These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7374#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 982 fasta sequence [AAGAAAAACATTTTAGCCCCAATAGTTAACACTGATTCGTTAAAATCTTCAGAGGTTACTTTCAGAAAACCCCATCAAGGTCGTAAAAGACGCTGTTTACGGGTATTAACATCCTCCAAGTCCAACGCGGGTAACTCTTCAAATCAGCAGTCAGCGAATCTCCGTGATGACTGCATTGTATCTATGTATCCAAACACACAAGGTGTCGCTTTTTCGGCCCAAAGAACAAGTTCCCAAAACCATGTTCACGGAAAAAGTAACATATTTTGTAAATCATATGAAAAACCACATCAAAGTGCCTTGCTTTGTTTCCCTACCTCTGTTGGATCTCAAGTTTCGCGCCCAAGTAATTCGGGCTCTAATAGTTTTTCCCGTTTATCTCAAGCACAAAAACGTCATGCAACAGCTTCTAGACGCTCAAAGTAGACTACGATACAGTTTTGTACATAAATTCATATTTATATATACTTACCTGTTAAATTTTCAGTTTATTTCCTACCTAATTTATGTGTACATATCCCATTAATTTATCTATCTCTCTTCAGTTTTTTGAAAACATAAAAAAGTCACCCAAATTTTGTTTTGATTATTTCGGTCGTAATTCTTCTATTCATATGGAGAATATATATATTAAACAAACTCTTGTGTCTAAACTAGGTTATTTACAGTGAAGTGAAGCGAGCTATGCACCCAGTTATGTAAATAATAAGCATTTTGCAGAACTGTTAAATCCTCTTATTGCTTATTCCATATTTTGCGAGTACTTTTTTCTCGTTTTTCCCTACGAAATGCCTTTTTACCAATATGTGTATCTTCATCCGTAACCTTTCGACAAAAACAAAGGACAACACTGTGATTCTTTCGAATAAGTTTATTCGATCGCTTTACATATGTTCAGAGTTTCCATGTATATGTATTTGCAGACACGTCTCTAGATTTACCTGTATTTTGTTTTATTCAGTGTTAG-AAATGAATAAAATCT] [+] EMBL CD155661 [AAGAAAAACATTTTAGCCCCAATAGTTAACACTGATTCGTTAAAATCTTCAGAGGTTACTTTCAGAAAACCCCATCAAGGTCGTAAAAGACGCTGTTTACGGG ] [+] EMBL CD080430 [ TTTCAGAAAACCCCATCAAGGTCGTAAAAGACGCTGTTTACGGGTATTAACATCCTCCAAGTCCAACGCGGGTAACTCTTCAAATCAGCAGTCAGCGAATCTCCGTGATGACTGCATTGTATCTATGTATCCAAACACACAAGGTGTCGCTTTTTCGGCCCAAAGAACAAGTTCCCAAAACCATGTTCACGGAAAAAGTAACATATTTTGTAAATCATATGAAAAACCACATCAAAGTGCCTTGCTTTGTTTCCCTACCTCTGTTGGATCTCAAGTTTCGCGCCCAAGTAATTCGGGCTCTAATAGTTTTTCCCGTTTATCTCAAGCACAAAAACGTCATGCAACAGCTTCTAGACGCTCAAAGTAGACTACGATACAGTTTTGTACATAAATTCATATTTATATATACTTACCTGTTAAATTTTCAGTTTATTTCCTACCTAATTTATGTGTACATATCCCATTAATTTATCTATCTCTCTTCAGTTTTTTGAAAACATAAAAAAGTCACCCAAATTTTGTTTTGATTATTTCGGTCGTAATTCTTCTATTCATATGGAGAATATATATATTAAACAAACTCTTGTGTCTAAACTAGGTTATTTACAGTGAAGTGAAGCGAGCTATGCACCCAGTTATGTAAATAATAAGCATTNTGCAGAACTGTTAAATCCT ] [-] EMBL CD074522 [ AAGTTTCGCGCCCAAGTAATTCGGGCTCTAATAGTTTTTCCCGTTTATCTCAAGCACAAAAACGTCATGCAACAGCTTCTAGACGCTCAAAGTAGACTACGATACAGTTTTGTACATAAATTCATATTTATATATACTTACCTGTTAAATTTTCAGTTTATTTCCTACCTAATTTATGTGTACATATCCCATTAATTTATCTATCTCTCTTCAGTTTTTTGAAAACATAAAAAAGTCACCCAAATTTTGTTTTGATTATTTCGGTCGTAATTCTTCTATTCATATGGAGAATATATATATTAAACAAACTCTTGTGTCTAAACTAGGTTATTTACAGTGAAGTGAAGCGAGCTATGCACCCAGTTATGTAAATAATAAGCATTTTGCAGAACTGTTAAATCCTCTTATTGCTTATTCCATATTTTGCGAGTACTTTTTTCTCGTTTTTCCCTACGAAATGCCTTTTTACCAATATGTGTATCTTCATCCGTAACCTTTCGACAAAAACAAAGGACAACACTGTGATTCTTTCGAATAAGTTTATTCGATCGCTTTACATATGTTCAGAGTTTCCATGTATATGTATTTGCAGACACGTCTCTAGATTTACCTGTATTTTGTTTTATTCAGTGTTAG AAATGAATAAAATCT] [-] EMBL CD074343 [ CGCCCAAGTAATTCGGGCTCTAATAGTTTTTCCCGTTTATCTCAAGCACAAAAACGTCATGCAACAGCTTCTAGACGCTCAAAGTAGACTACGATACAGTTTTGTACATAAATTCATATTTATATATACTTACCTGTTAAATTTTCAGTTTATTTCCTACCTAATTTATGTGTACATATCCCATTAATTTATCTATCTCTCTTCAGTTTTTTGAAAACATAAAAAAGTCACCCAAATTTTGTTTTGATTATTTCGGTCGTAATTCTTCTATTCATATGGAGAATATATATATTAAACAAACTCTTGTGTCTAAACTAGGTTATTTACAGTGAAGTGAAGCGAGCTATGCACCCAGTTATGTAAATAATAAGCATTTTGCAGAACTGTTAAATCCTCTTATTGCTTATTCCATATTTTGCGAGTACTTTTTTCTCGTTTTTCCCTACGAAATGCCTTTTTACCAATATGTGTATCTTCATCCGTAACCTTTCGACAAAAACAAAGGACAACACTGTGATTCTTTCGAATAAGTTTATTCGATCGCTTTACATATGTTCAGAGTTTCCATGTATATGTATTTGCAGACACGTCTCTAGATTTACCTGTATTTTGTTTTATTCAGTGTTAG AAATGAATAAAATCT] [+] EMBL AI021783 [ atataaATGGAGA ATATATATTAAACAAACTCTTGTGTCTAAACTAGGTTATTTACAGTGAAGTGAAGCGAGCTATGCACCCAGTTATGTAAATAATAAGCATTTTGCAGAACTGGTAAATCCTCTTATTGCTTATTCCATATTTTGCGAGTACTTTTTTCTCGTTTTTCCCTACGAAATGCCTTTTTACCAATATGTGTATCTTCATCCGTAACCTTTCGACAAAAACAAAGGACAACACTGTGATTCTTTCGAATAAGTTTATTCGATCGCTTTACATATGTTCAGAGTTTCCATGTATATGTATTTGCAGACACGTCTCTAGATTTACCTGTATTTTGTTTTATTCAGGGGTAGAAAATGAA AAAATCT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||