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Schistosoma mansoni
cluster # 7211 cluster # 7211       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7211#0 length = 1332 sequences # 5  

consensusID : consensus_7211#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1332
fasta sequence
                              [CTAATAACGATAACAACACTAATTAAACACTATTTTTATATGCTAAATCTTATCCAAGGTCTATTCTCTTTACTATTTTATTGCTTTATCTACGTCACATAATAATCATCTCTGTGTTGTCTGTTGCTTGTAATTATAAAGAAATATGCATAACTAGTCGAACATTCTATTCAAAAGGTATCACACTATTATTTTTCTACTTCTATCCCACTATTTCCATCCCATCCTTATGTGTGTACTTGTTGGATTTGCTATACTACCAATAATATATACACTTAAACTTCTGTGAAATATAAGACAATGTTAATGTATTGTGTATTGAGTTTTCTTCCTTTGAAATTTGTCTCGTTTCTATATTGCTTACGACAGATACTGGTTTTCTTTCATCTCATTATGTAAATAACTTGGTCTCTTCGCTTGTCCTCTCTCTCTATTTCCCTTCCTTTTCTTATGGATTGATTCATGTGTAAATGATTTGTAACATTGAGACTAATGTGATTACTACTACTTCTGTGTTGTTATTATCCTTATCGTTAAATCTCACATTATTCATGTAGGTTCTTCTTGACAGTTTCCTGTTTTTCTACAACTCAATCGTTATAATTTTGCTTTTAACTATAACTATACCTCTTACGCACATAATCAATTTCTCTTCTGTTATTGTTTCTTAGTCACTTACTGCTTGTTCATTTTTATCATTGTTATGTACATTTACTATTGATGATAACTATCATGATGATGCTATCGTTAAGATGCCTCATATTATTGCTTTCATTGTTGTTACTACTGCTGCTATTGCTGACGCCACCGCTGCCATCATCGTATTTGTTGTTTCTGTGAAGAAATTTCATTTACTTATTACTTTCTTTGATATTAACCATATTCTAGCAAATACTTTCACTACTACTCTTACTCCTACTACTACCACTAATCTGTCTTTTCATTCATTCTGTTAATTTGATTTTAATTAATTCATGTTTATTATATTTGATAATTTATTGATTAATTGATTGATTTATTGACTTAATGTTATGTTTTTTTTTCGAAACAAAACAAATCGAATGTCATCGATGTTTTTTTTTGTTGGTTGTGTAATTTGTCAGTGTTTTTTTTCTTTCTTTAAATTTCATTTTTTGATGCTGGTCTCATCGTGTGTGTGTGTGTGTGAAAATTTGATGAACTCGTTTGTGTTTATAAGTTTGTCAAAAAATTTTTAAAAAAATTGTTCGATTTGAAAGATTTCAACAGATGTATACCGTTTGTTTGTTTTTTTTGTTGTTGCTATTTGTCTATTTATTTTCAAGAAAATCAATTACATAAAATATTTAAAGT]

[+] EMBL CD082880             [CTAATAACGATAACAACACTAATTAAACACTATTTTTATATGCTAAATCTTATCCAAGGTCTATTCTCTTTACTATTTTATTGCTTTATCTACGTCACATAATAATCATCTCTGTGTTGTCTGTTGCTTGTAATTATAAAGAAATATGCATAACTAGTCGAACATTCTATTCAAAAGGTATCACACTATTATTTTTCTACTTCTATCCCACTATTTCCATCCCATCCTTATGTGTGTACTTGTTGGATTTGCTATACTACCAATAATATATACACTTAAACTTCTGTGAAATATAAGACAATGTTAATGTATTGTGTATTGAGTTTTCTTCCTTTGAAATTTGTCTCGTTTCTATATTGCTTACGACAGATACTGGTTTTCTTTCATCTCATTATGTAAATAACTTGGTCTCTTCGCTTGTCCTCTCTCTCTATTTCCCTTCCTTTTCTTATGGATTGATTCATGTGTAAATGATTTGTAACATTGAGACTAATGTGATTACTACTACTTCTGTGTTGNTATTATCCTTATCGTTAAATCTCACATTATTCATGTANGGTCTTCTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD118697             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GTATTGAGTTTTCTTCCTNTGAAATNTGTCTCGTTTCTATATTGCTTACGACAGATACTGGTTTTCTTTCATCTCATTATGTAAATAACTTGGTCTCTTCGCTTGTCCTCTCTCTCTATTTCCCTTCCTTTTCTTATGGATTGATTCATGTGTAAATGATTTGTAACATTGAGACTAATGTGATTACTACTACTTCTGTGTTGTTATTATCCTTATCGTTAAATCTCACATTATTCATGTAGGTTCTTCTTGACAGTTTCCTGTTTTTCTACAACTCAATCGTTATAATTTTGCTTTTAACTATAACTATACCTCTTACGCACATAATCAATTTCTCTTCTGTTATTGTTTCTTAGTCACTTACTGCTTGTTCATTTTTATCATTGTTATGTACATTTACTATTGATGATAACTATCATGATGATGCTATCGTTAAGATGCCTCATATTATTGCTTTCATTGTTGTTACTACTGCTGCTATTGCTGACGCCACCGCTGCCATCATCGTATTTGTTGTTTCTGTGAAGAAATTTCATTTACTTATTACTTTCTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD120658             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GTTTTCTTTCATCTCATTATGTAAATAACTTGGTCTCTTCGCTTGTCCTCTCTCTCTCCTTCCCTTCCTTTTCTTATGGATTGATTCATGTGTAAATGATTTGTAACATTGAGACTAATGTGATTACTACTACTTCTGTGTTGTTATTATCCTTATCGTTAAATCTCACATTATTCATGTAGGTTCTTCTTGACAGTTTCCTGTTTTTCTACAACTCAATCGTTATAATTTTGCTTTTAACTATAACTATACCTCTTACGCACATAATCAATTTCTCTTCTGTTATTGTTTCTTAGTCACTTACTGCTTGTTCATTTTTATCATTGTTATGTACATTTACTATTGATGATAACTATCATGATGATGCTATCGTTAAGATGCCTCATATTATTGCTTTCATTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD183178             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ACAGTTTCCTGTTNTTCTACAACTCAATCGTTATAATTTTGCTTTTAACTATAACTATACCTCTTACGCACATAATCAATTTCTCTTCTGTTATTGTTTCTTAGTCACTTACTGCTTGTTCATTTTTATCATTGTTATGTACATTTACTATTGGTGATAACTATCATGATGATGCTATCGTTAAGATGCCTCATATTATTGCTTTCATTGTTGTTACTACTGCTGCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD076465             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GCTGCCATCATCGTATTTGTTGTTTCTGTGAAGAAATTTCATTTACTTATTACTTTCTTTGATATTAACCATATTCTAGCAAATACTTTCACTACTACTCTTACTCCTACTACTACCACTAATCTGTCTTTTCATTCATTCTGTTAATTTGATTTTAATTAATTCATGTTTATTATATTTGATAATTTATTGATTAATTGATTGATTTATTGACTTAATGTTATGTTTTTTTTTCGAAACAAAACAAATCGAATGTCATCGATGTTTTTTTTTGTTGGTTGTGTAATTTGTCAGTGTTTTTTTTCTTTCTTTAAATTTCATTTTTTGATGCTGGTCTCATCGTGTGTGTGTGTGTGTGAAAATTTGATGAACTCGTTTGTGTTTATAAGTTTGTCAAAAAATTTTTAAAAAAATTGTTCGATTTGAAAGATTTCAACAGATGTATACCGTTTGTTTGTTTTTTTTGTTGTTGCTATTTGTCTATTTATTTTCAAGAAAATCAATTACATAAAATATTTAAAGT]


>consensus_7211#0 CTAATAACGATAACAACACTAATTAAACACTATTTTTATATGCTAAATCTTATCCAAGGT CTATTCTCTTTACTATTTTATTGCTTTATCTACGTCACATAATAATCATCTCTGTGTTGT CTGTTGCTTGTAATTATAAAGAAATATGCATAACTAGTCGAACATTCTATTCAAAAGGTA TCACACTATTATTTTTCTACTTCTATCCCACTATTTCCATCCCATCCTTATGTGTGTACT TGTTGGATTTGCTATACTACCAATAATATATACACTTAAACTTCTGTGAAATATAAGACA ATGTTAATGTATTGTGTATTGAGTTTTCTTCCTTTGAAATTTGTCTCGTTTCTATATTGC TTACGACAGATACTGGTTTTCTTTCATCTCATTATGTAAATAACTTGGTCTCTTCGCTTG TCCTCTCTCTCTATTTCCCTTCCTTTTCTTATGGATTGATTCATGTGTAAATGATTTGTA ACATTGAGACTAATGTGATTACTACTACTTCTGTGTTGTTATTATCCTTATCGTTAAATC TCACATTATTCATGTAGGTTCTTCTTGACAGTTTCCTGTTTTTCTACAACTCAATCGTTA TAATTTTGCTTTTAACTATAACTATACCTCTTACGCACATAATCAATTTCTCTTCTGTTA TTGTTTCTTAGTCACTTACTGCTTGTTCATTTTTATCATTGTTATGTACATTTACTATTG ATGATAACTATCATGATGATGCTATCGTTAAGATGCCTCATATTATTGCTTTCATTGTTG TTACTACTGCTGCTATTGCTGACGCCACCGCTGCCATCATCGTATTTGTTGTTTCTGTGA AGAAATTTCATTTACTTATTACTTTCTTTGATATTAACCATATTCTAGCAAATACTTTCA CTACTACTCTTACTCCTACTACTACCACTAATCTGTCTTTTCATTCATTCTGTTAATTTG ATTTTAATTAATTCATGTTTATTATATTTGATAATTTATTGATTAATTGATTGATTTATT GACTTAATGTTATGTTTTTTTTTCGAAACAAAACAAATCGAATGTCATCGATGTTTTTTT TTGTTGGTTGTGTAATTTGTCAGTGTTTTTTTTCTTTCTTTAAATTTCATTTTTTGATGC TGGTCTCATCGTGTGTGTGTGTGTGTGAAAATTTGATGAACTCGTTTGTGTTTATAAGTT TGTCAAAAAATTTTTAAAAAAATTGTTCGATTTGAAAGATTTCAACAGATGTATACCGTT TGTTTGTTTTTTTTGTTGTTGCTATTTGTCTATTTATTTTCAAGAAAATCAATTACATAA AATATTTAAAGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)