These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7146#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 726 fasta sequence [TTATCAAACGCCTTCTCATAGTCAAAGAAGCTGATGTATTGTAAATAATTCCATTCCGATTTGGTTTCTGCAAGACCAATCCTTACGAAATCCGGTTTGTTGATTTCGAAGTTGGGCGTCCACTGAATCTTTCATCCGATTCAACAACACTCTGTCGAAAACTTCTGGTGCTGACAGTAGTATGATGTCTCTGTAGTCCTCACACTTGCTCATATCTTTCATTGTTATCTTGATGAGGTAAGGTACCATCTTAAAAGCTTTAAAAATGTGCTATATAGACAAGTAGATGAATTTTTCACAAATCTTGAAGGTCTCGATTCTGATTGGTTCGTCTCTCTAGTGTACTTTTACCATTTATTTTAATTTTAACCAATAATCCGGTGAAAGGATCGGAGAATAGATATGAACCAGATTGAAGATTTCAGACGAGTTTTAGATTTTTTGCGCTGACAATCATAAATGATGCAGAATGAGCAGTAGGTATCTCTACACAGCTTTCAGAATGTTTAAAATGAAGGCGAAAAATTACTTTCAGGCATCATAGATTTAAGATGATGAAGTTTGTTCAATTCTTTCTCTGTATATTTTACATAAAAGGATAGCCAACATTCTTTAAATCCTAAGATTTAATCCTGAGACAGACCATGTGTTAAAACGGAACTAATATTTCAGAGGTTGGGACAATTTTTCTGGATTATCATTAATTGTAATTTTGTTGTGTAGTTA] [+] EMBL CD123465 [TTATCAAACGCCTTCTCATAGTCAAAGAAGCTGATGTATTGTAAATAATTCCATTCCGATTTGGTTTCTGCAAGACCAATCCTTACGAAATCCGGTTTGTTGATTTCGAAGTTGGGCGTCCACTGAATCTTTCATCCGATTCAACAACACTCTGTCGAAAACTTCTGGTGCTGACAGTAGTATGATGTCTCTGTAGTCCTCACACTTGCTCATATCTTTCATTGTTATCTTGATGAGGT AGGTACCATCTTAAAAGCTTTAAAAATGTGCTATATAGACAAGTAGATGAATTTTTCACAAATCTTGAAGGTCTCGATTCTGATTGGTTCGTCTCTCTAGTGTACTTTTACCATTTATTTTAATTTTAACCAATAATCCGGTGAAAGGATCGGAGAATAGATATGAACCAGATTGAAGATTTCAGACGAGTTTTAGATTTTTTGCGCTGACAATCATAAATGATGCAGAATGAGCAGTAGGTATCTCTACACAGCTTTCAGAATGTTTAAAATGAAGGCGAAAAATTACTTTCAGGCATCATAGATTTAAGATGATGAAGTTTGNTCAATTCTTTCTCTGTATATTTTACATAAAAGGATAGCCAACATTCTTTAAATCCTAAGATTTA ] [-] EMBL CD123484 [ TGATTTCGAAGTTGGGCGTCCACTGAATCTTTCATCCGATTCAACAACACTCTGTCGAAAACTTCTGGTGCTGACAGTAGTATGATGTCTCTGTAGTCCTCACACTTGCTCATATCTTTCATTGTTATCTTGATGAGGTAAGGTACCATCTTAAAAGCTTTAAAAATGTGCTATATAGACAAGTAGATGAATTTTTCACAAATCTTGAAGGTCTCGATTCTGATTGGTTCGTCTCTCTAGTGTACTTTTACCATTTATTTTAATTTTAACCAATAATCCGGTGAAAGGATCGGAGAATAGATATGAACCAGATTGAAGATTTCAGACGAGTTTTAGATTTTTTGCGCTGACAATCATAAATGATGCAGAATGAGCAGTAGGTATCTCTACACAGCTTTCAGAATGTTTAAAATGAAGGCGAAAAATTACTTTCAGGCATCATAGATTTAAGATGATGAAGTTTGTTCAATTCTTTCTCTGTATATTTTACATAAAAGGATAGCCAACATTCTTTAAATCCTAAGATTTAATCCTGAGACAGACCATGTGTTAAAACGGAACTAATATTTCAGAGGTTGGGACAATTTTTCTGGATTATCATTAATTGTAATTTTGTTGTGTAGTTA] [-] EMBL CD123515 [ AACAACACTCTGTCGANAACTTCTGGTGCTGACAGTAGTATGATGTCTCTGTAGTCCTCACACTTGCTCATATCTTTCATTGTTACCTTGATGAGGTAAGGTACCATCCTAAAAGCTTTAAAAATGTGCTATATAGACAAGTAGATGAATTTTTCACAAATCTTGAAGGTCTCGATTCTGATTGGTTCGTCTCTCTAGTGTACTTTTACCATTTATTTTAATTTTAACCAATAATCCGGTGAAAGGATCGGAGAATAGATATGAACCAGATTGAAGATTTCAGACGAGTTTTGGATTTTTTGCGCTGACAATCATAAATGATGCAGAATGAGCAGTAGGTATCTCTACACAGCTTTCAGAATGTTTAAAATGAAGGCGAAAAATTACTTTCAGGCATCACAGATTTAAGATGATGAAGTTTGTTCAATTCTTTCTCTGTATATTTTACATAAAAGGATAGCCAACATTCTTTAAATCCTAAGATTTAATCCTGAGACAGACCATGTGTTAAAACGGAACTAATATTTCAGAGGTTGGGACAATTTTTCTGGATTATCATTAATTGTAATTTTGTTGTGTAGTTA] [-] EMBL CD123499 [ ACAGTAGTATGATGTCTCTGTAGTCCTCACACTTGCTCATATCTTTCATTGTTATCTTGATGAGGTAAGGTACCATCTTAAAAGCTTTAAAAATGTGCTATATAGACAAGTAGATGAATTTTTCACAAATCTTGAAGGTCTCGATTCTGATTGGTTCGTCTCTCTAGTGTACTTTTACCATTTATTTTAATTTTAACCAATAATCCGGTGAAAGGATCGGAGAATAGATATGAACCAGATTGAAGATTTCAGACGAGTTTTAGATTTTTTGCGCTGACAATCATAAATGATGCAGAATGAGCAGTAGGTATCTCTACACAGCTTTCAGAATGTTTAAAATGAAGGCGAAAAATTACTTTCAGGCATCATAGATTTAAGATGATGAAGTTTGTTCAATTCTTTCTCTGTATATTTTACATAAAAGGATAGCCAACATTCTTTAAATCCTAAGATTTAATCCTGAGACAGACCATGTGTTAAAACGGAACTAATATTTCAGAGGTCGGGACAATTTTTCTGGATTATCATTAATTGTAATTTTGTTGTGTAGTTA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||