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Schistosoma mansoni
cluster # 7171 cluster # 7171       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7171#0 length = 1012 sequences # 4  

consensusID : consensus_7171#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1012
fasta sequence
                              [TTTTCTTTAGCAAAAACAGGACTTCATTCTCATTATTGAAATGATTTAATTCCAGTGCCGTATCTTTTTTTATTTCATTCATTTCCATCAAAGTAACTAACGGAAAATATTGAAGGAAAAAGTTTGTCATAAGTAGTGTATTATTTTATTGAATTACTTTAGAGTAAGTTATGTTTTAGTATACAGGACGTATATACATGTATAAACCATTTGGATTGTTATGACAGTTCGGTTGATTCGCAAACACGCTGACACACAGATATTTGATTACAAAAATAATATCAATGGATGACTGATGAGAAATAAATGTCATTCTCAGATTTCAAGTTTCGCTTGACAGTTATTGATTATTAACGGGAAATTATTCACTAAGTTGTGTACGTCAGATTACATTATTACGTTACGTGTCAGTCAAAACAAAAGTTCTGTTGTCGTTAGTTTTTAAGACGTATTCGAACTCTTAGAAAAATACATTATTCATTTCAGATAGTTGAGGTTACATTGTTCCTCGACAAAATTAGAGATGATTTCAAGATGATGCATAACATAACCTAATGAACATATTGTACTCTGTAACCAATAGATTTTGACTTTAACTCATTATTGAATGCCCAATAAACTACTCACGATAAAGTCTGTTTCGATTTAGTTTGCTTCGTAATGAAGTGTATATTCTAAGTTGTTTAGGAATAGAAATTTGGATAAATAATTCATTATAGATTTTATCATATTTGCAAAATATCTTGTCAACAAAAACTCATACGCAAATAATCCTACTTTCATACCTTTAGCCTGCTTAGCTTGAATTATCCGATATAAACCATGAAAGCTGTGTTAAATCTTTGTTCAGTTTTCATCACTGTCATTTGAGTATTGTGTATGATATCATGATACCATCCTAAAGCTTTTATTATTTAATATTTCATATAAACAAATTAGGAATGATTACACTTTAAAACAAAGCAATACGAAAAGATTTGTATTTGCTTATTCTTGCTTTGTTCGAATTTAT]

[+] EMBL CD121685             [TTTTCTTTAGCAAAAACAGGACTTCATTCTCATTATTGAAATGATTTAATTCCAGTGCCGTATCTTTTTTTATTTCATTCATTTCCATCAAAGTAACTAACGGAAAATATTGAAGGAAAAAGTTTGTCATAAGTAGTGTATTATTTTATTGAATTACTTTAGAGTAAGTTATGTTTTAGTATACAGGACGTATATACATGTATAAACCATTTGGATTGTTATGACAGTTCGGTTGATTCGCAAACACGCTGACACACAGATATTTGATTACAAAAATAATATCAATGGATGACTGATGAGAAATAAATGTCATTCTCAGATTTCAAGTTTCGCTTGACAGTTATTGATTATTAACGGGAAATTATTCACTAAGTTGTGTACGTCAGATTACATTATTACGTTACGTGTCAGTCAAAACAAAAGTTCTGTTGTCGTTAGTTTTTAAGACGTATTCGAACTCTTAGAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD121687             [  TTCTTTAGCAAAAACAGGACTTCATTCTCATTATTGAAATGATTTAATTCCAGTGCCGTATCTTTTTTTATTTCATTCATTTCCATCAAAGTAACTAACGGAAAATATTGAAGGAAAAAGTTTGTCATAAGTAGTGTATTATTTTATTGAATTACTTTAGAGTAAGTTATGTTTTAGTATACAGGACGTATATACATGTATAAACCATTTGGATTGTTATGACAGTTCGGTTGATTCGCAAACACGCTGACACACAGATATTTGATTACAAAAATAATATCAATGGATGACTGATGAGAAATAAATGTCATTCTCAGATTTCAAGTTTCGCTTGACAGTTATTGATTATTAACGGGAAATTATTCACTAAGTTGTGTACGTCAGATTACATTATTACGTTACGTGTCAGTCAAAACAAAAGTTCTGTTGTCGTTAGTTTTTAAGACG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD121797             [                                                                                                                                                                                                                                                                     ATTTGATTACAAAAATAATATCAATGGATGACTGATGAGAAATAAATGTCATTCTCAGATTTCAAGTTTCGCTTGACAGTTATTGATTATTAACGGGAAATTATTCACTAAGTTGTGTACGTCAGATTACATTATTACGTTACGTGTCAGTCAAAACAAAAGTTCTGTTGTCGTTAGTTTTTAAGACGTATTCGAACTCTTAGAAAAATACATTATTCATTTCAGATAGTTGAGGTTACATTGTTCCTCGACAAAATTAGAGATGATTTCAAGATGATGCATAACATAACCTAATGAACATATTGTACTCTGTAACCAATAGATTTTGACTTTAACTCATTATTGAATGCCCAATAAACTACTCACGATAAAGTCTGTTTCGATTTAGTTTGCTTCGTAATGAAGTGTATATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD089441             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tttactGATGATGCATAACATAACCTAATGAATGTATTGTACTCTGTAACCAATAGATTTTGACTTTAACTCATTATTGAATGCCCAATAAACTACTCACGATAAAGTCTGTTTCGATTTAGTTTGCTTTGTAATGAAGTGTATATTCTAAGTTGTTTAGGAATAGAAATTTGGATAAATAATTCATTATAGATTTTATCATATTTGCAAAATATCTTGTCAACAAAAACTCATACGCAAATAATCCTACTTTCATACCTTTAGCCTGCTTAGCTTGAATTATCCGATATAAACCATGAAAGCTGTGTTAAATCTTTGTTCAGTTTTCATCACTGTCATTTGAGTATTGTGTATGATATCATGATACCATCCTAAAGCTTTTATTATTTAATATTTCATATAAACAAATTAGGAATGATTACACTTTAAAACAAAGCAATACGAAAAGATTTGTATTTGCTTATTCTTGCTTTGTTCGAATTTAT]


>consensus_7171#0 TTTTCTTTAGCAAAAACAGGACTTCATTCTCATTATTGAAATGATTTAATTCCAGTGCCG TATCTTTTTTTATTTCATTCATTTCCATCAAAGTAACTAACGGAAAATATTGAAGGAAAA AGTTTGTCATAAGTAGTGTATTATTTTATTGAATTACTTTAGAGTAAGTTATGTTTTAGT ATACAGGACGTATATACATGTATAAACCATTTGGATTGTTATGACAGTTCGGTTGATTCG CAAACACGCTGACACACAGATATTTGATTACAAAAATAATATCAATGGATGACTGATGAG AAATAAATGTCATTCTCAGATTTCAAGTTTCGCTTGACAGTTATTGATTATTAACGGGAA ATTATTCACTAAGTTGTGTACGTCAGATTACATTATTACGTTACGTGTCAGTCAAAACAA AAGTTCTGTTGTCGTTAGTTTTTAAGACGTATTCGAACTCTTAGAAAAATACATTATTCA TTTCAGATAGTTGAGGTTACATTGTTCCTCGACAAAATTAGAGATGATTTCAAGATGATG CATAACATAACCTAATGAACATATTGTACTCTGTAACCAATAGATTTTGACTTTAACTCA TTATTGAATGCCCAATAAACTACTCACGATAAAGTCTGTTTCGATTTAGTTTGCTTCGTA ATGAAGTGTATATTCTAAGTTGTTTAGGAATAGAAATTTGGATAAATAATTCATTATAGA TTTTATCATATTTGCAAAATATCTTGTCAACAAAAACTCATACGCAAATAATCCTACTTT CATACCTTTAGCCTGCTTAGCTTGAATTATCCGATATAAACCATGAAAGCTGTGTTAAAT CTTTGTTCAGTTTTCATCACTGTCATTTGAGTATTGTGTATGATATCATGATACCATCCT AAAGCTTTTATTATTTAATATTTCATATAAACAAATTAGGAATGATTACACTTTAAAACA AAGCAATACGAAAAGATTTGTATTTGCTTATTCTTGCTTTGTTCGAATTTAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)