These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7428#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 638 fasta sequence [AAGTTGTTGAGATGTCTCTATAACGCTGCATTCTCCAATGAACTTGGTTAAAAGCCTGAAGTTGGTCACAACCAGATCAAAATTTTTGCATT-ACTTAATCGAGGATAATTTGGTTGGTAAGACTACGGTGTATCGGTTTTCAACCAGACCTGGATCGATTTCAAATTCCGTCAAGACAACTGCACGTCCAAAACCTTCATCCCTTGTTGGTAAACATGCACCACTGACTCTTACAAAGTCGGCCGTAGCTCGAGCTCTACAGCTTTTGCAAATGAATCCAAAAGCCACAGGTTTACGAATTGGAGTTAGGACCCGTGGATGCAACGGCTTGTCATATACTTTGGACTTTTGTTTTGAAGGACGCCAACCTGGAGATGAGGTTGTAGAACAAGATAACGTGCGCATTTTTATTGATCGCCGAGCACAGCTGACGTTATTAGGCACTGAAATGGACTATCAGCAGGACGTGCTATCAAGTCAATTTGTTTTTAATAACCCTAATATTAAAGGCACATGTGGGTGCGGAGAGAGCTTCAGTGTATAGATTTCGATTCTTAATTGTGATCTAGCACCTGTGTATACTTCCAGATATGTATGAAATTTAAGTCGACTTATTCTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAA] [+] EMBL CD079251 [AAGTTGTTGAGATGTCTCTATAACGCTGCATTCTCCAATGAACTTGGTTAAAAGCCTGAAGTTGGTCACAACCAGATCAAAATTTTTGCATT ACTTAATCGAGGATAATTTGGTTGGTAAGACTACGGTGTATCGGTTTTCAACCAGACCTGGATCGATTTCAAATTCCGTCAAGACAACTGCACGTCCAAAACCTTCATCCCTTGTTGGTAAACATGCACCACTGACTCTTACAAAGTCGGCCGTAGCTCGAGCTCTACAGCTTTTGCAAATGAATCCAAAAGCCACAGGTTTACGAATTGGAGTTAGGACCCGTGGATGCAACGGCTTGTCATATACTTTGGACTTTTGTTTTGAAGGACGCCAACCTGGAGATGAGGTTGTAGAACAAGATAACGTGCGCATTTTTATTGATCGCCGAGCACAGCTGACGTTATTAGGCACTGAAATGGACTATCAGCAGGACGTGCTATCAAGTCAATTTGTTTTTAATAACCCTAATATTAAAGGCACATGTGGGTGCGGAGAGAGCTTCAGTGTATAGATTTCGATTCTTAATTGTGATCTAGCACCTGTGTATACTTCCAGATATGTATGANATTTAAGTCGA ] [-] EMBL CD068534 [ TCACAACCAGATCGAAATTTTTGCATTGACTTAATCGAGGATAATTTGGTTGGTAAGACTACGGTGTATCGGTTTTCAACCAGACCTGGATCGATTTCAAATTCCGTCAAGACAACTGCACGTCCAAAACCTTCATCCCTTGTTGGTAAACATGCACCACTGACTCTTACAAAGTCGGCCGTAGCTCGAGCTCTACAGCTTTTGCAAATGAATCCAAAAGCCACAGGTTTACGAATTGGAGTTAGGACCCGTGGATGCAACGGCTTGTCATATACTTTGGACTTTTGTTTTGAAGGACGCCAACCTGGAGATGAGGTTGTAG ACAAGATAACGTGCGCA ] [-] EMBL CD146500 [ CCAAAACCTTCATCCCTTGTTGGTAAACATGCACCACTGACTCTTACAAAGTCGGCCGTAGCTCGAGCTCTACAGCTTTTGCAAATGAATCCAAAAGCCACAGGTTTACGAATTGGAGTTAGGACCCGTGGATGCAACGGCTTGTCATATACTTTGGACTTTTGTTTTGAAGGACGCCAACCTGGAGATGAGGTTGTAGAACAAGATAACGTGCGCATTTTTATTGATCGCCGAGCACAGCTGACGTTATTAGGCACTGAAATGGACTATCAGCAGGACGTGCTATCAAGTCAATTTGTTTTTAATAACCCTAATATT ] [-] EMBL AI395349 [ ATCCAAAAGCCACAGGTTTACGAATTGGAGTTAGGACCCGTGGATGCAACGGCTTGTCATATACTTTGGACTTGTGTTTTGAAGGACGCCAACCTGGAGATGAGGTTGTAGAACAAGATAACGTGCGCATTTTTATTGATCGCCGAGCACAGCTGACGTTATTAGGCACTGAAATGGACTATCAGCAGGACGTGCTATCAAGTCAATTTGTTTTTAATAACCCTAATATTAAAGGCACATGTGGGTGCGGAGAGAGCTTCAGTGTATAGATTTCGATTCTTAATTGTGATCTAGCACCTGTGTATACTTCCAGATATGTATGAAATTTAAGTCGACTTATTCTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAA] [+] EMBL CD135154 [ ACAAGATAACGTGCGCATTTTTATTGATCGCCGAGCACAGCTGACGTTATTAGGCACTGAAATGGACTATCAGCAGGACGTGCTATCAAGTCAATTTGTTTTTAATAACCCTAATATTAAAGGCACATGTGGGTGCGGAGAGAGCTTCAGTGTATAGATTTCGATTCTTAATTGTGATCTAGCACCTGTGTATACTTCCAGATATGTATGAAATTTAAGTCGAC ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||