These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7487#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 743 fasta sequence [AATTTAATTTGGATTGATAGGAAACTTTTGTCTACTTTGAATATTGAAAATGTACAATTAATACTAATTGACACATGTTGATTGACTGTATCACATATATGTTTTGTGGTATTGGTTATCTATCATTATTACTGTATGTGATATGGGAAACATACTACTTATTACTATATCTATCGTACTTTGTAAACACAAAGAAATATAATGCAGTAATTATATAAACTACTAATTTACATTTAAATTTGTTCAAATGAAGGTGTCTATTAATATAGTATTACGTCCTTGGTTTGAATCTCGCGAGTTGCGATCTTGGATTCGCACTGCTGTAAATTCCCAC-AA-TAAGACGAA-ACGGCCGTCTAGTGCTTCCAGGTTTTCCATGGTGGTCTAGCTTCAACTGACTCATGATCTCAATCAATAAAATGTTTGTGATATTCTAACATGATATATGAGATTTGAAATCCAAAAACTTTAGATAAATATCAACATGATCAAAATGCATACC-CC-ATCTTTTTTTTACCTAAACTTCTTACCTT-AACTATGAATCCTAAGTTCTTTTCTGACTTTTATATGATAAATTATTCATTTATTTCATATCCTGATTGACTTCACTTTCTCAAAGTCATCGAAGATCTCCAGCCCAATATATACCTAGTTTCACCTAGTTTTCATTTAATTTTATTATCAGTTAATTTGATTTGCTCCTCAGGTCATAGCTGAGAAAACTCAATTTAGAATGATGTTTTAAA] [+] EMBL CD140896 [AATTTAATTTGGATTGATAGGAAACTTTTGTCTACTTTGAATATTGAAAATGTACAATTAATACTAATTGACACATGTTGATTGACTGTATCACATATATGTTTTGTGGTATTGGTTATCTATCATTATTACTGTATGTGATATGGGAAACATACTACTTATTACTATATCTATCGTACTTTGTAAACACAAAGAAATATAATGCAGTAATTATATAAACTACTAATTTACATTTAAATTTGTTCAAATGAAGGTGTCTATTAATATAGTATTACGTCCTTGGTTTGAATCTCGCGAGTTGCGATCTTGGATTCGCACTGCTGTAAATTCCCAC AA TAAGACGAA ACGGCCGTTCAGTGCTTCCAGATTTTCCATGGTATTCTAGCTT ] [+] EMBL CD140931 [AATTTAATTTGGATTGATAGGAAACTTTTGTCTACTTTGAATATTGAAAATGTACAATTAATACTAATTGACACATGTTGATTGACTGTATCACGTATATGTTTTGTGGTATTGGTTATCTATCATTATTACTGTATGTGATATGGGAAACATACTACTTATTACTATATCTATCGTACTTTGTAAACACAAAGAAATATAATGCAGTAATTATATAAACTACTAATTTACATTTAAATTTGTTCAAATGAAGGTGTCTATTAATATAGTATTACGTCCTTGGTTTGAATCTCGCGAGTTGCGATCTTGGATTCGCACTGCTGAAAATTCCCAC AA TAAGACGAA ACGGCCGTTCAGTGCTTCCAGATTTTCCATGGTattc ] [+] EMBL CD125116 [ gagTCCCACTAATTAAGACGAATTCGGCCGTCTAGTGCTTCCAGGTTTTCCATGGTGGTCTAGCTTCAACTGACTCATGATCTCAATCAATAAAATGTTTGTGATATTCTAACATGATATATGAGATTCGAAATCCAAAAACTTTAAATAAATATCAACATGATCAAAATGCATACCGCCTATCTTTTTTTTACCTAAACTTCTTACCTTAAACTATGGATCCTAAGTTCTTTTCTGACTTTTATATGATAAATTATTCATTTATTTCATATCCTGATTGACTTCACTTTCTCAAAGTCATCGAAGATCTCCAGCCCAATATATACCTAGTTTCACCTAGTGTGCATTTAATTTGATCATCAGTTAATTTGATTTGCTCCTCAGGTCATAGCTGAGAAAAGTCAATTTAGAATGAGGTcgtag ] [+] EMBL CD125159 [ gTCCCAC AA TAAGACGAA ACGGCCGTCTAGTGCTTCCAGGTTTTCCATGGTGGTCTAGCTTCAACTGACTCATGATCTCAATCAATAAAATGTTTGTGATATTCTAACATGATATATGAGATTTGAAATCCAAAAACTTTAGATAAATATCAACATGATCAAAATGCATACC CC ATCTTTTTTTTACCTAAACTTCTTACCTT AACTATGAATCCTAAGTTCTTTTCTGACTTTTATATGATAAATTATTCATTTATTTCATATCCTGATTGACTTCACTTTCTCAAAGTCATCGAAGATCTCCAGCCCAATATATACCTAGTTTCACCTAGTTTTCATTTAATTTTATTATCAGTTAATTTGATTTGCTCCTCAGGTCATAGCTGAGAAAACTCAATTTAGAATGATGTTTTAA ] [-] EMBL CD125216 [ TCCCAC AA TAAGACGAA ACGGCCGTCTAGTGCTTCCAGGTTTTCCATGGTGGTCTAGCTTCAACTGACTCATGATCTCAATCAATAAAATGTTTGTGATATTCTAACATGATATATGAGATTTGAAATCCAAAAACTTTAGATAAATATCAACATGATCAAAATGCATACC CC ATCTTTTTTTTACCTAAACTTCTTACCTT AACTATGAATCCTAAGTTCTTTTCTGACTTTTATATGATAAATTATTCATTTATTTCATATCCTGATTGACTTCACTTTCTCAAAGTCATCGAAGATCTCCAGCCCAATATATACCTAGTTTCACCAAGTTTTCATTTAATTTTATTATCAGTTAATTTGATTTGCTCCTCAGGTCATAGCTGAGAAAACTCAATTTAGAATGATGTTTTAAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||