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Schistosoma mansoni
cluster # 7179 cluster # 7179       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7179#0 length = 657 sequences # 4  

consensusID : consensus_7179#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 657
fasta sequence
                              [TAGAAAAATGTTAGATTGCCTTAGTCAGTATTATCAAATGCATATATGCACTTTTGGTAATCGTGTCTATGCACATCAACTTGCTTCAATGATTGATCCAAAACGTAGATATTTTTCACAACGTATTCTATCACGGGATGAATGCTTTAATCCAGTTACAAAGTCAGCAAATTTAAAAGCATTATTTCCTCGTGGTCTCAACCTAGTATGTATTATTGATGATCGTGGTGAAGTATGGGATTGGTCTTCCAATTTAATTCATGTTAAACCATATCGCTTTTTTCCAGATATTGGAGATATTAATGCTTTTCCATGGTCATCTCAATCATCACCATTGTCATCATCTTCAATCCCTACTTCGTCATCTTTTGGTAGTTGTACATCGACCTCAACAAAGGTCACAGAATCCTCCTCCTTCCTGTTATCCAATTGTTCAAATGTTCAGCTGATAGATAAGTCTGATGAAAATGTGAATTCACAGGTTAGTGAAGTTAATGAGAATATTATATCACACGATGTGGAAACAAAGTCAAATAACAATGATAATACTACAACTGCTATCAACAATACTGAAAAACCAGTTCGCTGTACAGTGGATAAGACTAATGATAATCCTTCTGTTACTACTACTGATAATAATGATATCGAATTTTGTCA]

[+] EMBL CD178780             [TAGAAAAATGTTAGATTGCCTTAGTCAGTATTATCAAATGCATATATGCACTTTTGGTAATCGTGTCTATGCACATCAACTTGCTTCAATGATTGATCCAAAACGTAGATATTTTTCACAACGTATTCTATCACGGGATGAATGCTTTAATCCAGTTACAAAGTCAGCAAATTTAAAAGCATTATTTCCTCGTGGTCTCAACCTAGTATGTATTATTGATGATCGTGGTGAAGTATGGGATTGGTCTTCCAATTTAATTCATGTTAAACCATATCGCTTTTTTCCAGATATGGGAGATATTAATGCTTTTCCATGGTCATCTCAATCATCACCATTGTCATCATCTTCAATCCCTACTTCGTCATCTTTTGGTAGTTGTACATCGACCTCAACAAAGGTCACA                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD117466             [                                                                                                                                            AATGCTTTAATCCAGTTACAAAGTCAGCAAATTTAAAAGCATTATTTCCTCGTGGTCTCATCCTAGTATGTATTATTGATGATCGTGGTGAAGTATGGGATTGGTCTTCCAATTTAATTCATGTTAAACCATATCGCTTTTTTCCAGATATTGGAGATATTAATGCTTTTCCATGGTCATCTCAATCATCACCATTGTCATCATCTTCAATCCCTACTTCGTCATCTTTTGGTAGTTGTACATCGACCTCAACAAAGGTCACAGAATCCTCCTCCTTCCTGTTATCCAATTGTTCAAATGTTCAGCTGATAGATAAGTCTGATGAAAATGTGAATTCACAGGTTAGTGAAGTTAATGAGAATATTATATCACACGATGTGGAAACAAAGTCAAATAACAATGATAATACTACAACTGCTATCAACAATACCGAAAAACCAGTTCGCTGTACAGTGGATAAGACTAATGATAATCCTTCTGTTACTACTACTGATAATAATGATATCGAATTTTGTC ]
[-] EMBL CD117179             [                                                                                                                                             ATGCTTTAATCCAGTTACAAAGTCAGCAAATTTAAAAGCATTATTTCCTCGTGGTCTCAACCTAGTATGTATTATTGATGATCGTGGTGAAGTATGGGATTGGTCTTCCAATTTAATTCATGTTAAACCATATCGCTTTTTTCCAGATATTGGAGATATTAATGCTTTTCCATGGTCATCTCAATCATCACCATTGTCATCATCTTCAATCCCTACTTCGTCATCTTTTGGTAGTTGTACATCGACCTCAACAAAGGTCACAGAATCCTCCTCCTTCCTGTTATCCAATTGTTCAAATGTTCAGCTGATAGATAAGTCTGACGAAAATGTGAATTCACAGGTTAGTGAAGTTAATGAGAATATTATATCACACGATGTGGAAACAAAGTCAAATAACAATGATAATACTACAACTGCTATCAACAATACTGAAAAACCAGTTCGCTGTACAGTGGATAAGACTAATGATAATCCTTCTGTTACTACTACTGATAATAATGATATCGAATTTTGTCA]
[-] EMBL CD117394             [                                                                                                                                                                              AAAAGCATTATTTCCTCGTGGTCTCAACCTAGTATGTATTATTGATGATCGTGGTGAAGTATGGGATTGGTCTTCCAATTTAATTCATGTTAAACCATATCGCTTTTTTCCAGATATTGGAGATATTAATGCTTTTCCATGGTCATCTCAATCATCACCATTGTCATCATCTTCAATCCCTACTTCGTCATCTTTTGGTAGTTGTACATCGACCTCAACAAAGGTCACAGAATCCTCCTCCTTCCTGTTATCCAATTGTTCAAATGTTCAGCTGATAGATAAGTCTGATGAAAATGTGAATTCACAGGTTAGTGAAGTTAATGAGAATATTATATCACACGATGTGGAAACAAAGTCAAATAACAATGATAATACTACAACTGCTATCAACAATACTGAAAAACCAGTTCGCTGTACAGTGGATAAGACTAATGATAATCCTTCTGTTACTACTACTGATAATAATGATATCGAATTTTGTCA]


>consensus_7179#0 TAGAAAAATGTTAGATTGCCTTAGTCAGTATTATCAAATGCATATATGCACTTTTGGTAA TCGTGTCTATGCACATCAACTTGCTTCAATGATTGATCCAAAACGTAGATATTTTTCACA ACGTATTCTATCACGGGATGAATGCTTTAATCCAGTTACAAAGTCAGCAAATTTAAAAGC ATTATTTCCTCGTGGTCTCAACCTAGTATGTATTATTGATGATCGTGGTGAAGTATGGGA TTGGTCTTCCAATTTAATTCATGTTAAACCATATCGCTTTTTTCCAGATATTGGAGATAT TAATGCTTTTCCATGGTCATCTCAATCATCACCATTGTCATCATCTTCAATCCCTACTTC GTCATCTTTTGGTAGTTGTACATCGACCTCAACAAAGGTCACAGAATCCTCCTCCTTCCT GTTATCCAATTGTTCAAATGTTCAGCTGATAGATAAGTCTGATGAAAATGTGAATTCACA GGTTAGTGAAGTTAATGAGAATATTATATCACACGATGTGGAAACAAAGTCAAATAACAA TGATAATACTACAACTGCTATCAACAATACTGAAAAACCAGTTCGCTGTACAGTGGATAA GACTAATGATAATCCTTCTGTTACTACTACTGATAATAATGATATCGAATTTTGTCA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)