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Schistosoma mansoni
cluster # 7374 cluster # 7374       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7374#0 length = 982 sequences # 5  

consensusID : consensus_7374#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 982
fasta sequence
                              [AAGAAAAACATTTTAGCCCCAATAGTTAACACTGATTCGTTAAAATCTTCAGAGGTTACTTTCAGAAAACCCCATCAAGGTCGTAAAAGACGCTGTTTACGGGTATTAACATCCTCCAAGTCCAACGCGGGTAACTCTTCAAATCAGCAGTCAGCGAATCTCCGTGATGACTGCATTGTATCTATGTATCCAAACACACAAGGTGTCGCTTTTTCGGCCCAAAGAACAAGTTCCCAAAACCATGTTCACGGAAAAAGTAACATATTTTGTAAATCATATGAAAAACCACATCAAAGTGCCTTGCTTTGTTTCCCTACCTCTGTTGGATCTCAAGTTTCGCGCCCAAGTAATTCGGGCTCTAATAGTTTTTCCCGTTTATCTCAAGCACAAAAACGTCATGCAACAGCTTCTAGACGCTCAAAGTAGACTACGATACAGTTTTGTACATAAATTCATATTTATATATACTTACCTGTTAAATTTTCAGTTTATTTCCTACCTAATTTATGTGTACATATCCCATTAATTTATCTATCTCTCTTCAGTTTTTTGAAAACATAAAAAAGTCACCCAAATTTTGTTTTGATTATTTCGGTCGTAATTCTTCTATTCATATGGAGAATATATATATTAAACAAACTCTTGTGTCTAAACTAGGTTATTTACAGTGAAGTGAAGCGAGCTATGCACCCAGTTATGTAAATAATAAGCATTTTGCAGAACTGTTAAATCCTCTTATTGCTTATTCCATATTTTGCGAGTACTTTTTTCTCGTTTTTCCCTACGAAATGCCTTTTTACCAATATGTGTATCTTCATCCGTAACCTTTCGACAAAAACAAAGGACAACACTGTGATTCTTTCGAATAAGTTTATTCGATCGCTTTACATATGTTCAGAGTTTCCATGTATATGTATTTGCAGACACGTCTCTAGATTTACCTGTATTTTGTTTTATTCAGTGTTAG-AAATGAATAAAATCT]

[+] EMBL CD155661             [AAGAAAAACATTTTAGCCCCAATAGTTAACACTGATTCGTTAAAATCTTCAGAGGTTACTTTCAGAAAACCCCATCAAGGTCGTAAAAGACGCTGTTTACGGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD080430             [                                                           TTTCAGAAAACCCCATCAAGGTCGTAAAAGACGCTGTTTACGGGTATTAACATCCTCCAAGTCCAACGCGGGTAACTCTTCAAATCAGCAGTCAGCGAATCTCCGTGATGACTGCATTGTATCTATGTATCCAAACACACAAGGTGTCGCTTTTTCGGCCCAAAGAACAAGTTCCCAAAACCATGTTCACGGAAAAAGTAACATATTTTGTAAATCATATGAAAAACCACATCAAAGTGCCTTGCTTTGTTTCCCTACCTCTGTTGGATCTCAAGTTTCGCGCCCAAGTAATTCGGGCTCTAATAGTTTTTCCCGTTTATCTCAAGCACAAAAACGTCATGCAACAGCTTCTAGACGCTCAAAGTAGACTACGATACAGTTTTGTACATAAATTCATATTTATATATACTTACCTGTTAAATTTTCAGTTTATTTCCTACCTAATTTATGTGTACATATCCCATTAATTTATCTATCTCTCTTCAGTTTTTTGAAAACATAAAAAAGTCACCCAAATTTTGTTTTGATTATTTCGGTCGTAATTCTTCTATTCATATGGAGAATATATATATTAAACAAACTCTTGTGTCTAAACTAGGTTATTTACAGTGAAGTGAAGCGAGCTATGCACCCAGTTATGTAAATAATAAGCATTNTGCAGAACTGTTAAATCCT                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD074522             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AAGTTTCGCGCCCAAGTAATTCGGGCTCTAATAGTTTTTCCCGTTTATCTCAAGCACAAAAACGTCATGCAACAGCTTCTAGACGCTCAAAGTAGACTACGATACAGTTTTGTACATAAATTCATATTTATATATACTTACCTGTTAAATTTTCAGTTTATTTCCTACCTAATTTATGTGTACATATCCCATTAATTTATCTATCTCTCTTCAGTTTTTTGAAAACATAAAAAAGTCACCCAAATTTTGTTTTGATTATTTCGGTCGTAATTCTTCTATTCATATGGAGAATATATATATTAAACAAACTCTTGTGTCTAAACTAGGTTATTTACAGTGAAGTGAAGCGAGCTATGCACCCAGTTATGTAAATAATAAGCATTTTGCAGAACTGTTAAATCCTCTTATTGCTTATTCCATATTTTGCGAGTACTTTTTTCTCGTTTTTCCCTACGAAATGCCTTTTTACCAATATGTGTATCTTCATCCGTAACCTTTCGACAAAAACAAAGGACAACACTGTGATTCTTTCGAATAAGTTTATTCGATCGCTTTACATATGTTCAGAGTTTCCATGTATATGTATTTGCAGACACGTCTCTAGATTTACCTGTATTTTGTTTTATTCAGTGTTAG AAATGAATAAAATCT]
[-] EMBL CD074343             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CGCCCAAGTAATTCGGGCTCTAATAGTTTTTCCCGTTTATCTCAAGCACAAAAACGTCATGCAACAGCTTCTAGACGCTCAAAGTAGACTACGATACAGTTTTGTACATAAATTCATATTTATATATACTTACCTGTTAAATTTTCAGTTTATTTCCTACCTAATTTATGTGTACATATCCCATTAATTTATCTATCTCTCTTCAGTTTTTTGAAAACATAAAAAAGTCACCCAAATTTTGTTTTGATTATTTCGGTCGTAATTCTTCTATTCATATGGAGAATATATATATTAAACAAACTCTTGTGTCTAAACTAGGTTATTTACAGTGAAGTGAAGCGAGCTATGCACCCAGTTATGTAAATAATAAGCATTTTGCAGAACTGTTAAATCCTCTTATTGCTTATTCCATATTTTGCGAGTACTTTTTTCTCGTTTTTCCCTACGAAATGCCTTTTTACCAATATGTGTATCTTCATCCGTAACCTTTCGACAAAAACAAAGGACAACACTGTGATTCTTTCGAATAAGTTTATTCGATCGCTTTACATATGTTCAGAGTTTCCATGTATATGTATTTGCAGACACGTCTCTAGATTTACCTGTATTTTGTTTTATTCAGTGTTAG AAATGAATAAAATCT]
[+] EMBL AI021783             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                atataaATGGAGA  ATATATATTAAACAAACTCTTGTGTCTAAACTAGGTTATTTACAGTGAAGTGAAGCGAGCTATGCACCCAGTTATGTAAATAATAAGCATTTTGCAGAACTGGTAAATCCTCTTATTGCTTATTCCATATTTTGCGAGTACTTTTTTCTCGTTTTTCCCTACGAAATGCCTTTTTACCAATATGTGTATCTTCATCCGTAACCTTTCGACAAAAACAAAGGACAACACTGTGATTCTTTCGAATAAGTTTATTCGATCGCTTTACATATGTTCAGAGTTTCCATGTATATGTATTTGCAGACACGTCTCTAGATTTACCTGTATTTTGTTTTATTCAGGGGTAGAAAATGAA AAAATCT]


>consensus_7374#0 AAGAAAAACATTTTAGCCCCAATAGTTAACACTGATTCGTTAAAATCTTCAGAGGTTACT TTCAGAAAACCCCATCAAGGTCGTAAAAGACGCTGTTTACGGGTATTAACATCCTCCAAG TCCAACGCGGGTAACTCTTCAAATCAGCAGTCAGCGAATCTCCGTGATGACTGCATTGTA TCTATGTATCCAAACACACAAGGTGTCGCTTTTTCGGCCCAAAGAACAAGTTCCCAAAAC CATGTTCACGGAAAAAGTAACATATTTTGTAAATCATATGAAAAACCACATCAAAGTGCC TTGCTTTGTTTCCCTACCTCTGTTGGATCTCAAGTTTCGCGCCCAAGTAATTCGGGCTCT AATAGTTTTTCCCGTTTATCTCAAGCACAAAAACGTCATGCAACAGCTTCTAGACGCTCA AAGTAGACTACGATACAGTTTTGTACATAAATTCATATTTATATATACTTACCTGTTAAA TTTTCAGTTTATTTCCTACCTAATTTATGTGTACATATCCCATTAATTTATCTATCTCTC TTCAGTTTTTTGAAAACATAAAAAAGTCACCCAAATTTTGTTTTGATTATTTCGGTCGTA ATTCTTCTATTCATATGGAGAATATATATATTAAACAAACTCTTGTGTCTAAACTAGGTT ATTTACAGTGAAGTGAAGCGAGCTATGCACCCAGTTATGTAAATAATAAGCATTTTGCAG AACTGTTAAATCCTCTTATTGCTTATTCCATATTTTGCGAGTACTTTTTTCTCGTTTTTC CCTACGAAATGCCTTTTTACCAATATGTGTATCTTCATCCGTAACCTTTCGACAAAAACA AAGGACAACACTGTGATTCTTTCGAATAAGTTTATTCGATCGCTTTACATATGTTCAGAG TTTCCATGTATATGTATTTGCAGACACGTCTCTAGATTTACCTGTATTTTGTTTTATTCA GTGTTAGAAATGAATAAAATCT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)