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Schistosoma mansoni
cluster # 7550 cluster # 7550       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7550#0 length = 816 sequences # 5  

consensusID : consensus_7550#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 816
fasta sequence
                              [CAAACGACATATTTCGTGCTAATGTACTTGTTATTGAAGAATTATTATTGTCTTGGCCAGCCGTGCAAGTGCATGGAGTAATAATTCTAGTGGACCTATCAGGCTTTTCCTGGAGACATGCCATTAATTTAATGTCTCCTTGGTTTCTACATCGAGCAGTACATTTTTTACAAGGTTCAAGTCCTGTACGAGTAAAAGCTGTTCATATTTTCAATAGTCCTTATATGTTTTCTAAAATATATTCAGCATTAATGCCTTTGTTAAAACCAAAAAATCAAGCGCGTGTTGTTATGCACAATACATCGTTAGAAAGTCTTCATGCTGCAATCCCTCCCCATCTACTCCCGTGTAATGGTGGTTTAAACGGGACTGGACCTTCAGTTCCATCATATGAATATATCAATGGTTTATTAAATTTGGAAGATTATTTCATTGAAATGAATAAATATCCATATCATATAAATAGTATATCTGACATATAAACAATTGTTGATCTATAAATTGTTTCTATGTAAATTCTATCATTTATCCATACAGATCACTATTATGATTATCAGTAGTATATTACTTATTTTTTCTAACAGACATATATGTGTGTGATATAAGTATATTTTTCTTGGGTTCTTTTCTTATGTACACTCATTTATCATGTGATTTTACCACTTAATACGTATAGTTAATGTTCAATCTTTGTGTTTACTGATCCATTGTTGTAAATGACATTGACGTAACACATTGTATGGAGAGTCTTTCAAAATTTTTGTTTCCTGTTTTGTTTTGCCTTCACTACTAGTTTTTTATTTATTTAAAGAAAAT]

[+] EMBL CD079003             [CAAACGACATATTTCGTGCTAATGTACTTGTTATTGAAGAATTATTATTGTCTTGGCCAGCCGTGCAAGTGCATGGAGTAATAATTCTAGTGGACCTATCAGGCTTTTCCTGGAGACATGCCATTAATTTAATGTCTCCTTGGTTTCTACATCGAGCAGTACATTTTTTACAAGGTTCAAGTCCTGTACGAGTAAAAGCTGTTCATATTTTCAATAGTCCTTATATGTTTTCTAAAATATATTCAGCATTAATGCCTTTGTTAAAACCAAAAAATCAAGCGCGTGTTGTTATGCACAATACATCGTTAGAAAGTCTTCATGCTGCAATCCCTCCCCATCTACTCCCGTGTAATGGTGGTTTAAACGGGACTGGACCTTCAGTTCCATCATATGAATATATCAATGGTTTATTAAATTTGGAAGATTATTTCATTGAAATGAATAAATATCCATATCATATAAATAGTATATCTGACATATAAACAATTGTTGATCTATAAATTGTTTCTATGTAAATTCTATCATTTATCCATACAGATCACTATTATGATTATCAGTAGTATATTACTTATTTTTTCTAACAGACATATATGTGTGTGATATAAGTA                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD151917             [                                                                                    TTCTAGTGGACCTATCAGGCTTTTCCTGGAGACATGCCATTAATTTAATGTCTCCTTGGTTTCTACATCGAGCAGTACATTTTTTACAAGGTTCAAGTCCTGTACGAGTAAAAGCTGTTCATATTTTCAATAGTCCTTATATGTTTTCTAAAATATATTCAGCATTAATGCCTTTGTTAAAACCAAAAAATCAAGCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD116031             [                                                                                                                                                                 CATTTTTTACAAGGTTCAAGTCCTGTACGAGTAAAAGCTGTTCATATTTTCAATAGTCCTTATATGTTTTCTAAAATATATTCAGCATTAATGCCTTTGTTAAAACCAAAAAATCAAGCGCGTGTTGTTATGCACAATACATCGTTAGAAAGTCTTCATGCTGCAATCCCTCCCCATCTACTCCCGTGTAATGGTGGTTTAAACGGGACTGGACCTTCAGTTCCATCATATGAATATATCAATGGTTTATTAAATTTGGAAGATTATTTCATTGAAATGAATAAATATCCATATCATATAAATAGTATATCTGACATATAAACAATTGTTGATCTATAAATTGTTTCTATGTAAATTCTATCATTTATCCATACAGATCACTATTATGATTATCAGTAGTATATTACTTATTTTTTCTAACAGACATATATGTGTGTGATATAAGTATATTTTTCTTGGG                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD116139             [                                                                                                                                                                 CATTTTTTACAAGGTTCAAGTCCTGTACGAGTAAAAGCTGTTCATATTTTCAATAGTCCTTATATGTTTTCTAAAATATATTCAGCATTAATGCCTTTGTTAAAACCAAAAAATCAAGCGCGTGTTGTTATGCACAATACATCGTTAGAAAGTCTTCATGCTGCAATCCCTCCCCATCTACTCCCGTGTAATGGTGGTTTAAACGGGACTGGACCTTCAGTTCCATCATATGAATATATCAATGGTTTATTAAATTTGGAAGATTATTTCATTGAAATGAATAAATATCCATATCATATAAATAGTATATCTGACATATAAACAATTGTTGATCTATAAATTGTTTCTATGTAAATTCTATCATTTATCCATACAGATCACTATTATGATTATCAGTAGTATATTACTTATTTTTTCTAACAGACATATATGTGTGTGATATAAGTATATTTTTCTTGGG                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD073454             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TCATATAAATAGTATATCTGACATATAAACAATTGTTGATCTATAAATTGTTTCTATGTAAATTCTATCATTTATCCATACAGATCACTATTATGATTATCAGTAGTATATTACTTATTTTTTCTAACAGACATATATGTGTGTGATATAAGTATATTTTTCTTGTGTTCTTTTCTTATGTACACTCATTTATCATGTGATTTTACCACTTAATACGTATAGTTAATGTTCAATCTTTGTGTTTACTGATCCATTGTTGTAAATGACATTGACGTAACACATTGTATGGAGAGTCTTTCAAAATTTTTGTTTCCTGTTTTGTTTTGCCTTCACTACTAGTTTTTTATTTATTTAAAGAAAAT]


>consensus_7550#0 CAAACGACATATTTCGTGCTAATGTACTTGTTATTGAAGAATTATTATTGTCTTGGCCAG CCGTGCAAGTGCATGGAGTAATAATTCTAGTGGACCTATCAGGCTTTTCCTGGAGACATG CCATTAATTTAATGTCTCCTTGGTTTCTACATCGAGCAGTACATTTTTTACAAGGTTCAA GTCCTGTACGAGTAAAAGCTGTTCATATTTTCAATAGTCCTTATATGTTTTCTAAAATAT ATTCAGCATTAATGCCTTTGTTAAAACCAAAAAATCAAGCGCGTGTTGTTATGCACAATA CATCGTTAGAAAGTCTTCATGCTGCAATCCCTCCCCATCTACTCCCGTGTAATGGTGGTT TAAACGGGACTGGACCTTCAGTTCCATCATATGAATATATCAATGGTTTATTAAATTTGG AAGATTATTTCATTGAAATGAATAAATATCCATATCATATAAATAGTATATCTGACATAT AAACAATTGTTGATCTATAAATTGTTTCTATGTAAATTCTATCATTTATCCATACAGATC ACTATTATGATTATCAGTAGTATATTACTTATTTTTTCTAACAGACATATATGTGTGTGA TATAAGTATATTTTTCTTGGGTTCTTTTCTTATGTACACTCATTTATCATGTGATTTTAC CACTTAATACGTATAGTTAATGTTCAATCTTTGTGTTTACTGATCCATTGTTGTAAATGA CATTGACGTAACACATTGTATGGAGAGTCTTTCAAAATTTTTGTTTCCTGTTTTGTTTTG CCTTCACTACTAGTTTTTTATTTATTTAAAGAAAAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)