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Schistosoma mansoni
cluster # 7182 cluster # 7182       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7182#0 length = 1461 sequences # 5  

consensusID : consensus_7182#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1461
fasta sequence
                              [CAGAGGAGAATATTAATTACATCTCCATAATTAGTGCATTGACTGGCTATGGTATACCAGAACTAATCGACTTTCTGTTATCTAAACGTTTTCATTCTAAAAATCCAATATATTTGATAGGTTCTACAAATGTCGGAAAGTCTAGTTTATTCAATCGTTTATTATTGTCAGATTTATGTAAATCAGAAGCCAAAGAATCTATTCATCGAGCTACAATATCTACGTGGCCAGGTACCACAATGGGCCTCTTAAGTTTTCCATTAACCCTAATGAATTCAGCTAAACGTGGTCAGCGTATACAATCACGTTATGAACAATCACATCAAAAGACTATACAACATAAAGAATGCAATTCATCACATGGTTTCCGATATTTGAAACCAAAAGAAATTGTCTCTGGTATTTGTGACCAACGGTCGGCAAATTATTATGCGGCAAAAAAGGCTCGTGAAACGCTGCCAGATTTGTCTACTATGCCGACATATACATGGAAACCTAATGAAAATTCCAATTCCAACAACTCTGGGATTTGTGTTGGTAGTGAGTTCGGATTGGAACAGTTGGCTTCTGAGTCATTGCGTGGAGATATTTTCATGGACAAAGCTACTTGGGATGGAGATCAAAGTACTAGATTACTAACAAATATATTAAATCCAAGATATTTTAATGATCATGCATGGTGTTATGATACTCCAGGTGTTTTTTGTAAAGACCAGATTCTTAACTACTTCTCATCAAACTTATTACATTCTATAACTAATTACAAATCAGAGGGAACTGGTATTTTCCACTGGCCAAATGGTGTAAATAATAAAGTTTTAATTCCTCGTACATTCGTCATGCGGNCAGGTTTGACACTTTTAATGGGATCTCTTGGTCGTTTAGATGTTTTGAAAGCTCCAAGTTCTGTTTATTTCACCACTTTTTCTCATCTTCCAATCCATATTGTATCTATAAAAGAAGTTGATGAGTATAGAAGTAGATTTGTCAAATTTCTCATGCCAAAAATTAAAGACAATTCTGTAAATACTGATAATAACTATAAGAATACAGTTGGACCTTGTGGTGTACTACCACCAATGGAATCAAAAAATCTTGATCCCATCGAAACTGTACCTAATTTAGATCAATCTAACATAGATGTTGTTTTATCCGGAGCAGGATGGGTCAGTGTAGCTGGTTTATCAAAGACCAATAAGAAATTACTAGATGAGAAAAATTCAGAAGAAATATCTACTGAGAACAGTGTCGTTGATAATGATGATGATGATAGTAATAATAATGATGATGAATTGTTTTGTGCTGATATTTTATTAGCAGCATGGACTCCTGGAGCTTTGGGTATATCATTAAGAAAACCTTTAATTCCATATGCAATTAAACGTCGCGGTCATCGTTTAAAATGGTTAAGAGAATTTTCAGGTATACCATGATCTTTATATTTGTGATTAATTTTTTTAC]

[+] EMBL CD152328             [CAGAGGAGAATATTAATTACATCTCCATAATTAGTGCATTGACTGGCTATGGTATACCAGAACTAATCGACTTTCTGTTATCTAAACGTTTTCATTCTAAAAATCCAATATATTTGATAGGTTCTACAAATGTCGGAAAGTCTAGTTTATTCAATCGTTTATTATTGTCAGATTTATGTAAATCAGAAGCCAAAGAATCTATTCATCGAGCTACAATATCTACGTGGCCAGGTACCACAATGGGCCTCTTAAGTTTTCCATTAACCCTAATGAATTCAGCTAAACGTGGTCAGCGTATACAATCACGTTATGAACAATCACATCAAAAGACTATACAACATAAAGAATGCAATTCATCACATGGTTTCCGATATTTGAAACCAAAAGAAATTATCTCTGGTATTTGTGACCAACGGTCGGCAAATTATTATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD152354             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATTCATCACATGGTTTCCGATATTTGAAACCAAAAGAAATTGTCTCTGGTATTTGTGACCAACGGTCGGCAAATTATTATGCGGCAAAAAAGGCTCGTGAAACGCTGCCAGATTTGTCTACTATGCCGACATATACATGGAAACCTAATGAAAATTCCAATTCCAACAACTCTGGGATTTGTGTTGGTAGTGAGTTCGGATTGGAACAGTTGGCTTCTGAGTCATTGCGTGGAGATATTTTCATGGACAAAGCTACTTGGGATGGAGATCAAAGTACTAGATTACTAACAAATATATTAAATCCAAGATATTTTAATGATCATGCATGGTGTTATGATACTCCAGGTGTTTTTTGTAAAGACCAGATTCTTAACTACTTCTCATCAAACTTATTACATTCTATAACTAATTACAAATCAGAGGGAACTGGTATTTTCCACTGGCCAAATGGTGTATATAATAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD078607             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CATCACATGGTTTCCGATATTTGAAACCAAAAGAAATTGTCTCTGGTATTTGTGACCAACGGTCGGCAAATTATTATGCGGCAAAAAAGGCTCGTGAAACGCTGCCAGATTTGTCTACTATGCCGACATATACATGGAAACCTAATGAAAATTCCAATTCCAACAACTCTGGGATTTGTGTTGGTAGTGAGTTCGGATTGGAACAGTTGGCTTCTGAGTCATTGCGTGGAGATATTTTCATGGACAAAGCTACTTGGGATGGAGATCAAAGTACTAGATTACTAACAAATATATTAAATCCAAGATATTTTAATGATCATGCATGGTGTTATGATACTCCAGGTGTTTTTTGTAAAGACCAGATTCTTAACTACTTCTCATCAAACTTATTACATTCTATAACTAATTACAAATCAGAGGGAACTGGTATTTTCCACTGGCCAAATGGTGTAAATAATAAAGTTTTAATTCCTCGTACATTCGTCATGCGGNCAGGTTTGACACTTTTAATGGGATCTCTTGGTCGTTTAGATGTTTTGAAAGCTCCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD124433             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTTTGTAAAGACCAGATTCTTAACTACTTCTCATCAAACTTATTACATTCTATAACTAATTACAAATCAGAGGGAACTGGTATTTTCCACTGGCCAAATGGTGTAAATAATAAAGTTTTAATTCCCCGTACATTCGTCATGCGGCCAGGTTTGACACTTTTAATGGGATCTCTTGGTCGTTTAGATGTTTTGAAAGCTCCAAGTTCTGTTTATTTCACCACTTTTTCTCATCTTCCAATCCATATTGTATCTATAAAAGAAGTTGATGAGTATAGAAGTAGATTTGTCAAATTTCTCATGCCAAAAATTAAAGACAATTCTGTAAATACTGATAATAACTATAAGAATACAGTTGGACCTTGTGGTGTACTACCACCAATGGAATCAAAAAATCTTGATCCCATCGAAACTGTACCTAATTTAGATCAATCTAACATAGATGTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD073071             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTGGACCTTGTGGTGTACTACCACCAATGGAATCAAAAAATCTTGATCCCATCGAAACTGTACCTAATTTAGATCAATCTAACATAGATGTTGTTTTATCCGGAGCAGGATGGGTCAGTGTAGCTGGTTTATCAAAGACCAATAAGAAATTACTAGATGAGAAAAATTCAGAAGAAATATCTACTGAGAACAGTGTCGTTGATAATGATGATGATGATAGTAATAATAATGATGATGAATTGTTTTGTGCTGATATTTTATTAGCAGCATGGACTCCTGGAGCTTTGGGTATATCATTAAGAAAACCTTTAATTCCATATGCAATTAAACGTCGCGGTCATCGTTTAAAATGGTTAAGAGAATTTTCAGGTATACCATGATCTTTATATTTGTGATTAATTTTTTTAC]


>consensus_7182#0 CAGAGGAGAATATTAATTACATCTCCATAATTAGTGCATTGACTGGCTATGGTATACCAG AACTAATCGACTTTCTGTTATCTAAACGTTTTCATTCTAAAAATCCAATATATTTGATAG GTTCTACAAATGTCGGAAAGTCTAGTTTATTCAATCGTTTATTATTGTCAGATTTATGTA AATCAGAAGCCAAAGAATCTATTCATCGAGCTACAATATCTACGTGGCCAGGTACCACAA TGGGCCTCTTAAGTTTTCCATTAACCCTAATGAATTCAGCTAAACGTGGTCAGCGTATAC AATCACGTTATGAACAATCACATCAAAAGACTATACAACATAAAGAATGCAATTCATCAC ATGGTTTCCGATATTTGAAACCAAAAGAAATTGTCTCTGGTATTTGTGACCAACGGTCGG CAAATTATTATGCGGCAAAAAAGGCTCGTGAAACGCTGCCAGATTTGTCTACTATGCCGA CATATACATGGAAACCTAATGAAAATTCCAATTCCAACAACTCTGGGATTTGTGTTGGTA GTGAGTTCGGATTGGAACAGTTGGCTTCTGAGTCATTGCGTGGAGATATTTTCATGGACA AAGCTACTTGGGATGGAGATCAAAGTACTAGATTACTAACAAATATATTAAATCCAAGAT ATTTTAATGATCATGCATGGTGTTATGATACTCCAGGTGTTTTTTGTAAAGACCAGATTC TTAACTACTTCTCATCAAACTTATTACATTCTATAACTAATTACAAATCAGAGGGAACTG GTATTTTCCACTGGCCAAATGGTGTAAATAATAAAGTTTTAATTCCTCGTACATTCGTCA TGCGGNCAGGTTTGACACTTTTAATGGGATCTCTTGGTCGTTTAGATGTTTTGAAAGCTC CAAGTTCTGTTTATTTCACCACTTTTTCTCATCTTCCAATCCATATTGTATCTATAAAAG AAGTTGATGAGTATAGAAGTAGATTTGTCAAATTTCTCATGCCAAAAATTAAAGACAATT CTGTAAATACTGATAATAACTATAAGAATACAGTTGGACCTTGTGGTGTACTACCACCAA TGGAATCAAAAAATCTTGATCCCATCGAAACTGTACCTAATTTAGATCAATCTAACATAG ATGTTGTTTTATCCGGAGCAGGATGGGTCAGTGTAGCTGGTTTATCAAAGACCAATAAGA AATTACTAGATGAGAAAAATTCAGAAGAAATATCTACTGAGAACAGTGTCGTTGATAATG ATGATGATGATAGTAATAATAATGATGATGAATTGTTTTGTGCTGATATTTTATTAGCAG CATGGACTCCTGGAGCTTTGGGTATATCATTAAGAAAACCTTTAATTCCATATGCAATTA AACGTCGCGGTCATCGTTTAAAATGGTTAAGAGAATTTTCAGGTATACCATGATCTTTAT ATTTGTGATTAATTTTTTTAC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)