGTCGTTCTTAATTCTATCAACCAAATGTACTCATTCCTGGATGGTTAATTAATAA CTTTGTATGCTTGTGTATACCGGAATGTACGTATGGAGTACTGATATTGTGTAAAATCTA TGGACATAAATAAACTGAGATTATTTAGCGATTTCGAGGACATATCAGCTTACTAGTTCA TCGATTTACGCTCATTGTCGATCTCCATATACCAATATATGAAATACACGTATCTGAACG ACTTTTTCATACTTCGATGTTTACAATTCTGATGTTAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)