These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7505#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1272 fasta sequence [AGCGATCTGTATCAGAAAACTTATGTCAAAAAGATGTGTGCTGCTGATGATGATAGTGAATAACTAGTGATGTGCAAGTAGTAGTTTAAAGCGATTGCAAACACTGAATTAATGAATACTAAAATGACAAGAAGCATAACGTATTGTTGGTGTTGTGTTGCTTTTTACAATAAAGACAGGAAAAACAAAGCTAGTTAGTATACATTGTGTAATGACAGAGACAAACGACTGATTGTCGAAGAAAAATGTTCAAAAAATGAGAGAATTATAACAATCCACAAATGGTATATATATATATGAAGAGACAAAACTAAACTAATAAATGTATATAGAATATGGGGA-AATAAGAAATTAAT-AATAAACGGTGCTCTAATTCACTTATCCCTGTTCGTCGTTACACTGTAGTAGTAGCATAAAGCAACACAGATTATTGTAGTTGCAATAGTAACAAACTCTACGTGCGATGATTAGCTTTGTCATTTGATGATTTGTGTGTAGTTGTTGTTGCTGTAGTGTTAGTAGAAGAATCGTTTTGTTGTAATGTAGTCATACCATTACTTTCAGAGTTCGAACCAGGCGATTTGCTGGCTGCTGGCGTCCCACCATTATTACTATTGTTGGTGTTATTACAACCGCCATTGTTGTTACCAGTGCCGTTATTATTATTACTATTATTTGAAGTTTTAGAAACATGATTGGTGGAAGAATTATTTGAAACTGACAAATTAGTATTGTTATTATTAGTTGTATTATTATTATTGTTGTTATTATTATTATTATTTGCAGATGAGCTTTTTCCAGTAGTGTTATTATTCCCGGCCACATTGTTATATTTTTCCAATTTAGCTATAATATGCTTGCCATAATTAAATTTGCGTAGAACATTTTGCATAGGACGGATTCGATTAATTAATACACGACGTTGTTCAGTATCGGCTAATTCTAGCATACGTTGAACTACATAATTTGCATATTGATCTTTCATCATATCAACTAATGATGAAGAGATGTTATTAGTTGTTACTGACGAGGTGTCTCCATTAATATTCACATTAGAAATTGGATGTAAAATTTCTTCAATTAATACAGCTCTTTCAGATGGTACAGCGTTGGCAATTGCTTTCTCCATAACATTCGATGCAAATTTATGCGAACTTAAAGCACATACACGACCACGTAGATTTTGAATAATACGTGATTTATCCTCATTTGAACCATGCTCTAAAACATGTTGAATGACGTAGTTGCCGTACTGATCTTTGAATAAATGTT] [+] EMBL CD187828 [AGCGATCTGTATCAGAAAACTTATGTCAAAAAGATGTGTGCTGCTGATGATGATAGTGAATAACTAGTGATGTGCAAGTAGTAGTTTAAAGCGATTGCAAACACTGAATTAATGAATACTAAAATGACAAGAAGCATAACGTATTGTTGGTGTTGTGTTGCTTTTTACAATAAAGACAGGAAAAACAAAGCTAGTTAGTATACATTGTGTAATGACAGAGACAAACGACTGATTGTCGAAGAAAAATGTTCAAAAAATGAGAGAATTATAACAATCCACAAATGGTATATATATATATGAAGAGACAAAACTAAACTAATAAATGTATATAGAATATGGGGA AATAAGAAATTAAT AATAAACGGTGCTCTAATTCACTTATCCCTGTTCGTCGTTACACTGTAGTAGTAGCATAAAGCAACACAGATTATTGTAGTTGCAATAGTAACAAACTCTACGTGCGATGATTAGCTTTGTCATTTGATGATTTGTGTGTAGTTGTTGTTGCTGTAGTGTTAGTAGAAGAATC ] [+] EMBL CD069146 [ GTGTTGTGTTGCTTTTTACAATAAAGACAGGAAAAACAAAGCTAGTTAGTATACATTGTGTAATGACAGAGACAAACGACTGGTTGTCGAAGAAAAATGTTCAAAAAATGAGAGAATTATAACAATCCACAAATGGTATATATATATATGAAGAGACAAAACTAAACTAATAAATGTATATAGAATATGGGGACAATAAGACATTACTCACTAAACGGTGCTCTAATTCACTTATCCCTGTTCGTCGTTACACTGTAGTAGTAGCATAAAGCAACACAGATTATTGTAGTTGCAATAGTAACAAACTCTACGTGCGATGATTAGCTTTGTCATTTGATGATTTGTGTGTAGTTGTTGTTGCTGTAGTGTTAGTAGAAGAATCGTTTTGTTGTAATGTAGTCATACCATTACTTTCAGAGTTCGAACCAGGCGATTT ] [-] EMBL CD152084 [ CTGTAGTAGTAGCATAAAGCAACACAGATTATTGTAGTTGCAATAGTAACAAACTCTACGTGCGATGATTAGCTTTGTCATTTGATGATTTGTGTGTAGTTGTTGTTGCTGTAGTGTTAGTAGAAGAATCGTTTTGTTGTAATGTAGTCATACCATTACTTTCAGAGTTCGAACCAGCCGATTTGCTGGCTGCTGGCGTCCCACCATTATTACTATTGTTGGTGTTATTACAACCGCCATTGTTGTTACCAGTGCCGTTATTATTATTACTATTATTTGAAGTTTTAGAAACATGATTGGTGGAAGAATTATTTGAAA ] [-] EMBL CD146086 [ ATTACTATTATTTGAAGTTTTAGAAACATGATTGGTGGAAGAATTATTTGAAACTGACAAATTAGTATTGTTATTATTAGTTGTATTATTATTATTGTTGTTATTATTATTATTATTTGCAGATGAGCTTTTTCCAGTAGTGTTATTATTCCCGGCCACATTGTTATATTTTTCCAATTTAGCTATAATATGCTTGCCATAATTAAATTTGCGTAGAACATTTTGCATAGGACGGATTCGATTAATTAATACACGACGTTGTTCAGTATCGGCTAATTCTA ] [-] EMBL AI975784 [ TAATT AATTTGCGTAGAACATTTTGCATAGGACGGATTCGATTAATTAATACACGACGTTGTTCAGTATCAGCTAATTCTAGCATACGTTGAACTACATAATTTGCATATTGATCTTTCATCATATCAACTAATGATGAAGAGATGTTATTAGTTGTTACTGACGAGGTGTCTCCATTAATATTCACATTAGAAATTGGATGTAAAATTTCTTCAATTAATACAGCTCTTTCAGATGGTACAGCGTTGGCAATTGCTTTCTCCATAACATTCGATGCAAATTTATGCGAACTTAAAGCACATACACGACCACGTAGATTTTGAATAATACGTGATTTATCCTCATTTGAACCATGCTCTAAAACATGTTGAATGACGTAGTTGCCGTACTGATCTTTGAATAAATGTT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||