cluster # 7408

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 7408 cluster # 7408 Sequences # 5 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_7408#0 length = 291 sequences # 5

consensusID : consensus_7408#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 291
fasta sequence

                              [TGGATTTATTCTCAAAAATCGTCTATGTTGTCAAGCGATTTGGGTCAAAAGGAGCATAAATTAACAACTTGCGCAATGCAAAGGTTTTGGTAATTCATTATTTTAAAAGTGAGTTGTGTACAGAAGTGGCACTTAAGAGCTCTAATTTTACCGTGACCGTAACTTATTTTTTTC-ACTCAAGGTAAATTCGTCAGTATTCCCTCCAAGTGGTTTCGTCCTTATATTTTCGTAGATATCACCGTCACTTCCTANATTCATTTTTCACCTNTCTCCTATNTGTCGAATGAACAG]

[+] EMBL CD199346             [TGGATTTATTCCCAAAAATCGTCTATGTTGTCAAGCGATTTGGGTCAAAAGGAGCATAAATTAACAACTTGCGCAATGCAAAGGTTTTGGTAATTCATTATTTTAAAAGTGAGTTGTGTACAGAAGTGGCACTTAAGAGCTCTAATTTTACCGTGACCGTAACTTATTTTTTTC ACTCAAGGTAAATTCGTCAGTATTCCCTCCAAGTGGTTTCGTCCTTATATTTTCGTAGATATCACCGTCACTTCCTANATTCATTTTTCACCTNTCTCCTATNTGTCGAATGAACAG]
[+] EMBL CD199345             [TGGATTTATTCTCAAAAATCGTCTATGTTGTCAAGCGATTTGGGTCAAAAGGAGCATAAATTAACAACTTGCGCAATGCAAAGGTTTTGGTAATTCATTATTTTAAAAGTGAGTTGTGTACAGAAGTGGCACTTAAGAGCTCTAATTTTACCGTGACCGTAACTTATTTTTTTCNACTC AGGTAAATTCGTCAGTATTCCCTCCAAGTGGATTCGTCCTTATATATTCGTAGATATCACCGTCACTTCCT GAATCATTTTTCACCTTTCTCCTATNTGTCGAATGAACAG]
[+] EMBL CD199385             [TGGATTTATTCTCAAAAATCGTCTATGTTGTCAAGCGATTTGGGTCAAAAGGAGCATAAATTAACAACTTGCGCAATGCAAAGGTTTTGGTAATTCATTATTTTAAAAGTGAGTTGTGTACAGAAGTGGCACTTAAGAGCTCTAATTTTACCGTGACCGTAACTTATTTTTTTC ACTCAAGGTAAATTCGTCAGTATTCCCTCCAAGTGGTTTCGTCCTTATATTTTCGTAGATATCACCGTCACTTCCTA ATTCA TTTTCACCT TCTCCTAT TGTCG ATG ACAG]
[+] EMBL CD199429             [TGGATTTATCCTCAAAAATCGTCTATGTTGTCAAGCGATTTGGGTCAAAAGGAGCATAAATTAACAACTTGCGCAATGCAAAGGTTTTGGTAATTCATTATTTTAAAAGTGAGTTGTGTACAGAAGTGGCACTTAAGAGCTCTAATTTTACCGTGACCGTAACTTATTTTTTTC ACTCAAGGTAAATTCGTCAGTATTCCCTCCAAGTGGTTTCGTCCTTATATTTTCGTAGATATCACCGTCACTTCCTAAATTCATTTTTCACCTNTCTCCTATNTGTCGA        ]
[+] EMBL CD199410             [TGGATTTATTCTCAAAAATCGTCTATGTTGTCAAGCGATTTGGGTCAAAAGGAGCATAAATTAACAACTTGCGCAATGCANAGGTTTTGGTAATTCATTATTTTAAAAGTGAGTTGTGTACAGAAGTGGCACTTAAGAGCTCTAATTTTACCGTGACCGTAACTTATTTTTTTC ACTCAAGGCAAATTCGTCAGTATTCCCTC                                                                                        ]




>consensus_7408#0
TGGATTTATTCTCAAAAATCGTCTATGTTGTCAAGCGATTTGGGTCAAAAGGAGCATAAA
TTAACAACTTGCGCAATGCAAAGGTTTTGGTAATTCATTATTTTAAAAGTGAGTTGTGTA
CAGAAGTGGCACTTAAGAGCTCTAATTTTACCGTGACCGTAACTTATTTTTTTCACTCAA
GGTAAATTCGTCAGTATTCCCTCCAAGTGGTTTCGTCCTTATATTTTCGTAGATATCACC
GTCACTTCCTANATTCATTTTTCACCTNTCTCCTATNTGTCGAATGAACAG

clustalw multiple alignements is not computed in this case