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Schistosoma mansoni
cluster # 7428 cluster # 7428       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7428#0 length = 638 sequences # 5  

consensusID : consensus_7428#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 638
fasta sequence
                              [AAGTTGTTGAGATGTCTCTATAACGCTGCATTCTCCAATGAACTTGGTTAAAAGCCTGAAGTTGGTCACAACCAGATCAAAATTTTTGCATT-ACTTAATCGAGGATAATTTGGTTGGTAAGACTACGGTGTATCGGTTTTCAACCAGACCTGGATCGATTTCAAATTCCGTCAAGACAACTGCACGTCCAAAACCTTCATCCCTTGTTGGTAAACATGCACCACTGACTCTTACAAAGTCGGCCGTAGCTCGAGCTCTACAGCTTTTGCAAATGAATCCAAAAGCCACAGGTTTACGAATTGGAGTTAGGACCCGTGGATGCAACGGCTTGTCATATACTTTGGACTTTTGTTTTGAAGGACGCCAACCTGGAGATGAGGTTGTAGAACAAGATAACGTGCGCATTTTTATTGATCGCCGAGCACAGCTGACGTTATTAGGCACTGAAATGGACTATCAGCAGGACGTGCTATCAAGTCAATTTGTTTTTAATAACCCTAATATTAAAGGCACATGTGGGTGCGGAGAGAGCTTCAGTGTATAGATTTCGATTCTTAATTGTGATCTAGCACCTGTGTATACTTCCAGATATGTATGAAATTTAAGTCGACTTATTCTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL CD079251             [AAGTTGTTGAGATGTCTCTATAACGCTGCATTCTCCAATGAACTTGGTTAAAAGCCTGAAGTTGGTCACAACCAGATCAAAATTTTTGCATT ACTTAATCGAGGATAATTTGGTTGGTAAGACTACGGTGTATCGGTTTTCAACCAGACCTGGATCGATTTCAAATTCCGTCAAGACAACTGCACGTCCAAAACCTTCATCCCTTGTTGGTAAACATGCACCACTGACTCTTACAAAGTCGGCCGTAGCTCGAGCTCTACAGCTTTTGCAAATGAATCCAAAAGCCACAGGTTTACGAATTGGAGTTAGGACCCGTGGATGCAACGGCTTGTCATATACTTTGGACTTTTGTTTTGAAGGACGCCAACCTGGAGATGAGGTTGTAGAACAAGATAACGTGCGCATTTTTATTGATCGCCGAGCACAGCTGACGTTATTAGGCACTGAAATGGACTATCAGCAGGACGTGCTATCAAGTCAATTTGTTTTTAATAACCCTAATATTAAAGGCACATGTGGGTGCGGAGAGAGCTTCAGTGTATAGATTTCGATTCTTAATTGTGATCTAGCACCTGTGTATACTTCCAGATATGTATGANATTTAAGTCGA                            ]
[-] EMBL CD068534             [                                                                 TCACAACCAGATCGAAATTTTTGCATTGACTTAATCGAGGATAATTTGGTTGGTAAGACTACGGTGTATCGGTTTTCAACCAGACCTGGATCGATTTCAAATTCCGTCAAGACAACTGCACGTCCAAAACCTTCATCCCTTGTTGGTAAACATGCACCACTGACTCTTACAAAGTCGGCCGTAGCTCGAGCTCTACAGCTTTTGCAAATGAATCCAAAAGCCACAGGTTTACGAATTGGAGTTAGGACCCGTGGATGCAACGGCTTGTCATATACTTTGGACTTTTGTTTTGAAGGACGCCAACCTGGAGATGAGGTTGTAG ACAAGATAACGTGCGCA                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD146500             [                                                                                                                                                                                            CCAAAACCTTCATCCCTTGTTGGTAAACATGCACCACTGACTCTTACAAAGTCGGCCGTAGCTCGAGCTCTACAGCTTTTGCAAATGAATCCAAAAGCCACAGGTTTACGAATTGGAGTTAGGACCCGTGGATGCAACGGCTTGTCATATACTTTGGACTTTTGTTTTGAAGGACGCCAACCTGGAGATGAGGTTGTAGAACAAGATAACGTGCGCATTTTTATTGATCGCCGAGCACAGCTGACGTTATTAGGCACTGAAATGGACTATCAGCAGGACGTGCTATCAAGTCAATTTGTTTTTAATAACCCTAATATT                                                                                                                                     ]
[-] EMBL AI395349             [                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATCCAAAAGCCACAGGTTTACGAATTGGAGTTAGGACCCGTGGATGCAACGGCTTGTCATATACTTTGGACTTGTGTTTTGAAGGACGCCAACCTGGAGATGAGGTTGTAGAACAAGATAACGTGCGCATTTTTATTGATCGCCGAGCACAGCTGACGTTATTAGGCACTGAAATGGACTATCAGCAGGACGTGCTATCAAGTCAATTTGTTTTTAATAACCCTAATATTAAAGGCACATGTGGGTGCGGAGAGAGCTTCAGTGTATAGATTTCGATTCTTAATTGTGATCTAGCACCTGTGTATACTTCCAGATATGTATGAAATTTAAGTCGACTTATTCTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAA]
[+] EMBL CD135154             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ACAAGATAACGTGCGCATTTTTATTGATCGCCGAGCACAGCTGACGTTATTAGGCACTGAAATGGACTATCAGCAGGACGTGCTATCAAGTCAATTTGTTTTTAATAACCCTAATATTAAAGGCACATGTGGGTGCGGAGAGAGCTTCAGTGTATAGATTTCGATTCTTAATTGTGATCTAGCACCTGTGTATACTTCCAGATATGTATGAAATTTAAGTCGAC                           ]


>consensus_7428#0 AAGTTGTTGAGATGTCTCTATAACGCTGCATTCTCCAATGAACTTGGTTAAAAGCCTGAA GTTGGTCACAACCAGATCAAAATTTTTGCATTACTTAATCGAGGATAATTTGGTTGGTAA GACTACGGTGTATCGGTTTTCAACCAGACCTGGATCGATTTCAAATTCCGTCAAGACAAC TGCACGTCCAAAACCTTCATCCCTTGTTGGTAAACATGCACCACTGACTCTTACAAAGTC GGCCGTAGCTCGAGCTCTACAGCTTTTGCAAATGAATCCAAAAGCCACAGGTTTACGAAT TGGAGTTAGGACCCGTGGATGCAACGGCTTGTCATATACTTTGGACTTTTGTTTTGAAGG ACGCCAACCTGGAGATGAGGTTGTAGAACAAGATAACGTGCGCATTTTTATTGATCGCCG AGCACAGCTGACGTTATTAGGCACTGAAATGGACTATCAGCAGGACGTGCTATCAAGTCA ATTTGTTTTTAATAACCCTAATATTAAAGGCACATGTGGGTGCGGAGAGAGCTTCAGTGT ATAGATTTCGATTCTTAATTGTGATCTAGCACCTGTGTATACTTCCAGATATGTATGAAA TTTAAGTCGACTTATTCTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)