These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7258#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 970 fasta sequence [AGCTTTTAATGAAAAGCTTAGTTGTGTAGCCATACACACTGCGGCTGATAAATATGTATTTCGTGGGGGTTCACACGATCATGTCCCTCAAGGAAAGGTTGCGTTTGGTCTGGCTCAGCGTAAATGGGGCAATATTTCAGTAGATGAACCTTTAGATGTTCAACCATACACATTTAATTTGGCTCGTGAATGTCTAGCTTCTGCAGTTTTGGCTGTGGATTTTAATAATAAAAAAATGTCGATCAATGAGCCATTGGATTCAGATCGAATGGCTCTAGAATTCAGCATGCAATTCGCAGATACACCATTGACCGTTGGTCAGCATATTCTTTATCGGTTTAACAAAATGACTCTCCTTGTTGAGGTTAAGAAATTGTCAACTTTGTCAATGGATGGCGGAGATGTTGACAATAGTAAAATTGGCATGTTAACTGGGAATACAGTAATTCGTTGGATGCCTCAACCAGATTCTAAATTATTGTTGATTGGTAAAGCTGCATTGGATGACGATGGCGCTAGTTCTATTGGAGGTGGGTGGTGGCTATCATAGTATCATCAATCCAAATTGGGATTTTAATCAAATGGGTATCGGTGGGATTGGATAAAGAATTTTCAGCTATATTCCGACGAACATTTGCATCACGAAATGTTTCCTCCCAGCAGTGGCAAAACAATTAGGTTTAAAACATGTCCGTGGTATTCTGTTATACGGTCCACCTGGTACTGGTAAAACACTAATGGCACGACAAATTGGTAAAATGCTTAATGCACATGAACCTAAAATTGTCAATGGTCCAAGTATATTAGATAAATATGTTGGTGAATCTGAAGCGAATATCCGTAAATTA-TTCGC--TGATGCTGAAG-AGGAAGAAAAACGCATG-GGTGCGAAATCTGCATTGCATATTATTATATTTGATGAAATTGATGCCATTTGTAAATCACGTGGATCTACAGGTGGAGGTGCTGGTGG] [+] EMBL BF936679 [AGCTTTTAATGAAAAGCTTAGTTGTGTAGCCATACACACTGCGGCTGATAAATATGTATTTCGTGGGGGTTCACACGATCATGTCCCTCAAGGAAAGGTTGCGTTTGGTCTGGCTCAGCGTAAATGGGGCAATATTTCAGTAGATGAACCTTTAGATGTTCAACCATACACATTTAATTTGGCTCGTGAATGTCTAGCTTCTGCAGTTTTGGCTGTGGATTTTAATAATAAAAAAATGTCGATCAATGAGCCATTGGATTCAGATCGAATGGCTCTAGAATTCAGCATGCAATTCGCAGATACACCATTGACCGTTGGTCAGCATATTCTTTATCGGTTTAACAAAATGACTCTCCTTGTTGAGGTTAAGAAATTGTCAACTTTGTCAATGGATGGCGGAGATGTTGACAATAGTAAAATTGGCATGTTAACTGGGAATACAGTAATTCGTTGGATGCCTCAACCAGATTCTAAATTATTGTTGATTGGTAAAGCTGCATTGGATGACGATGGCGCTAGTTCTATTGGAGGTGGGTGGTGGCTATCATAGTATCATCAATCCAAATTGGGATTTTAATCAAATGGGTATCGGTGGGATTGGATAAAGAATTTTCAGCTATATTCCGACGAACATTTGCATCACGAAATGTTTCCTCCCAGCAGTG ] [-] EMBL CD181812 [ cgactgacGTAGCCATACACACTGCGGCTGATAAATATGTATTTCGTGGGGGTTCACACGATCATGTCCCTCAAGGAAAGGTTGCGTTTGGTTTAGCTCAGCGTAAATGGGGCAATATTTCAGTAGATGAACCTTTAGATGTTCAACCATACACATTTAATTTGGCTCGTGAATGTCTAGCTTCTGCAGTTTTGGCTGTGGATTTTAATAATAAAAAAATGTCGATCAATGAGCCATTGGATTCAGATCGAATGGCTCTAGAATTCAGCATGCAATTCGCAGATACACCAT ] [-] EMBL CD114065 [ GGCTCTAGAATTCAGCATGCAATTCGCAGATACACCATTGACCGTTGGTCAGCATATTCTTTATCGGTTTAACANAATGACTCTCCTTGTTGAGGTTAAGAAATTGTCAACTTTGTCAATGGATGGCGGAGATGTTGACAATAGTAAAATTGGCATGTTAACTGGGAATACAGTAATTCGTTGGATGCCTCAGCCAGATTCTAAATTATTGTTGATTGGTAAAGCTGCATTGGATGACGATGGCGCTAGTTCTATTGGAGGT GGTGGTGGCTATCATAGTATCATCAATCCAAATTGGGATTTTAATCAAATGGGTATCGGT GGATTGGATAAAGAATTTTCCGCTATATTCCGACGAACATTTGCATCACG AATGTTTCCT CCAGCAGTTGCAAAACAATTAGGTTTAAAACATGTCCGTGGTATTCTGTTATACGGTCCACCTGGTACTGGTAAAACACTAATGGCACGACAAATTGGTAAAATGCTTAATGCACATGAACCTAAAATTGTCAATGGTCCAAGTATATTAGATAAATATGTTGGTGAATCTGAAGCGAATATCCGTAAATTA TT ] [-] EMBL CD180779 [ AACACTAATGGCACGACAAATTGGTAAAATGCTTAATGCACGTGAACCTAAAATTGTCAATGGTCCAAGTATATTAGATAAATATGTTGGTGAATCTGAAGCGAATATCCGTAAATTA TTCGC TGATGCTGAAG AGGAAGAAAAACGCATG GGTGCGAAATCTGCATTGCATATTATTATATTTGATGAAATTGATGCCATTTGTAAATCACGTGGATCTACAG ] [+] EMBL CD092923 [ CGTAAATTATTTCGCNNTGATGCTGAAGAAGGAAGAAAAACGCATGNGGTGCGAAATCTGCATTGCATATTATTATATTTGATGAAATTGATGCCATTTGTAAATCACGTGGATCTACAGGTGGAGGTGCTGGTGG] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||