These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7319#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 946 fasta sequence [GTTTGTGAAAGCTAATTCAGTCCTAACAAGATATAGGCAAAAGAACATTACAACAAAATATAACAAGATTATAGAAGCCATTCTTGCTAGTTCGTTAACTACCACTTTATGTTTTTCAATAATGTGGGCTGTTCGTGATTGTAGTCCATTAGCATATACTAGCAGTTCTTTCCCTCTCAGGATGATGTGTGCGGACAACGAGTTTAATTCAATTTCCTCACTATTATTTTCAACACCTGAACGTTCTCTCCGAACTCTGCTTCACGATCCTCCAATGACATACAGTATTTCAGTATTAACCATATTTGTGCTCGTATACTATTTCTTGGCTTGTATTACGTATGGTTTGTCTGTTCCTGCTGGTCTATTCATACCGTCTTTGTTGATTGGTGCTGGCT--GGGGCCGAATCATAGGTAATTTAATGCATACTGTTGATCCAATTCATTTCTCCGATCCCGGTAAATTCGCACTGATTGGCGCTGCTGCACAATTAGGTGGTATTGTTCGAATGACATTAAGTCTAACAGTTATTATAATGGAGGCAACAGGAAACGTAATTGTTGGATTACCATTGCTAATGACTTTGACTGTTGCTAAATATATGGGTGATTGTTTAAGCGAAGGGATCTATGATGAACATATTGGGTTGAATAGTATGGCTTTACTTCCGTGGACACCGCATTCTCTATCTGTAACTAAGAGAGCCTATGACCTGATGTATAATCCAGTTGTGTATTTATATCCTATCATGCGTGTTAGTGAATTAGTTGAACGGATTGCAAATAATTTACATCATGGGTTTCCAGTTGTAGTGGGTTCTACAGATTCATCAAGATTTTCATATGGTACTTTAGTTGGAATGGATTTGTTCAGAGCATTTAGCACTACTGTTGCAAAAACGTGTATGTTACCTTTTCTCGTTGTAATTTTCTTTTTCTCTTATCAA] [+] EMBL CD129514 [GTTTGTGAAAGCTAATTCAGTCCTAACAAGATATAGGCAAAAGAACATTACAACAAAATATAACAAGATTATAGAAGCCATTCTTGCTAGTTCGTTAACTACCACTTTATGTTTTTCAATAATGTGGGCTGTTCGTGATTGTAGTCCATTAGCATATACTAGCAGTTCTTTCCCTCTCAGGATGATGTGTGCGGACAACGAGTTTAATTCAATTTCCTCACTATTATTTTCAACACCTGAACGTTCTCTCCGAACTCTGCTTCACGATCCTCCAATGACATACAGTATTTCAGTATTAACCATATTTGTGCTCGTATACTATTTCTTGGCTTGTATTACGTATGGTTTGTCTGTTCCTGCTGGTCTATTCATACCGTCTTTGTTGATTGGTGCTGGCT GGGGCCGAATCATAGGTAATTTAATGCATACTGTTGATCCAATTCATTTCTCCGATCCCGGCAAATTCGCACTGATTGGCGCTGCTGCACAATTAGGTGGTATTGTTCGAATGACATTAAGTCTAAC ] [-] EMBL CD180534 [ TGTGCGGACAACGAGTTTAATTCAATTTCCTCACTATTATTTTCAACAACTGAACGTTCTCTCCGAACTCTGCTTCACGATCCTCCAATGACATACAGTATTTCAGTATTAACCATATTTGTGCTCGTATACTATTTCTTGGCTTGTATTACGTATGGTTTGTCTGTTCCTGCTGGTCTATTCATACCGTCTTTGTTGATTGGTGCTGGCT GGGGCCGAATCATA ] [-] EMBL BG931166 [ tATT GTGATGGATGGGGGGTCGAATCATAGGTAATTTAATGCATACTGTTGATCCAATTCATTTCTCCGATCCCGGTAAATTCGCACTGATTGGCGCTGCTGCACAATTAGGTGGTATTGTTCGAATGACATTAAGTCTAACAGTTATTATAATGGAGGCAACAGGAAACGTAATTGTTGGATTACCATTGCTAATGACTTTGACTGTTGCTAAATATATGGGTGATTGTTTAAGCGAAGGGATCTATGATGAACATATTGGGTTGAATAGTATGGCTTTACTTCCGTGGAa ] [-] EMBL CD113390 [ TAGGTAATTTAATGCATACTGTTGATCCAATTCATTTCTCCGATCCCGGTAAATTCGCACTGATTGGCGCTGCTGCACAATTAGGTGGTATTGTTCGAATGACATTAAGTCTAACAGTTATTCTAATGGAGGCAACAGGATACGTAATTGTTGGATTACCATTGCTAATGACTTTGACTGTTGCTAAATATATGGGTGATTGTTTAAGCGAAGGGATCTATGATGAACATATTGGGTTGAATAGTATGGCTTTACTTCCGTGGACACCGCATTCTCTATCTGTAACTAAGAGAGCCTATGACCTGATGTATAATCCAGTTGTGTATTTATATCCTATCATGCGTGTTAGTGAATTAGTTGAACGGATTGCAAATAATTTACATCATGGGTTTCCAGTTGTAGTGGGTTCTACAGATTCATCAAGATTTTCATATGGTACTTTAGTTGGAATGGATTTGTTCAGAGCAT ] [-] EMBL CD117467 [ ATATTGGGTTGAATAGTATGGCTTTACTTCCGTGGACACCGCATTCTCTATCTGTAACTAAGAGAGCCTATGACCTGATGTCTAATCCAGTTGTGTATTTATATCCTATCATGCGTGTTAGTGAATTAGTTGAACGGATTGCAAATAATTTACATCATGGATTTCCAGTTGTAGTGGGTTCTACAGATTCATCAAGATTTTCATATGGTACTTTAGTTGGAAT GATTTCTTCAGAGCATTTAGCACTACTGTTGCAAAAACGTGTATGTTACCTTTTCTCGTTGTAATTTTCTTTTTCTCTTATCAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||