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Schistosoma mansoni
cluster # 7382 cluster # 7382       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7382#0 length = 747 sequences # 5  

consensusID : consensus_7382#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 747
fasta sequence
                              [TACTATACACGATATTACTATACGACATCACGGAGTATGGGCTACATCACTAACAAACCACTGGACTTTACGCGACTATCCTAACACACTGGGCGCGTCTGGGATCTAACAGAATAATTACACTGGCCTTTCGACGAGTTTTATAAAAAACTACCGGAGGCAGGTCTTTACCGCTTATAAACCTAGGGGCTATTAACTATAATCCTGCCAAACAGATATACTACCCACTAACATATGGATCACACATCGGTCATCAACCAACTAAAGTATAAGAAATTTATTATCACGTCACACTAACGAAACAAAACACTTACAGTGTAAACGCTTTTCTCACTATATCCTCAGTAGTACTAATTAGTAATGTAATGTCAAACAACACTCGCAATAATATCAAATTTATCCACACACATTAGCTACATATATATAGATATATAAATATACATACAAATACAAATACAAATACAAATATATACTTCACTCACATCAAACCTACCTAATCATGTACAGTTAATTTCATTAACCAAGAAATGTGTCCATCCGCAACTACTACTTCTACTACTACTACTCATTGACTTTTGAAACAACTTCTGAATTGACTAGTAGTGAGCAAGAAGTTTTGTGAGAGGTTGAGAGTTGTTTAGTTTTGTTTTTTGGGGTGAATTTCTTACTGGCATTGTAATTATAGTTTTGTAAATCAACTGGTCAGTACTATTATTTTCGATGAAAAAAAGATTTGCTAATTTTAAT]

[+] EMBL CD067560             [TACTATACACGATATTACTATACGACATCACGGAGTATGGGCTACATCACTAACAAACCACTGGACTTTACGCGACTATCCTAACACACTGGGCGCGTCTGGGATCTAACAGAATAATTACACTGGCCTTTCGACGAGTTTTATAAAAAACTACCGGAGGCAGGTCTTTACCGCTTATAAACCTAGGGGCTATTAACTATAATCCTGCCAAACAGATATACTACCCACTAACATATGGATCACACATCGGTCATCAACCAACTAAAGTATAAGAAATTTATTATCACGTCACACTAACAAAACAAAACACTTACAGTGTAAACGCTTTTCTCACTATATACTGAGTAGTACTAATTAGTAATGTAATGTCAAACAACACTCGCAATAATATCAAATTTATCCACGCACATTATCTACATATATATAGATATATAAATATACATACAAATACAAATACAAATACAAATATATACTTCACTCACATCAAACCTACCTAATCATGTACAGTTAATTTCA                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD153509             [                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATCACGTCACACTAACGAAACAAAACACTTACAGTGTAAACGCTTTTCTCACTATATCCTCAGTAGTACTAATTAGTAATGTAATGTCAAACAACACTCGCAATAATATCAAATTTATCCACACACATTAGCTACATATATATAGATATATAAATATACATACAAATACAAATACAAATACAAATATATACTTCACTCACATCAAACCTACCTAATCATGTACAGTTAATTTCATTAACCAAGAAATGTGTCCATCCGCAACTACTACTTCTACTACTACTACTCATTGACTTTTGAAACAACTTCTGAATTGACTAGTAGTGAGCAAGAAGTTTTGTGAGAGGTTGAGAGTTGTTTAGTTTTGTTTTTTGGGGTGAATTTCTTACTGGCATTGTAATTATAGTTTTGTAAATCAACTGGTCAGTACTATTATTTTCGATGAAAAAAAGATTTGCTAATTTTAAT]
[-] EMBL CD153546             [                                                                                                                                                                                                                                                                                               GTCACACTAACGAAACTAGACACTTACAGTGTAAACGCTTTTCTCACTATATCCTCAGTAGTACTAATTAGTAATGTAATGTCAAACAACACTCGCAATAATATCAAATTTATCCACACACATTAGCTACATATATATAGATATATAAATATACATACAAATACAAATACAAATACAAATATATACTTCACTCACATCAAACCTACCTAATCATGTACAGTTAATTTCATTAACCAAGAAATGTGTCCATCCGCAACTACTACTTCTACTACTACTACTCATTGACTTTTGAAACAACTTCTGAATTGACTAGTAGTGAGCAAGAAGTTTTGTGAGAGGTTGAGAGTTGTTTAGTTTTGTTTTTTGGGGTGAATTTCTTACTGGCATTGTAATTATAGTTTTGTAAATCAACTGGTCAGTACTATTATTTTCGATGAAAAAAAGATTTGCTAATTTTAAT]
[-] EMBL CD153539             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CACACTAACGAAACAAGACACTTACAGTGTAAACGCTTTTCTCACTATATCCTCAGTAGTACTAATTAGTAATGTAATGTCAAACAACACTCGCAATAATATCAAATTTATCCACACACATTAGCTACATATATATAGATATATAAATATACATACAAATACAAATACAAATACAAATATATACTTCACTCACATCAAACCTACCTAATCATGTACAGTTAATTTCATTAACCAAGAAATGTGTCCATCCGCAACTACTACTTCTACTACTACTACTCATTGACTTTTGAAACAACTTCTGAATCGACTAGTAGTGAGCAAGAAGTTTTGTGAGAGGTTGAGAGTTGTTTAGTTTTGTTTTTTGGGGTGAATTTCTTACTGGCATTGTAATTATAGTTTTGTAAATCAACTGGTCAGTACTATTATTTTCGATGAAAAAAAGATTTGCTAATTTTAAT]
[-] EMBL CD153565             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ctAAACACTGACAGTGTAAACGCTTTTCTCACTATATCCTCAGTAGTACTAATTAGTAATGTAATGTCAAACAACACTCGCAATAATATCAAATTTATCCACACACATTAGCTACATATATATAGATATATAAATATACATACAAATACAAATACAAATACAAATATATACTTCACTCACATCAAACCTACCTAATCATGTACAGTTAATTTCATTAACCAAGAAATGTGTCCATCCGCAACTACTACTTCTACTACTACTACTCATTGACTTTTGAAACAACTTCTGAATTGACTAGTAGTGAGCAAGAAGTTTTGTGAGAGGTTGAGAGTTGTTTAGTTTTGTTTTTTGGGGTGAATTTCTTACTGGCATTGTAATTATAGTTTTGTAAATCAACTGGTCAGTACTATTATTTTCGATGAAAAAAGGATTTGCTAATTTTAAT]


>consensus_7382#0 TACTATACACGATATTACTATACGACATCACGGAGTATGGGCTACATCACTAACAAACCA CTGGACTTTACGCGACTATCCTAACACACTGGGCGCGTCTGGGATCTAACAGAATAATTA CACTGGCCTTTCGACGAGTTTTATAAAAAACTACCGGAGGCAGGTCTTTACCGCTTATAA ACCTAGGGGCTATTAACTATAATCCTGCCAAACAGATATACTACCCACTAACATATGGAT CACACATCGGTCATCAACCAACTAAAGTATAAGAAATTTATTATCACGTCACACTAACGA AACAAAACACTTACAGTGTAAACGCTTTTCTCACTATATCCTCAGTAGTACTAATTAGTA ATGTAATGTCAAACAACACTCGCAATAATATCAAATTTATCCACACACATTAGCTACATA TATATAGATATATAAATATACATACAAATACAAATACAAATACAAATATATACTTCACTC ACATCAAACCTACCTAATCATGTACAGTTAATTTCATTAACCAAGAAATGTGTCCATCCG CAACTACTACTTCTACTACTACTACTCATTGACTTTTGAAACAACTTCTGAATTGACTAG TAGTGAGCAAGAAGTTTTGTGAGAGGTTGAGAGTTGTTTAGTTTTGTTTTTTGGGGTGAA TTTCTTACTGGCATTGTAATTATAGTTTTGTAAATCAACTGGTCAGTACTATTATTTTCG ATGAAAAAAAGATTTGCTAATTTTAAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)