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Schistosoma mansoni
cluster # 7487 cluster # 7487       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7487#0 length = 743 sequences # 5  

consensusID : consensus_7487#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 743
fasta sequence
                              [AATTTAATTTGGATTGATAGGAAACTTTTGTCTACTTTGAATATTGAAAATGTACAATTAATACTAATTGACACATGTTGATTGACTGTATCACATATATGTTTTGTGGTATTGGTTATCTATCATTATTACTGTATGTGATATGGGAAACATACTACTTATTACTATATCTATCGTACTTTGTAAACACAAAGAAATATAATGCAGTAATTATATAAACTACTAATTTACATTTAAATTTGTTCAAATGAAGGTGTCTATTAATATAGTATTACGTCCTTGGTTTGAATCTCGCGAGTTGCGATCTTGGATTCGCACTGCTGTAAATTCCCAC-AA-TAAGACGAA-ACGGCCGTCTAGTGCTTCCAGGTTTTCCATGGTGGTCTAGCTTCAACTGACTCATGATCTCAATCAATAAAATGTTTGTGATATTCTAACATGATATATGAGATTTGAAATCCAAAAACTTTAGATAAATATCAACATGATCAAAATGCATACC-CC-ATCTTTTTTTTACCTAAACTTCTTACCTT-AACTATGAATCCTAAGTTCTTTTCTGACTTTTATATGATAAATTATTCATTTATTTCATATCCTGATTGACTTCACTTTCTCAAAGTCATCGAAGATCTCCAGCCCAATATATACCTAGTTTCACCTAGTTTTCATTTAATTTTATTATCAGTTAATTTGATTTGCTCCTCAGGTCATAGCTGAGAAAACTCAATTTAGAATGATGTTTTAAA]

[+] EMBL CD140896             [AATTTAATTTGGATTGATAGGAAACTTTTGTCTACTTTGAATATTGAAAATGTACAATTAATACTAATTGACACATGTTGATTGACTGTATCACATATATGTTTTGTGGTATTGGTTATCTATCATTATTACTGTATGTGATATGGGAAACATACTACTTATTACTATATCTATCGTACTTTGTAAACACAAAGAAATATAATGCAGTAATTATATAAACTACTAATTTACATTTAAATTTGTTCAAATGAAGGTGTCTATTAATATAGTATTACGTCCTTGGTTTGAATCTCGCGAGTTGCGATCTTGGATTCGCACTGCTGTAAATTCCCAC AA TAAGACGAA ACGGCCGTTCAGTGCTTCCAGATTTTCCATGGTATTCTAGCTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD140931             [AATTTAATTTGGATTGATAGGAAACTTTTGTCTACTTTGAATATTGAAAATGTACAATTAATACTAATTGACACATGTTGATTGACTGTATCACGTATATGTTTTGTGGTATTGGTTATCTATCATTATTACTGTATGTGATATGGGAAACATACTACTTATTACTATATCTATCGTACTTTGTAAACACAAAGAAATATAATGCAGTAATTATATAAACTACTAATTTACATTTAAATTTGTTCAAATGAAGGTGTCTATTAATATAGTATTACGTCCTTGGTTTGAATCTCGCGAGTTGCGATCTTGGATTCGCACTGCTGAAAATTCCCAC AA TAAGACGAA ACGGCCGTTCAGTGCTTCCAGATTTTCCATGGTattc                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD125116             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gagTCCCACTAATTAAGACGAATTCGGCCGTCTAGTGCTTCCAGGTTTTCCATGGTGGTCTAGCTTCAACTGACTCATGATCTCAATCAATAAAATGTTTGTGATATTCTAACATGATATATGAGATTCGAAATCCAAAAACTTTAAATAAATATCAACATGATCAAAATGCATACCGCCTATCTTTTTTTTACCTAAACTTCTTACCTTAAACTATGGATCCTAAGTTCTTTTCTGACTTTTATATGATAAATTATTCATTTATTTCATATCCTGATTGACTTCACTTTCTCAAAGTCATCGAAGATCTCCAGCCCAATATATACCTAGTTTCACCTAGTGTGCATTTAATTTGATCATCAGTTAATTTGATTTGCTCCTCAGGTCATAGCTGAGAAAAGTCAATTTAGAATGAGGTcgtag ]
[+] EMBL CD125159             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gTCCCAC AA TAAGACGAA ACGGCCGTCTAGTGCTTCCAGGTTTTCCATGGTGGTCTAGCTTCAACTGACTCATGATCTCAATCAATAAAATGTTTGTGATATTCTAACATGATATATGAGATTTGAAATCCAAAAACTTTAGATAAATATCAACATGATCAAAATGCATACC CC ATCTTTTTTTTACCTAAACTTCTTACCTT AACTATGAATCCTAAGTTCTTTTCTGACTTTTATATGATAAATTATTCATTTATTTCATATCCTGATTGACTTCACTTTCTCAAAGTCATCGAAGATCTCCAGCCCAATATATACCTAGTTTCACCTAGTTTTCATTTAATTTTATTATCAGTTAATTTGATTTGCTCCTCAGGTCATAGCTGAGAAAACTCAATTTAGAATGATGTTTTAA ]
[-] EMBL CD125216             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TCCCAC AA TAAGACGAA ACGGCCGTCTAGTGCTTCCAGGTTTTCCATGGTGGTCTAGCTTCAACTGACTCATGATCTCAATCAATAAAATGTTTGTGATATTCTAACATGATATATGAGATTTGAAATCCAAAAACTTTAGATAAATATCAACATGATCAAAATGCATACC CC ATCTTTTTTTTACCTAAACTTCTTACCTT AACTATGAATCCTAAGTTCTTTTCTGACTTTTATATGATAAATTATTCATTTATTTCATATCCTGATTGACTTCACTTTCTCAAAGTCATCGAAGATCTCCAGCCCAATATATACCTAGTTTCACCAAGTTTTCATTTAATTTTATTATCAGTTAATTTGATTTGCTCCTCAGGTCATAGCTGAGAAAACTCAATTTAGAATGATGTTTTAAA]


>consensus_7487#0 AATTTAATTTGGATTGATAGGAAACTTTTGTCTACTTTGAATATTGAAAATGTACAATTA ATACTAATTGACACATGTTGATTGACTGTATCACATATATGTTTTGTGGTATTGGTTATC TATCATTATTACTGTATGTGATATGGGAAACATACTACTTATTACTATATCTATCGTACT TTGTAAACACAAAGAAATATAATGCAGTAATTATATAAACTACTAATTTACATTTAAATT TGTTCAAATGAAGGTGTCTATTAATATAGTATTACGTCCTTGGTTTGAATCTCGCGAGTT GCGATCTTGGATTCGCACTGCTGTAAATTCCCACAATAAGACGAAACGGCCGTCTAGTGC TTCCAGGTTTTCCATGGTGGTCTAGCTTCAACTGACTCATGATCTCAATCAATAAAATGT TTGTGATATTCTAACATGATATATGAGATTTGAAATCCAAAAACTTTAGATAAATATCAA CATGATCAAAATGCATACCCCATCTTTTTTTTACCTAAACTTCTTACCTTAACTATGAAT CCTAAGTTCTTTTCTGACTTTTATATGATAAATTATTCATTTATTTCATATCCTGATTGA CTTCACTTTCTCAAAGTCATCGAAGATCTCCAGCCCAATATATACCTAGTTTCACCTAGT TTTCATTTAATTTTATTATCAGTTAATTTGATTTGCTCCTCAGGTCATAGCTGAGAAAAC TCAATTTAGAATGATGTTTTAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)