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Schistosoma mansoni
cluster # 7146 cluster # 7146       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7146#0 length = 726 sequences # 4  

consensusID : consensus_7146#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 726
fasta sequence
                              [TTATCAAACGCCTTCTCATAGTCAAAGAAGCTGATGTATTGTAAATAATTCCATTCCGATTTGGTTTCTGCAAGACCAATCCTTACGAAATCCGGTTTGTTGATTTCGAAGTTGGGCGTCCACTGAATCTTTCATCCGATTCAACAACACTCTGTCGAAAACTTCTGGTGCTGACAGTAGTATGATGTCTCTGTAGTCCTCACACTTGCTCATATCTTTCATTGTTATCTTGATGAGGTAAGGTACCATCTTAAAAGCTTTAAAAATGTGCTATATAGACAAGTAGATGAATTTTTCACAAATCTTGAAGGTCTCGATTCTGATTGGTTCGTCTCTCTAGTGTACTTTTACCATTTATTTTAATTTTAACCAATAATCCGGTGAAAGGATCGGAGAATAGATATGAACCAGATTGAAGATTTCAGACGAGTTTTAGATTTTTTGCGCTGACAATCATAAATGATGCAGAATGAGCAGTAGGTATCTCTACACAGCTTTCAGAATGTTTAAAATGAAGGCGAAAAATTACTTTCAGGCATCATAGATTTAAGATGATGAAGTTTGTTCAATTCTTTCTCTGTATATTTTACATAAAAGGATAGCCAACATTCTTTAAATCCTAAGATTTAATCCTGAGACAGACCATGTGTTAAAACGGAACTAATATTTCAGAGGTTGGGACAATTTTTCTGGATTATCATTAATTGTAATTTTGTTGTGTAGTTA]

[+] EMBL CD123465             [TTATCAAACGCCTTCTCATAGTCAAAGAAGCTGATGTATTGTAAATAATTCCATTCCGATTTGGTTTCTGCAAGACCAATCCTTACGAAATCCGGTTTGTTGATTTCGAAGTTGGGCGTCCACTGAATCTTTCATCCGATTCAACAACACTCTGTCGAAAACTTCTGGTGCTGACAGTAGTATGATGTCTCTGTAGTCCTCACACTTGCTCATATCTTTCATTGTTATCTTGATGAGGT AGGTACCATCTTAAAAGCTTTAAAAATGTGCTATATAGACAAGTAGATGAATTTTTCACAAATCTTGAAGGTCTCGATTCTGATTGGTTCGTCTCTCTAGTGTACTTTTACCATTTATTTTAATTTTAACCAATAATCCGGTGAAAGGATCGGAGAATAGATATGAACCAGATTGAAGATTTCAGACGAGTTTTAGATTTTTTGCGCTGACAATCATAAATGATGCAGAATGAGCAGTAGGTATCTCTACACAGCTTTCAGAATGTTTAAAATGAAGGCGAAAAATTACTTTCAGGCATCATAGATTTAAGATGATGAAGTTTGNTCAATTCTTTCTCTGTATATTTTACATAAAAGGATAGCCAACATTCTTTAAATCCTAAGATTTA                                                                                                 ]
[-] EMBL CD123484             [                                                                                                    TGATTTCGAAGTTGGGCGTCCACTGAATCTTTCATCCGATTCAACAACACTCTGTCGAAAACTTCTGGTGCTGACAGTAGTATGATGTCTCTGTAGTCCTCACACTTGCTCATATCTTTCATTGTTATCTTGATGAGGTAAGGTACCATCTTAAAAGCTTTAAAAATGTGCTATATAGACAAGTAGATGAATTTTTCACAAATCTTGAAGGTCTCGATTCTGATTGGTTCGTCTCTCTAGTGTACTTTTACCATTTATTTTAATTTTAACCAATAATCCGGTGAAAGGATCGGAGAATAGATATGAACCAGATTGAAGATTTCAGACGAGTTTTAGATTTTTTGCGCTGACAATCATAAATGATGCAGAATGAGCAGTAGGTATCTCTACACAGCTTTCAGAATGTTTAAAATGAAGGCGAAAAATTACTTTCAGGCATCATAGATTTAAGATGATGAAGTTTGTTCAATTCTTTCTCTGTATATTTTACATAAAAGGATAGCCAACATTCTTTAAATCCTAAGATTTAATCCTGAGACAGACCATGTGTTAAAACGGAACTAATATTTCAGAGGTTGGGACAATTTTTCTGGATTATCATTAATTGTAATTTTGTTGTGTAGTTA]
[-] EMBL CD123515             [                                                                                                                                              AACAACACTCTGTCGANAACTTCTGGTGCTGACAGTAGTATGATGTCTCTGTAGTCCTCACACTTGCTCATATCTTTCATTGTTACCTTGATGAGGTAAGGTACCATCCTAAAAGCTTTAAAAATGTGCTATATAGACAAGTAGATGAATTTTTCACAAATCTTGAAGGTCTCGATTCTGATTGGTTCGTCTCTCTAGTGTACTTTTACCATTTATTTTAATTTTAACCAATAATCCGGTGAAAGGATCGGAGAATAGATATGAACCAGATTGAAGATTTCAGACGAGTTTTGGATTTTTTGCGCTGACAATCATAAATGATGCAGAATGAGCAGTAGGTATCTCTACACAGCTTTCAGAATGTTTAAAATGAAGGCGAAAAATTACTTTCAGGCATCACAGATTTAAGATGATGAAGTTTGTTCAATTCTTTCTCTGTATATTTTACATAAAAGGATAGCCAACATTCTTTAAATCCTAAGATTTAATCCTGAGACAGACCATGTGTTAAAACGGAACTAATATTTCAGAGGTTGGGACAATTTTTCTGGATTATCATTAATTGTAATTTTGTTGTGTAGTTA]
[-] EMBL CD123499             [                                                                                                                                                                             ACAGTAGTATGATGTCTCTGTAGTCCTCACACTTGCTCATATCTTTCATTGTTATCTTGATGAGGTAAGGTACCATCTTAAAAGCTTTAAAAATGTGCTATATAGACAAGTAGATGAATTTTTCACAAATCTTGAAGGTCTCGATTCTGATTGGTTCGTCTCTCTAGTGTACTTTTACCATTTATTTTAATTTTAACCAATAATCCGGTGAAAGGATCGGAGAATAGATATGAACCAGATTGAAGATTTCAGACGAGTTTTAGATTTTTTGCGCTGACAATCATAAATGATGCAGAATGAGCAGTAGGTATCTCTACACAGCTTTCAGAATGTTTAAAATGAAGGCGAAAAATTACTTTCAGGCATCATAGATTTAAGATGATGAAGTTTGTTCAATTCTTTCTCTGTATATTTTACATAAAAGGATAGCCAACATTCTTTAAATCCTAAGATTTAATCCTGAGACAGACCATGTGTTAAAACGGAACTAATATTTCAGAGGTCGGGACAATTTTTCTGGATTATCATTAATTGTAATTTTGTTGTGTAGTTA]


>consensus_7146#0 TTATCAAACGCCTTCTCATAGTCAAAGAAGCTGATGTATTGTAAATAATTCCATTCCGAT TTGGTTTCTGCAAGACCAATCCTTACGAAATCCGGTTTGTTGATTTCGAAGTTGGGCGTC CACTGAATCTTTCATCCGATTCAACAACACTCTGTCGAAAACTTCTGGTGCTGACAGTAG TATGATGTCTCTGTAGTCCTCACACTTGCTCATATCTTTCATTGTTATCTTGATGAGGTA AGGTACCATCTTAAAAGCTTTAAAAATGTGCTATATAGACAAGTAGATGAATTTTTCACA AATCTTGAAGGTCTCGATTCTGATTGGTTCGTCTCTCTAGTGTACTTTTACCATTTATTT TAATTTTAACCAATAATCCGGTGAAAGGATCGGAGAATAGATATGAACCAGATTGAAGAT TTCAGACGAGTTTTAGATTTTTTGCGCTGACAATCATAAATGATGCAGAATGAGCAGTAG GTATCTCTACACAGCTTTCAGAATGTTTAAAATGAAGGCGAAAAATTACTTTCAGGCATC ATAGATTTAAGATGATGAAGTTTGTTCAATTCTTTCTCTGTATATTTTACATAAAAGGAT AGCCAACATTCTTTAAATCCTAAGATTTAATCCTGAGACAGACCATGTGTTAAAACGGAA CTAATATTTCAGAGGTTGGGACAATTTTTCTGGATTATCATTAATTGTAATTTTGTTGTG TAGTTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)