These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7171#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 1012 fasta sequence [TTTTCTTTAGCAAAAACAGGACTTCATTCTCATTATTGAAATGATTTAATTCCAGTGCCGTATCTTTTTTTATTTCATTCATTTCCATCAAAGTAACTAACGGAAAATATTGAAGGAAAAAGTTTGTCATAAGTAGTGTATTATTTTATTGAATTACTTTAGAGTAAGTTATGTTTTAGTATACAGGACGTATATACATGTATAAACCATTTGGATTGTTATGACAGTTCGGTTGATTCGCAAACACGCTGACACACAGATATTTGATTACAAAAATAATATCAATGGATGACTGATGAGAAATAAATGTCATTCTCAGATTTCAAGTTTCGCTTGACAGTTATTGATTATTAACGGGAAATTATTCACTAAGTTGTGTACGTCAGATTACATTATTACGTTACGTGTCAGTCAAAACAAAAGTTCTGTTGTCGTTAGTTTTTAAGACGTATTCGAACTCTTAGAAAAATACATTATTCATTTCAGATAGTTGAGGTTACATTGTTCCTCGACAAAATTAGAGATGATTTCAAGATGATGCATAACATAACCTAATGAACATATTGTACTCTGTAACCAATAGATTTTGACTTTAACTCATTATTGAATGCCCAATAAACTACTCACGATAAAGTCTGTTTCGATTTAGTTTGCTTCGTAATGAAGTGTATATTCTAAGTTGTTTAGGAATAGAAATTTGGATAAATAATTCATTATAGATTTTATCATATTTGCAAAATATCTTGTCAACAAAAACTCATACGCAAATAATCCTACTTTCATACCTTTAGCCTGCTTAGCTTGAATTATCCGATATAAACCATGAAAGCTGTGTTAAATCTTTGTTCAGTTTTCATCACTGTCATTTGAGTATTGTGTATGATATCATGATACCATCCTAAAGCTTTTATTATTTAATATTTCATATAAACAAATTAGGAATGATTACACTTTAAAACAAAGCAATACGAAAAGATTTGTATTTGCTTATTCTTGCTTTGTTCGAATTTAT] [+] EMBL CD121685 [TTTTCTTTAGCAAAAACAGGACTTCATTCTCATTATTGAAATGATTTAATTCCAGTGCCGTATCTTTTTTTATTTCATTCATTTCCATCAAAGTAACTAACGGAAAATATTGAAGGAAAAAGTTTGTCATAAGTAGTGTATTATTTTATTGAATTACTTTAGAGTAAGTTATGTTTTAGTATACAGGACGTATATACATGTATAAACCATTTGGATTGTTATGACAGTTCGGTTGATTCGCAAACACGCTGACACACAGATATTTGATTACAAAAATAATATCAATGGATGACTGATGAGAAATAAATGTCATTCTCAGATTTCAAGTTTCGCTTGACAGTTATTGATTATTAACGGGAAATTATTCACTAAGTTGTGTACGTCAGATTACATTATTACGTTACGTGTCAGTCAAAACAAAAGTTCTGTTGTCGTTAGTTTTTAAGACGTATTCGAACTCTTAGAAAA ] [+] EMBL CD121687 [ TTCTTTAGCAAAAACAGGACTTCATTCTCATTATTGAAATGATTTAATTCCAGTGCCGTATCTTTTTTTATTTCATTCATTTCCATCAAAGTAACTAACGGAAAATATTGAAGGAAAAAGTTTGTCATAAGTAGTGTATTATTTTATTGAATTACTTTAGAGTAAGTTATGTTTTAGTATACAGGACGTATATACATGTATAAACCATTTGGATTGTTATGACAGTTCGGTTGATTCGCAAACACGCTGACACACAGATATTTGATTACAAAAATAATATCAATGGATGACTGATGAGAAATAAATGTCATTCTCAGATTTCAAGTTTCGCTTGACAGTTATTGATTATTAACGGGAAATTATTCACTAAGTTGTGTACGTCAGATTACATTATTACGTTACGTGTCAGTCAAAACAAAAGTTCTGTTGTCGTTAGTTTTTAAGACG ] [+] EMBL CD121797 [ ATTTGATTACAAAAATAATATCAATGGATGACTGATGAGAAATAAATGTCATTCTCAGATTTCAAGTTTCGCTTGACAGTTATTGATTATTAACGGGAAATTATTCACTAAGTTGTGTACGTCAGATTACATTATTACGTTACGTGTCAGTCAAAACAAAAGTTCTGTTGTCGTTAGTTTTTAAGACGTATTCGAACTCTTAGAAAAATACATTATTCATTTCAGATAGTTGAGGTTACATTGTTCCTCGACAAAATTAGAGATGATTTCAAGATGATGCATAACATAACCTAATGAACATATTGTACTCTGTAACCAATAGATTTTGACTTTAACTCATTATTGAATGCCCAATAAACTACTCACGATAAAGTCTGTTTCGATTTAGTTTGCTTCGTAATGAAGTGTATATT ] [+] EMBL CD089441 [ tttactGATGATGCATAACATAACCTAATGAATGTATTGTACTCTGTAACCAATAGATTTTGACTTTAACTCATTATTGAATGCCCAATAAACTACTCACGATAAAGTCTGTTTCGATTTAGTTTGCTTTGTAATGAAGTGTATATTCTAAGTTGTTTAGGAATAGAAATTTGGATAAATAATTCATTATAGATTTTATCATATTTGCAAAATATCTTGTCAACAAAAACTCATACGCAAATAATCCTACTTTCATACCTTTAGCCTGCTTAGCTTGAATTATCCGATATAAACCATGAAAGCTGTGTTAAATCTTTGTTCAGTTTTCATCACTGTCATTTGAGTATTGTGTATGATATCATGATACCATCCTAAAGCTTTTATTATTTAATATTTCATATAAACAAATTAGGAATGATTACACTTTAAAACAAAGCAATACGAAAAGATTTGTATTTGCTTATTCTTGCTTTGTTCGAATTTAT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||